RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524349.5

RPS20-211, Transcript of ribosomal protein S20, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RPS20, Length 752 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS20-211ENST00000524349 JPH4Q96JJ6 628 aa43.15■■■■■ 4.5
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RPS20-211ENST00000524349 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa43.01■■■■■ 4.48
RPS20-211ENST00000524349 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.85■■■■■ 4.45
RPS20-211ENST00000524349 IQGAP2Q13576 1575 aa42.71■■■■■ 4.43
RPS20-211ENST00000524349 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP42.7■■■■■ 4.43
RPS20-211ENST00000524349 PRXQ9BXM0 1461 aa42.58■■■■■ 4.41
RPS20-211ENST00000524349 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa42.57■■■■■ 4.41
RPS20-211ENST00000524349 PTPRGP23470 1445 aa42.54■■■■■ 4.4
RPS20-211ENST00000524349 CSRNP3Q8WYN3 585 aa42.5■■■■■ 4.39
RPS20-211ENST00000524349 TNIKQ9UKE5 1360 aa42.49■■■■■ 4.39
RPS20-211ENST00000524349 ADCY10Q96PN6 1610 aa42.48■■■■■ 4.39
RPS20-211ENST00000524349 DISP1Q96F81 1524 aa42.47■■■■■ 4.39
RPS20-211ENST00000524349 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP42.47■■■■■ 4.39
RPS20-211ENST00000524349 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP42.45■■■■■ 4.39
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RPS20-211ENST00000524349 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.41■■■■■ 4.38
RPS20-211ENST00000524349 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa42.38■■■■■ 4.37
RPS20-211ENST00000524349 EEA1Q15075 1411 aa42.33■■■■■ 4.37
RPS20-211ENST00000524349 KIAA0556O60303 1618 aa42.31■■■■■ 4.36
RPS20-211ENST00000524349 MAPKBP1O60336 1514 aa42.22■■■■■ 4.35
RPS20-211ENST00000524349 UACAQ9BZF9 1416 aa42.2■■■■■ 4.35
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RPS20-211ENST00000524349 ABCC2Q92887 1545 aa42.16■■■■■ 4.34
RPS20-211ENST00000524349 ABCC10Q5T3U5 1492 aa42.14■■■■■ 4.34
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RPS20-211ENST00000524349 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa42.11■■■■■ 4.33
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RPS20-211ENST00000524349 EHMT2Q96KQ7 1210 aa42.08■■■■■ 4.33
RPS20-211ENST00000524349 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP42.07■■■■■ 4.33
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RPS20-211ENST00000524349 PLB1Q6P1J6 1458 aa42.04■■■■■ 4.32
RPS20-211ENST00000524349 ASXL2Q76L83 1435 aa42■■■■■ 4.31
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RPS20-211ENST00000524349 KDM5BQ9UGL1 1544 aa41.95■■■■■ 4.31
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RPS20-211ENST00000524349 FHOD3Q2V2M9 1422 aa41.75■■■■■ 4.27
RPS20-211ENST00000524349 TSPOAP1O95153 1857 aa41.74■■■■■ 4.27
RPS20-211ENST00000524349 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP41.71■■■■■ 4.27
RPS20-211ENST00000524349 WDR7Q9Y4E6 1490 aa41.67■■■■■ 4.26
RPS20-211ENST00000524349 GLI2P10070 1586 aa41.67■■■■■ 4.26
RPS20-211ENST00000524349 KCNH8Q96L42 1107 aa41.61■■■■■ 4.25
RPS20-211ENST00000524349 ATP10BO94823 1461 aa41.58■■■■■ 4.25
RPS20-211ENST00000524349 EFCAB5A4FU69 1503 aa41.57■■■■■ 4.25
RPS20-211ENST00000524349 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa41.57■■■■■ 4.25
RPS20-211ENST00000524349 KDM6BO15054 1643 aa41.51■■■■■ 4.24
RPS20-211ENST00000524349 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP41.51■■■■■ 4.24
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RPS20-211ENST00000524349 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP41.51■■■■■ 4.24
RPS20-211ENST00000524349 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa41.49■■■■■ 4.23
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RPS20-211ENST00000524349 CD109Q6YHK3 1445 aa41.36■■■■■ 4.21
RPS20-211ENST00000524349 TEX14Q8IWB6 1497 aa41.34■■■■■ 4.21
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RPS20-211ENST00000524349 CFAP43Q8NDM7 1665 aa41.26■■■■■ 4.2
RPS20-211ENST00000524349 FMN1Q68DA7 1419 aa41.23■■■■■ 4.19
RPS20-211ENST00000524349 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa41.23■■■■■ 4.19
RPS20-211ENST00000524349 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP41.2■■■■■ 4.19
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RPS20-211ENST00000524349 ABCA9Q8IUA7 1624 aa41.12■■■■■ 4.17
RPS20-211ENST00000524349 HECW1Q76N89 1606 aa41.08■■■■■ 4.17
RPS20-211ENST00000524349 CLIP1P30622 1438 aa41.03■■■■■ 4.16
RPS20-211ENST00000524349 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP40.93■■■■■ 4.141e-70■□□□□ 10.3
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RPS20-211ENST00000524349 ARAP3Q8WWN8 1544 aa40.87■■■■■ 4.13
RPS20-211ENST00000524349 NEO1Q92859 1461 aa40.85■■■■■ 4.13
RPS20-211ENST00000524349 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa40.85■■■■■ 4.13
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RPS20-211ENST00000524349 CEP162Q5TB80 1403 aa40.75■■■■■ 4.11
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RPS20-211ENST00000524349 MYO5CQ9NQX4 1742 aa40.56■■■■■ 4.08
RPS20-211ENST00000524349 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa40.55■■■■■ 4.08
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RPS20-211ENST00000524349 ARHGAP5Q13017 1502 aa40.52■■■■■ 4.08
RPS20-211ENST00000524349 RICTORQ6R327 1708 aa40.48■■■■■ 4.07
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