RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517876.5

CNOT8-204, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CNOT8, Length 2,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT8-204ENST00000517876 TRIM52Q96A61 297 aa22.45■■□□□ 1.19
CNOT8-204ENST00000517876 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
CNOT8-204ENST00000517876 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.41■■□□□ 1.18
CNOT8-204ENST00000517876 CCER2I3L3R5 266 aa22.36■■□□□ 1.17
CNOT8-204ENST00000517876 MSH5O43196 834 aa22.36■■□□□ 1.17
CNOT8-204ENST00000517876 KIF27Q86VH2 1401 aa22.36■■□□□ 1.17
CNOT8-204ENST00000517876 ANP32CO43423 234 aa22.33■■□□□ 1.17
CNOT8-204ENST00000517876 CUX1P39880 1505 aa22.33■■□□□ 1.16
CNOT8-204ENST00000517876 TIAM1Q13009 1591 aa22.3■■□□□ 1.16
CNOT8-204ENST00000517876 ERICH6Q7L0X2 663 aa22.3■■□□□ 1.16
CNOT8-204ENST00000517876 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
CNOT8-204ENST00000517876 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.27■■□□□ 1.16
CNOT8-204ENST00000517876 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.24■■□□□ 1.15
CNOT8-204ENST00000517876 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.23■■□□□ 1.15
CNOT8-204ENST00000517876 MAP3K1Q13233 1512 aa22.22■■□□□ 1.15
CNOT8-204ENST00000517876 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
CNOT8-204ENST00000517876 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.17■■□□□ 1.14
CNOT8-204ENST00000517876 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
CNOT8-204ENST00000517876 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.13
CNOT8-204ENST00000517876 IGF1RP08069 1367 aa22.1■■□□□ 1.13
CNOT8-204ENST00000517876 TONSLQ96HA7 1378 aa22.07■■□□□ 1.12
CNOT8-204ENST00000517876 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
CNOT8-204ENST00000517876 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.05■■□□□ 1.12
CNOT8-204ENST00000517876 P3H3Q8IVL6 736 aa22.05■■□□□ 1.12
CNOT8-204ENST00000517876 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
CNOT8-204ENST00000517876 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.02■■□□□ 1.11
CNOT8-204ENST00000517876 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.01■■□□□ 1.11
CNOT8-204ENST00000517876 CFTRP13569 1480 aa21.99■■□□□ 1.11
CNOT8-204ENST00000517876 HMGXB3Q12766 1538 aa21.95■■□□□ 1.1
CNOT8-204ENST00000517876 NCAPD3P42695 1498 aa21.94■■□□□ 1.1
CNOT8-204ENST00000517876 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.94■■□□□ 1.1
CNOT8-204ENST00000517876 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP21.93■■□□□ 1.1
CNOT8-204ENST00000517876 PPP4R2Q9NY27 417 aa21.93■■□□□ 1.1
CNOT8-204ENST00000517876 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.9■■□□□ 1.1
CNOT8-204ENST00000517876 ERICH6BQ5W0A0 696 aa21.9■■□□□ 1.1
CNOT8-204ENST00000517876 UACAQ9BZF9 1416 aa21.89■■□□□ 1.09
CNOT8-204ENST00000517876 WASHC2AQ641Q2 1341 aa21.88■■□□□ 1.09
CNOT8-204ENST00000517876 CCDC184Q52MB2 194 aa21.87■■□□□ 1.09
CNOT8-204ENST00000517876 KDM5BQ9UGL1 1544 aa21.87■■□□□ 1.09
CNOT8-204ENST00000517876 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.87■■□□□ 1.09
CNOT8-204ENST00000517876 PTPRKQ15262 1439 aa21.87■■□□□ 1.09
CNOT8-204ENST00000517876 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.85■■□□□ 1.09
CNOT8-204ENST00000517876 DEKP35659 375 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
CNOT8-204ENST00000517876 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa21.85■■□□□ 1.09
CNOT8-204ENST00000517876 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
CNOT8-204ENST00000517876 HFM1A2PYH4 1435 aa21.84■■□□□ 1.09
CNOT8-204ENST00000517876 PTPN23Q9H3S7 1636 aa21.84■■□□□ 1.09
CNOT8-204ENST00000517876 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.83■■□□□ 1.08
CNOT8-204ENST00000517876 MYT1LQ9UL68 1186 aa21.83■■□□□ 1.08
CNOT8-204ENST00000517876 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.82■■□□□ 1.08
CNOT8-204ENST00000517876 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.82■■□□□ 1.084e-10■■■■■ 49.3
CNOT8-204ENST00000517876 PRDM2Q13029 1718 aa21.78■■□□□ 1.08
CNOT8-204ENST00000517876 NAIPQ13075 1403 aa21.78■■□□□ 1.08
CNOT8-204ENST00000517876 FAM9BQ8IZU0 186 aa21.78■■□□□ 1.08
CNOT8-204ENST00000517876 CNTLNQ9NXG0 1405 aa21.75■■□□□ 1.07
CNOT8-204ENST00000517876 NCOA2Q15596 1464 aa21.74■■□□□ 1.07
CNOT8-204ENST00000517876 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP21.72■■□□□ 1.07
CNOT8-204ENST00000517876 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
CNOT8-204ENST00000517876 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.72■■□□□ 1.07
CNOT8-204ENST00000517876 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.72■■□□□ 1.07
CNOT8-204ENST00000517876 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
CNOT8-204ENST00000517876 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
CNOT8-204ENST00000517876 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
CNOT8-204ENST00000517876 NBR1Q14596 966 aa21.71■■□□□ 1.07
CNOT8-204ENST00000517876 MRS2Q9HD23 443 aa21.71■■□□□ 1.07
CNOT8-204ENST00000517876 ZBED9Q6R2W3 1325 aa21.7■■□□□ 1.06
CNOT8-204ENST00000517876 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
CNOT8-204ENST00000517876 FMN1Q68DA7 1419 aa21.69■■□□□ 1.06
CNOT8-204ENST00000517876 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.65■■□□□ 1.06
CNOT8-204ENST00000517876 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa21.65■■□□□ 1.06
CNOT8-204ENST00000517876 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.64■■□□□ 1.05
CNOT8-204ENST00000517876 CCDC7Q96M83 1385 aa21.64■■□□□ 1.05
CNOT8-204ENST00000517876 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
CNOT8-204ENST00000517876 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.63■■□□□ 1.05
CNOT8-204ENST00000517876 NCOA1Q15788 1441 aa21.61■■□□□ 1.05
CNOT8-204ENST00000517876 CHIC2Q9UKJ5 165 aa21.61■■□□□ 1.05
CNOT8-204ENST00000517876 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa21.6■■□□□ 1.05
CNOT8-204ENST00000517876 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa21.59■■□□□ 1.05
CNOT8-204ENST00000517876 L3MBTL2Q969R5 705 aa21.59■■□□□ 1.05
CNOT8-204ENST00000517876 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.59■■□□□ 1.05
CNOT8-204ENST00000517876 AKNAQ7Z591 1439 aa21.57■■□□□ 1.04
CNOT8-204ENST00000517876 HECW1Q76N89 1606 aa21.55■■□□□ 1.04
CNOT8-204ENST00000517876 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
CNOT8-204ENST00000517876 FOXD1Q16676 465 aa21.54■■□□□ 1.04
CNOT8-204ENST00000517876 KDM6BO15054 1643 aa21.53■■□□□ 1.04
CNOT8-204ENST00000517876 MPHOSPH9Q99550 1183 aa21.52■■□□□ 1.04
CNOT8-204ENST00000517876 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
CNOT8-204ENST00000517876 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
CNOT8-204ENST00000517876 NBPF8Q3BBV2 869 aa21.51■■□□□ 1.03
CNOT8-204ENST00000517876 KIF7Q2M1P5 1343 aa21.51■■□□□ 1.03
CNOT8-204ENST00000517876 GCC2Q8IWJ2 1684 aa21.5■■□□□ 1.03
CNOT8-204ENST00000517876 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
CNOT8-204ENST00000517876 CCDC136Q96JN2 1154 aa21.5■■□□□ 1.03
CNOT8-204ENST00000517876 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.5■■□□□ 1.03
CNOT8-204ENST00000517876 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa21.5■■□□□ 1.03
CNOT8-204ENST00000517876 GRIN2BQ13224 1484 aa21.5■■□□□ 1.03
CNOT8-204ENST00000517876 CUL7Q14999 1698 aa21.49■■□□□ 1.03
CNOT8-204ENST00000517876 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa21.48■■□□□ 1.03
CNOT8-204ENST00000517876 UGGT2Q9NYU1 1516 aa21.48■■□□□ 1.03
CNOT8-204ENST00000517876 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
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