RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536420.5

ACVR1B-204, Transcript of activin A receptor type 1B, humanhuman

TSL 4

Gene ACVR1B, Length 539 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1B-204ENST00000536420 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.28■■■■■ 7.24
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ACVR1B-204ENST00000536420 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa51.49■■■■■ 5.83
ACVR1B-204ENST00000536420 NACADO15069 1562 aa51.18■■■■■ 5.78
ACVR1B-204ENST00000536420 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.81■■■■■ 5.72
ACVR1B-204ENST00000536420 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.55■■■■■ 5.68
ACVR1B-204ENST00000536420 DNAJC5BQ9UF47 199 aa50.5■■■■■ 5.67
ACVR1B-204ENST00000536420 UNC13AQ9UPW8 1703 aa50.28■■■■■ 5.64
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ACVR1B-204ENST00000536420 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.95■■■■■ 5.59
ACVR1B-204ENST00000536420 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.9■■■■■ 5.58
ACVR1B-204ENST00000536420 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.89■■■■■ 5.58
ACVR1B-204ENST00000536420 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.41■■■■■ 5.5
ACVR1B-204ENST00000536420 SCRIBQ14160 1630 aa49.19■■■■■ 5.46
ACVR1B-204ENST00000536420 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48.77■■■■■ 5.4
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ACVR1B-204ENST00000536420 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.63■■■■■ 5.38
ACVR1B-204ENST00000536420 NCAPD3P42695 1498 aa47.22■■■■■ 5.15
ACVR1B-204ENST00000536420 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa47.03■■■■■ 5.12
ACVR1B-204ENST00000536420 SMARCA4P51532 1647 aa47■■■■■ 5.11
ACVR1B-204ENST00000536420 SMARCA2P51531 1590 aa46.98■■■■■ 5.11
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ACVR1B-204ENST00000536420 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.61■■■■■ 5.05
ACVR1B-204ENST00000536420 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.6■■■■■ 5.05
ACVR1B-204ENST00000536420 CUX2O14529 1486 aa46.58■■■■■ 5.05
ACVR1B-204ENST00000536420 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa46.48■■■■■ 5.03
ACVR1B-204ENST00000536420 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.38■■■■■ 5.01
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ACVR1B-204ENST00000536420 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa46.17■■■■■ 4.98
ACVR1B-204ENST00000536420 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.9■■■■■ 4.94
ACVR1B-204ENST00000536420 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.9■■■■■ 4.94
ACVR1B-204ENST00000536420 WIZO95785 1651 aa45.83■■■■■ 4.93
ACVR1B-204ENST00000536420 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.79■■■■■ 4.92
ACVR1B-204ENST00000536420 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.77■■■■■ 4.92
ACVR1B-204ENST00000536420 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.48■■■■■ 4.87
ACVR1B-204ENST00000536420 MRC2Q9UBG0 1479 aa45.44■■■■■ 4.87
ACVR1B-204ENST00000536420 WDR62O43379 1518 aa45.32■■■■■ 4.85
ACVR1B-204ENST00000536420 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.31■■■■■ 4.84
ACVR1B-204ENST00000536420 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.28■■■■■ 4.84
ACVR1B-204ENST00000536420 CFTRP13569 1480 aa45.25■■■■■ 4.83
ACVR1B-204ENST00000536420 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.22■■■■■ 4.83
ACVR1B-204ENST00000536420 PRDM2Q13029 1718 aa44.87■■■■■ 4.77
ACVR1B-204ENST00000536420 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.8■■■■■ 4.76
ACVR1B-204ENST00000536420 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.78■■■■■ 4.76
ACVR1B-204ENST00000536420 OSCARQ8IYS5 282 aa44.49■■■■■ 4.71
ACVR1B-204ENST00000536420 ABCC8Q09428 1581 aa44.42■■■■■ 4.7
ACVR1B-204ENST00000536420 IFT140Q96RY7 1462 aa44.4■■■■■ 4.7
ACVR1B-204ENST00000536420 TOPBP1Q92547 1522 aa44.36■■■■■ 4.69
ACVR1B-204ENST00000536420 TRIM41Q8WV44 630 aa44.36■■■■■ 4.69
ACVR1B-204ENST00000536420 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.23■■■■■ 4.67
ACVR1B-204ENST00000536420 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44.21■■■■■ 4.67
ACVR1B-204ENST00000536420 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP44.01■■■■■ 4.64
ACVR1B-204ENST00000536420 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.97■■■■■ 4.63
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ACVR1B-204ENST00000536420 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa43.81■■■■■ 4.6
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ACVR1B-204ENST00000536420 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.81■■■■■ 4.6
ACVR1B-204ENST00000536420 SOGA1O94964 1423 aa43.74■■■■■ 4.59
ACVR1B-204ENST00000536420 CHD1O14646 1710 aa43.69■■■■■ 4.58
ACVR1B-204ENST00000536420 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.69■■■■■ 4.58
ACVR1B-204ENST00000536420 ARHGEF11O15085 1522 aa43.68■■■■■ 4.58
ACVR1B-204ENST00000536420 WDR97A6NE52 1622 aa43.66■■■■■ 4.58
ACVR1B-204ENST00000536420 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.63■■■■■ 4.57
ACVR1B-204ENST00000536420 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.59■■■■■ 4.57
ACVR1B-204ENST00000536420 CUX1P39880 1505 aa43.58■■■■■ 4.57
ACVR1B-204ENST00000536420 FBLN2P98095 1184 aa43.57■■■■■ 4.57
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ACVR1B-204ENST00000536420 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP43.38■■■■■ 4.54
ACVR1B-204ENST00000536420 CYB5RLQ6IPT4 315 aa43.37■■■■■ 4.53
ACVR1B-204ENST00000536420 GRIN2BQ13224 1484 aa43.37■■■■■ 4.53
ACVR1B-204ENST00000536420 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.33■■■■■ 4.53
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ACVR1B-204ENST00000536420 SYNJ2O15056 1496 aa43.22■■■■■ 4.51
ACVR1B-204ENST00000536420 ARAP1Q96P48 1450 aa43.22■■■■■ 4.51
ACVR1B-204ENST00000536420 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.21■■■■■ 4.51
ACVR1B-204ENST00000536420 CLASP1Q7Z460 1538 aa43.19■■■■■ 4.5
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ACVR1B-204ENST00000536420 PBRM1Q86U86 1689 aa43.17■■■■■ 4.5
ACVR1B-204ENST00000536420 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.08■■■■■ 4.49
ACVR1B-204ENST00000536420 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.05■■■■■ 4.48
ACVR1B-204ENST00000536420 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.97■■■■■ 4.47
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ACVR1B-204ENST00000536420 TRHP20396 242 aaPredicted RBP42.88■■■■■ 4.45
ACVR1B-204ENST00000536420 GRIN2AQ12879 1464 aa42.79■■■■■ 4.44
ACVR1B-204ENST00000536420 ADAMTS12P58397 1594 aa42.73■■■■■ 4.43
ACVR1B-204ENST00000536420 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.69■■■■■ 4.42
ACVR1B-204ENST00000536420 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.68■■■■■ 4.42
ACVR1B-204ENST00000536420 NUP160Q12769 1436 aa42.64■■■■■ 4.42
ACVR1B-204ENST00000536420 CEP170Q5SW79 1584 aa42.58■■■■■ 4.41
ACVR1B-204ENST00000536420 SHROOM2Q13796 1616 aa42.46■■■■■ 4.39
ACVR1B-204ENST00000536420 ERCC6L2Q5T890 1561 aa42.44■■■■■ 4.38
ACVR1B-204ENST00000536420 JPH4Q96JJ6 628 aa42.24■■■■■ 4.35
ACVR1B-204ENST00000536420 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP42.22■■■■■ 4.35
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ACVR1B-204ENST00000536420 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.14■■■■■ 4.34
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