RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534219.5

PTPRJ-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRJ, Length 546 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-206ENST00000534219 CUL7Q14999 1698 aa42.89■■■■■ 4.46
PTPRJ-206ENST00000534219 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.87■■■■■ 4.45
PTPRJ-206ENST00000534219 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.83■■■■■ 4.45
PTPRJ-206ENST00000534219 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa42.77■■■■■ 4.44
PTPRJ-206ENST00000534219 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP42.47■■■■■ 4.39
PTPRJ-206ENST00000534219 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.47■■■■■ 4.39
PTPRJ-206ENST00000534219 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP42.41■■■■■ 4.38
PTPRJ-206ENST00000534219 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa42.39■■■■■ 4.38
PTPRJ-206ENST00000534219 IQGAP2Q13576 1575 aa42.39■■■■■ 4.38
PTPRJ-206ENST00000534219 PTPRGP23470 1445 aa42.36■■■■■ 4.37
PTPRJ-206ENST00000534219 TNIKQ9UKE5 1360 aa42.3■■■■■ 4.36
PTPRJ-206ENST00000534219 ADCY10Q96PN6 1610 aa42.29■■■■■ 4.36
PTPRJ-206ENST00000534219 FAM69CQ0P6D2 419 aa42.18■■■■■ 4.34
PTPRJ-206ENST00000534219 MAPKBP1O60336 1514 aa42.17■■■■■ 4.34
PTPRJ-206ENST00000534219 DISP1Q96F81 1524 aa42.17■■■■■ 4.34
PTPRJ-206ENST00000534219 UGGT2Q9NYU1 1516 aa42.13■■■■■ 4.33
PTPRJ-206ENST00000534219 ABCC10Q5T3U5 1492 aa42.12■■■■■ 4.33
PTPRJ-206ENST00000534219 PRXQ9BXM0 1461 aa42.11■■■■■ 4.33
PTPRJ-206ENST00000534219 KIF13AQ9H1H9 1805 aa42.09■■■■■ 4.33
PTPRJ-206ENST00000534219 UACAQ9BZF9 1416 aa42.02■■■■■ 4.32
PTPRJ-206ENST00000534219 ABCC2Q92887 1545 aa42■■■■■ 4.31
PTPRJ-206ENST00000534219 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.99■■■■■ 4.31
PTPRJ-206ENST00000534219 KIAA0556O60303 1618 aa41.98■■■■■ 4.31
PTPRJ-206ENST00000534219 DIP2BQ9P265 1576 aa41.97■■■■■ 4.31
PTPRJ-206ENST00000534219 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa41.96■■■■■ 4.31
PTPRJ-206ENST00000534219 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa41.96■■■■■ 4.31
PTPRJ-206ENST00000534219 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP41.89■■■■■ 4.3
PTPRJ-206ENST00000534219 GOLGA3Q08378 1498 aa41.89■■■■■ 4.3
PTPRJ-206ENST00000534219 ASXL2Q76L83 1435 aa41.86■■■■■ 4.29
PTPRJ-206ENST00000534219 PLB1Q6P1J6 1458 aa41.81■■■■■ 4.28
PTPRJ-206ENST00000534219 EEA1Q15075 1411 aa41.81■■■■■ 4.28
PTPRJ-206ENST00000534219 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.8■■■■■ 4.28
PTPRJ-206ENST00000534219 KDM5BQ9UGL1 1544 aa41.77■■■■■ 4.28
PTPRJ-206ENST00000534219 P3H3Q8IVL6 736 aa41.69■■■■■ 4.26
PTPRJ-206ENST00000534219 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP41.65■■■■■ 4.26
PTPRJ-206ENST00000534219 TSPOAP1O95153 1857 aa41.64■■■■■ 4.26
PTPRJ-206ENST00000534219 GLI2P10070 1586 aa41.6■■■■■ 4.25
PTPRJ-206ENST00000534219 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.58■■■■■ 4.25
PTPRJ-206ENST00000534219 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP41.57■■■■■ 4.25
PTPRJ-206ENST00000534219 ABCA8O94911 1581 aa41.57■■■■■ 4.25
PTPRJ-206ENST00000534219 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP41.56■■■■■ 4.24
PTPRJ-206ENST00000534219 KDM6BO15054 1643 aa41.55■■■■■ 4.24
PTPRJ-206ENST00000534219 WDR7Q9Y4E6 1490 aa41.49■■■■■ 4.23
PTPRJ-206ENST00000534219 ARID3CA6NKF2 412 aa41.45■■■■■ 4.23
PTPRJ-206ENST00000534219 KCNH8Q96L42 1107 aa41.44■■■■■ 4.22
PTPRJ-206ENST00000534219 SAMD9Q5K651 1589 aa41.43■■■■■ 4.22
PTPRJ-206ENST00000534219 EHMT2Q96KQ7 1210 aa41.38■■■■■ 4.21
PTPRJ-206ENST00000534219 KIF21BO75037 1637 aa41.37■■■■■ 4.21
PTPRJ-206ENST00000534219 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP41.37■■■■■ 4.21
PTPRJ-206ENST00000534219 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa41.36■■■■■ 4.21
PTPRJ-206ENST00000534219 TEX14Q8IWB6 1497 aa41.32■■■■■ 4.2
PTPRJ-206ENST00000534219 ATP10BO94823 1461 aa41.29■■■■■ 4.2
PTPRJ-206ENST00000534219 FHOD3Q2V2M9 1422 aa41.29■■■■■ 4.2
PTPRJ-206ENST00000534219 UBTFP17480 764 aaKnown RBP41.27■■■■■ 4.2
PTPRJ-206ENST00000534219 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP41.25■■■■■ 4.19
PTPRJ-206ENST00000534219 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP41.25■■■■■ 4.19
PTPRJ-206ENST00000534219 CD109Q6YHK3 1445 aa41.25■■■■■ 4.19
PTPRJ-206ENST00000534219 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa41.22■■■■■ 4.19
PTPRJ-206ENST00000534219 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP41.18■■■■■ 4.18
PTPRJ-206ENST00000534219 EFCAB5A4FU69 1503 aa41.14■■■■■ 4.18
PTPRJ-206ENST00000534219 CFAP43Q8NDM7 1665 aa41.13■■■■■ 4.17
PTPRJ-206ENST00000534219 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa41.13■■■■■ 4.17
PTPRJ-206ENST00000534219 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP41.1■■■■■ 4.17
PTPRJ-206ENST00000534219 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa41.01■■■■■ 4.16
PTPRJ-206ENST00000534219 PLEKHD1A6NEE1 506 aa40.96■■■■■ 4.15
PTPRJ-206ENST00000534219 ABCA9Q8IUA7 1624 aa40.91■■■■■ 4.14
PTPRJ-206ENST00000534219 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP40.89■■■■■ 4.14
PTPRJ-206ENST00000534219 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa40.87■■■■■ 4.13
PTPRJ-206ENST00000534219 FMN1Q68DA7 1419 aa40.84■■■■■ 4.13
PTPRJ-206ENST00000534219 PHLDB1Q86UU1 1377 aa40.79■■■■■ 4.12
PTPRJ-206ENST00000534219 ARAP3Q8WWN8 1544 aa40.78■■■■■ 4.12
PTPRJ-206ENST00000534219 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP40.77■■■■■ 4.12
PTPRJ-206ENST00000534219 ADGRL1O94910 1474 aa40.75■■■■■ 4.11
PTPRJ-206ENST00000534219 NEO1Q92859 1461 aa40.71■■■■■ 4.11
PTPRJ-206ENST00000534219 RAPGEF3O95398 923 aa40.68■■■■■ 4.1
PTPRJ-206ENST00000534219 HECW1Q76N89 1606 aa40.67■■■■■ 4.1
PTPRJ-206ENST00000534219 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP40.64■■■■■ 4.1
PTPRJ-206ENST00000534219 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP40.63■■■■■ 4.09
PTPRJ-206ENST00000534219 FANCAO15360 1455 aa40.55■■■■■ 4.08
PTPRJ-206ENST00000534219 TTC37Q6PGP7 1564 aa40.55■■■■■ 4.08
PTPRJ-206ENST00000534219 AKNAQ7Z591 1439 aa40.53■■■■■ 4.08
PTPRJ-206ENST00000534219 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP40.47■■■■■ 4.07
PTPRJ-206ENST00000534219 CFAP74Q9C0B2 1584 aa40.45■■■■■ 4.07
PTPRJ-206ENST00000534219 PLCH2O75038 1416 aa40.43■■■■■ 4.06
PTPRJ-206ENST00000534219 CLIP1P30622 1438 aa40.43■■■■■ 4.06
PTPRJ-206ENST00000534219 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa40.43■■■■■ 4.06
PTPRJ-206ENST00000534219 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa40.42■■■■■ 4.06
PTPRJ-206ENST00000534219 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP40.42■■■■■ 4.06
PTPRJ-206ENST00000534219 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP40.37■■■■■ 4.05
PTPRJ-206ENST00000534219 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa40.35■■■■■ 4.05
PTPRJ-206ENST00000534219 KIF14Q15058 1648 aa40.34■■■■■ 4.05
PTPRJ-206ENST00000534219 CCDC18Q5T9S5 1454 aa40.33■■■■■ 4.05
PTPRJ-206ENST00000534219 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP40.33■■■■■ 4.05
PTPRJ-206ENST00000534219 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa40.32■■■■■ 4.05
PTPRJ-206ENST00000534219 SCAPERQ9BY12 1400 aa40.3■■■■■ 4.04
PTPRJ-206ENST00000534219 RICTORQ6R327 1708 aa40.28■■■■■ 4.04
PTPRJ-206ENST00000534219 FYCO1Q9BQS8 1478 aa40.26■■■■■ 4.04
PTPRJ-206ENST00000534219 MYO5CQ9NQX4 1742 aa40.24■■■■■ 4.03
PTPRJ-206ENST00000534219 ARHGAP5Q13017 1502 aa40.21■■■■■ 4.03
PTPRJ-206ENST00000534219 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa40.21■■■■■ 4.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms