RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527952.1

PTPRJ-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRJ, Length 626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-205ENST00000527952 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.26■■■■■ 7.24
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PTPRJ-205ENST00000527952 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48.94■■■■■ 5.43
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PTPRJ-205ENST00000527952 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.49■■■■■ 4.87
PTPRJ-205ENST00000527952 WDR62O43379 1518 aa45.36■■■■■ 4.85
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PTPRJ-205ENST00000527952 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.29■■■■■ 4.84
PTPRJ-205ENST00000527952 CFTRP13569 1480 aa45.22■■■■■ 4.83
PTPRJ-205ENST00000527952 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.95■■■■■ 4.79
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PTPRJ-205ENST00000527952 PRDM2Q13029 1718 aa44.79■■■■■ 4.76
PTPRJ-205ENST00000527952 OSCARQ8IYS5 282 aa44.55■■■■■ 4.72
PTPRJ-205ENST00000527952 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44.44■■■■■ 4.7
PTPRJ-205ENST00000527952 TOPBP1Q92547 1522 aa44.43■■■■■ 4.7
PTPRJ-205ENST00000527952 IFT140Q96RY7 1462 aa44.39■■■■■ 4.7
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PTPRJ-205ENST00000527952 ABCC8Q09428 1581 aa44.21■■■■■ 4.67
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PTPRJ-205ENST00000527952 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa44.02■■■■■ 4.64
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PTPRJ-205ENST00000527952 ARHGEF11O15085 1522 aa43.84■■■■■ 4.61
PTPRJ-205ENST00000527952 FBLN2P98095 1184 aa43.81■■■■■ 4.6
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PTPRJ-205ENST00000527952 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.77■■■■■ 4.6
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PTPRJ-205ENST00000527952 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.55■■■■■ 4.56
PTPRJ-205ENST00000527952 WDR97A6NE52 1622 aa43.43■■■■■ 4.54
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PTPRJ-205ENST00000527952 ADAMTS12P58397 1594 aa42.8■■■■■ 4.44
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PTPRJ-205ENST00000527952 CEP170Q5SW79 1584 aa42.72■■■■■ 4.43
PTPRJ-205ENST00000527952 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.65■■■■■ 4.42
PTPRJ-205ENST00000527952 NUP160Q12769 1436 aa42.64■■■■■ 4.42
PTPRJ-205ENST00000527952 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.58■■■■■ 4.41
PTPRJ-205ENST00000527952 SHROOM2Q13796 1616 aa42.46■■■■■ 4.39
PTPRJ-205ENST00000527952 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP42.32■■■■■ 4.37
PTPRJ-205ENST00000527952 JPH4Q96JJ6 628 aa42.29■■■■■ 4.36
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PTPRJ-205ENST00000527952 IGF1RP08069 1367 aa42.11■■■■■ 4.33
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