RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541667.5

CLSTN3-211, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 671 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-211ENST00000541667 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa20.56■□□□□ 0.88
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CLSTN3-211ENST00000541667 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa20.52■□□□□ 0.88
CLSTN3-211ENST00000541667 CUL7Q14999 1698 aa20.5■□□□□ 0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 ADCY10Q96PN6 1610 aa20.35■□□□□ 0.85
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CLSTN3-211ENST00000541667 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa20.31■□□□□ 0.84
CLSTN3-211ENST00000541667 PTPRGP23470 1445 aa20.31■□□□□ 0.84
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CLSTN3-211ENST00000541667 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP19.92■□□□□ 0.78
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CLSTN3-211ENST00000541667 ADGRL1O94910 1474 aa19.61■□□□□ 0.73
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CLSTN3-211ENST00000541667 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
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CLSTN3-211ENST00000541667 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP19.36■□□□□ 0.69
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CLSTN3-211ENST00000541667 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa19.31■□□□□ 0.68
CLSTN3-211ENST00000541667 CFAP74Q9C0B2 1584 aa19.31■□□□□ 0.68
CLSTN3-211ENST00000541667 YEATS2Q9ULM3 1422 aa19.3■□□□□ 0.68
CLSTN3-211ENST00000541667 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa19.3■□□□□ 0.68
CLSTN3-211ENST00000541667 HECW2Q9P2P5 1572 aa19.29■□□□□ 0.68
CLSTN3-211ENST00000541667 PTPRMP28827 1452 aa19.28■□□□□ 0.68
CLSTN3-211ENST00000541667 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa19.28■□□□□ 0.68
CLSTN3-211ENST00000541667 BCORL1Q5H9F3 1711 aa19.28■□□□□ 0.68
CLSTN3-211ENST00000541667 MAGI2Q86UL8 1455 aa19.27■□□□□ 0.67
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