RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531938.1

AP000911.1-206, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene AP000911.1, Length 711 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP000911.1-206ENST00000531938 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP45.69■■■■■ 4.91
AP000911.1-206ENST00000531938 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa45.67■■■■■ 4.9
AP000911.1-206ENST00000531938 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa45.56■■■■■ 4.88
AP000911.1-206ENST00000531938 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa45.52■■■■■ 4.88
AP000911.1-206ENST00000531938 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP45.22■■■■■ 4.83
AP000911.1-206ENST00000531938 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa45.18■■■■■ 4.82
AP000911.1-206ENST00000531938 IQGAP2Q13576 1575 aa45.17■■■■■ 4.82
AP000911.1-206ENST00000531938 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa45.13■■■■■ 4.82
AP000911.1-206ENST00000531938 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP45.11■■■■■ 4.81
AP000911.1-206ENST00000531938 ADCY10Q96PN6 1610 aa45.08■■■■■ 4.81
AP000911.1-206ENST00000531938 PTPRGP23470 1445 aa45.07■■■■■ 4.81
AP000911.1-206ENST00000531938 KIF13AQ9H1H9 1805 aa45.03■■■■■ 4.8
AP000911.1-206ENST00000531938 TNIKQ9UKE5 1360 aa45.01■■■■■ 4.8
AP000911.1-206ENST00000531938 MAPKBP1O60336 1514 aa44.92■■■■■ 4.78
AP000911.1-206ENST00000531938 FAM69CQ0P6D2 419 aa44.89■■■■■ 4.78
AP000911.1-206ENST00000531938 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa44.86■■■■■ 4.77
AP000911.1-206ENST00000531938 DISP1Q96F81 1524 aa44.85■■■■■ 4.77
AP000911.1-206ENST00000531938 UGGT2Q9NYU1 1516 aa44.85■■■■■ 4.77
AP000911.1-206ENST00000531938 ABCC10Q5T3U5 1492 aa44.85■■■■■ 4.77
AP000911.1-206ENST00000531938 PRXQ9BXM0 1461 aa44.76■■■■■ 4.76
AP000911.1-206ENST00000531938 DIP2BQ9P265 1576 aa44.75■■■■■ 4.75
AP000911.1-206ENST00000531938 KIAA0556O60303 1618 aa44.73■■■■■ 4.75
AP000911.1-206ENST00000531938 ABCC2Q92887 1545 aa44.72■■■■■ 4.75
AP000911.1-206ENST00000531938 UACAQ9BZF9 1416 aa44.71■■■■■ 4.75
AP000911.1-206ENST00000531938 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa44.66■■■■■ 4.74
AP000911.1-206ENST00000531938 CSRNP3Q8WYN3 585 aa44.63■■■■■ 4.74
AP000911.1-206ENST00000531938 TSPOAP1O95153 1857 aa44.61■■■■■ 4.73
AP000911.1-206ENST00000531938 GOLGA3Q08378 1498 aa44.61■■■■■ 4.73
AP000911.1-206ENST00000531938 ASXL2Q76L83 1435 aa44.54■■■■■ 4.72
AP000911.1-206ENST00000531938 PLB1Q6P1J6 1458 aa44.53■■■■■ 4.72
AP000911.1-206ENST00000531938 EEA1Q15075 1411 aa44.49■■■■■ 4.71
AP000911.1-206ENST00000531938 KDM5BQ9UGL1 1544 aa44.45■■■■■ 4.71
AP000911.1-206ENST00000531938 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP44.43■■■■■ 4.7
AP000911.1-206ENST00000531938 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP44.4■■■■■ 4.7
AP000911.1-206ENST00000531938 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP44.36■■■■■ 4.69
AP000911.1-206ENST00000531938 GLI2P10070 1586 aa44.34■■■■■ 4.69
AP000911.1-206ENST00000531938 KDM6BO15054 1643 aa44.32■■■■■ 4.68
AP000911.1-206ENST00000531938 P3H3Q8IVL6 736 aa44.31■■■■■ 4.68
AP000911.1-206ENST00000531938 ABCA8O94911 1581 aa44.28■■■■■ 4.68
AP000911.1-206ENST00000531938 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP44.24■■■■■ 4.67
AP000911.1-206ENST00000531938 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP44.17■■■■■ 4.66
AP000911.1-206ENST00000531938 WDR7Q9Y4E6 1490 aa44.17■■■■■ 4.66
AP000911.1-206ENST00000531938 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP44.17■■■■■ 4.66
AP000911.1-206ENST00000531938 CHIC1Q5VXU3 224 aa44.16■■■■■ 4.66
AP000911.1-206ENST00000531938 SAMD9Q5K651 1589 aa44.14■■■■■ 4.66
AP000911.1-206ENST00000531938 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa44.13■■■■■ 4.65
AP000911.1-206ENST00000531938 KIF21BO75037 1637 aa44.09■■■■■ 4.65
AP000911.1-206ENST00000531938 KCNH8Q96L42 1107 aa44.07■■■■■ 4.65
AP000911.1-206ENST00000531938 ARID3CA6NKF2 412 aa44.05■■■■■ 4.64
AP000911.1-206ENST00000531938 TEX14Q8IWB6 1497 aa44.03■■■■■ 4.64
AP000911.1-206ENST00000531938 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa43.95■■■■■ 4.63
AP000911.1-206ENST00000531938 EHMT2Q96KQ7 1210 aa43.95■■■■■ 4.63
AP000911.1-206ENST00000531938 CFAP43Q8NDM7 1665 aa43.92■■■■■ 4.62
AP000911.1-206ENST00000531938 ATP10BO94823 1461 aa43.92■■■■■ 4.62
AP000911.1-206ENST00000531938 FHOD3Q2V2M9 1422 aa43.9■■■■■ 4.62
AP000911.1-206ENST00000531938 CD109Q6YHK3 1445 aa43.9■■■■■ 4.62
AP000911.1-206ENST00000531938 UBTFP17480 764 aaKnown RBP43.89■■■■■ 4.62
AP000911.1-206ENST00000531938 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP43.88■■■■■ 4.62
AP000911.1-206ENST00000531938 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP43.88■■■■■ 4.62
AP000911.1-206ENST00000531938 EFCAB5A4FU69 1503 aa43.82■■■■■ 4.61
AP000911.1-206ENST00000531938 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP43.79■■■■■ 4.6
AP000911.1-206ENST00000531938 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa43.78■■■■■ 4.6
AP000911.1-206ENST00000531938 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP43.71■■■■■ 4.59
AP000911.1-206ENST00000531938 ABCA9Q8IUA7 1624 aa43.62■■■■■ 4.57
AP000911.1-206ENST00000531938 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa43.61■■■■■ 4.57
AP000911.1-206ENST00000531938 PLEKHD1A6NEE1 506 aa43.59■■■■■ 4.57
AP000911.1-206ENST00000531938 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP43.49■■■■■ 4.55
AP000911.1-206ENST00000531938 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa43.46■■■■■ 4.55
AP000911.1-206ENST00000531938 FMN1Q68DA7 1419 aa43.46■■■■■ 4.55
AP000911.1-206ENST00000531938 PHLDB1Q86UU1 1377 aa43.43■■■■■ 4.54
AP000911.1-206ENST00000531938 ARAP3Q8WWN8 1544 aa43.43■■■■■ 4.54
AP000911.1-206ENST00000531938 ADGRL1O94910 1474 aa43.41■■■■■ 4.54
AP000911.1-206ENST00000531938 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP43.38■■■■■ 4.54
AP000911.1-206ENST00000531938 NEO1Q92859 1461 aa43.36■■■■■ 4.53
AP000911.1-206ENST00000531938 HECW1Q76N89 1606 aa43.36■■■■■ 4.53
AP000911.1-206ENST00000531938 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP43.27■■■■■ 4.52
AP000911.1-206ENST00000531938 RAPGEF3O95398 923 aa43.25■■■■■ 4.51
AP000911.1-206ENST00000531938 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP43.24■■■■■ 4.51
AP000911.1-206ENST00000531938 TTC37Q6PGP7 1564 aa43.2■■■■■ 4.51
AP000911.1-206ENST00000531938 CFAP74Q9C0B2 1584 aa43.19■■■■■ 4.5
AP000911.1-206ENST00000531938 FANCAO15360 1455 aa43.16■■■■■ 4.5
AP000911.1-206ENST00000531938 AKNAQ7Z591 1439 aa43.14■■■■■ 4.5
AP000911.1-206ENST00000531938 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP43.08■■■■■ 4.49
AP000911.1-206ENST00000531938 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa43.08■■■■■ 4.49
AP000911.1-206ENST00000531938 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa43.07■■■■■ 4.48
AP000911.1-206ENST00000531938 CLIP1P30622 1438 aa43.02■■■■■ 4.48
AP000911.1-206ENST00000531938 RICTORQ6R327 1708 aa43.02■■■■■ 4.48
AP000911.1-206ENST00000531938 MYO5CQ9NQX4 1742 aa43.02■■■■■ 4.48
AP000911.1-206ENST00000531938 PLCH2O75038 1416 aa43.01■■■■■ 4.48
AP000911.1-206ENST00000531938 KIF14Q15058 1648 aa43■■■■■ 4.47
AP000911.1-206ENST00000531938 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP43■■■■■ 4.47
AP000911.1-206ENST00000531938 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP43■■■■■ 4.47
AP000911.1-206ENST00000531938 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa43■■■■■ 4.47
AP000911.1-206ENST00000531938 CCDC18Q5T9S5 1454 aa42.94■■■■■ 4.47
AP000911.1-206ENST00000531938 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP42.94■■■■■ 4.46
AP000911.1-206ENST00000531938 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa42.93■■■■■ 4.46
AP000911.1-206ENST00000531938 SCAPERQ9BY12 1400 aa42.88■■■■■ 4.45
AP000911.1-206ENST00000531938 FYCO1Q9BQS8 1478 aa42.86■■■■■ 4.45
AP000911.1-206ENST00000531938 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa42.86■■■■■ 4.45
AP000911.1-206ENST00000531938 ARHGAP5Q13017 1502 aa42.81■■■■■ 4.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms