RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514669.5

CTBP1-216, Transcript of C-terminal binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTBP1, Length 809 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP1-216ENST00000514669 SHROOM2Q13796 1616 aa28.42■■■□□ 2.14
CTBP1-216ENST00000514669 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa28.42■■■□□ 2.14
CTBP1-216ENST00000514669 ARHGEF11O15085 1522 aa28.38■■■□□ 2.13
CTBP1-216ENST00000514669 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa28.37■■■□□ 2.13
CTBP1-216ENST00000514669 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa28.37■■■□□ 2.13
CTBP1-216ENST00000514669 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa28.37■■■□□ 2.13
CTBP1-216ENST00000514669 IQGAP2Q13576 1575 aa28.37■■■□□ 2.13
CTBP1-216ENST00000514669 JPH4Q96JJ6 628 aa28.29■■■□□ 2.12
CTBP1-216ENST00000514669 GOLGA3Q08378 1498 aa28.28■■■□□ 2.12
CTBP1-216ENST00000514669 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
CTBP1-216ENST00000514669 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.24■■■□□ 2.11
CTBP1-216ENST00000514669 UGGT2Q9NYU1 1516 aa28.21■■■□□ 2.11
CTBP1-216ENST00000514669 ARAP1Q96P48 1450 aa28.18■■■□□ 2.1
CTBP1-216ENST00000514669 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa28.13■■■□□ 2.09
CTBP1-216ENST00000514669 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.12■■■□□ 2.09
CTBP1-216ENST00000514669 DISP1Q96F81 1524 aa28.1■■■□□ 2.09
CTBP1-216ENST00000514669 UBTFP17480 764 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
CTBP1-216ENST00000514669 KIAA0556O60303 1618 aa28.1■■■□□ 2.09
CTBP1-216ENST00000514669 CYB5RLQ6IPT4 315 aa28.02■■■□□ 2.08
CTBP1-216ENST00000514669 SAMD9Q5K651 1589 aa28.02■■■□□ 2.08
CTBP1-216ENST00000514669 TNIKQ9UKE5 1360 aa27.99■■■□□ 2.07
CTBP1-216ENST00000514669 EFCAB5A4FU69 1503 aa27.96■■■□□ 2.07
CTBP1-216ENST00000514669 PTPRGP23470 1445 aa27.94■■■□□ 2.06
CTBP1-216ENST00000514669 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
CTBP1-216ENST00000514669 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
CTBP1-216ENST00000514669 P3H3Q8IVL6 736 aa27.83■■■□□ 2.05
CTBP1-216ENST00000514669 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa27.83■■■□□ 2.04
CTBP1-216ENST00000514669 ADCY10Q96PN6 1610 aa27.81■■■□□ 2.04
CTBP1-216ENST00000514669 FHOD3Q2V2M9 1422 aa27.81■■■□□ 2.04
CTBP1-216ENST00000514669 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27.8■■■□□ 2.04
CTBP1-216ENST00000514669 UACAQ9BZF9 1416 aa27.78■■■□□ 2.04
CTBP1-216ENST00000514669 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa27.76■■■□□ 2.04
CTBP1-216ENST00000514669 ABCC2Q92887 1545 aa27.76■■■□□ 2.03
CTBP1-216ENST00000514669 CLIP1P30622 1438 aa27.75■■■□□ 2.03
CTBP1-216ENST00000514669 ABCA8O94911 1581 aa27.75■■■□□ 2.03
CTBP1-216ENST00000514669 PLB1Q6P1J6 1458 aa27.73■■■□□ 2.03
CTBP1-216ENST00000514669 CEP162Q5TB80 1403 aa27.7■■■□□ 2.03
CTBP1-216ENST00000514669 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa27.69■■■□□ 2.02
CTBP1-216ENST00000514669 FMN1Q68DA7 1419 aa27.66■■■□□ 2.02
CTBP1-216ENST00000514669 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP27.63■■■□□ 2.01
CTBP1-216ENST00000514669 KDM5BQ9UGL1 1544 aa27.62■■■□□ 2.01
CTBP1-216ENST00000514669 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
CTBP1-216ENST00000514669 MAPKBP1O60336 1514 aa27.58■■■□□ 2.01
CTBP1-216ENST00000514669 HECW1Q76N89 1606 aa27.55■■■□□ 2
CTBP1-216ENST00000514669 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP27.54■■■□□ 2
CTBP1-216ENST00000514669 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP27.52■■■□□ 2
CTBP1-216ENST00000514669 ATP10BO94823 1461 aa27.48■■□□□ 1.99
CTBP1-216ENST00000514669 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.47■■□□□ 1.99
CTBP1-216ENST00000514669 ASXL2Q76L83 1435 aa27.46■■□□□ 1.99
CTBP1-216ENST00000514669 FYCO1Q9BQS8 1478 aa27.44■■□□□ 1.98
CTBP1-216ENST00000514669 ARID3CA6NKF2 412 aa27.42■■□□□ 1.98
CTBP1-216ENST00000514669 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa27.41■■□□□ 1.98
CTBP1-216ENST00000514669 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
CTBP1-216ENST00000514669 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
CTBP1-216ENST00000514669 DIP2BQ9P265 1576 aa27.39■■□□□ 1.98
CTBP1-216ENST00000514669 WDR7Q9Y4E6 1490 aa27.39■■□□□ 1.98
CTBP1-216ENST00000514669 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
CTBP1-216ENST00000514669 KIF13AQ9H1H9 1805 aa27.39■■□□□ 1.97
CTBP1-216ENST00000514669 ABCC10Q5T3U5 1492 aa27.38■■□□□ 1.97
CTBP1-216ENST00000514669 VPS8Q8N3P4 1428 aa27.37■■□□□ 1.97
CTBP1-216ENST00000514669 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
CTBP1-216ENST00000514669 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
CTBP1-216ENST00000514669 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.36■■□□□ 1.97
CTBP1-216ENST00000514669 TRHP20396 242 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
CTBP1-216ENST00000514669 GLI2P10070 1586 aa27.3■■□□□ 1.96
CTBP1-216ENST00000514669 FAM69CQ0P6D2 419 aa27.26■■□□□ 1.95
CTBP1-216ENST00000514669 PLEKHD1A6NEE1 506 aa27.25■■□□□ 1.95
CTBP1-216ENST00000514669 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP27.23■■□□□ 1.95
CTBP1-216ENST00000514669 CFAP43Q8NDM7 1665 aa27.22■■□□□ 1.95
CTBP1-216ENST00000514669 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa27.19■■□□□ 1.94
CTBP1-216ENST00000514669 KCNH8Q96L42 1107 aa27.19■■□□□ 1.94
CTBP1-216ENST00000514669 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
CTBP1-216ENST00000514669 ABCA9Q8IUA7 1624 aa27.17■■□□□ 1.94
CTBP1-216ENST00000514669 TSPOAP1O95153 1857 aa27.15■■□□□ 1.94
CTBP1-216ENST00000514669 TIAM1Q13009 1591 aa27.15■■□□□ 1.94
CTBP1-216ENST00000514669 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa27.15■■□□□ 1.94
CTBP1-216ENST00000514669 KIF14Q15058 1648 aa27.14■■□□□ 1.94
CTBP1-216ENST00000514669 MAP3K1Q13233 1512 aa27.11■■□□□ 1.93
CTBP1-216ENST00000514669 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
CTBP1-216ENST00000514669 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa27.1■■□□□ 1.93
CTBP1-216ENST00000514669 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP27.1■■□□□ 1.932e-7■■■■■ 38
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CTBP1-216ENST00000514669 CD109Q6YHK3 1445 aa27.07■■□□□ 1.92
CTBP1-216ENST00000514669 MTUS2Q5JR59 1369 aa27.07■■□□□ 1.92
CTBP1-216ENST00000514669 TEX14Q8IWB6 1497 aa27.03■■□□□ 1.92
CTBP1-216ENST00000514669 APLP2Q06481 763 aa27.02■■□□□ 1.92
CTBP1-216ENST00000514669 MYO5CQ9NQX4 1742 aa27.02■■□□□ 1.92
CTBP1-216ENST00000514669 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa27■■□□□ 1.91
CTBP1-216ENST00000514669 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
CTBP1-216ENST00000514669 CFAP74Q9C0B2 1584 aa26.93■■□□□ 1.9
CTBP1-216ENST00000514669 ARAP3Q8WWN8 1544 aa26.93■■□□□ 1.9
CTBP1-216ENST00000514669 PREX2Q70Z35 1606 aa26.93■■□□□ 1.9
CTBP1-216ENST00000514669 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa26.93■■□□□ 1.9
CTBP1-216ENST00000514669 PLCH2O75038 1416 aa26.91■■□□□ 1.9
CTBP1-216ENST00000514669 NEO1Q92859 1461 aa26.89■■□□□ 1.9
CTBP1-216ENST00000514669 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
CTBP1-216ENST00000514669 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.89■■□□□ 1.9
CTBP1-216ENST00000514669 FANCAO15360 1455 aa26.87■■□□□ 1.89
CTBP1-216ENST00000514669 NCOA2Q15596 1464 aa26.87■■□□□ 1.89
CTBP1-216ENST00000514669 KDM6BO15054 1643 aa26.87■■□□□ 1.89
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