RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517351.5

TCEA1-202, Transcript of transcription elongation factor A1, humanhuman

TSL 4

Gene TCEA1, Length 539 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1-202ENST00000517351 JPH4Q96JJ6 628 aa43.46■■■■■ 4.55
TCEA1-202ENST00000517351 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa43.41■■■■■ 4.54
TCEA1-202ENST00000517351 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP43.4■■■■■ 4.54
TCEA1-202ENST00000517351 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa43.31■■■■■ 4.52
TCEA1-202ENST00000517351 IQGAP2Q13576 1575 aa43.12■■■■■ 4.49
TCEA1-202ENST00000517351 PRXQ9BXM0 1461 aa43.07■■■■■ 4.49
TCEA1-202ENST00000517351 TRHP20396 242 aaPredicted RBP43.06■■■■■ 4.48
TCEA1-202ENST00000517351 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.99■■■■■ 4.47
TCEA1-202ENST00000517351 CSRNP3Q8WYN3 585 aa42.99■■■■■ 4.47
TCEA1-202ENST00000517351 EEA1Q15075 1411 aa42.97■■■■■ 4.47
TCEA1-202ENST00000517351 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa42.97■■■■■ 4.47
TCEA1-202ENST00000517351 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa42.9■■■■■ 4.46
TCEA1-202ENST00000517351 UGGT2Q9NYU1 1516 aa42.87■■■■■ 4.45
TCEA1-202ENST00000517351 TNIKQ9UKE5 1360 aa42.85■■■■■ 4.45
TCEA1-202ENST00000517351 PTPRGP23470 1445 aa42.85■■■■■ 4.45
TCEA1-202ENST00000517351 DISP1Q96F81 1524 aa42.83■■■■■ 4.45
TCEA1-202ENST00000517351 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP42.82■■■■■ 4.45
TCEA1-202ENST00000517351 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP42.8■■■■■ 4.44
TCEA1-202ENST00000517351 ADCY10Q96PN6 1610 aa42.76■■■■■ 4.44
TCEA1-202ENST00000517351 KIAA0556O60303 1618 aa42.72■■■■■ 4.43
TCEA1-202ENST00000517351 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP42.72■■■■■ 4.43
TCEA1-202ENST00000517351 GOLGA3Q08378 1498 aa42.62■■■■■ 4.41
TCEA1-202ENST00000517351 MAPKBP1O60336 1514 aa42.55■■■■■ 4.4
TCEA1-202ENST00000517351 UACAQ9BZF9 1416 aa42.54■■■■■ 4.4
TCEA1-202ENST00000517351 KIF21BO75037 1637 aa42.54■■■■■ 4.4
TCEA1-202ENST00000517351 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa42.51■■■■■ 4.4
TCEA1-202ENST00000517351 ABCC2Q92887 1545 aa42.49■■■■■ 4.39
TCEA1-202ENST00000517351 KIF13AQ9H1H9 1805 aa42.43■■■■■ 4.38
TCEA1-202ENST00000517351 ABCC10Q5T3U5 1492 aa42.4■■■■■ 4.38
TCEA1-202ENST00000517351 P3H3Q8IVL6 736 aa42.36■■■■■ 4.37
TCEA1-202ENST00000517351 FAM69CQ0P6D2 419 aa42.34■■■■■ 4.37
TCEA1-202ENST00000517351 PLB1Q6P1J6 1458 aa42.34■■■■■ 4.37
TCEA1-202ENST00000517351 SAMD9Q5K651 1589 aa42.32■■■■■ 4.37
TCEA1-202ENST00000517351 DIP2BQ9P265 1576 aa42.32■■■■■ 4.37
TCEA1-202ENST00000517351 KDM5BQ9UGL1 1544 aa42.31■■■■■ 4.36
TCEA1-202ENST00000517351 EHMT2Q96KQ7 1210 aa42.3■■■■■ 4.36
TCEA1-202ENST00000517351 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP42.29■■■■■ 4.36
TCEA1-202ENST00000517351 ABCA8O94911 1581 aa42.27■■■■■ 4.36
TCEA1-202ENST00000517351 ASXL2Q76L83 1435 aa42.26■■■■■ 4.36
TCEA1-202ENST00000517351 UBTFP17480 764 aaKnown RBP42.23■■■■■ 4.35
TCEA1-202ENST00000517351 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP42.23■■■■■ 4.35
TCEA1-202ENST00000517351 FHOD3Q2V2M9 1422 aa42.1■■■■■ 4.33
TCEA1-202ENST00000517351 EFCAB5A4FU69 1503 aa42.09■■■■■ 4.33
TCEA1-202ENST00000517351 GLI2P10070 1586 aa42.02■■■■■ 4.32
TCEA1-202ENST00000517351 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP42■■■■■ 4.31
TCEA1-202ENST00000517351 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa42■■■■■ 4.31
TCEA1-202ENST00000517351 TSPOAP1O95153 1857 aa42■■■■■ 4.31
TCEA1-202ENST00000517351 WDR7Q9Y4E6 1490 aa41.99■■■■■ 4.31
TCEA1-202ENST00000517351 ARID3CA6NKF2 412 aa41.96■■■■■ 4.31
TCEA1-202ENST00000517351 ATP10BO94823 1461 aa41.92■■■■■ 4.3
TCEA1-202ENST00000517351 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa41.85■■■■■ 4.29
TCEA1-202ENST00000517351 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP41.84■■■■■ 4.29
TCEA1-202ENST00000517351 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa41.83■■■■■ 4.29
TCEA1-202ENST00000517351 KCNH8Q96L42 1107 aa41.82■■■■■ 4.29
TCEA1-202ENST00000517351 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP41.8■■■■■ 4.28
TCEA1-202ENST00000517351 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP41.78■■■■■ 4.28
TCEA1-202ENST00000517351 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP41.78■■■■■ 4.28
TCEA1-202ENST00000517351 KDM6BO15054 1643 aa41.73■■■■■ 4.27
TCEA1-202ENST00000517351 FMN1Q68DA7 1419 aa41.72■■■■■ 4.27
TCEA1-202ENST00000517351 CFAP43Q8NDM7 1665 aa41.67■■■■■ 4.26
TCEA1-202ENST00000517351 TEX14Q8IWB6 1497 aa41.66■■■■■ 4.26
TCEA1-202ENST00000517351 CD109Q6YHK3 1445 aa41.65■■■■■ 4.26
TCEA1-202ENST00000517351 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP41.57■■■■■ 4.25
TCEA1-202ENST00000517351 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa41.57■■■■■ 4.25
TCEA1-202ENST00000517351 HECW1Q76N89 1606 aa41.56■■■■■ 4.24
TCEA1-202ENST00000517351 PLEKHD1A6NEE1 506 aa41.56■■■■■ 4.24
TCEA1-202ENST00000517351 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP41.54■■■■■ 4.24
TCEA1-202ENST00000517351 CLIP1P30622 1438 aa41.52■■■■■ 4.24
TCEA1-202ENST00000517351 ABCA9Q8IUA7 1624 aa41.51■■■■■ 4.24
TCEA1-202ENST00000517351 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP41.46■■■■■ 4.23
TCEA1-202ENST00000517351 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP41.36■■■■■ 4.21
TCEA1-202ENST00000517351 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa41.35■■■■■ 4.21
TCEA1-202ENST00000517351 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP41.32■■■■■ 4.21
TCEA1-202ENST00000517351 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa41.3■■■■■ 4.2
TCEA1-202ENST00000517351 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP41.29■■■■■ 4.24e-8■■■■■ 52.5
TCEA1-202ENST00000517351 CEP162Q5TB80 1403 aa41.26■■■■■ 4.19
TCEA1-202ENST00000517351 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa41.25■■■■■ 4.19
TCEA1-202ENST00000517351 FYCO1Q9BQS8 1478 aa41.24■■■■■ 4.19
TCEA1-202ENST00000517351 PHLDB1Q86UU1 1377 aa41.24■■■■■ 4.19
TCEA1-202ENST00000517351 TTC37Q6PGP7 1564 aa41.23■■■■■ 4.19
TCEA1-202ENST00000517351 CCDC18Q5T9S5 1454 aa41.22■■■■■ 4.19
TCEA1-202ENST00000517351 NEO1Q92859 1461 aa41.21■■■■■ 4.19
TCEA1-202ENST00000517351 ARAP3Q8WWN8 1544 aa41.21■■■■■ 4.19
TCEA1-202ENST00000517351 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP41.18■■■■■ 4.18
TCEA1-202ENST00000517351 KIF14Q15058 1648 aa41.11■■■■■ 4.17
TCEA1-202ENST00000517351 FANCAO15360 1455 aa41.09■■■■■ 4.17
TCEA1-202ENST00000517351 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP41.09■■■■■ 4.17
TCEA1-202ENST00000517351 CFAP74Q9C0B2 1584 aa41.07■■■■■ 4.16
TCEA1-202ENST00000517351 PLCH2O75038 1416 aa41.05■■■■■ 4.16
TCEA1-202ENST00000517351 AKNAQ7Z591 1439 aa41.04■■■■■ 4.16
TCEA1-202ENST00000517351 RAPGEF3O95398 923 aa41.01■■■■■ 4.16
TCEA1-202ENST00000517351 MYO5CQ9NQX4 1742 aa41.01■■■■■ 4.16
TCEA1-202ENST00000517351 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP40.94■■■■■ 4.14
TCEA1-202ENST00000517351 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa40.93■■■■■ 4.14
TCEA1-202ENST00000517351 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa40.91■■■■■ 4.14
TCEA1-202ENST00000517351 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa40.91■■■■■ 4.14
TCEA1-202ENST00000517351 ADGRL1O94910 1474 aa40.87■■■■■ 4.13
TCEA1-202ENST00000517351 ARHGAP5Q13017 1502 aa40.86■■■■■ 4.13
TCEA1-202ENST00000517351 RICTORQ6R327 1708 aa40.85■■■■■ 4.13
TCEA1-202ENST00000517351 SCAPERQ9BY12 1400 aa40.83■■■■■ 4.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.3 ms