RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536420.5

ACVR1B-204, Transcript of activin A receptor type 1B, humanhuman

TSL 4

Gene ACVR1B, Length 539 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1B-204ENST00000536420 IGF1RP08069 1367 aa42.1■■■■■ 4.33
ACVR1B-204ENST00000536420 CUL7Q14999 1698 aa42.08■■■■■ 4.33
ACVR1B-204ENST00000536420 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa42■■■■■ 4.31
ACVR1B-204ENST00000536420 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP41.86■■■■■ 4.29
ACVR1B-204ENST00000536420 KIF13AQ9H1H9 1805 aa41.84■■■■■ 4.29
ACVR1B-204ENST00000536420 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.84■■■■■ 4.29
ACVR1B-204ENST00000536420 MAPKBP1O60336 1514 aa41.73■■■■■ 4.27
ACVR1B-204ENST00000536420 ADCY10Q96PN6 1610 aa41.71■■■■■ 4.27
ACVR1B-204ENST00000536420 ABCC10Q5T3U5 1492 aa41.68■■■■■ 4.26
ACVR1B-204ENST00000536420 FAM69CQ0P6D2 419 aa41.63■■■■■ 4.25
ACVR1B-204ENST00000536420 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP41.63■■■■■ 4.25
ACVR1B-204ENST00000536420 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa41.62■■■■■ 4.25
ACVR1B-204ENST00000536420 PTPRGP23470 1445 aa41.6■■■■■ 4.25
ACVR1B-204ENST00000536420 IQGAP2Q13576 1575 aa41.57■■■■■ 4.25
ACVR1B-204ENST00000536420 DIP2BQ9P265 1576 aa41.54■■■■■ 4.24
ACVR1B-204ENST00000536420 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.52■■■■■ 4.24
ACVR1B-204ENST00000536420 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.47■■■■■ 4.23
ACVR1B-204ENST00000536420 ABCC2Q92887 1545 aa41.37■■■■■ 4.21
ACVR1B-204ENST00000536420 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP41.37■■■■■ 4.21
ACVR1B-204ENST00000536420 DISP1Q96F81 1524 aa41.34■■■■■ 4.21
ACVR1B-204ENST00000536420 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa41.33■■■■■ 4.21
ACVR1B-204ENST00000536420 UGGT2Q9NYU1 1516 aa41.31■■■■■ 4.2
ACVR1B-204ENST00000536420 UACAQ9BZF9 1416 aa41.27■■■■■ 4.2
ACVR1B-204ENST00000536420 TSPOAP1O95153 1857 aa41.26■■■■■ 4.19
ACVR1B-204ENST00000536420 PLB1Q6P1J6 1458 aa41.25■■■■■ 4.19
ACVR1B-204ENST00000536420 ASXL2Q76L83 1435 aa41.2■■■■■ 4.19
ACVR1B-204ENST00000536420 KDM6BO15054 1643 aa41.2■■■■■ 4.19
ACVR1B-204ENST00000536420 KIAA0556O60303 1618 aa41.17■■■■■ 4.18
ACVR1B-204ENST00000536420 GLI2P10070 1586 aa41.15■■■■■ 4.18
ACVR1B-204ENST00000536420 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa41.14■■■■■ 4.18
ACVR1B-204ENST00000536420 KDM5BQ9UGL1 1544 aa41.12■■■■■ 4.17
ACVR1B-204ENST00000536420 GOLGA3Q08378 1498 aa41.04■■■■■ 4.16
ACVR1B-204ENST00000536420 PRXQ9BXM0 1461 aa41.02■■■■■ 4.16
ACVR1B-204ENST00000536420 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP40.99■■■■■ 4.15
ACVR1B-204ENST00000536420 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP40.95■■■■■ 4.15
ACVR1B-204ENST00000536420 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP40.95■■■■■ 4.15
ACVR1B-204ENST00000536420 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa40.89■■■■■ 4.14
ACVR1B-204ENST00000536420 TEX14Q8IWB6 1497 aa40.83■■■■■ 4.13
ACVR1B-204ENST00000536420 WDR7Q9Y4E6 1490 aa40.82■■■■■ 4.12
ACVR1B-204ENST00000536420 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP40.81■■■■■ 4.12
ACVR1B-204ENST00000536420 ABCA8O94911 1581 aa40.79■■■■■ 4.12
ACVR1B-204ENST00000536420 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa40.74■■■■■ 4.11
ACVR1B-204ENST00000536420 CSRNP3Q8WYN3 585 aa40.74■■■■■ 4.11
ACVR1B-204ENST00000536420 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP40.64■■■■■ 4.1
ACVR1B-204ENST00000536420 CFAP43Q8NDM7 1665 aa40.63■■■■■ 4.1
ACVR1B-204ENST00000536420 EEA1Q15075 1411 aa40.62■■■■■ 4.09
ACVR1B-204ENST00000536420 CD109Q6YHK3 1445 aa40.59■■■■■ 4.09
ACVR1B-204ENST00000536420 KCNH8Q96L42 1107 aa40.58■■■■■ 4.09
ACVR1B-204ENST00000536420 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa40.57■■■■■ 4.09
ACVR1B-204ENST00000536420 SAMD9Q5K651 1589 aa40.52■■■■■ 4.08
ACVR1B-204ENST00000536420 P3H3Q8IVL6 736 aa40.52■■■■■ 4.08
ACVR1B-204ENST00000536420 ATP10BO94823 1461 aa40.45■■■■■ 4.07
ACVR1B-204ENST00000536420 ADGRL1O94910 1474 aa40.43■■■■■ 4.06
ACVR1B-204ENST00000536420 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa40.38■■■■■ 4.05
ACVR1B-204ENST00000536420 ARID3CA6NKF2 412 aa40.33■■■■■ 4.05
ACVR1B-204ENST00000536420 ABCA9Q8IUA7 1624 aa40.29■■■■■ 4.04
ACVR1B-204ENST00000536420 PHLDB1Q86UU1 1377 aa40.28■■■■■ 4.04
ACVR1B-204ENST00000536420 ARAP3Q8WWN8 1544 aa40.27■■■■■ 4.04
ACVR1B-204ENST00000536420 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP40.24■■■■■ 4.03
ACVR1B-204ENST00000536420 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP40.24■■■■■ 4.03
ACVR1B-204ENST00000536420 KIF21BO75037 1637 aa40.24■■■■■ 4.03
ACVR1B-204ENST00000536420 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP40.19■■■■■ 4.03
ACVR1B-204ENST00000536420 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP40.19■■■■■ 4.02
ACVR1B-204ENST00000536420 FHOD3Q2V2M9 1422 aa40.17■■■■■ 4.02
ACVR1B-204ENST00000536420 EFCAB5A4FU69 1503 aa40.16■■■■■ 4.02
ACVR1B-204ENST00000536420 NEO1Q92859 1461 aa40.12■■■■■ 4.01
ACVR1B-204ENST00000536420 PLEKHD1A6NEE1 506 aa40.08■■■■■ 4.01
ACVR1B-204ENST00000536420 RAPGEF3O95398 923 aa39.94■■■■□ 3.98
ACVR1B-204ENST00000536420 UBTFP17480 764 aaKnown RBP39.93■■■■□ 3.98
ACVR1B-204ENST00000536420 CHIC1Q5VXU3 224 aa39.91■■■■□ 3.98
ACVR1B-204ENST00000536420 HECW2Q9P2P5 1572 aa39.86■■■■□ 3.97
ACVR1B-204ENST00000536420 CFAP74Q9C0B2 1584 aa39.85■■■■□ 3.97
ACVR1B-204ENST00000536420 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP39.84■■■■□ 3.97
ACVR1B-204ENST00000536420 FMN1Q68DA7 1419 aa39.83■■■■□ 3.97
ACVR1B-204ENST00000536420 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa39.82■■■■□ 3.97
ACVR1B-204ENST00000536420 AKNAQ7Z591 1439 aa39.8■■■■□ 3.96
ACVR1B-204ENST00000536420 FANCAO15360 1455 aa39.8■■■■□ 3.96
ACVR1B-204ENST00000536420 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP39.8■■■■□ 3.96
ACVR1B-204ENST00000536420 ADAMTSL3P82987 1691 aa39.75■■■■□ 3.95
ACVR1B-204ENST00000536420 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP39.75■■■■□ 3.95
ACVR1B-204ENST00000536420 RICTORQ6R327 1708 aa39.74■■■■□ 3.95
ACVR1B-204ENST00000536420 TTC37Q6PGP7 1564 aa39.74■■■■□ 3.95
ACVR1B-204ENST00000536420 HECW1Q76N89 1606 aa39.73■■■■□ 3.95
ACVR1B-204ENST00000536420 EHMT2Q96KQ7 1210 aa39.73■■■■□ 3.95
ACVR1B-204ENST00000536420 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa39.73■■■■□ 3.95
ACVR1B-204ENST00000536420 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP39.71■■■■□ 3.95
ACVR1B-204ENST00000536420 BCORL1Q5H9F3 1711 aa39.68■■■■□ 3.94
ACVR1B-204ENST00000536420 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP39.67■■■■□ 3.94
ACVR1B-204ENST00000536420 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP39.67■■■■□ 3.94
ACVR1B-204ENST00000536420 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa39.65■■■■□ 3.94
ACVR1B-204ENST00000536420 PTPRMP28827 1452 aa39.65■■■■□ 3.94
ACVR1B-204ENST00000536420 PLCH2O75038 1416 aa39.64■■■■□ 3.94
ACVR1B-204ENST00000536420 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa39.61■■■■□ 3.93
ACVR1B-204ENST00000536420 MAGI2Q86UL8 1455 aa39.59■■■■□ 3.93
ACVR1B-204ENST00000536420 MYO5CQ9NQX4 1742 aa39.54■■■■□ 3.92
ACVR1B-204ENST00000536420 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa39.53■■■■□ 3.92
ACVR1B-204ENST00000536420 MADDQ8WXG6 1647 aa39.53■■■■□ 3.92
ACVR1B-204ENST00000536420 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa39.52■■■■□ 3.92
ACVR1B-204ENST00000536420 SCAPERQ9BY12 1400 aa39.52■■■■□ 3.92
ACVR1B-204ENST00000536420 POGZQ7Z3K3 1410 aa39.51■■■■□ 3.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms