RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542481.1

ATG16L2-218, Transcript of autophagy related 16 like 2, humanhuman

TSL 5

Gene ATG16L2, Length 571 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2-218ENST00000542481 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
ATG16L2-218ENST00000542481 JPH4Q96JJ6 628 aa23.91■■□□□ 1.42
ATG16L2-218ENST00000542481 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.89■■□□□ 1.41
ATG16L2-218ENST00000542481 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.79■■□□□ 1.4
ATG16L2-218ENST00000542481 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.78■■□□□ 1.4
ATG16L2-218ENST00000542481 IQGAP2Q13576 1575 aa23.74■■□□□ 1.39
ATG16L2-218ENST00000542481 PRXQ9BXM0 1461 aa23.66■■□□□ 1.38
ATG16L2-218ENST00000542481 ADCY10Q96PN6 1610 aa23.64■■□□□ 1.38
ATG16L2-218ENST00000542481 DISP1Q96F81 1524 aa23.61■■□□□ 1.37
ATG16L2-218ENST00000542481 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.6■■□□□ 1.37
ATG16L2-218ENST00000542481 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa23.6■■□□□ 1.37
ATG16L2-218ENST00000542481 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.6■■□□□ 1.37
ATG16L2-218ENST00000542481 PTPRGP23470 1445 aa23.58■■□□□ 1.36
ATG16L2-218ENST00000542481 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.57■■□□□ 1.36
ATG16L2-218ENST00000542481 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
ATG16L2-218ENST00000542481 KIAA0556O60303 1618 aa23.53■■□□□ 1.36
ATG16L2-218ENST00000542481 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.52■■□□□ 1.36
ATG16L2-218ENST00000542481 KIF13AQ9H1H9 1805 aa23.5■■□□□ 1.35
ATG16L2-218ENST00000542481 MAPKBP1O60336 1514 aa23.5■■□□□ 1.35
ATG16L2-218ENST00000542481 EEA1Q15075 1411 aa23.49■■□□□ 1.35
ATG16L2-218ENST00000542481 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP23.47■■□□□ 1.35
ATG16L2-218ENST00000542481 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.47■■□□□ 1.35
ATG16L2-218ENST00000542481 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
ATG16L2-218ENST00000542481 ABCC2Q92887 1545 aa23.43■■□□□ 1.34
ATG16L2-218ENST00000542481 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa23.43■■□□□ 1.34
ATG16L2-218ENST00000542481 ABCC10Q5T3U5 1492 aa23.42■■□□□ 1.34
ATG16L2-218ENST00000542481 UACAQ9BZF9 1416 aa23.42■■□□□ 1.34
ATG16L2-218ENST00000542481 DIP2BQ9P265 1576 aa23.4■■□□□ 1.34
ATG16L2-218ENST00000542481 GOLGA3Q08378 1498 aa23.4■■□□□ 1.34
ATG16L2-218ENST00000542481 FAM69CQ0P6D2 419 aa23.35■■□□□ 1.33
ATG16L2-218ENST00000542481 KIF21BO75037 1637 aa23.33■■□□□ 1.33
ATG16L2-218ENST00000542481 PLB1Q6P1J6 1458 aa23.33■■□□□ 1.33
ATG16L2-218ENST00000542481 KDM5BQ9UGL1 1544 aa23.33■■□□□ 1.32
ATG16L2-218ENST00000542481 ASXL2Q76L83 1435 aa23.31■■□□□ 1.32
ATG16L2-218ENST00000542481 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
ATG16L2-218ENST00000542481 ABCA8O94911 1581 aa23.3■■□□□ 1.32
ATG16L2-218ENST00000542481 SAMD9Q5K651 1589 aa23.3■■□□□ 1.32
ATG16L2-218ENST00000542481 P3H3Q8IVL6 736 aa23.26■■□□□ 1.31
ATG16L2-218ENST00000542481 TSPOAP1O95153 1857 aa23.22■■□□□ 1.31
ATG16L2-218ENST00000542481 GLI2P10070 1586 aa23.2■■□□□ 1.3
ATG16L2-218ENST00000542481 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
ATG16L2-218ENST00000542481 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
ATG16L2-218ENST00000542481 EHMT2Q96KQ7 1210 aa23.17■■□□□ 1.3
ATG16L2-218ENST00000542481 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
ATG16L2-218ENST00000542481 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.15■■□□□ 1.3
ATG16L2-218ENST00000542481 WDR7Q9Y4E6 1490 aa23.14■■□□□ 1.29
ATG16L2-218ENST00000542481 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa23.11■■□□□ 1.29
ATG16L2-218ENST00000542481 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa23.11■■□□□ 1.29
ATG16L2-218ENST00000542481 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.1■■□□□ 1.29
ATG16L2-218ENST00000542481 ARID3CA6NKF2 412 aa23.1■■□□□ 1.29
ATG16L2-218ENST00000542481 ATP10BO94823 1461 aa23.09■■□□□ 1.29
ATG16L2-218ENST00000542481 KDM6BO15054 1643 aa23.08■■□□□ 1.29
ATG16L2-218ENST00000542481 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
ATG16L2-218ENST00000542481 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
ATG16L2-218ENST00000542481 KCNH8Q96L42 1107 aa23■■□□□ 1.27
ATG16L2-218ENST00000542481 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.98■■□□□ 1.27
ATG16L2-218ENST00000542481 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.98■■□□□ 1.27
ATG16L2-218ENST00000542481 TEX14Q8IWB6 1497 aa22.95■■□□□ 1.26
ATG16L2-218ENST00000542481 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
ATG16L2-218ENST00000542481 CD109Q6YHK3 1445 aa22.94■■□□□ 1.26
ATG16L2-218ENST00000542481 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.92■■□□□ 1.26
ATG16L2-218ENST00000542481 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
ATG16L2-218ENST00000542481 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
ATG16L2-218ENST00000542481 ABCA9Q8IUA7 1624 aa22.9■■□□□ 1.26
ATG16L2-218ENST00000542481 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
ATG16L2-218ENST00000542481 FMN1Q68DA7 1419 aa22.86■■□□□ 1.25
ATG16L2-218ENST00000542481 HECW1Q76N89 1606 aa22.82■■□□□ 1.24
ATG16L2-218ENST00000542481 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.79■■□□□ 1.24
ATG16L2-218ENST00000542481 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.77■■□□□ 1.24
ATG16L2-218ENST00000542481 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
ATG16L2-218ENST00000542481 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.75■■□□□ 1.23
ATG16L2-218ENST00000542481 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
ATG16L2-218ENST00000542481 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
ATG16L2-218ENST00000542481 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.74■■□□□ 1.23
ATG16L2-218ENST00000542481 CLIP1P30622 1438 aa22.74■■□□□ 1.23
ATG16L2-218ENST00000542481 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22.73■■□□□ 1.23
ATG16L2-218ENST00000542481 NEO1Q92859 1461 aa22.7■■□□□ 1.22
ATG16L2-218ENST00000542481 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.69■■□□□ 1.22
ATG16L2-218ENST00000542481 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa22.68■■□□□ 1.22
ATG16L2-218ENST00000542481 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.66■■□□□ 1.22
ATG16L2-218ENST00000542481 KIF14Q15058 1648 aa22.65■■□□□ 1.22
ATG16L2-218ENST00000542481 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa22.63■■□□□ 1.21
ATG16L2-218ENST00000542481 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
ATG16L2-218ENST00000542481 FANCAO15360 1455 aa22.62■■□□□ 1.21
ATG16L2-218ENST00000542481 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.62■■□□□ 1.21
ATG16L2-218ENST00000542481 RAPGEF3O95398 923 aa22.61■■□□□ 1.21
ATG16L2-218ENST00000542481 ADGRL1O94910 1474 aa22.6■■□□□ 1.21
ATG16L2-218ENST00000542481 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.6■■□□□ 1.21
ATG16L2-218ENST00000542481 CFAP74Q9C0B2 1584 aa22.6■■□□□ 1.21
ATG16L2-218ENST00000542481 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
ATG16L2-218ENST00000542481 AKNAQ7Z591 1439 aa22.59■■□□□ 1.21
ATG16L2-218ENST00000542481 CEP162Q5TB80 1403 aa22.58■■□□□ 1.21
ATG16L2-218ENST00000542481 PLCH2O75038 1416 aa22.57■■□□□ 1.2
ATG16L2-218ENST00000542481 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22.57■■□□□ 1.2
ATG16L2-218ENST00000542481 RICTORQ6R327 1708 aa22.57■■□□□ 1.2
ATG16L2-218ENST00000542481 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
ATG16L2-218ENST00000542481 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa22.53■■□□□ 1.2
ATG16L2-218ENST00000542481 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.47■■□□□ 1.19
ATG16L2-218ENST00000542481 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.47■■□□□ 1.19
ATG16L2-218ENST00000542481 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.3 ms