RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519645.5

HACE1-210, Transcript of HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

TSL 5

Gene HACE1, Length 859 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1-210ENST00000519645 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58■■■■■ 6.88
HACE1-210ENST00000519645 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.61■■■■■ 5.85
HACE1-210ENST00000519645 ABCC9O60706 1549 aa50.93■■■■■ 5.74
HACE1-210ENST00000519645 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.81■■■■■ 5.4
HACE1-210ENST00000519645 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.76■■■■■ 5.4
HACE1-210ENST00000519645 NACADO15069 1562 aa48.67■■■■■ 5.38
HACE1-210ENST00000519645 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.26■■■■■ 5.32
HACE1-210ENST00000519645 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.23■■■■■ 5.31
HACE1-210ENST00000519645 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.94■■■■■ 5.26
HACE1-210ENST00000519645 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.6■■■■■ 5.21
HACE1-210ENST00000519645 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.54■■■■■ 5.2
HACE1-210ENST00000519645 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.3■■■■■ 5.16
HACE1-210ENST00000519645 SCRIBQ14160 1630 aa47.15■■■■■ 5.14
HACE1-210ENST00000519645 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.05■■■■■ 5.12
HACE1-210ENST00000519645 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.81■■■■■ 5.08
HACE1-210ENST00000519645 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.11■■■■■ 4.97
HACE1-210ENST00000519645 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.99■■■■■ 4.95
HACE1-210ENST00000519645 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.8■■■■■ 4.92
HACE1-210ENST00000519645 SMARCA4P51532 1647 aa45.04■■■■■ 4.8
HACE1-210ENST00000519645 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.98■■■■■ 4.79
HACE1-210ENST00000519645 NCAPD3P42695 1498 aa44.94■■■■■ 4.78
HACE1-210ENST00000519645 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.91■■■■■ 4.78
HACE1-210ENST00000519645 SMARCA2P51531 1590 aa44.84■■■■■ 4.77
HACE1-210ENST00000519645 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.69■■■■■ 4.75
HACE1-210ENST00000519645 HMGXB3Q12766 1538 aa44.65■■■■■ 4.74
HACE1-210ENST00000519645 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.58■■■■■ 4.73
HACE1-210ENST00000519645 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.56■■■■■ 4.72
HACE1-210ENST00000519645 WIZO95785 1651 aa44.16■■■■■ 4.66
HACE1-210ENST00000519645 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.1■■■■■ 4.65
HACE1-210ENST00000519645 NESP48681 1621 aa43.96■■■■■ 4.63
HACE1-210ENST00000519645 ERCC6Q03468 1493 aa43.96■■■■■ 4.63
HACE1-210ENST00000519645 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.77■■■■■ 4.6
HACE1-210ENST00000519645 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.7■■■■■ 4.59
HACE1-210ENST00000519645 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.65■■■■■ 4.58
HACE1-210ENST00000519645 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.56■■■■■ 4.56
HACE1-210ENST00000519645 CUX2O14529 1486 aa43.55■■■■■ 4.56
HACE1-210ENST00000519645 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.34■■■■■ 4.53
HACE1-210ENST00000519645 CFTRP13569 1480 aa43.29■■■■■ 4.52
HACE1-210ENST00000519645 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.29■■■■■ 4.52
HACE1-210ENST00000519645 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.22■■■■■ 4.51
HACE1-210ENST00000519645 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.13■■■■■ 4.5
HACE1-210ENST00000519645 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.11■■■■■ 4.49
HACE1-210ENST00000519645 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.1■■■■■ 4.49
HACE1-210ENST00000519645 WDR62O43379 1518 aa42.93■■■■■ 4.46
HACE1-210ENST00000519645 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.86■■■■■ 4.45
HACE1-210ENST00000519645 PRDM2Q13029 1718 aa42.77■■■■■ 4.44
HACE1-210ENST00000519645 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.7■■■■■ 4.43
HACE1-210ENST00000519645 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.63■■■■■ 4.41
HACE1-210ENST00000519645 TOPBP1Q92547 1522 aa42.39■■■■■ 4.38
HACE1-210ENST00000519645 ABCC8Q09428 1581 aa42.38■■■■■ 4.37
HACE1-210ENST00000519645 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.29■■■■■ 4.36
HACE1-210ENST00000519645 IFT140Q96RY7 1462 aa42.22■■■■■ 4.35
HACE1-210ENST00000519645 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.05■■■■■ 4.32
HACE1-210ENST00000519645 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.01■■■■■ 4.32
HACE1-210ENST00000519645 CUX1P39880 1505 aa41.95■■■■■ 4.31
HACE1-210ENST00000519645 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.91■■■■■ 4.3
HACE1-210ENST00000519645 SOGA1O94964 1423 aa41.88■■■■■ 4.3
HACE1-210ENST00000519645 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.87■■■■■ 4.29
HACE1-210ENST00000519645 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.86■■■■■ 4.29
HACE1-210ENST00000519645 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.82■■■■■ 4.29
HACE1-210ENST00000519645 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.8■■■■■ 4.289e-7■■■■■ 27.1
HACE1-210ENST00000519645 OSCARQ8IYS5 282 aa41.77■■■■■ 4.28
HACE1-210ENST00000519645 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.71■■■■■ 4.27
HACE1-210ENST00000519645 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.61■■■■■ 4.25
HACE1-210ENST00000519645 WDR97A6NE52 1622 aa41.55■■■■■ 4.24
HACE1-210ENST00000519645 TOP2BQ02880 1626 aa41.48■■■■■ 4.23
HACE1-210ENST00000519645 SYNJ1O43426 1573 aa41.46■■■■■ 4.23
HACE1-210ENST00000519645 FBLN2P98095 1184 aa41.46■■■■■ 4.23
HACE1-210ENST00000519645 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.44■■■■■ 4.22
HACE1-210ENST00000519645 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.44■■■■■ 4.22
HACE1-210ENST00000519645 GRIN2BQ13224 1484 aa41.41■■■■■ 4.22
HACE1-210ENST00000519645 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.39■■■■■ 4.22
HACE1-210ENST00000519645 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.37■■■■■ 4.21
HACE1-210ENST00000519645 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.31■■■■■ 4.2
HACE1-210ENST00000519645 CHD1O14646 1710 aa41.3■■■■■ 4.2
HACE1-210ENST00000519645 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.27■■■■■ 4.2
HACE1-210ENST00000519645 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.26■■■■■ 4.19
HACE1-210ENST00000519645 PBRM1Q86U86 1689 aa41.18■■■■■ 4.18
HACE1-210ENST00000519645 SYNJ2O15056 1496 aa41.17■■■■■ 4.18
HACE1-210ENST00000519645 TRIM41Q8WV44 630 aa41.16■■■■■ 4.18
HACE1-210ENST00000519645 ARHGEF11O15085 1522 aa41.02■■■■■ 4.16
HACE1-210ENST00000519645 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.01■■■■■ 4.16
HACE1-210ENST00000519645 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.01■■■■■ 4.16
HACE1-210ENST00000519645 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.01■■■■■ 4.16
HACE1-210ENST00000519645 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.93■■■■■ 4.14
HACE1-210ENST00000519645 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.9■■■■■ 4.14
HACE1-210ENST00000519645 ADAMTS12P58397 1594 aa40.9■■■■■ 4.14
HACE1-210ENST00000519645 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.89■■■■■ 4.14
HACE1-210ENST00000519645 GRIN2AQ12879 1464 aa40.86■■■■■ 4.13
HACE1-210ENST00000519645 KIF27Q86VH2 1401 aa40.78■■■■■ 4.12
HACE1-210ENST00000519645 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.75■■■■■ 4.11
HACE1-210ENST00000519645 NUP160Q12769 1436 aa40.67■■■■■ 4.1
HACE1-210ENST00000519645 ARAP1Q96P48 1450 aa40.66■■■■■ 4.1
HACE1-210ENST00000519645 IGF1RP08069 1367 aa40.65■■■■■ 4.1
HACE1-210ENST00000519645 CEP170Q5SW79 1584 aa40.63■■■■■ 4.09
HACE1-210ENST00000519645 CUL7Q14999 1698 aa40.47■■■■■ 4.07
HACE1-210ENST00000519645 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.4■■■■■ 4.06
HACE1-210ENST00000519645 SHROOM2Q13796 1616 aa40.34■■■■■ 4.05
HACE1-210ENST00000519645 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.33■■■■■ 4.05
HACE1-210ENST00000519645 JPH4Q96JJ6 628 aa40.33■■■■■ 4.05
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