RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531938.1

AP000911.1-206, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene AP000911.1, Length 711 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP000911.1-206ENST00000531938 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP45.69■■■■■ 4.91
AP000911.1-206ENST00000531938 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa45.67■■■■■ 4.9
AP000911.1-206ENST00000531938 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa45.56■■■■■ 4.88
AP000911.1-206ENST00000531938 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa45.52■■■■■ 4.88
AP000911.1-206ENST00000531938 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP45.22■■■■■ 4.83
AP000911.1-206ENST00000531938 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa45.18■■■■■ 4.82
AP000911.1-206ENST00000531938 IQGAP2Q13576 1575 aa45.17■■■■■ 4.82
AP000911.1-206ENST00000531938 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa45.13■■■■■ 4.82
AP000911.1-206ENST00000531938 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP45.11■■■■■ 4.81
AP000911.1-206ENST00000531938 ADCY10Q96PN6 1610 aa45.08■■■■■ 4.81
AP000911.1-206ENST00000531938 PTPRGP23470 1445 aa45.07■■■■■ 4.81
AP000911.1-206ENST00000531938 KIF13AQ9H1H9 1805 aa45.03■■■■■ 4.8
AP000911.1-206ENST00000531938 TNIKQ9UKE5 1360 aa45.01■■■■■ 4.8
AP000911.1-206ENST00000531938 MAPKBP1O60336 1514 aa44.92■■■■■ 4.78
AP000911.1-206ENST00000531938 FAM69CQ0P6D2 419 aa44.89■■■■■ 4.78
AP000911.1-206ENST00000531938 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa44.86■■■■■ 4.77
AP000911.1-206ENST00000531938 DISP1Q96F81 1524 aa44.85■■■■■ 4.77
AP000911.1-206ENST00000531938 UGGT2Q9NYU1 1516 aa44.85■■■■■ 4.77
AP000911.1-206ENST00000531938 ABCC10Q5T3U5 1492 aa44.85■■■■■ 4.77
AP000911.1-206ENST00000531938 PRXQ9BXM0 1461 aa44.76■■■■■ 4.76
AP000911.1-206ENST00000531938 DIP2BQ9P265 1576 aa44.75■■■■■ 4.75
AP000911.1-206ENST00000531938 KIAA0556O60303 1618 aa44.73■■■■■ 4.75
AP000911.1-206ENST00000531938 ABCC2Q92887 1545 aa44.72■■■■■ 4.75
AP000911.1-206ENST00000531938 UACAQ9BZF9 1416 aa44.71■■■■■ 4.75
AP000911.1-206ENST00000531938 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa44.66■■■■■ 4.74
AP000911.1-206ENST00000531938 CSRNP3Q8WYN3 585 aa44.63■■■■■ 4.74
AP000911.1-206ENST00000531938 TSPOAP1O95153 1857 aa44.61■■■■■ 4.73
AP000911.1-206ENST00000531938 GOLGA3Q08378 1498 aa44.61■■■■■ 4.73
AP000911.1-206ENST00000531938 ASXL2Q76L83 1435 aa44.54■■■■■ 4.72
AP000911.1-206ENST00000531938 PLB1Q6P1J6 1458 aa44.53■■■■■ 4.72
AP000911.1-206ENST00000531938 EEA1Q15075 1411 aa44.49■■■■■ 4.71
AP000911.1-206ENST00000531938 KDM5BQ9UGL1 1544 aa44.45■■■■■ 4.71
AP000911.1-206ENST00000531938 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP44.43■■■■■ 4.7
AP000911.1-206ENST00000531938 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP44.4■■■■■ 4.7
AP000911.1-206ENST00000531938 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP44.36■■■■■ 4.69
AP000911.1-206ENST00000531938 GLI2P10070 1586 aa44.34■■■■■ 4.69
AP000911.1-206ENST00000531938 KDM6BO15054 1643 aa44.32■■■■■ 4.68
AP000911.1-206ENST00000531938 P3H3Q8IVL6 736 aa44.31■■■■■ 4.68
AP000911.1-206ENST00000531938 ABCA8O94911 1581 aa44.28■■■■■ 4.68
AP000911.1-206ENST00000531938 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP44.24■■■■■ 4.67
AP000911.1-206ENST00000531938 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP44.17■■■■■ 4.66
AP000911.1-206ENST00000531938 WDR7Q9Y4E6 1490 aa44.17■■■■■ 4.66
AP000911.1-206ENST00000531938 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP44.17■■■■■ 4.66
AP000911.1-206ENST00000531938 CHIC1Q5VXU3 224 aa44.16■■■■■ 4.66
AP000911.1-206ENST00000531938 SAMD9Q5K651 1589 aa44.14■■■■■ 4.66
AP000911.1-206ENST00000531938 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa44.13■■■■■ 4.65
AP000911.1-206ENST00000531938 KIF21BO75037 1637 aa44.09■■■■■ 4.65
AP000911.1-206ENST00000531938 KCNH8Q96L42 1107 aa44.07■■■■■ 4.65
AP000911.1-206ENST00000531938 ARID3CA6NKF2 412 aa44.05■■■■■ 4.64
AP000911.1-206ENST00000531938 TEX14Q8IWB6 1497 aa44.03■■■■■ 4.64
AP000911.1-206ENST00000531938 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa43.95■■■■■ 4.63
AP000911.1-206ENST00000531938 EHMT2Q96KQ7 1210 aa43.95■■■■■ 4.63
AP000911.1-206ENST00000531938 CFAP43Q8NDM7 1665 aa43.92■■■■■ 4.62
AP000911.1-206ENST00000531938 ATP10BO94823 1461 aa43.92■■■■■ 4.62
AP000911.1-206ENST00000531938 FHOD3Q2V2M9 1422 aa43.9■■■■■ 4.62
AP000911.1-206ENST00000531938 CD109Q6YHK3 1445 aa43.9■■■■■ 4.62
AP000911.1-206ENST00000531938 UBTFP17480 764 aaKnown RBP43.89■■■■■ 4.62
AP000911.1-206ENST00000531938 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP43.88■■■■■ 4.62
AP000911.1-206ENST00000531938 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP43.88■■■■■ 4.62
AP000911.1-206ENST00000531938 EFCAB5A4FU69 1503 aa43.82■■■■■ 4.61
AP000911.1-206ENST00000531938 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP43.79■■■■■ 4.6
AP000911.1-206ENST00000531938 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa43.78■■■■■ 4.6
AP000911.1-206ENST00000531938 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP43.71■■■■■ 4.59
AP000911.1-206ENST00000531938 ABCA9Q8IUA7 1624 aa43.62■■■■■ 4.57
AP000911.1-206ENST00000531938 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa43.61■■■■■ 4.57
AP000911.1-206ENST00000531938 PLEKHD1A6NEE1 506 aa43.59■■■■■ 4.57
AP000911.1-206ENST00000531938 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP43.49■■■■■ 4.55
AP000911.1-206ENST00000531938 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa43.46■■■■■ 4.55
AP000911.1-206ENST00000531938 FMN1Q68DA7 1419 aa43.46■■■■■ 4.55
AP000911.1-206ENST00000531938 PHLDB1Q86UU1 1377 aa43.43■■■■■ 4.54
AP000911.1-206ENST00000531938 ARAP3Q8WWN8 1544 aa43.43■■■■■ 4.54
AP000911.1-206ENST00000531938 ADGRL1O94910 1474 aa43.41■■■■■ 4.54
AP000911.1-206ENST00000531938 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP43.38■■■■■ 4.54
AP000911.1-206ENST00000531938 NEO1Q92859 1461 aa43.36■■■■■ 4.53
AP000911.1-206ENST00000531938 HECW1Q76N89 1606 aa43.36■■■■■ 4.53
AP000911.1-206ENST00000531938 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP43.27■■■■■ 4.52
AP000911.1-206ENST00000531938 RAPGEF3O95398 923 aa43.25■■■■■ 4.51
AP000911.1-206ENST00000531938 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP43.24■■■■■ 4.51
AP000911.1-206ENST00000531938 TTC37Q6PGP7 1564 aa43.2■■■■■ 4.51
AP000911.1-206ENST00000531938 CFAP74Q9C0B2 1584 aa43.19■■■■■ 4.5
AP000911.1-206ENST00000531938 FANCAO15360 1455 aa43.16■■■■■ 4.5
AP000911.1-206ENST00000531938 AKNAQ7Z591 1439 aa43.14■■■■■ 4.5
AP000911.1-206ENST00000531938 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP43.08■■■■■ 4.49
AP000911.1-206ENST00000531938 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa43.08■■■■■ 4.49
AP000911.1-206ENST00000531938 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa43.07■■■■■ 4.48
AP000911.1-206ENST00000531938 CLIP1P30622 1438 aa43.02■■■■■ 4.48
AP000911.1-206ENST00000531938 RICTORQ6R327 1708 aa43.02■■■■■ 4.48
AP000911.1-206ENST00000531938 MYO5CQ9NQX4 1742 aa43.02■■■■■ 4.48
AP000911.1-206ENST00000531938 PLCH2O75038 1416 aa43.01■■■■■ 4.48
AP000911.1-206ENST00000531938 KIF14Q15058 1648 aa43■■■■■ 4.47
AP000911.1-206ENST00000531938 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP43■■■■■ 4.47
AP000911.1-206ENST00000531938 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP43■■■■■ 4.47
AP000911.1-206ENST00000531938 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa43■■■■■ 4.47
AP000911.1-206ENST00000531938 CCDC18Q5T9S5 1454 aa42.94■■■■■ 4.47
AP000911.1-206ENST00000531938 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP42.94■■■■■ 4.46
AP000911.1-206ENST00000531938 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa42.93■■■■■ 4.46
AP000911.1-206ENST00000531938 SCAPERQ9BY12 1400 aa42.88■■■■■ 4.45
AP000911.1-206ENST00000531938 FYCO1Q9BQS8 1478 aa42.86■■■■■ 4.45
AP000911.1-206ENST00000531938 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa42.86■■■■■ 4.45
AP000911.1-206ENST00000531938 ARHGAP5Q13017 1502 aa42.81■■■■■ 4.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.1 ms