RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514275.5

IFT122-231, Transcript of intraflagellar transport 122, human

TSL 5

Gene IFT122, Length 296 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IFT122-231	ENST00000514275	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	7.76	□□□□□ -1.17
IFT122-231	ENST00000514275	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	7.74	□□□□□ -1.17
IFT122-231	ENST00000514275	CEP162	Q5TB80	1403 aa		7.71	□□□□□ -1.17
IFT122-231	ENST00000514275	NCAPD3	P42695	1498 aa		7.7	□□□□□ -1.18
IFT122-231	ENST00000514275	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	7.7	□□□□□ -1.18
IFT122-231	ENST00000514275	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	7.69	□□□□□ -1.18
IFT122-231	ENST00000514275	GOLGA3	Q08378	1498 aa		7.68	□□□□□ -1.18
IFT122-231	ENST00000514275	SYNJ1	O43426	1573 aa		7.67	□□□□□ -1.18
IFT122-231	ENST00000514275	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		7.65	□□□□□ -1.18
IFT122-231	ENST00000514275	AKT1S1	Q96B36	256 aa		7.64	□□□□□ -1.19
IFT122-231	ENST00000514275	KIF21B	O75037	1637 aa		7.63	□□□□□ -1.19
IFT122-231	ENST00000514275	HMGXB3	Q12766	1538 aa		7.62	□□□□□ -1.19
IFT122-231	ENST00000514275	TOP2B	Q02880	1626 aa		7.61	□□□□□ -1.19
IFT122-231	ENST00000514275	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	7.61	□□□□□ -1.19
IFT122-231	ENST00000514275	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	7.6	□□□□□ -1.19
IFT122-231	ENST00000514275	FBXO3	Q9UK99	471 aa		7.6	□□□□□ -1.19
IFT122-231	ENST00000514275	CLIP1	P30622	1438 aa		7.6	□□□□□ -1.19
IFT122-231	ENST00000514275	CFTR	P13569	1480 aa		7.59	□□□□□ -1.19
IFT122-231	ENST00000514275	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		7.59	□□□□□ -1.19
IFT122-231	ENST00000514275	PRX	Q9BXM0	1461 aa		7.58	□□□□□ -1.2
IFT122-231	ENST00000514275	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		7.58	□□□□□ -1.2
IFT122-231	ENST00000514275	CUX1	P39880	1505 aa		7.57	□□□□□ -1.2
IFT122-231	ENST00000514275	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	7.56	□□□□□ -1.2
IFT122-231	ENST00000514275	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		7.56	□□□□□ -1.2
IFT122-231	ENST00000514275	VASP	P50552	380 aa	Predicted RBP	7.55	□□□□□ -1.2
IFT122-231	ENST00000514275	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		7.54	□□□□□ -1.2
IFT122-231	ENST00000514275	KIF27	Q86VH2	1401 aa		7.53	□□□□□ -1.2
IFT122-231	ENST00000514275	PITPNM1	O00562	1244 aa		7.53	□□□□□ -1.2
IFT122-231	ENST00000514275	SPDYE1	Q8NFV5	336 aa	Predicted RBP	7.53	□□□□□ -1.2
IFT122-231	ENST00000514275	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		7.52	□□□□□ -1.2
IFT122-231	ENST00000514275	IGF1R	P08069	1367 aa		7.52	□□□□□ -1.21
IFT122-231	ENST00000514275	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		7.52	□□□□□ -1.21
IFT122-231	ENST00000514275	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		7.51	□□□□□ -1.21
IFT122-231	ENST00000514275	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	7.49	□□□□□ -1.21
IFT122-231	ENST00000514275	ARAP1	Q96P48	1450 aa		7.49	□□□□□ -1.21
IFT122-231	ENST00000514275	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
IFT122-231	ENST00000514275	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
IFT122-231	ENST00000514275	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.22
IFT122-231	ENST00000514275	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	7.45	□□□□□ -1.22
IFT122-231	ENST00000514275	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		7.45	□□□□□ -1.22
IFT122-231	ENST00000514275	CUX2	O14529	1486 aa		7.44	□□□□□ -1.22
IFT122-231	ENST00000514275	PRR29	P0C7W0	189 aa		7.44	□□□□□ -1.22
IFT122-231	ENST00000514275	MIER1	Q8N108	512 aa		7.44	□□□□□ -1.22
IFT122-231	ENST00000514275	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		7.43	□□□□□ -1.22
IFT122-231	ENST00000514275	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		7.43	□□□□□ -1.22
IFT122-231	ENST00000514275	PLCD3	Q8N3E9	789 aa		7.43	□□□□□ -1.22
IFT122-231	ENST00000514275	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		7.42	□□□□□ -1.22
IFT122-231	ENST00000514275	CREBZF	Q9NS37	354 aa		7.41	□□□□□ -1.22
IFT122-231	ENST00000514275	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		7.41	□□□□□ -1.22
IFT122-231	ENST00000514275	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
IFT122-231	ENST00000514275	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		7.41	□□□□□ -1.22
IFT122-231	ENST00000514275	PRDM2	Q13029	1718 aa		7.41	□□□□□ -1.22
IFT122-231	ENST00000514275	RTN4	Q9NQC3	1192 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
IFT122-231	ENST00000514275	MAP3K1	Q13233	1512 aa		7.39	□□□□□ -1.23
IFT122-231	ENST00000514275	CHRDL2	Q6WN34	429 aa		7.39	□□□□□ -1.23
IFT122-231	ENST00000514275	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		7.37	□□□□□ -1.23
IFT122-231	ENST00000514275	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
IFT122-231	ENST00000514275	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
IFT122-231	ENST00000514275	KLHL34	Q8N239	644 aa		7.37	□□□□□ -1.23
IFT122-231	ENST00000514275	TOPBP1	Q92547	1522 aa		7.37	□□□□□ -1.23
IFT122-231	ENST00000514275	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		7.36	□□□□□ -1.23
IFT122-231	ENST00000514275	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		7.36	□□□□□ -1.23
IFT122-231	ENST00000514275	MNX1	P50219	401 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
IFT122-231	ENST00000514275	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		7.36	□□□□□ -1.23
IFT122-231	ENST00000514275	FXR2	P51116	673 aa	Known RBP eCLIP	7.35	□□□□□ -1.23
IFT122-231	ENST00000514275	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
IFT122-231	ENST00000514275	CHADL	Q6NUI6	762 aa		7.35	□□□□□ -1.23
IFT122-231	ENST00000514275	NES	P48681	1621 aa		7.34	□□□□□ -1.23
IFT122-231	ENST00000514275	NEUROD1	Q13562	356 aa		7.34	□□□□□ -1.23
IFT122-231	ENST00000514275	PIP4P2	Q8N4L2	257 aa		7.34	□□□□□ -1.23
IFT122-231	ENST00000514275	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
IFT122-231	ENST00000514275	PLEKHG5	O94827	1062 aa		7.33	□□□□□ -1.24
IFT122-231	ENST00000514275	P3H3	Q8IVL6	736 aa		7.33	□□□□□ -1.24
IFT122-231	ENST00000514275	SPOCK2	Q92563	424 aa		7.33	□□□□□ -1.24
IFT122-231	ENST00000514275	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		7.32	□□□□□ -1.24
IFT122-231	ENST00000514275	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
IFT122-231	ENST00000514275	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		7.31	□□□□□ -1.24
IFT122-231	ENST00000514275	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
IFT122-231	ENST00000514275	PRKAR2A	P13861	404 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
IFT122-231	ENST00000514275	TIAM1	Q13009	1591 aa		7.31	□□□□□ -1.24
IFT122-231	ENST00000514275	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		7.31	□□□□□ -1.24
IFT122-231	ENST00000514275	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
IFT122-231	ENST00000514275	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	7.3	□□□□□ -1.24
IFT122-231	ENST00000514275	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		7.29	□□□□□ -1.24
IFT122-231	ENST00000514275	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		7.29	□□□□□ -1.24
IFT122-231	ENST00000514275	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		7.29	□□□□□ -1.24
IFT122-231	ENST00000514275	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		7.29	□□□□□ -1.24
IFT122-231	ENST00000514275	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
IFT122-231	ENST00000514275	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	7.29	□□□□□ -1.24
IFT122-231	ENST00000514275	ITGAE	P38570	1179 aa		7.28	□□□□□ -1.24
IFT122-231	ENST00000514275	NUBP1	P53384	320 aa		7.28	□□□□□ -1.24
IFT122-231	ENST00000514275	FARP1	Q9Y4F1	1045 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
IFT122-231	ENST00000514275	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		7.28	□□□□□ -1.24
IFT122-231	ENST00000514275	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		7.27	□□□□□ -1.25
IFT122-231	ENST00000514275	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		7.27	□□□□□ -1.25
IFT122-231	ENST00000514275	CUL7	Q14999	1698 aa		7.26	□□□□□ -1.25
IFT122-231	ENST00000514275	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		7.26	□□□□□ -1.25
IFT122-231	ENST00000514275	PKD2	Q13563	968 aa		7.26	□□□□□ -1.25
IFT122-231	ENST00000514275	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
IFT122-231	ENST00000514275	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		7.25	□□□□□ -1.25

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