RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522721.1

SORBS3-215, Transcript of sorbin and SH3 domain containing 3, humanhuman

TSL 4

Gene SORBS3, Length 601 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORBS3-215ENST00000522721 JPH4Q96JJ6 628 aa39.91■■■■□ 3.98
SORBS3-215ENST00000522721 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP39.89■■■■□ 3.98
SORBS3-215ENST00000522721 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa39.86■■■■□ 3.97
SORBS3-215ENST00000522721 TRHP20396 242 aaPredicted RBP39.66■■■■□ 3.94
SORBS3-215ENST00000522721 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.65■■■■□ 3.94
SORBS3-215ENST00000522721 IQGAP2Q13576 1575 aa39.54■■■■□ 3.92
SORBS3-215ENST00000522721 PRXQ9BXM0 1461 aa39.46■■■■□ 3.91
SORBS3-215ENST00000522721 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa39.39■■■■□ 3.9
SORBS3-215ENST00000522721 ADCY10Q96PN6 1610 aa39.36■■■■□ 3.89
SORBS3-215ENST00000522721 DISP1Q96F81 1524 aa39.36■■■■□ 3.89
SORBS3-215ENST00000522721 UGGT2Q9NYU1 1516 aa39.36■■■■□ 3.89
SORBS3-215ENST00000522721 TNIKQ9UKE5 1360 aa39.34■■■■□ 3.89
SORBS3-215ENST00000522721 PTPRGP23470 1445 aa39.34■■■■□ 3.89
SORBS3-215ENST00000522721 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa39.23■■■■□ 3.87
SORBS3-215ENST00000522721 CSRNP3Q8WYN3 585 aa39.23■■■■□ 3.87
SORBS3-215ENST00000522721 MAPKBP1O60336 1514 aa39.22■■■■□ 3.87
SORBS3-215ENST00000522721 EEA1Q15075 1411 aa39.21■■■■□ 3.87
SORBS3-215ENST00000522721 KIAA0556O60303 1618 aa39.2■■■■□ 3.87
SORBS3-215ENST00000522721 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP39.18■■■■□ 3.86
SORBS3-215ENST00000522721 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP39.14■■■■□ 3.86
SORBS3-215ENST00000522721 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa39.11■■■■□ 3.85
SORBS3-215ENST00000522721 KIF13AQ9H1H9 1805 aa39.1■■■■□ 3.85
SORBS3-215ENST00000522721 ABCC10Q5T3U5 1492 aa39.1■■■■□ 3.85
SORBS3-215ENST00000522721 CHIC1Q5VXU3 224 aa39.09■■■■□ 3.85
SORBS3-215ENST00000522721 ABCC2Q92887 1545 aa39.09■■■■□ 3.85
SORBS3-215ENST00000522721 UACAQ9BZF9 1416 aa39.07■■■■□ 3.85
SORBS3-215ENST00000522721 GOLGA3Q08378 1498 aa39.04■■■■□ 3.84
SORBS3-215ENST00000522721 DIP2BQ9P265 1576 aa39.01■■■■□ 3.84
SORBS3-215ENST00000522721 FAM69CQ0P6D2 419 aa38.96■■■■□ 3.83
SORBS3-215ENST00000522721 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP38.93■■■■□ 3.82
SORBS3-215ENST00000522721 KDM5BQ9UGL1 1544 aa38.92■■■■□ 3.82
SORBS3-215ENST00000522721 ASXL2Q76L83 1435 aa38.87■■■■□ 3.81
SORBS3-215ENST00000522721 PLB1Q6P1J6 1458 aa38.86■■■■□ 3.81
SORBS3-215ENST00000522721 KIF21BO75037 1637 aa38.85■■■■□ 3.81
SORBS3-215ENST00000522721 ABCA8O94911 1581 aa38.82■■■■□ 3.8
SORBS3-215ENST00000522721 SAMD9Q5K651 1589 aa38.8■■■■□ 3.8
SORBS3-215ENST00000522721 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP38.78■■■■□ 3.8
SORBS3-215ENST00000522721 GLI2P10070 1586 aa38.71■■■■□ 3.79
SORBS3-215ENST00000522721 P3H3Q8IVL6 736 aa38.71■■■■□ 3.79
SORBS3-215ENST00000522721 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP38.66■■■■□ 3.78
SORBS3-215ENST00000522721 WDR7Q9Y4E6 1490 aa38.6■■■■□ 3.77
SORBS3-215ENST00000522721 TSPOAP1O95153 1857 aa38.57■■■■□ 3.76
SORBS3-215ENST00000522721 FHOD3Q2V2M9 1422 aa38.54■■■■□ 3.76
SORBS3-215ENST00000522721 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP38.53■■■■□ 3.76
SORBS3-215ENST00000522721 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP38.52■■■■□ 3.76
SORBS3-215ENST00000522721 EFCAB5A4FU69 1503 aa38.51■■■■□ 3.76
SORBS3-215ENST00000522721 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa38.5■■■■□ 3.75
SORBS3-215ENST00000522721 ATP10BO94823 1461 aa38.49■■■■□ 3.75
SORBS3-215ENST00000522721 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa38.47■■■■□ 3.75
SORBS3-215ENST00000522721 KDM6BO15054 1643 aa38.45■■■■□ 3.75
SORBS3-215ENST00000522721 UBTFP17480 764 aaKnown RBP38.43■■■■□ 3.74
SORBS3-215ENST00000522721 EHMT2Q96KQ7 1210 aa38.43■■■■□ 3.74
SORBS3-215ENST00000522721 ARID3CA6NKF2 412 aa38.39■■■■□ 3.74
SORBS3-215ENST00000522721 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP38.39■■■■□ 3.74
SORBS3-215ENST00000522721 KCNH8Q96L42 1107 aa38.32■■■■□ 3.72
SORBS3-215ENST00000522721 TEX14Q8IWB6 1497 aa38.32■■■■□ 3.72
SORBS3-215ENST00000522721 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa38.28■■■■□ 3.72
SORBS3-215ENST00000522721 CFAP43Q8NDM7 1665 aa38.28■■■■□ 3.72
SORBS3-215ENST00000522721 CD109Q6YHK3 1445 aa38.27■■■■□ 3.72
SORBS3-215ENST00000522721 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa38.27■■■■□ 3.72
SORBS3-215ENST00000522721 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP38.25■■■■□ 3.71
SORBS3-215ENST00000522721 ABCA9Q8IUA7 1624 aa38.15■■■■□ 3.7
SORBS3-215ENST00000522721 FMN1Q68DA7 1419 aa38.14■■■■□ 3.7
SORBS3-215ENST00000522721 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP38.14■■■■□ 3.7
SORBS3-215ENST00000522721 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP38.14■■■■□ 3.7
SORBS3-215ENST00000522721 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP38.05■■■■□ 3.68
SORBS3-215ENST00000522721 PLEKHD1A6NEE1 506 aa38.03■■■■□ 3.68
SORBS3-215ENST00000522721 HECW1Q76N89 1606 aa38.01■■■■□ 3.67
SORBS3-215ENST00000522721 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP37.96■■■■□ 3.67
SORBS3-215ENST00000522721 ARAP3Q8WWN8 1544 aa37.94■■■■□ 3.66
SORBS3-215ENST00000522721 PHLDB1Q86UU1 1377 aa37.91■■■■□ 3.66
SORBS3-215ENST00000522721 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP37.9■■■■□ 3.66
SORBS3-215ENST00000522721 NEO1Q92859 1461 aa37.89■■■■□ 3.66
SORBS3-215ENST00000522721 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP37.87■■■■□ 3.65
SORBS3-215ENST00000522721 CLIP1P30622 1438 aa37.86■■■■□ 3.65
SORBS3-215ENST00000522721 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa37.85■■■■□ 3.65
SORBS3-215ENST00000522721 TTC37Q6PGP7 1564 aa37.84■■■■□ 3.65
SORBS3-215ENST00000522721 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa37.83■■■■□ 3.65
SORBS3-215ENST00000522721 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP37.8■■■■□ 3.64
SORBS3-215ENST00000522721 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa37.8■■■■□ 3.64
SORBS3-215ENST00000522721 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP37.75■■■■□ 3.63
SORBS3-215ENST00000522721 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP37.73■■■■□ 3.63
SORBS3-215ENST00000522721 FANCAO15360 1455 aa37.71■■■■□ 3.63
SORBS3-215ENST00000522721 CCDC18Q5T9S5 1454 aa37.7■■■■□ 3.63
SORBS3-215ENST00000522721 FYCO1Q9BQS8 1478 aa37.7■■■■□ 3.63
SORBS3-215ENST00000522721 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa37.69■■■■□ 3.62
SORBS3-215ENST00000522721 RAPGEF3O95398 923 aa37.68■■■■□ 3.62
SORBS3-215ENST00000522721 PLCH2O75038 1416 aa37.68■■■■□ 3.62
SORBS3-215ENST00000522721 AKNAQ7Z591 1439 aa37.68■■■■□ 3.62
SORBS3-215ENST00000522721 ADGRL1O94910 1474 aa37.67■■■■□ 3.62
SORBS3-215ENST00000522721 KIF14Q15058 1648 aa37.67■■■■□ 3.62
SORBS3-215ENST00000522721 CFAP74Q9C0B2 1584 aa37.66■■■■□ 3.62
SORBS3-215ENST00000522721 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP37.6■■■■□ 3.61
SORBS3-215ENST00000522721 CEP162Q5TB80 1403 aa37.59■■■■□ 3.61
SORBS3-215ENST00000522721 RICTORQ6R327 1708 aa37.56■■■■□ 3.6
SORBS3-215ENST00000522721 MYO5CQ9NQX4 1742 aa37.53■■■■□ 3.6
SORBS3-215ENST00000522721 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa37.47■■■■□ 3.59
SORBS3-215ENST00000522721 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa37.46■■■■□ 3.59
SORBS3-215ENST00000522721 SCAPERQ9BY12 1400 aa37.45■■■■□ 3.59
SORBS3-215ENST00000522721 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa37.45■■■■□ 3.59
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