RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531461.5

ACER3-211, Transcript of alkaline ceramidase 3, humanhuman

TSL 2

Gene ACER3, Length 1,292 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3-211ENST00000531461 IGF1RP08069 1367 aa42.07■■■■■ 4.33
ACER3-211ENST00000531461 CUL7Q14999 1698 aa42.05■■■■■ 4.32
ACER3-211ENST00000531461 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa41.95■■■■■ 4.31
ACER3-211ENST00000531461 KIF13AQ9H1H9 1805 aa41.81■■■■■ 4.28
ACER3-211ENST00000531461 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.78■■■■■ 4.28
ACER3-211ENST00000531461 MAPKBP1O60336 1514 aa41.7■■■■■ 4.27
ACER3-211ENST00000531461 ADCY10Q96PN6 1610 aa41.7■■■■■ 4.27
ACER3-211ENST00000531461 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP41.66■■■■■ 4.26
ACER3-211ENST00000531461 ABCC10Q5T3U5 1492 aa41.63■■■■■ 4.25
ACER3-211ENST00000531461 IQGAP2Q13576 1575 aa41.54■■■■■ 4.24
ACER3-211ENST00000531461 DIP2BQ9P265 1576 aa41.52■■■■■ 4.24
ACER3-211ENST00000531461 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa41.52■■■■■ 4.24
ACER3-211ENST00000531461 PTPRGP23470 1445 aa41.51■■■■■ 4.24
ACER3-211ENST00000531461 FAM69CQ0P6D2 419 aa41.5■■■■■ 4.23
ACER3-211ENST00000531461 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.46■■■■■ 4.23
ACER3-211ENST00000531461 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.42■■■■■ 4.22
ACER3-211ENST00000531461 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP41.38■■■■■ 4.21
ACER3-211ENST00000531461 DISP1Q96F81 1524 aa41.34■■■■■ 4.21
ACER3-211ENST00000531461 ABCC2Q92887 1545 aa41.33■■■■■ 4.21
ACER3-211ENST00000531461 UGGT2Q9NYU1 1516 aa41.31■■■■■ 4.2
ACER3-211ENST00000531461 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa41.29■■■■■ 4.2
ACER3-211ENST00000531461 UACAQ9BZF9 1416 aa41.22■■■■■ 4.19
ACER3-211ENST00000531461 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP41.21■■■■■ 4.19
ACER3-211ENST00000531461 PLB1Q6P1J6 1458 aa41.16■■■■■ 4.18
ACER3-211ENST00000531461 KIAA0556O60303 1618 aa41.16■■■■■ 4.18
ACER3-211ENST00000531461 TSPOAP1O95153 1857 aa41.16■■■■■ 4.18
ACER3-211ENST00000531461 ASXL2Q76L83 1435 aa41.14■■■■■ 4.18
ACER3-211ENST00000531461 KDM6BO15054 1643 aa41.12■■■■■ 4.17
ACER3-211ENST00000531461 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa41.12■■■■■ 4.17
ACER3-211ENST00000531461 GLI2P10070 1586 aa41.12■■■■■ 4.17
ACER3-211ENST00000531461 KDM5BQ9UGL1 1544 aa41.09■■■■■ 4.17
ACER3-211ENST00000531461 PRXQ9BXM0 1461 aa41.03■■■■■ 4.16
ACER3-211ENST00000531461 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP40.97■■■■■ 4.15
ACER3-211ENST00000531461 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP40.96■■■■■ 4.15
ACER3-211ENST00000531461 GOLGA3Q08378 1498 aa40.96■■■■■ 4.15
ACER3-211ENST00000531461 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP40.92■■■■■ 4.14
ACER3-211ENST00000531461 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa40.86■■■■■ 4.13
ACER3-211ENST00000531461 ABCA8O94911 1581 aa40.79■■■■■ 4.12
ACER3-211ENST00000531461 WDR7Q9Y4E6 1490 aa40.77■■■■■ 4.12
ACER3-211ENST00000531461 TEX14Q8IWB6 1497 aa40.74■■■■■ 4.11
ACER3-211ENST00000531461 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa40.66■■■■■ 4.1
ACER3-211ENST00000531461 CSRNP3Q8WYN3 585 aa40.66■■■■■ 4.1
ACER3-211ENST00000531461 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP40.64■■■■■ 4.1
ACER3-211ENST00000531461 EEA1Q15075 1411 aa40.59■■■■■ 4.09
ACER3-211ENST00000531461 CFAP43Q8NDM7 1665 aa40.58■■■■■ 4.09
ACER3-211ENST00000531461 SAMD9Q5K651 1589 aa40.54■■■■■ 4.08
ACER3-211ENST00000531461 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP40.54■■■■■ 4.08
ACER3-211ENST00000531461 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa40.53■■■■■ 4.08
ACER3-211ENST00000531461 CD109Q6YHK3 1445 aa40.5■■■■■ 4.07
ACER3-211ENST00000531461 KCNH8Q96L42 1107 aa40.44■■■■■ 4.06
ACER3-211ENST00000531461 ATP10BO94823 1461 aa40.43■■■■■ 4.06
ACER3-211ENST00000531461 P3H3Q8IVL6 736 aa40.42■■■■■ 4.06
ACER3-211ENST00000531461 ADGRL1O94910 1474 aa40.36■■■■■ 4.05
ACER3-211ENST00000531461 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa40.34■■■■■ 4.05
ACER3-211ENST00000531461 ABCA9Q8IUA7 1624 aa40.27■■■■■ 4.04
ACER3-211ENST00000531461 KIF21BO75037 1637 aa40.24■■■■■ 4.03
ACER3-211ENST00000531461 ARID3CA6NKF2 412 aa40.24■■■■■ 4.03
ACER3-211ENST00000531461 ARAP3Q8WWN8 1544 aa40.22■■■■■ 4.03
ACER3-211ENST00000531461 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP40.19■■■■■ 4.03
ACER3-211ENST00000531461 PHLDB1Q86UU1 1377 aa40.18■■■■■ 4.02
ACER3-211ENST00000531461 FHOD3Q2V2M9 1422 aa40.16■■■■■ 4.02
ACER3-211ENST00000531461 EFCAB5A4FU69 1503 aa40.14■■■■■ 4.02
ACER3-211ENST00000531461 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP40.06■■■■■ 4
ACER3-211ENST00000531461 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP40.06■■■■■ 4
ACER3-211ENST00000531461 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP40.06■■■■■ 4
ACER3-211ENST00000531461 NEO1Q92859 1461 aa40.06■■■■■ 4
ACER3-211ENST00000531461 PLEKHD1A6NEE1 506 aa39.94■■■■□ 3.98
ACER3-211ENST00000531461 CHIC1Q5VXU3 224 aa39.88■■■■□ 3.97
ACER3-211ENST00000531461 RAPGEF3O95398 923 aa39.85■■■■□ 3.97
ACER3-211ENST00000531461 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa39.84■■■■□ 3.97
ACER3-211ENST00000531461 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP39.83■■■■□ 3.97
ACER3-211ENST00000531461 HECW2Q9P2P5 1572 aa39.8■■■■□ 3.96
ACER3-211ENST00000531461 UBTFP17480 764 aaKnown RBP39.8■■■■□ 3.96
ACER3-211ENST00000531461 CFAP74Q9C0B2 1584 aa39.79■■■■□ 3.96
ACER3-211ENST00000531461 FMN1Q68DA7 1419 aa39.77■■■■□ 3.96
ACER3-211ENST00000531461 TTC37Q6PGP7 1564 aa39.75■■■■□ 3.95
ACER3-211ENST00000531461 FANCAO15360 1455 aa39.75■■■■□ 3.95
ACER3-211ENST00000531461 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP39.74■■■■□ 3.95
ACER3-211ENST00000531461 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa39.74■■■■□ 3.95
ACER3-211ENST00000531461 AKNAQ7Z591 1439 aa39.74■■■■□ 3.95
ACER3-211ENST00000531461 RICTORQ6R327 1708 aa39.73■■■■□ 3.95
ACER3-211ENST00000531461 ADAMTSL3P82987 1691 aa39.73■■■■□ 3.95
ACER3-211ENST00000531461 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP39.72■■■■□ 3.95
ACER3-211ENST00000531461 HECW1Q76N89 1606 aa39.69■■■■□ 3.94
ACER3-211ENST00000531461 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa39.65■■■■□ 3.94
ACER3-211ENST00000531461 BCORL1Q5H9F3 1711 aa39.64■■■■□ 3.94
ACER3-211ENST00000531461 EHMT2Q96KQ7 1210 aa39.63■■■■□ 3.93
ACER3-211ENST00000531461 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa39.6■■■■□ 3.93
ACER3-211ENST00000531461 PLCH2O75038 1416 aa39.59■■■■□ 3.93
ACER3-211ENST00000531461 PTPRMP28827 1452 aa39.59■■■■□ 3.93
ACER3-211ENST00000531461 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP39.55■■■■□ 3.92
ACER3-211ENST00000531461 MAGI2Q86UL8 1455 aa39.52■■■■□ 3.92
ACER3-211ENST00000531461 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP39.5■■■■□ 3.91
ACER3-211ENST00000531461 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP39.5■■■■□ 3.91
ACER3-211ENST00000531461 MYO5CQ9NQX4 1742 aa39.5■■■■□ 3.91
ACER3-211ENST00000531461 MADDQ8WXG6 1647 aa39.49■■■■□ 3.91
ACER3-211ENST00000531461 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa39.46■■■■□ 3.91
ACER3-211ENST00000531461 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP39.45■■■■□ 3.91
ACER3-211ENST00000531461 KIF14Q15058 1648 aa39.44■■■■□ 3.9
ACER3-211ENST00000531461 POGZQ7Z3K3 1410 aa39.44■■■■□ 3.9
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