RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519645.5

HACE1-210, Transcript of HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

TSL 5

Gene HACE1, Length 859 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1-210ENST00000519645 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.3■■■■■ 4.04
HACE1-210ENST00000519645 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.27■■■■■ 4.04
HACE1-210ENST00000519645 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa40.24■■■■■ 4.03
HACE1-210ENST00000519645 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40.11■■■■■ 4.01
HACE1-210ENST00000519645 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.07■■■■■ 4.01
HACE1-210ENST00000519645 IQGAP2Q13576 1575 aa39.93■■■■□ 3.98
HACE1-210ENST00000519645 PRXQ9BXM0 1461 aa39.88■■■■□ 3.97
HACE1-210ENST00000519645 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa39.86■■■■□ 3.97
HACE1-210ENST00000519645 CSRNP3Q8WYN3 585 aa39.83■■■■□ 3.97
HACE1-210ENST00000519645 CHIC1Q5VXU3 224 aa39.77■■■■□ 3.96
HACE1-210ENST00000519645 PTPRGP23470 1445 aa39.76■■■■□ 3.96
HACE1-210ENST00000519645 EEA1Q15075 1411 aa39.76■■■■□ 3.96
HACE1-210ENST00000519645 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP39.75■■■■□ 3.95
HACE1-210ENST00000519645 TNIKQ9UKE5 1360 aa39.74■■■■□ 3.95
HACE1-210ENST00000519645 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP39.71■■■■□ 3.95
HACE1-210ENST00000519645 UGGT2Q9NYU1 1516 aa39.7■■■■□ 3.95
HACE1-210ENST00000519645 DISP1Q96F81 1524 aa39.69■■■■□ 3.94
HACE1-210ENST00000519645 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP39.67■■■■□ 3.94
HACE1-210ENST00000519645 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa39.63■■■■□ 3.93
HACE1-210ENST00000519645 ADCY10Q96PN6 1610 aa39.62■■■■□ 3.93
HACE1-210ENST00000519645 KIAA0556O60303 1618 aa39.54■■■■□ 3.92
HACE1-210ENST00000519645 GOLGA3Q08378 1498 aa39.5■■■■□ 3.91
HACE1-210ENST00000519645 UACAQ9BZF9 1416 aa39.46■■■■□ 3.91
HACE1-210ENST00000519645 MAPKBP1O60336 1514 aa39.45■■■■□ 3.91
HACE1-210ENST00000519645 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa39.41■■■■□ 3.9
HACE1-210ENST00000519645 ABCC2Q92887 1545 aa39.4■■■■□ 3.9
HACE1-210ENST00000519645 FAM69CQ0P6D2 419 aa39.35■■■■□ 3.89
HACE1-210ENST00000519645 ABCC10Q5T3U5 1492 aa39.35■■■■□ 3.89
HACE1-210ENST00000519645 KIF21BO75037 1637 aa39.32■■■■□ 3.88
HACE1-210ENST00000519645 P3H3Q8IVL6 736 aa39.28■■■■□ 3.88
HACE1-210ENST00000519645 KIF13AQ9H1H9 1805 aa39.26■■■■□ 3.87
HACE1-210ENST00000519645 PLB1Q6P1J6 1458 aa39.24■■■■□ 3.87
HACE1-210ENST00000519645 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP39.23■■■■□ 3.87
HACE1-210ENST00000519645 DIP2BQ9P265 1576 aa39.22■■■■□ 3.87
HACE1-210ENST00000519645 KDM5BQ9UGL1 1544 aa39.22■■■■□ 3.87
HACE1-210ENST00000519645 EHMT2Q96KQ7 1210 aa39.21■■■■□ 3.87
HACE1-210ENST00000519645 ASXL2Q76L83 1435 aa39.21■■■■□ 3.87
HACE1-210ENST00000519645 SAMD9Q5K651 1589 aa39.16■■■■□ 3.86
HACE1-210ENST00000519645 UBTFP17480 764 aaKnown RBP39.15■■■■□ 3.86
HACE1-210ENST00000519645 ABCA8O94911 1581 aa39.13■■■■□ 3.85
HACE1-210ENST00000519645 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP39.1■■■■□ 3.85
HACE1-210ENST00000519645 FHOD3Q2V2M9 1422 aa38.99■■■■□ 3.83
HACE1-210ENST00000519645 EFCAB5A4FU69 1503 aa38.96■■■■□ 3.83
HACE1-210ENST00000519645 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP38.95■■■■□ 3.83
HACE1-210ENST00000519645 ARID3CA6NKF2 412 aa38.95■■■■□ 3.83
HACE1-210ENST00000519645 GLI2P10070 1586 aa38.95■■■■□ 3.83
HACE1-210ENST00000519645 WDR7Q9Y4E6 1490 aa38.94■■■■□ 3.82
HACE1-210ENST00000519645 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa38.86■■■■□ 3.81
HACE1-210ENST00000519645 TSPOAP1O95153 1857 aa38.86■■■■□ 3.81
HACE1-210ENST00000519645 ATP10BO94823 1461 aa38.86■■■■□ 3.81
HACE1-210ENST00000519645 KCNH8Q96L42 1107 aa38.84■■■■□ 3.81
HACE1-210ENST00000519645 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP38.79■■■■□ 3.8
HACE1-210ENST00000519645 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP38.79■■■■□ 3.8
HACE1-210ENST00000519645 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP38.76■■■■□ 3.8
HACE1-210ENST00000519645 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa38.73■■■■□ 3.79
HACE1-210ENST00000519645 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa38.73■■■■□ 3.79
HACE1-210ENST00000519645 KDM6BO15054 1643 aa38.71■■■■□ 3.79
HACE1-210ENST00000519645 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP38.68■■■■□ 3.78
HACE1-210ENST00000519645 TEX14Q8IWB6 1497 aa38.66■■■■□ 3.78
HACE1-210ENST00000519645 FMN1Q68DA7 1419 aa38.65■■■■□ 3.78
HACE1-210ENST00000519645 CD109Q6YHK3 1445 aa38.65■■■■□ 3.78
HACE1-210ENST00000519645 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP38.58■■■■□ 3.77
HACE1-210ENST00000519645 CFAP43Q8NDM7 1665 aa38.58■■■■□ 3.77
HACE1-210ENST00000519645 PLEKHD1A6NEE1 506 aa38.57■■■■□ 3.76
HACE1-210ENST00000519645 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa38.54■■■■□ 3.76
HACE1-210ENST00000519645 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP38.46■■■■□ 3.75
HACE1-210ENST00000519645 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP38.46■■■■□ 3.75
HACE1-210ENST00000519645 HECW1Q76N89 1606 aa38.45■■■■□ 3.75
HACE1-210ENST00000519645 ABCA9Q8IUA7 1624 aa38.44■■■■□ 3.74
HACE1-210ENST00000519645 CLIP1P30622 1438 aa38.44■■■■□ 3.74
HACE1-210ENST00000519645 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP38.35■■■■□ 3.73
HACE1-210ENST00000519645 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa38.3■■■■□ 3.72
HACE1-210ENST00000519645 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP38.3■■■■□ 3.72
HACE1-210ENST00000519645 PHLDB1Q86UU1 1377 aa38.27■■■■□ 3.72
HACE1-210ENST00000519645 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP38.24■■■■□ 3.71
HACE1-210ENST00000519645 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP38.24■■■■□ 3.71
HACE1-210ENST00000519645 ARAP3Q8WWN8 1544 aa38.22■■■■□ 3.71
HACE1-210ENST00000519645 NEO1Q92859 1461 aa38.22■■■■□ 3.71
HACE1-210ENST00000519645 FYCO1Q9BQS8 1478 aa38.18■■■■□ 3.7
HACE1-210ENST00000519645 CEP162Q5TB80 1403 aa38.18■■■■□ 3.7
HACE1-210ENST00000519645 CCDC18Q5T9S5 1454 aa38.17■■■■□ 3.7
HACE1-210ENST00000519645 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa38.17■■■■□ 3.7
HACE1-210ENST00000519645 TTC37Q6PGP7 1564 aa38.17■■■■□ 3.7
HACE1-210ENST00000519645 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP38.16■■■■□ 3.7
HACE1-210ENST00000519645 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa38.12■■■■□ 3.69
HACE1-210ENST00000519645 FANCAO15360 1455 aa38.11■■■■□ 3.69
HACE1-210ENST00000519645 RAPGEF3O95398 923 aa38.08■■■■□ 3.69
HACE1-210ENST00000519645 PLCH2O75038 1416 aa38.06■■■■□ 3.68
HACE1-210ENST00000519645 AKNAQ7Z591 1439 aa38.06■■■■□ 3.68
HACE1-210ENST00000519645 KIF14Q15058 1648 aa38.06■■■■□ 3.68
HACE1-210ENST00000519645 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa38.03■■■■□ 3.68
HACE1-210ENST00000519645 CFAP74Q9C0B2 1584 aa38.02■■■■□ 3.68
HACE1-210ENST00000519645 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP37.97■■■■□ 3.67
HACE1-210ENST00000519645 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa37.97■■■■□ 3.67
HACE1-210ENST00000519645 MYO5CQ9NQX4 1742 aa37.91■■■■□ 3.66
HACE1-210ENST00000519645 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa37.9■■■■□ 3.66
HACE1-210ENST00000519645 ADGRL1O94910 1474 aa37.9■■■■□ 3.66
HACE1-210ENST00000519645 ARHGAP5Q13017 1502 aa37.87■■■■□ 3.65
HACE1-210ENST00000519645 SCAPERQ9BY12 1400 aa37.87■■■■□ 3.65
HACE1-210ENST00000519645 MTUS2Q5JR59 1369 aa37.81■■■■□ 3.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 160 ms