RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527871.5

RPS2-208, Transcript of ribosomal protein S2, human

TSL 1 (best)

Gene RPS2, Length 1,243 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS2-208	ENST00000527871	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		42.53	■■■■■ 4.4
RPS2-208	ENST00000527871	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		42.41	■■■■■ 4.38
RPS2-208	ENST00000527871	CUL7	Q14999	1698 aa		42.38	■■■■■ 4.37
RPS2-208	ENST00000527871	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		42.33	■■■■■ 4.37
RPS2-208	ENST00000527871	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		42.12	■■■■■ 4.33
RPS2-208	ENST00000527871	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		42.1	■■■■■ 4.33
RPS2-208	ENST00000527871	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	42.09	■■■■■ 4.33
RPS2-208	ENST00000527871	MAPKBP1	O60336	1514 aa		42.04	■■■■■ 4.32
RPS2-208	ENST00000527871	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		42.04	■■■■■ 4.32
RPS2-208	ENST00000527871	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		42	■■■■■ 4.31
RPS2-208	ENST00000527871	PTPRG	P23470	1445 aa		42	■■■■■ 4.31
RPS2-208	ENST00000527871	IQGAP2	Q13576	1575 aa		41.93	■■■■■ 4.3
RPS2-208	ENST00000527871	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		41.92	■■■■■ 4.3
RPS2-208	ENST00000527871	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		41.92	■■■■■ 4.3
RPS2-208	ENST00000527871	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		41.91	■■■■■ 4.3
RPS2-208	ENST00000527871	DIP2B	Q9P265	1576 aa		41.87	■■■■■ 4.29
RPS2-208	ENST00000527871	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	41.84	■■■■■ 4.29
RPS2-208	ENST00000527871	DISP1	Q96F81	1524 aa		41.84	■■■■■ 4.29
RPS2-208	ENST00000527871	ABCC2	Q92887	1545 aa		41.74	■■■■■ 4.27
RPS2-208	ENST00000527871	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		41.74	■■■■■ 4.27
RPS2-208	ENST00000527871	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	41.72	■■■■■ 4.27
RPS2-208	ENST00000527871	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		41.71	■■■■■ 4.27
RPS2-208	ENST00000527871	UACA	Q9BZF9	1416 aa		41.68	■■■■■ 4.26
RPS2-208	ENST00000527871	ASXL2	Q76L83	1435 aa		41.6	■■■■■ 4.25
RPS2-208	ENST00000527871	PRX	Q9BXM0	1461 aa		41.57	■■■■■ 4.25
RPS2-208	ENST00000527871	KIAA0556	O60303	1618 aa		41.55	■■■■■ 4.24
RPS2-208	ENST00000527871	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		41.55	■■■■■ 4.24
RPS2-208	ENST00000527871	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		41.53	■■■■■ 4.24
RPS2-208	ENST00000527871	TSPOAP1	O95153	1857 aa		41.51	■■■■■ 4.24
RPS2-208	ENST00000527871	GLI2	P10070	1586 aa		41.46	■■■■■ 4.23
RPS2-208	ENST00000527871	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		41.42	■■■■■ 4.22
RPS2-208	ENST00000527871	KDM6B	O15054	1643 aa		41.42	■■■■■ 4.22
RPS2-208	ENST00000527871	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	41.35	■■■■■ 4.21
RPS2-208	ENST00000527871	GOLGA3	Q08378	1498 aa		41.34	■■■■■ 4.21
RPS2-208	ENST00000527871	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	41.34	■■■■■ 4.21
RPS2-208	ENST00000527871	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	41.33	■■■■■ 4.21
RPS2-208	ENST00000527871	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		41.28	■■■■■ 4.2
RPS2-208	ENST00000527871	ABCA8	O94911	1581 aa		41.24	■■■■■ 4.19
RPS2-208	ENST00000527871	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		41.19	■■■■■ 4.18
RPS2-208	ENST00000527871	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	41.18	■■■■■ 4.18
RPS2-208	ENST00000527871	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		41.18	■■■■■ 4.18
RPS2-208	ENST00000527871	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		41.18	■■■■■ 4.18
RPS2-208	ENST00000527871	P3H3	Q8IVL6	736 aa		41.08	■■■■■ 4.17
RPS2-208	ENST00000527871	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		41.04	■■■■■ 4.16
RPS2-208	ENST00000527871	EEA1	Q15075	1411 aa		41.01	■■■■■ 4.16
RPS2-208	ENST00000527871	KCNH8	Q96L42	1107 aa		41.01	■■■■■ 4.16
RPS2-208	ENST00000527871	ATP10B	O94823	1461 aa		40.96	■■■■■ 4.15
RPS2-208	ENST00000527871	SAMD9	Q5K651	1589 aa		40.95	■■■■■ 4.15
RPS2-208	ENST00000527871	CD109	Q6YHK3	1445 aa		40.95	■■■■■ 4.15
RPS2-208	ENST00000527871	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		40.93	■■■■■ 4.14
RPS2-208	ENST00000527871	ARID3C	A6NKF2	412 aa		40.89	■■■■■ 4.14
RPS2-208	ENST00000527871	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	40.89	■■■■■ 4.14
RPS2-208	ENST00000527871	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		40.86	■■■■■ 4.13
RPS2-208	ENST00000527871	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	40.73	■■■■■ 4.11
RPS2-208	ENST00000527871	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		40.73	■■■■■ 4.11
RPS2-208	ENST00000527871	ADGRL1	O94910	1474 aa		40.72	■■■■■ 4.11
RPS2-208	ENST00000527871	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		40.7	■■■■■ 4.11
RPS2-208	ENST00000527871	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	40.69	■■■■■ 4.1
RPS2-208	ENST00000527871	KIF21B	O75037	1637 aa		40.67	■■■■■ 4.1
RPS2-208	ENST00000527871	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		40.64	■■■■■ 4.1
RPS2-208	ENST00000527871	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		40.63	■■■■■ 4.09
RPS2-208	ENST00000527871	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		40.62	■■■■■ 4.09
RPS2-208	ENST00000527871	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	40.58	■■■■■ 4.09
RPS2-208	ENST00000527871	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	40.58	■■■■■ 4.09
RPS2-208	ENST00000527871	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		40.53	■■■■■ 4.08
RPS2-208	ENST00000527871	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		40.52	■■■■■ 4.08
RPS2-208	ENST00000527871	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		40.45	■■■■■ 4.07
RPS2-208	ENST00000527871	NEO1	Q92859	1461 aa		40.43	■■■■■ 4.06
RPS2-208	ENST00000527871	RAPGEF3	O95398	923 aa		40.41	■■■■■ 4.06
RPS2-208	ENST00000527871	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	40.4	■■■■■ 4.06
RPS2-208	ENST00000527871	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		40.39	■■■■■ 4.06
RPS2-208	ENST00000527871	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		40.28	■■■■■ 4.04
RPS2-208	ENST00000527871	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	40.26	■■■■■ 4.04	not detected	■□□□□ 9.1
RPS2-208	ENST00000527871	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	40.25	■■■■■ 4.03
RPS2-208	ENST00000527871	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		40.24	■■■■■ 4.03
RPS2-208	ENST00000527871	FMN1	Q68DA7	1419 aa		40.19	■■■■■ 4.02
RPS2-208	ENST00000527871	AKNA	Q7Z591	1439 aa		40.19	■■■■■ 4.02
RPS2-208	ENST00000527871	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		40.16	■■■■■ 4.02
RPS2-208	ENST00000527871	FANCA	O15360	1455 aa		40.16	■■■■■ 4.02
RPS2-208	ENST00000527871	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	40.13	■■■■■ 4.02
RPS2-208	ENST00000527871	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		40.11	■■■■■ 4.01
RPS2-208	ENST00000527871	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	40.1	■■■■■ 4.01
RPS2-208	ENST00000527871	RICTOR	Q6R327	1708 aa		40.07	■■■■■ 4
RPS2-208	ENST00000527871	PLCH2	O75038	1416 aa		40.07	■■■■■ 4
RPS2-208	ENST00000527871	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		40.06	■■■■■ 4
RPS2-208	ENST00000527871	HECW1	Q76N89	1606 aa		40.05	■■■■■ 4
RPS2-208	ENST00000527871	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		40.01	■■■■■ 4
RPS2-208	ENST00000527871	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	39.99	■■■■□ 3.99
RPS2-208	ENST00000527871	PTPRM	P28827	1452 aa		39.98	■■■■□ 3.99
RPS2-208	ENST00000527871	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		39.96	■■■■□ 3.99
RPS2-208	ENST00000527871	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	39.95	■■■■□ 3.99
RPS2-208	ENST00000527871	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		39.94	■■■■□ 3.98
RPS2-208	ENST00000527871	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		39.94	■■■■□ 3.98
RPS2-208	ENST00000527871	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		39.92	■■■■□ 3.98
RPS2-208	ENST00000527871	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	39.91	■■■■□ 3.98
RPS2-208	ENST00000527871	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		39.91	■■■■□ 3.98
RPS2-208	ENST00000527871	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		39.89	■■■■□ 3.98
RPS2-208	ENST00000527871	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		39.88	■■■■□ 3.97
RPS2-208	ENST00000527871	KIF14	Q15058	1648 aa		39.87	■■■■□ 3.97
RPS2-208	ENST00000527871	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		39.87	■■■■□ 3.97

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