RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533873.1

ACER3-213, Transcript of alkaline ceramidase 3, human

TSL 2 BASIC

Gene ACER3, Length 929 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACER3-213	ENST00000533873	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	12.12	□□□□□ -0.47
ACER3-213	ENST00000533873	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	12.1	□□□□□ -0.47
ACER3-213	ENST00000533873	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		12.08	□□□□□ -0.47
ACER3-213	ENST00000533873	SOGA1	O94964	1423 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ACER3-213	ENST00000533873	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
ACER3-213	ENST00000533873	CUX1	P39880	1505 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ACER3-213	ENST00000533873	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		12.06	□□□□□ -0.48
ACER3-213	ENST00000533873	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
ACER3-213	ENST00000533873	WDR97	A6NE52	1622 aa		12.05	□□□□□ -0.48
ACER3-213	ENST00000533873	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
ACER3-213	ENST00000533873	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		12.03	□□□□□ -0.48
ACER3-213	ENST00000533873	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	12.02	□□□□□ -0.48	2e-12	■■■■■ 32.2
ACER3-213	ENST00000533873	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	12.02	□□□□□ -0.49
ACER3-213	ENST00000533873	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
ACER3-213	ENST00000533873	GRIN2B	Q13224	1484 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ACER3-213	ENST00000533873	FBLN2	P98095	1184 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ACER3-213	ENST00000533873	TOP2B	Q02880	1626 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ACER3-213	ENST00000533873	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		11.96	□□□□□ -0.49
ACER3-213	ENST00000533873	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
ACER3-213	ENST00000533873	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		11.95	□□□□□ -0.5
ACER3-213	ENST00000533873	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		11.95	□□□□□ -0.5
ACER3-213	ENST00000533873	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		11.94	□□□□□ -0.5
ACER3-213	ENST00000533873	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
ACER3-213	ENST00000533873	SYNJ1	O43426	1573 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ACER3-213	ENST00000533873	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
ACER3-213	ENST00000533873	SYNJ2	O15056	1496 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ACER3-213	ENST00000533873	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ACER3-213	ENST00000533873	CHD1	O14646	1710 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ACER3-213	ENST00000533873	TRIM41	Q8WV44	630 aa		11.87	□□□□□ -0.51
ACER3-213	ENST00000533873	PBRM1	Q86U86	1689 aa		11.87	□□□□□ -0.51
ACER3-213	ENST00000533873	POTEH	Q6S545	545 aa		11.85	□□□□□ -0.51
ACER3-213	ENST00000533873	AKT1S1	Q96B36	256 aa		11.85	□□□□□ -0.51
ACER3-213	ENST00000533873	ARHGEF11	O15085	1522 aa		11.85	□□□□□ -0.51
ACER3-213	ENST00000533873	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		11.83	□□□□□ -0.52
ACER3-213	ENST00000533873	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		11.82	□□□□□ -0.52
ACER3-213	ENST00000533873	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		11.82	□□□□□ -0.52
ACER3-213	ENST00000533873	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		11.82	□□□□□ -0.52
ACER3-213	ENST00000533873	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		11.82	□□□□□ -0.52
ACER3-213	ENST00000533873	ADAMTS12	P58397	1594 aa		11.82	□□□□□ -0.52
ACER3-213	ENST00000533873	GRIN2A	Q12879	1464 aa		11.81	□□□□□ -0.52
ACER3-213	ENST00000533873	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		11.81	□□□□□ -0.52
ACER3-213	ENST00000533873	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		11.8	□□□□□ -0.52
ACER3-213	ENST00000533873	SPDYE6	P0CI01	402 aa		11.8	□□□□□ -0.52
ACER3-213	ENST00000533873	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		11.8	□□□□□ -0.52
ACER3-213	ENST00000533873	KIF27	Q86VH2	1401 aa		11.79	□□□□□ -0.52
ACER3-213	ENST00000533873	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
ACER3-213	ENST00000533873	NUP160	Q12769	1436 aa		11.75	□□□□□ -0.53
ACER3-213	ENST00000533873	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		11.74	□□□□□ -0.53
ACER3-213	ENST00000533873	ARAP1	Q96P48	1450 aa		11.74	□□□□□ -0.53
ACER3-213	ENST00000533873	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
ACER3-213	ENST00000533873	CUL7	Q14999	1698 aa		11.71	□□□□□ -0.54
ACER3-213	ENST00000533873	CEP170	Q5SW79	1584 aa		11.71	□□□□□ -0.54
ACER3-213	ENST00000533873	CHRDL2	Q6WN34	429 aa		11.7	□□□□□ -0.54
ACER3-213	ENST00000533873	IGF1R	P08069	1367 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ACER3-213	ENST00000533873	SSUH2	Q9Y2M2	353 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ACER3-213	ENST00000533873	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ACER3-213	ENST00000533873	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ACER3-213	ENST00000533873	SHROOM2	Q13796	1616 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ACER3-213	ENST00000533873	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ACER3-213	ENST00000533873	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ACER3-213	ENST00000533873	PITPNM1	O00562	1244 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ACER3-213	ENST00000533873	JPH4	Q96JJ6	628 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ACER3-213	ENST00000533873	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		11.58	□□□□□ -0.55
ACER3-213	ENST00000533873	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		11.58	□□□□□ -0.56
ACER3-213	ENST00000533873	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		11.55	□□□□□ -0.56
ACER3-213	ENST00000533873	IQGAP2	Q13576	1575 aa		11.54	□□□□□ -0.56
ACER3-213	ENST00000533873	SPDYE1	Q8NFV5	336 aa	Predicted RBP	11.53	□□□□□ -0.56
ACER3-213	ENST00000533873	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		11.53	□□□□□ -0.56
ACER3-213	ENST00000533873	EEA1	Q15075	1411 aa		11.52	□□□□□ -0.56
ACER3-213	ENST00000533873	SPDYE4	A6NLX3	237 aa		11.51	□□□□□ -0.57
ACER3-213	ENST00000533873	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	11.5	□□□□□ -0.57
ACER3-213	ENST00000533873	PIP4P2	Q8N4L2	257 aa		11.49	□□□□□ -0.57
ACER3-213	ENST00000533873	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		11.49	□□□□□ -0.57
ACER3-213	ENST00000533873	PTPRG	P23470	1445 aa		11.49	□□□□□ -0.57
ACER3-213	ENST00000533873	PRX	Q9BXM0	1461 aa		11.49	□□□□□ -0.57
ACER3-213	ENST00000533873	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		11.46	□□□□□ -0.57
ACER3-213	ENST00000533873	FXR2	P51116	673 aa	Known RBP eCLIP	11.46	□□□□□ -0.57
ACER3-213	ENST00000533873	GOLGA3	Q08378	1498 aa		11.45	□□□□□ -0.58
ACER3-213	ENST00000533873	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	11.44	□□□□□ -0.58
ACER3-213	ENST00000533873	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
ACER3-213	ENST00000533873	DISP1	Q96F81	1524 aa		11.43	□□□□□ -0.58
ACER3-213	ENST00000533873	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		11.43	□□□□□ -0.58
ACER3-213	ENST00000533873	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		11.42	□□□□□ -0.58
ACER3-213	ENST00000533873	MAPKBP1	O60336	1514 aa		11.42	□□□□□ -0.58
ACER3-213	ENST00000533873	KIAA0556	O60303	1618 aa		11.42	□□□□□ -0.58
ACER3-213	ENST00000533873	UACA	Q9BZF9	1416 aa		11.4	□□□□□ -0.58
ACER3-213	ENST00000533873	ABCC2	Q92887	1545 aa		11.4	□□□□□ -0.59
ACER3-213	ENST00000533873	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ACER3-213	ENST00000533873	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ACER3-213	ENST00000533873	PRR29	P0C7W0	189 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ACER3-213	ENST00000533873	KIF21B	O75037	1637 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ACER3-213	ENST00000533873	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ACER3-213	ENST00000533873	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ACER3-213	ENST00000533873	PRKAR2A	P13861	404 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
ACER3-213	ENST00000533873	DIP2B	Q9P265	1576 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ACER3-213	ENST00000533873	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		11.32	□□□□□ -0.6
ACER3-213	ENST00000533873	ASXL2	Q76L83	1435 aa		11.32	□□□□□ -0.6
ACER3-213	ENST00000533873	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		11.29	□□□□□ -0.6
ACER3-213	ENST00000533873	ABCA8	O94911	1581 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ACER3-213	ENST00000533873	SAMD9	Q5K651	1589 aa		11.28	□□□□□ -0.6

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