RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539463.1

DENR-204, Transcript of density regulated re-initiation and release factor, humanhuman

TSL 2

Gene DENR, Length 671 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENR-204ENST00000539463 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.12■■■■■ 4.65
DENR-204ENST00000539463 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP44.07■■■■■ 4.65
DENR-204ENST00000539463 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa44.03■■■■■ 4.64
DENR-204ENST00000539463 TRHP20396 242 aaPredicted RBP43.9■■■■■ 4.62
DENR-204ENST00000539463 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa43.83■■■■■ 4.61
DENR-204ENST00000539463 IQGAP2Q13576 1575 aa43.67■■■■■ 4.58
DENR-204ENST00000539463 PRXQ9BXM0 1461 aa43.57■■■■■ 4.57
DENR-204ENST00000539463 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa43.56■■■■■ 4.56
DENR-204ENST00000539463 PTPRGP23470 1445 aa43.49■■■■■ 4.55
DENR-204ENST00000539463 TNIKQ9UKE5 1360 aa43.47■■■■■ 4.55
DENR-204ENST00000539463 CSRNP3Q8WYN3 585 aa43.46■■■■■ 4.55
DENR-204ENST00000539463 DISP1Q96F81 1524 aa43.44■■■■■ 4.54
DENR-204ENST00000539463 UGGT2Q9NYU1 1516 aa43.44■■■■■ 4.54
DENR-204ENST00000539463 ADCY10Q96PN6 1610 aa43.42■■■■■ 4.54
DENR-204ENST00000539463 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP43.42■■■■■ 4.54
DENR-204ENST00000539463 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP43.41■■■■■ 4.54
DENR-204ENST00000539463 EEA1Q15075 1411 aa43.35■■■■■ 4.53
DENR-204ENST00000539463 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa43.33■■■■■ 4.53
DENR-204ENST00000539463 CHIC1Q5VXU3 224 aa43.32■■■■■ 4.53
DENR-204ENST00000539463 KIAA0556O60303 1618 aa43.25■■■■■ 4.51
DENR-204ENST00000539463 MAPKBP1O60336 1514 aa43.23■■■■■ 4.51
DENR-204ENST00000539463 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP43.22■■■■■ 4.51
DENR-204ENST00000539463 UACAQ9BZF9 1416 aa43.17■■■■■ 4.5
DENR-204ENST00000539463 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa43.15■■■■■ 4.5
DENR-204ENST00000539463 GOLGA3Q08378 1498 aa43.15■■■■■ 4.5
DENR-204ENST00000539463 ABCC2Q92887 1545 aa43.14■■■■■ 4.5
DENR-204ENST00000539463 ABCC10Q5T3U5 1492 aa43.13■■■■■ 4.5
DENR-204ENST00000539463 KIF13AQ9H1H9 1805 aa43.12■■■■■ 4.49
DENR-204ENST00000539463 FAM69CQ0P6D2 419 aa43.09■■■■■ 4.49
DENR-204ENST00000539463 DIP2BQ9P265 1576 aa43■■■■■ 4.47
DENR-204ENST00000539463 KDM5BQ9UGL1 1544 aa42.95■■■■■ 4.47
DENR-204ENST00000539463 PLB1Q6P1J6 1458 aa42.94■■■■■ 4.46
DENR-204ENST00000539463 ASXL2Q76L83 1435 aa42.92■■■■■ 4.46
DENR-204ENST00000539463 KIF21BO75037 1637 aa42.92■■■■■ 4.46
DENR-204ENST00000539463 P3H3Q8IVL6 736 aa42.91■■■■■ 4.46
DENR-204ENST00000539463 ABCA8O94911 1581 aa42.84■■■■■ 4.45
DENR-204ENST00000539463 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP42.82■■■■■ 4.44
DENR-204ENST00000539463 SAMD9Q5K651 1589 aa42.82■■■■■ 4.44
DENR-204ENST00000539463 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP42.76■■■■■ 4.44
DENR-204ENST00000539463 EHMT2Q96KQ7 1210 aa42.7■■■■■ 4.43
DENR-204ENST00000539463 GLI2P10070 1586 aa42.69■■■■■ 4.43
DENR-204ENST00000539463 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP42.66■■■■■ 4.42
DENR-204ENST00000539463 UBTFP17480 764 aaKnown RBP42.65■■■■■ 4.42
DENR-204ENST00000539463 TSPOAP1O95153 1857 aa42.62■■■■■ 4.41
DENR-204ENST00000539463 WDR7Q9Y4E6 1490 aa42.62■■■■■ 4.41
DENR-204ENST00000539463 FHOD3Q2V2M9 1422 aa42.59■■■■■ 4.41
DENR-204ENST00000539463 ARID3CA6NKF2 412 aa42.55■■■■■ 4.4
DENR-204ENST00000539463 EFCAB5A4FU69 1503 aa42.53■■■■■ 4.4
DENR-204ENST00000539463 ATP10BO94823 1461 aa42.53■■■■■ 4.4
DENR-204ENST00000539463 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa42.49■■■■■ 4.39
DENR-204ENST00000539463 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa42.47■■■■■ 4.39
DENR-204ENST00000539463 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP42.47■■■■■ 4.39
DENR-204ENST00000539463 KCNH8Q96L42 1107 aa42.46■■■■■ 4.39
DENR-204ENST00000539463 KDM6BO15054 1643 aa42.42■■■■■ 4.38
DENR-204ENST00000539463 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP42.39■■■■■ 4.38
DENR-204ENST00000539463 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP42.32■■■■■ 4.37
DENR-204ENST00000539463 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP42.32■■■■■ 4.37
DENR-204ENST00000539463 TEX14Q8IWB6 1497 aa42.31■■■■■ 4.36
DENR-204ENST00000539463 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa42.3■■■■■ 4.36
DENR-204ENST00000539463 CD109Q6YHK3 1445 aa42.3■■■■■ 4.36
DENR-204ENST00000539463 CFAP43Q8NDM7 1665 aa42.25■■■■■ 4.35
DENR-204ENST00000539463 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa42.22■■■■■ 4.35
DENR-204ENST00000539463 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP42.2■■■■■ 4.35
DENR-204ENST00000539463 FMN1Q68DA7 1419 aa42.18■■■■■ 4.34
DENR-204ENST00000539463 PLEKHD1A6NEE1 506 aa42.13■■■■■ 4.33
DENR-204ENST00000539463 ABCA9Q8IUA7 1624 aa42.09■■■■■ 4.33
DENR-204ENST00000539463 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP42.05■■■■■ 4.32
DENR-204ENST00000539463 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP42.03■■■■■ 4.32
DENR-204ENST00000539463 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP42.01■■■■■ 4.32
DENR-204ENST00000539463 HECW1Q76N89 1606 aa41.98■■■■■ 4.31
DENR-204ENST00000539463 CLIP1P30622 1438 aa41.9■■■■■ 4.3
DENR-204ENST00000539463 ARAP3Q8WWN8 1544 aa41.88■■■■■ 4.29
DENR-204ENST00000539463 PHLDB1Q86UU1 1377 aa41.88■■■■■ 4.29
DENR-204ENST00000539463 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP41.85■■■■■ 4.29
DENR-204ENST00000539463 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP41.83■■■■■ 4.29
DENR-204ENST00000539463 NEO1Q92859 1461 aa41.83■■■■■ 4.29
DENR-204ENST00000539463 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa41.82■■■■■ 4.29
DENR-204ENST00000539463 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa41.78■■■■■ 4.28
DENR-204ENST00000539463 TTC37Q6PGP7 1564 aa41.76■■■■■ 4.28
DENR-204ENST00000539463 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP41.76■■■■■ 4.27
DENR-204ENST00000539463 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa41.75■■■■■ 4.27
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DENR-204ENST00000539463 FANCAO15360 1455 aa41.67■■■■■ 4.26
DENR-204ENST00000539463 CCDC18Q5T9S5 1454 aa41.66■■■■■ 4.26
DENR-204ENST00000539463 FYCO1Q9BQS8 1478 aa41.66■■■■■ 4.26
DENR-204ENST00000539463 AKNAQ7Z591 1439 aa41.64■■■■■ 4.26
DENR-204ENST00000539463 PLCH2O75038 1416 aa41.63■■■■■ 4.26
DENR-204ENST00000539463 KIF14Q15058 1648 aa41.61■■■■■ 4.25
DENR-204ENST00000539463 CEP162Q5TB80 1403 aa41.6■■■■■ 4.25
DENR-204ENST00000539463 CFAP74Q9C0B2 1584 aa41.59■■■■■ 4.25
DENR-204ENST00000539463 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa41.58■■■■■ 4.25
DENR-204ENST00000539463 ADGRL1O94910 1474 aa41.57■■■■■ 4.25
DENR-204ENST00000539463 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa41.54■■■■■ 4.24
DENR-204ENST00000539463 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP41.54■■■■■ 4.24
DENR-204ENST00000539463 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa41.49■■■■■ 4.23
DENR-204ENST00000539463 MYO5CQ9NQX4 1742 aa41.47■■■■■ 4.23
DENR-204ENST00000539463 RICTORQ6R327 1708 aa41.43■■■■■ 4.22
DENR-204ENST00000539463 SCAPERQ9BY12 1400 aa41.41■■■■■ 4.22
DENR-204ENST00000539463 ARHGAP5Q13017 1502 aa41.37■■■■■ 4.21
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