RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522635.5

TCEA1-211, Transcript of transcription elongation factor A1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TCEA1, Length 1,432 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1-211ENST00000522635 UBTFP17480 764 aaKnown RBP38.14■■■■□ 3.7
TCEA1-211ENST00000522635 TNIKQ9UKE5 1360 aa38.1■■■■□ 3.69
TCEA1-211ENST00000522635 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa38.05■■■■□ 3.68
TCEA1-211ENST00000522635 IQGAP2Q13576 1575 aa38.01■■■■□ 3.68
TCEA1-211ENST00000522635 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.99■■■■□ 3.67
TCEA1-211ENST00000522635 OSCARQ8IYS5 282 aa37.89■■■■□ 3.66
TCEA1-211ENST00000522635 CEP162Q5TB80 1403 aa37.83■■■■□ 3.65
TCEA1-211ENST00000522635 UGGT2Q9NYU1 1516 aa37.83■■■■□ 3.65
TCEA1-211ENST00000522635 SHROOM2Q13796 1616 aa37.83■■■■□ 3.65
TCEA1-211ENST00000522635 CLIP1P30622 1438 aa37.75■■■■□ 3.63
TCEA1-211ENST00000522635 SAMD9Q5K651 1589 aa37.74■■■■□ 3.63
TCEA1-211ENST00000522635 EFCAB5A4FU69 1503 aa37.74■■■■□ 3.63
TCEA1-211ENST00000522635 JPH4Q96JJ6 628 aa37.72■■■■□ 3.63
TCEA1-211ENST00000522635 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP37.71■■■■□ 3.63
TCEA1-211ENST00000522635 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa37.68■■■■□ 3.62
TCEA1-211ENST00000522635 DISP1Q96F81 1524 aa37.67■■■■□ 3.62
TCEA1-211ENST00000522635 KIAA0556O60303 1618 aa37.66■■■■□ 3.62
TCEA1-211ENST00000522635 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP37.63■■■■□ 3.61
TCEA1-211ENST00000522635 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa37.58■■■■□ 3.61
TCEA1-211ENST00000522635 ERCC6L2Q5T890 1561 aa37.55■■■■□ 3.6
TCEA1-211ENST00000522635 ARAP1Q96P48 1450 aa37.54■■■■□ 3.6
TCEA1-211ENST00000522635 FHOD3Q2V2M9 1422 aa37.51■■■■□ 3.6
TCEA1-211ENST00000522635 P3H3Q8IVL6 736 aa37.47■■■■□ 3.59
TCEA1-211ENST00000522635 ARHGEF11O15085 1522 aa37.39■■■■□ 3.58
TCEA1-211ENST00000522635 FMN1Q68DA7 1419 aa37.32■■■■□ 3.57
TCEA1-211ENST00000522635 VPS8Q8N3P4 1428 aa37.31■■■■□ 3.56
TCEA1-211ENST00000522635 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.28■■■■□ 3.56
TCEA1-211ENST00000522635 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.28■■■■□ 3.56
TCEA1-211ENST00000522635 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.28■■■■□ 3.56
TCEA1-211ENST00000522635 PTPRGP23470 1445 aa37.27■■■■□ 3.56
TCEA1-211ENST00000522635 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP37.22■■■■□ 3.55
TCEA1-211ENST00000522635 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP37.2■■■■□ 3.55
TCEA1-211ENST00000522635 ABCA8O94911 1581 aa37.16■■■■□ 3.54
TCEA1-211ENST00000522635 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.16■■■■□ 3.54
TCEA1-211ENST00000522635 PLB1Q6P1J6 1458 aa37.15■■■■□ 3.54
TCEA1-211ENST00000522635 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa37.15■■■■□ 3.54
TCEA1-211ENST00000522635 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa37.15■■■■□ 3.54
TCEA1-211ENST00000522635 FYCO1Q9BQS8 1478 aa37.15■■■■□ 3.54
TCEA1-211ENST00000522635 HECW1Q76N89 1606 aa37.09■■■■□ 3.53
TCEA1-211ENST00000522635 UACAQ9BZF9 1416 aa37.08■■■■□ 3.53
TCEA1-211ENST00000522635 ABCC2Q92887 1545 aa37.05■■■■□ 3.52
TCEA1-211ENST00000522635 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP37.03■■■■□ 3.52
TCEA1-211ENST00000522635 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa37.02■■■■□ 3.52
TCEA1-211ENST00000522635 ADCY10Q96PN6 1610 aa36.98■■■■□ 3.51
TCEA1-211ENST00000522635 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa36.97■■■■□ 3.51
TCEA1-211ENST00000522635 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP36.92■■■■□ 3.5
TCEA1-211ENST00000522635 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP36.92■■■■□ 3.5
TCEA1-211ENST00000522635 CCDC18Q5T9S5 1454 aa36.91■■■■□ 3.5
TCEA1-211ENST00000522635 CFAP43Q8NDM7 1665 aa36.89■■■■□ 3.5
TCEA1-211ENST00000522635 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.88■■■■□ 3.49
TCEA1-211ENST00000522635 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP36.87■■■■□ 3.49
TCEA1-211ENST00000522635 TIAM1Q13009 1591 aa36.86■■■■□ 3.49
TCEA1-211ENST00000522635 MAP3K1Q13233 1512 aa36.86■■■■□ 3.49
TCEA1-211ENST00000522635 KDM5BQ9UGL1 1544 aa36.84■■■■□ 3.49
TCEA1-211ENST00000522635 ATP10BO94823 1461 aa36.82■■■■□ 3.49
TCEA1-211ENST00000522635 ARID3CA6NKF2 412 aa36.8■■■■□ 3.48
TCEA1-211ENST00000522635 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP36.8■■■■□ 3.48
TCEA1-211ENST00000522635 APLP2Q06481 763 aa36.76■■■■□ 3.47
TCEA1-211ENST00000522635 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa36.67■■■■□ 3.46
TCEA1-211ENST00000522635 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa36.66■■■■□ 3.46
TCEA1-211ENST00000522635 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP36.66■■■■□ 3.46
TCEA1-211ENST00000522635 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP36.66■■■■□ 3.46
TCEA1-211ENST00000522635 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa36.63■■■■□ 3.45
TCEA1-211ENST00000522635 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP36.6■■■■□ 3.45
TCEA1-211ENST00000522635 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP36.59■■■■□ 3.45
TCEA1-211ENST00000522635 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP36.59■■■■□ 3.45
TCEA1-211ENST00000522635 MTUS2Q5JR59 1369 aa36.58■■■■□ 3.45
TCEA1-211ENST00000522635 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP36.57■■■■□ 3.44
TCEA1-211ENST00000522635 MAPKBP1O60336 1514 aa36.55■■■■□ 3.44
TCEA1-211ENST00000522635 PLEKHD1A6NEE1 506 aa36.52■■■■□ 3.44
TCEA1-211ENST00000522635 ASXL2Q76L83 1435 aa36.52■■■■□ 3.44
TCEA1-211ENST00000522635 WDR7Q9Y4E6 1490 aa36.52■■■■□ 3.44
TCEA1-211ENST00000522635 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP36.47■■■■□ 3.43
TCEA1-211ENST00000522635 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP36.45■■■■□ 3.43
TCEA1-211ENST00000522635 KIF14Q15058 1648 aa36.44■■■■□ 3.42
TCEA1-211ENST00000522635 NCOA2Q15596 1464 aa36.39■■■■□ 3.42
TCEA1-211ENST00000522635 ABCC10Q5T3U5 1492 aa36.32■■■■□ 3.4
TCEA1-211ENST00000522635 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP36.3■■■■□ 3.44e-8■■■■■ 52.5
TCEA1-211ENST00000522635 TTC37Q6PGP7 1564 aa36.3■■■■□ 3.4
TCEA1-211ENST00000522635 KCNH8Q96L42 1107 aa36.28■■■■□ 3.4
TCEA1-211ENST00000522635 ABCA9Q8IUA7 1624 aa36.26■■■■□ 3.4
TCEA1-211ENST00000522635 PHLDB1Q86UU1 1377 aa36.25■■■■□ 3.39
TCEA1-211ENST00000522635 DIP2BQ9P265 1576 aa36.24■■■■□ 3.39
TCEA1-211ENST00000522635 GLI2P10070 1586 aa36.21■■■■□ 3.39
TCEA1-211ENST00000522635 CCNB3Q8WWL7 1395 aa36.19■■■■□ 3.38
TCEA1-211ENST00000522635 MYOM3Q5VTT5 1437 aa36.19■■■■□ 3.38
TCEA1-211ENST00000522635 ITSN2Q9NZM3 1697 aa36.18■■■■□ 3.38
TCEA1-211ENST00000522635 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa36.17■■■■□ 3.38
TCEA1-211ENST00000522635 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP36.16■■■■□ 3.38
TCEA1-211ENST00000522635 MYO5CQ9NQX4 1742 aa36.15■■■■□ 3.38
TCEA1-211ENST00000522635 PREX2Q70Z35 1606 aa36.15■■■■□ 3.38
TCEA1-211ENST00000522635 KIF13AQ9H1H9 1805 aa36.11■■■■□ 3.37
TCEA1-211ENST00000522635 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa36.1■■■■□ 3.37
TCEA1-211ENST00000522635 FGD6Q6ZV73 1430 aa36.08■■■■□ 3.37
TCEA1-211ENST00000522635 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa36.08■■■■□ 3.37
TCEA1-211ENST00000522635 ARAP3Q8WWN8 1544 aa36.07■■■■□ 3.36
TCEA1-211ENST00000522635 PLCH2O75038 1416 aa36.06■■■■□ 3.36
TCEA1-211ENST00000522635 MIA2Q96PC5 1412 aa36.06■■■■□ 3.36
TCEA1-211ENST00000522635 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP36.04■■■■□ 3.36
TCEA1-211ENST00000522635 FAM69CQ0P6D2 419 aa36.04■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.6 ms