RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531956.5

FADS3-210, Transcript of fatty acid desaturase 3, humanhuman

TSL 5

Gene FADS3, Length 841 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FADS3-210ENST00000531956 ARHGEF11O15085 1522 aa24.85■■□□□ 1.57
FADS3-210ENST00000531956 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa24.77■■□□□ 1.56
FADS3-210ENST00000531956 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.75■■□□□ 1.55
FADS3-210ENST00000531956 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.75■■□□□ 1.55
FADS3-210ENST00000531956 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.75■■□□□ 1.55
FADS3-210ENST00000531956 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
FADS3-210ENST00000531956 SHROOM2Q13796 1616 aa24.73■■□□□ 1.55
FADS3-210ENST00000531956 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.73■■□□□ 1.55
FADS3-210ENST00000531956 IQGAP2Q13576 1575 aa24.71■■□□□ 1.55
FADS3-210ENST00000531956 KIF21BO75037 1637 aa24.68■■□□□ 1.54
FADS3-210ENST00000531956 GOLGA3Q08378 1498 aa24.65■■□□□ 1.54
FADS3-210ENST00000531956 UBTFP17480 764 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
FADS3-210ENST00000531956 ARAP1Q96P48 1450 aa24.61■■□□□ 1.53
FADS3-210ENST00000531956 UGGT2Q9NYU1 1516 aa24.61■■□□□ 1.53
FADS3-210ENST00000531956 TNIKQ9UKE5 1360 aa24.59■■□□□ 1.53
FADS3-210ENST00000531956 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.58■■□□□ 1.53
FADS3-210ENST00000531956 PTPRGP23470 1445 aa24.56■■□□□ 1.52
FADS3-210ENST00000531956 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP24.53■■□□□ 1.52
FADS3-210ENST00000531956 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.48■■□□□ 1.51
FADS3-210ENST00000531956 DISP1Q96F81 1524 aa24.47■■□□□ 1.51
FADS3-210ENST00000531956 KIAA0556O60303 1618 aa24.42■■□□□ 1.5
FADS3-210ENST00000531956 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.4■■□□□ 1.5
FADS3-210ENST00000531956 EFCAB5A4FU69 1503 aa24.39■■□□□ 1.49
FADS3-210ENST00000531956 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
FADS3-210ENST00000531956 UACAQ9BZF9 1416 aa24.37■■□□□ 1.49
FADS3-210ENST00000531956 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
FADS3-210ENST00000531956 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa24.34■■□□□ 1.49
FADS3-210ENST00000531956 P3H3Q8IVL6 736 aa24.32■■□□□ 1.48
FADS3-210ENST00000531956 SAMD9Q5K651 1589 aa24.31■■□□□ 1.48
FADS3-210ENST00000531956 FMN1Q68DA7 1419 aa24.25■■□□□ 1.47
FADS3-210ENST00000531956 ABCC2Q92887 1545 aa24.25■■□□□ 1.47
FADS3-210ENST00000531956 TRHP20396 242 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
FADS3-210ENST00000531956 CLIP1P30622 1438 aa24.18■■□□□ 1.46
FADS3-210ENST00000531956 FHOD3Q2V2M9 1422 aa24.18■■□□□ 1.46
FADS3-210ENST00000531956 ADCY10Q96PN6 1610 aa24.18■■□□□ 1.46
FADS3-210ENST00000531956 KDM5BQ9UGL1 1544 aa24.17■■□□□ 1.46
FADS3-210ENST00000531956 PLB1Q6P1J6 1458 aa24.17■■□□□ 1.46
FADS3-210ENST00000531956 MAPKBP1O60336 1514 aa24.16■■□□□ 1.46
FADS3-210ENST00000531956 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa24.16■■□□□ 1.46
FADS3-210ENST00000531956 ABCA8O94911 1581 aa24.16■■□□□ 1.46
FADS3-210ENST00000531956 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.13■■□□□ 1.45
FADS3-210ENST00000531956 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
FADS3-210ENST00000531956 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
FADS3-210ENST00000531956 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
FADS3-210ENST00000531956 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa24.08■■□□□ 1.45
FADS3-210ENST00000531956 CEP162Q5TB80 1403 aa24.07■■□□□ 1.44
FADS3-210ENST00000531956 ASXL2Q76L83 1435 aa24.05■■□□□ 1.44
FADS3-210ENST00000531956 PLEKHD1A6NEE1 506 aa24.05■■□□□ 1.44
FADS3-210ENST00000531956 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
FADS3-210ENST00000531956 FAM69CQ0P6D2 419 aa24.04■■□□□ 1.44
FADS3-210ENST00000531956 ABCC10Q5T3U5 1492 aa24.04■■□□□ 1.44
FADS3-210ENST00000531956 ATP10BO94823 1461 aa24.01■■□□□ 1.43
FADS3-210ENST00000531956 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
FADS3-210ENST00000531956 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.99■■□□□ 1.43
FADS3-210ENST00000531956 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
FADS3-210ENST00000531956 WDR7Q9Y4E6 1490 aa23.98■■□□□ 1.43
FADS3-210ENST00000531956 HECW1Q76N89 1606 aa23.96■■□□□ 1.43
FADS3-210ENST00000531956 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.93■■□□□ 1.42
FADS3-210ENST00000531956 ARID3CA6NKF2 412 aa23.92■■□□□ 1.42
FADS3-210ENST00000531956 KCNH8Q96L42 1107 aa23.92■■□□□ 1.42
FADS3-210ENST00000531956 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.92■■□□□ 1.42
FADS3-210ENST00000531956 GLI2P10070 1586 aa23.91■■□□□ 1.42
FADS3-210ENST00000531956 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.42
FADS3-210ENST00000531956 DIP2BQ9P265 1576 aa23.88■■□□□ 1.41
FADS3-210ENST00000531956 APLP2Q06481 763 aa23.83■■□□□ 1.41
FADS3-210ENST00000531956 VPS8Q8N3P4 1428 aa23.82■■□□□ 1.4
FADS3-210ENST00000531956 TEX14Q8IWB6 1497 aa23.81■■□□□ 1.4
FADS3-210ENST00000531956 CD109Q6YHK3 1445 aa23.79■■□□□ 1.4
FADS3-210ENST00000531956 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
FADS3-210ENST00000531956 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.78■■□□□ 1.4
FADS3-210ENST00000531956 KIF13AQ9H1H9 1805 aa23.76■■□□□ 1.39
FADS3-210ENST00000531956 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
FADS3-210ENST00000531956 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
FADS3-210ENST00000531956 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa23.72■■□□□ 1.39
FADS3-210ENST00000531956 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.72■■□□□ 1.39
FADS3-210ENST00000531956 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.7■■□□□ 1.38
FADS3-210ENST00000531956 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa23.69■■□□□ 1.38
FADS3-210ENST00000531956 ABCA9Q8IUA7 1624 aa23.68■■□□□ 1.38
FADS3-210ENST00000531956 MAP3K1Q13233 1512 aa23.67■■□□□ 1.38
FADS3-210ENST00000531956 KIF14Q15058 1648 aa23.64■■□□□ 1.38
FADS3-210ENST00000531956 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa23.63■■□□□ 1.37
FADS3-210ENST00000531956 NEO1Q92859 1461 aa23.62■■□□□ 1.37
FADS3-210ENST00000531956 PLCH2O75038 1416 aa23.6■■□□□ 1.37
FADS3-210ENST00000531956 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP23.6■■□□□ 1.378e-7■■■■□ 23.5
FADS3-210ENST00000531956 ARAP3Q8WWN8 1544 aa23.58■■□□□ 1.36
FADS3-210ENST00000531956 TSPOAP1O95153 1857 aa23.56■■□□□ 1.36
FADS3-210ENST00000531956 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa23.56■■□□□ 1.36
FADS3-210ENST00000531956 CCNB3Q8WWL7 1395 aa23.54■■□□□ 1.36
FADS3-210ENST00000531956 TIAM1Q13009 1591 aa23.54■■□□□ 1.36
FADS3-210ENST00000531956 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.53■■□□□ 1.36
FADS3-210ENST00000531956 CFAP74Q9C0B2 1584 aa23.53■■□□□ 1.36
FADS3-210ENST00000531956 FANCAO15360 1455 aa23.53■■□□□ 1.36
FADS3-210ENST00000531956 KDM6BO15054 1643 aa23.51■■□□□ 1.35
FADS3-210ENST00000531956 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa23.5■■□□□ 1.35
FADS3-210ENST00000531956 AKNAQ7Z591 1439 aa23.5■■□□□ 1.35
FADS3-210ENST00000531956 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
FADS3-210ENST00000531956 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
FADS3-210ENST00000531956 TTC37Q6PGP7 1564 aa23.47■■□□□ 1.35
FADS3-210ENST00000531956 MYO5CQ9NQX4 1742 aa23.45■■□□□ 1.34
FADS3-210ENST00000531956 ARHGAP5Q13017 1502 aa23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.2 ms