RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527952.1

PTPRJ-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRJ, Length 626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-205ENST00000527952 KIF27Q86VH2 1401 aa42.07■■■■■ 4.33
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PTPRJ-205ENST00000527952 CUL7Q14999 1698 aa41.97■■■■■ 4.31
PTPRJ-205ENST00000527952 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa41.95■■■■■ 4.31
PTPRJ-205ENST00000527952 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP41.89■■■■■ 4.3
PTPRJ-205ENST00000527952 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP41.86■■■■■ 4.29
PTPRJ-205ENST00000527952 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.84■■■■■ 4.29
PTPRJ-205ENST00000527952 ADCY10Q96PN6 1610 aa41.84■■■■■ 4.29
PTPRJ-205ENST00000527952 FAM69CQ0P6D2 419 aa41.79■■■■■ 4.28
PTPRJ-205ENST00000527952 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP41.77■■■■■ 4.28
PTPRJ-205ENST00000527952 ABCC10Q5T3U5 1492 aa41.72■■■■■ 4.27
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PTPRJ-205ENST00000527952 PTPRGP23470 1445 aa41.62■■■■■ 4.25
PTPRJ-205ENST00000527952 IQGAP2Q13576 1575 aa41.56■■■■■ 4.24
PTPRJ-205ENST00000527952 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa41.53■■■■■ 4.24
PTPRJ-205ENST00000527952 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.52■■■■■ 4.24
PTPRJ-205ENST00000527952 TSPOAP1O95153 1857 aa41.51■■■■■ 4.24
PTPRJ-205ENST00000527952 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.42■■■■■ 4.22
PTPRJ-205ENST00000527952 DISP1Q96F81 1524 aa41.39■■■■■ 4.22
PTPRJ-205ENST00000527952 ABCC2Q92887 1545 aa41.37■■■■■ 4.21
PTPRJ-205ENST00000527952 KDM6BO15054 1643 aa41.32■■■■■ 4.2
PTPRJ-205ENST00000527952 ASXL2Q76L83 1435 aa41.29■■■■■ 4.2
PTPRJ-205ENST00000527952 UACAQ9BZF9 1416 aa41.29■■■■■ 4.2
PTPRJ-205ENST00000527952 UGGT2Q9NYU1 1516 aa41.26■■■■■ 4.2
PTPRJ-205ENST00000527952 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa41.25■■■■■ 4.19
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PTPRJ-205ENST00000527952 KDM5BQ9UGL1 1544 aa41.09■■■■■ 4.17
PTPRJ-205ENST00000527952 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP41.08■■■■■ 4.17
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PTPRJ-205ENST00000527952 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa40.92■■■■■ 4.14
PTPRJ-205ENST00000527952 GOLGA3Q08378 1498 aa40.9■■■■■ 4.14
PTPRJ-205ENST00000527952 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP40.87■■■■■ 4.13
PTPRJ-205ENST00000527952 WDR7Q9Y4E6 1490 aa40.83■■■■■ 4.13
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PTPRJ-205ENST00000527952 P3H3Q8IVL6 736 aa40.79■■■■■ 4.12
PTPRJ-205ENST00000527952 KCNH8Q96L42 1107 aa40.78■■■■■ 4.12
PTPRJ-205ENST00000527952 TEX14Q8IWB6 1497 aa40.77■■■■■ 4.12
PTPRJ-205ENST00000527952 ARID3CA6NKF2 412 aa40.72■■■■■ 4.11
PTPRJ-205ENST00000527952 CSRNP3Q8WYN3 585 aa40.68■■■■■ 4.1
PTPRJ-205ENST00000527952 CD109Q6YHK3 1445 aa40.63■■■■■ 4.09
PTPRJ-205ENST00000527952 ADGRL1O94910 1474 aa40.62■■■■■ 4.09
PTPRJ-205ENST00000527952 CFAP43Q8NDM7 1665 aa40.59■■■■■ 4.09
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PTPRJ-205ENST00000527952 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa40.53■■■■■ 4.08
PTPRJ-205ENST00000527952 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP40.52■■■■■ 4.08
PTPRJ-205ENST00000527952 ATP10BO94823 1461 aa40.51■■■■■ 4.08
PTPRJ-205ENST00000527952 SAMD9Q5K651 1589 aa40.48■■■■■ 4.07
PTPRJ-205ENST00000527952 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa40.38■■■■■ 4.06
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PTPRJ-205ENST00000527952 EHMT2Q96KQ7 1210 aa40.2■■■■■ 4.03
PTPRJ-205ENST00000527952 RAPGEF3O95398 923 aa40.13■■■■■ 4.01
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PTPRJ-205ENST00000527952 TTC37Q6PGP7 1564 aa39.86■■■■□ 3.97
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PTPRJ-205ENST00000527952 PTPRMP28827 1452 aa39.77■■■■□ 3.96
PTPRJ-205ENST00000527952 BCORL1Q5H9F3 1711 aa39.76■■■■□ 3.96
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PTPRJ-205ENST00000527952 MADDQ8WXG6 1647 aa39.71■■■■□ 3.95
PTPRJ-205ENST00000527952 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa39.7■■■■□ 3.95
PTPRJ-205ENST00000527952 FMN1Q68DA7 1419 aa39.67■■■■□ 3.94
PTPRJ-205ENST00000527952 HECW1Q76N89 1606 aa39.67■■■■□ 3.94
PTPRJ-205ENST00000527952 YEATS2Q9ULM3 1422 aa39.61■■■■□ 3.93
PTPRJ-205ENST00000527952 PLCH2O75038 1416 aa39.6■■■■□ 3.93
PTPRJ-205ENST00000527952 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP39.59■■■■□ 3.93
PTPRJ-205ENST00000527952 SCAPERQ9BY12 1400 aa39.58■■■■□ 3.93
PTPRJ-205ENST00000527952 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa39.57■■■■□ 3.93
PTPRJ-205ENST00000527952 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa39.57■■■■□ 3.93
PTPRJ-205ENST00000527952 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa39.57■■■■□ 3.93
PTPRJ-205ENST00000527952 PLPPR3Q6T4P5 718 aa39.57■■■■□ 3.93
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