RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539463.1

DENR-204, Transcript of density regulated re-initiation and release factor, humanhuman

TSL 2

Gene DENR, Length 671 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENR-204ENST00000539463 NISCHQ9Y2I1 1504 aa63.47■■■■■ 7.75
DENR-204ENST00000539463 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa56.52■■■■■ 6.64
DENR-204ENST00000539463 ABCC9O60706 1549 aa55.84■■■■■ 6.53
DENR-204ENST00000539463 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa53.46■■■■■ 6.15
DENR-204ENST00000539463 NACADO15069 1562 aa53.31■■■■■ 6.12
DENR-204ENST00000539463 DCAF8L2P0C7V8 631 aa53.28■■■■■ 6.12
DENR-204ENST00000539463 MYO15BQ96JP2 1530 aa52.85■■■■■ 6.05
DENR-204ENST00000539463 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP52.75■■■■■ 6.04
DENR-204ENST00000539463 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa52.46■■■■■ 5.99
DENR-204ENST00000539463 UNC13AQ9UPW8 1703 aa52.2■■■■■ 5.95
DENR-204ENST00000539463 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP52.17■■■■■ 5.94
DENR-204ENST00000539463 BICRAQ9NZM4 1560 aa51.9■■■■■ 5.9
DENR-204ENST00000539463 DNAJC5BQ9UF47 199 aa51.75■■■■■ 5.87
DENR-204ENST00000539463 SCRIBQ14160 1630 aa51.59■■■■■ 5.85
DENR-204ENST00000539463 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa51.26■■■■■ 5.8
DENR-204ENST00000539463 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP50.55■■■■■ 5.68
DENR-204ENST00000539463 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa50.45■■■■■ 5.67
DENR-204ENST00000539463 CECR2Q9BXF3 1484 aa50.21■■■■■ 5.63
DENR-204ENST00000539463 SMARCA4P51532 1647 aa49.3■■■■■ 5.48
DENR-204ENST00000539463 NCAPD3P42695 1498 aa49.25■■■■■ 5.47
DENR-204ENST00000539463 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa49.19■■■■■ 5.47
DENR-204ENST00000539463 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP49.19■■■■■ 5.46
DENR-204ENST00000539463 SMARCA2P51531 1590 aa49.07■■■■■ 5.45
DENR-204ENST00000539463 MROH2BQ7Z745 1585 aa48.92■■■■■ 5.42
DENR-204ENST00000539463 HMGXB3Q12766 1538 aa48.9■■■■■ 5.42
DENR-204ENST00000539463 PEG3Q9GZU2 1588 aa48.83■■■■■ 5.41
DENR-204ENST00000539463 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP48.74■■■■■ 5.39
DENR-204ENST00000539463 WIZO95785 1651 aa48.33■■■■■ 5.33
DENR-204ENST00000539463 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP48.22■■■■■ 5.31
DENR-204ENST00000539463 NESP48681 1621 aa48.2■■■■■ 5.31
DENR-204ENST00000539463 ERCC6Q03468 1493 aa48.13■■■■■ 5.3
DENR-204ENST00000539463 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa47.96■■■■■ 5.27
DENR-204ENST00000539463 CADPSQ9ULU8 1353 aa47.79■■■■■ 5.24
DENR-204ENST00000539463 CUX2O14529 1486 aa47.78■■■■■ 5.24
DENR-204ENST00000539463 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.78■■■■■ 5.24
DENR-204ENST00000539463 PDS5BQ9NTI5 1447 aa47.69■■■■■ 5.22
DENR-204ENST00000539463 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa47.53■■■■■ 5.2
DENR-204ENST00000539463 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP47.49■■■■■ 5.19
DENR-204ENST00000539463 CFTRP13569 1480 aa47.4■■■■■ 5.18
DENR-204ENST00000539463 CCDC88BA6NC98 1476 aa47.28■■■■■ 5.16
DENR-204ENST00000539463 FANCD2Q9BXW9 1451 aa47.22■■■■■ 5.15
DENR-204ENST00000539463 MRC2Q9UBG0 1479 aa47.21■■■■■ 5.15
DENR-204ENST00000539463 CEP164Q9UPV0 1460 aa47.18■■■■■ 5.14
DENR-204ENST00000539463 WDR62O43379 1518 aa47.06■■■■■ 5.12
DENR-204ENST00000539463 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa46.92■■■■■ 5.1
DENR-204ENST00000539463 PRDM2Q13029 1718 aa46.86■■■■■ 5.09
DENR-204ENST00000539463 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP46.79■■■■■ 5.08
DENR-204ENST00000539463 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46.69■■■■■ 5.06
DENR-204ENST00000539463 TOPBP1Q92547 1522 aa46.41■■■■■ 5.02
DENR-204ENST00000539463 ABCC8Q09428 1581 aa46.37■■■■■ 5.01
DENR-204ENST00000539463 DNMBPQ6XZF7 1577 aa46.29■■■■■ 5
DENR-204ENST00000539463 IFT140Q96RY7 1462 aa46.22■■■■■ 4.99
DENR-204ENST00000539463 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP46.08■■■■■ 4.97
DENR-204ENST00000539463 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP46■■■■■ 4.95
DENR-204ENST00000539463 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP45.93■■■■■ 4.94
DENR-204ENST00000539463 CUX1P39880 1505 aa45.91■■■■■ 4.94
DENR-204ENST00000539463 SOGA1O94964 1423 aa45.83■■■■■ 4.93
DENR-204ENST00000539463 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa45.82■■■■■ 4.93
DENR-204ENST00000539463 FGD5Q6ZNL6 1462 aa45.81■■■■■ 4.92
DENR-204ENST00000539463 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP45.81■■■■■ 4.92
DENR-204ENST00000539463 OSCARQ8IYS5 282 aa45.8■■■■■ 4.92
DENR-204ENST00000539463 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP45.79■■■■■ 4.926e-9■■■■■ 45.1
DENR-204ENST00000539463 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP45.64■■■■■ 4.9
DENR-204ENST00000539463 WDR97A6NE52 1622 aa45.48■■■■■ 4.87
DENR-204ENST00000539463 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.44■■■■■ 4.87
DENR-204ENST00000539463 TOP2BQ02880 1626 aa45.36■■■■■ 4.85
DENR-204ENST00000539463 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa45.35■■■■■ 4.85
DENR-204ENST00000539463 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.34■■■■■ 4.85
DENR-204ENST00000539463 SYNJ1O43426 1573 aa45.33■■■■■ 4.85
DENR-204ENST00000539463 FBLN2P98095 1184 aa45.33■■■■■ 4.85
DENR-204ENST00000539463 GRIN2BQ13224 1484 aa45.31■■■■■ 4.84
DENR-204ENST00000539463 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa45.31■■■■■ 4.84
DENR-204ENST00000539463 CHD1O14646 1710 aa45.29■■■■■ 4.84
DENR-204ENST00000539463 GAPVD1Q14C86 1478 aa45.27■■■■■ 4.84
DENR-204ENST00000539463 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP45.22■■■■■ 4.83
DENR-204ENST00000539463 TRIM41Q8WV44 630 aa45.18■■■■■ 4.82
DENR-204ENST00000539463 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa45.17■■■■■ 4.82
DENR-204ENST00000539463 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP45.14■■■■■ 4.82
DENR-204ENST00000539463 PBRM1Q86U86 1689 aa45.11■■■■■ 4.81
DENR-204ENST00000539463 SYNJ2O15056 1496 aa45.06■■■■■ 4.8
DENR-204ENST00000539463 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa45.03■■■■■ 4.8
DENR-204ENST00000539463 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa45.03■■■■■ 4.8
DENR-204ENST00000539463 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa45.03■■■■■ 4.8
DENR-204ENST00000539463 ARHGEF11O15085 1522 aa44.99■■■■■ 4.79
DENR-204ENST00000539463 CLASP1Q7Z460 1538 aa44.85■■■■■ 4.77
DENR-204ENST00000539463 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.77■■■■■ 4.76
DENR-204ENST00000539463 ADAMTS12P58397 1594 aa44.77■■■■■ 4.76
DENR-204ENST00000539463 FHAD1B1AJZ9 1412 aa44.73■■■■■ 4.75
DENR-204ENST00000539463 GRIN2AQ12879 1464 aa44.72■■■■■ 4.75
DENR-204ENST00000539463 CYB5RLQ6IPT4 315 aa44.68■■■■■ 4.74
DENR-204ENST00000539463 ARAP1Q96P48 1450 aa44.61■■■■■ 4.73
DENR-204ENST00000539463 NUP160Q12769 1436 aa44.56■■■■■ 4.72
DENR-204ENST00000539463 KIF27Q86VH2 1401 aa44.53■■■■■ 4.72
DENR-204ENST00000539463 CEP170Q5SW79 1584 aa44.52■■■■■ 4.72
DENR-204ENST00000539463 IGF1RP08069 1367 aa44.46■■■■■ 4.71
DENR-204ENST00000539463 CUL7Q14999 1698 aa44.24■■■■■ 4.67
DENR-204ENST00000539463 ERCC6L2Q5T890 1561 aa44.23■■■■■ 4.67
DENR-204ENST00000539463 SHROOM2Q13796 1616 aa44.23■■■■■ 4.67
DENR-204ENST00000539463 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa44.17■■■■■ 4.66
DENR-204ENST00000539463 JPH4Q96JJ6 628 aa44.15■■■■■ 4.66
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