RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510195.1

SNF8-208, Transcript of SNF8, ESCRT-II complex subunit, humanhuman

TSL 2

Gene SNF8, Length 445 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNF8-208ENST00000510195 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP46.2■■■■■ 4.99
SNF8-208ENST00000510195 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa46.17■■■■■ 4.98
SNF8-208ENST00000510195 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa46.06■■■■■ 4.96
SNF8-208ENST00000510195 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa46■■■■■ 4.95
SNF8-208ENST00000510195 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP45.68■■■■■ 4.9
SNF8-208ENST00000510195 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa45.62■■■■■ 4.89
SNF8-208ENST00000510195 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa45.61■■■■■ 4.89
SNF8-208ENST00000510195 IQGAP2Q13576 1575 aa45.61■■■■■ 4.89
SNF8-208ENST00000510195 ADCY10Q96PN6 1610 aa45.58■■■■■ 4.89
SNF8-208ENST00000510195 MAPKBP1O60336 1514 aa45.56■■■■■ 4.88
SNF8-208ENST00000510195 PTPRGP23470 1445 aa45.55■■■■■ 4.88
SNF8-208ENST00000510195 TNIKQ9UKE5 1360 aa45.52■■■■■ 4.88
SNF8-208ENST00000510195 KIF13AQ9H1H9 1805 aa45.52■■■■■ 4.88
SNF8-208ENST00000510195 ABCC10Q5T3U5 1492 aa45.47■■■■■ 4.87
SNF8-208ENST00000510195 FAM69CQ0P6D2 419 aa45.39■■■■■ 4.86
SNF8-208ENST00000510195 DISP1Q96F81 1524 aa45.36■■■■■ 4.85
SNF8-208ENST00000510195 UGGT2Q9NYU1 1516 aa45.36■■■■■ 4.85
SNF8-208ENST00000510195 DIP2BQ9P265 1576 aa45.29■■■■■ 4.84
SNF8-208ENST00000510195 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP45.28■■■■■ 4.84
SNF8-208ENST00000510195 ABCC2Q92887 1545 aa45.27■■■■■ 4.84
SNF8-208ENST00000510195 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa45.26■■■■■ 4.84
SNF8-208ENST00000510195 PRXQ9BXM0 1461 aa45.23■■■■■ 4.83
SNF8-208ENST00000510195 UACAQ9BZF9 1416 aa45.21■■■■■ 4.83
SNF8-208ENST00000510195 KIAA0556O60303 1618 aa45.17■■■■■ 4.82
SNF8-208ENST00000510195 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa45.17■■■■■ 4.82
SNF8-208ENST00000510195 PLB1Q6P1J6 1458 aa45.09■■■■■ 4.81
SNF8-208ENST00000510195 GOLGA3Q08378 1498 aa45.07■■■■■ 4.81
SNF8-208ENST00000510195 ASXL2Q76L83 1435 aa45.05■■■■■ 4.8
SNF8-208ENST00000510195 KDM5BQ9UGL1 1544 aa45.02■■■■■ 4.8
SNF8-208ENST00000510195 CSRNP3Q8WYN3 585 aa44.99■■■■■ 4.79
SNF8-208ENST00000510195 GLI2P10070 1586 aa44.94■■■■■ 4.78
SNF8-208ENST00000510195 EEA1Q15075 1411 aa44.92■■■■■ 4.78
SNF8-208ENST00000510195 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP44.9■■■■■ 4.78
SNF8-208ENST00000510195 TSPOAP1O95153 1857 aa44.89■■■■■ 4.78
SNF8-208ENST00000510195 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP44.85■■■■■ 4.77
SNF8-208ENST00000510195 KDM6BO15054 1643 aa44.83■■■■■ 4.77
SNF8-208ENST00000510195 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP44.79■■■■■ 4.76
SNF8-208ENST00000510195 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP44.76■■■■■ 4.76
SNF8-208ENST00000510195 ABCA8O94911 1581 aa44.76■■■■■ 4.76
SNF8-208ENST00000510195 WDR7Q9Y4E6 1490 aa44.68■■■■■ 4.74
SNF8-208ENST00000510195 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP44.67■■■■■ 4.74
SNF8-208ENST00000510195 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa44.64■■■■■ 4.74
SNF8-208ENST00000510195 TEX14Q8IWB6 1497 aa44.58■■■■■ 4.73
SNF8-208ENST00000510195 SAMD9Q5K651 1589 aa44.57■■■■■ 4.73
SNF8-208ENST00000510195 P3H3Q8IVL6 736 aa44.55■■■■■ 4.72
SNF8-208ENST00000510195 KIF21BO75037 1637 aa44.44■■■■■ 4.7
SNF8-208ENST00000510195 KCNH8Q96L42 1107 aa44.41■■■■■ 4.7
SNF8-208ENST00000510195 ATP10BO94823 1461 aa44.4■■■■■ 4.7
SNF8-208ENST00000510195 CFAP43Q8NDM7 1665 aa44.39■■■■■ 4.7
SNF8-208ENST00000510195 CD109Q6YHK3 1445 aa44.39■■■■■ 4.7
SNF8-208ENST00000510195 CHIC1Q5VXU3 224 aa44.38■■■■■ 4.7
SNF8-208ENST00000510195 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa44.37■■■■■ 4.69
SNF8-208ENST00000510195 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP44.36■■■■■ 4.69
SNF8-208ENST00000510195 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa44.33■■■■■ 4.69
SNF8-208ENST00000510195 ARID3CA6NKF2 412 aa44.26■■■■■ 4.68
SNF8-208ENST00000510195 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP44.25■■■■■ 4.67
SNF8-208ENST00000510195 EFCAB5A4FU69 1503 aa44.24■■■■■ 4.67
SNF8-208ENST00000510195 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa44.24■■■■■ 4.67
SNF8-208ENST00000510195 FHOD3Q2V2M9 1422 aa44.23■■■■■ 4.67
SNF8-208ENST00000510195 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP44.17■■■■■ 4.66
SNF8-208ENST00000510195 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP44.13■■■■■ 4.66
SNF8-208ENST00000510195 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP44.13■■■■■ 4.66
SNF8-208ENST00000510195 ABCA9Q8IUA7 1624 aa44.11■■■■■ 4.65
SNF8-208ENST00000510195 UBTFP17480 764 aaKnown RBP44.09■■■■■ 4.65
SNF8-208ENST00000510195 PHLDB1Q86UU1 1377 aa44.06■■■■■ 4.64
SNF8-208ENST00000510195 ARAP3Q8WWN8 1544 aa44.02■■■■■ 4.64
SNF8-208ENST00000510195 PLEKHD1A6NEE1 506 aa43.99■■■■■ 4.63
SNF8-208ENST00000510195 ADGRL1O94910 1474 aa43.95■■■■■ 4.63
SNF8-208ENST00000510195 NEO1Q92859 1461 aa43.9■■■■■ 4.62
SNF8-208ENST00000510195 EHMT2Q96KQ7 1210 aa43.9■■■■■ 4.62
SNF8-208ENST00000510195 FMN1Q68DA7 1419 aa43.88■■■■■ 4.61
SNF8-208ENST00000510195 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa43.83■■■■■ 4.61
SNF8-208ENST00000510195 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP43.71■■■■■ 4.59
SNF8-208ENST00000510195 HECW1Q76N89 1606 aa43.7■■■■■ 4.59
SNF8-208ENST00000510195 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP43.7■■■■■ 4.59
SNF8-208ENST00000510195 RAPGEF3O95398 923 aa43.68■■■■■ 4.58
SNF8-208ENST00000510195 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP43.64■■■■■ 4.58
SNF8-208ENST00000510195 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP43.64■■■■■ 4.58
SNF8-208ENST00000510195 CFAP74Q9C0B2 1584 aa43.63■■■■■ 4.57
SNF8-208ENST00000510195 FANCAO15360 1455 aa43.61■■■■■ 4.57
SNF8-208ENST00000510195 AKNAQ7Z591 1439 aa43.6■■■■■ 4.57
SNF8-208ENST00000510195 TTC37Q6PGP7 1564 aa43.59■■■■■ 4.57
SNF8-208ENST00000510195 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP43.56■■■■■ 4.56
SNF8-208ENST00000510195 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa43.55■■■■■ 4.56
SNF8-208ENST00000510195 PLCH2O75038 1416 aa43.51■■■■■ 4.56
SNF8-208ENST00000510195 RICTORQ6R327 1708 aa43.45■■■■■ 4.55
SNF8-208ENST00000510195 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP43.42■■■■■ 4.54
SNF8-208ENST00000510195 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa43.4■■■■■ 4.54
SNF8-208ENST00000510195 CLIP1P30622 1438 aa43.39■■■■■ 4.54
SNF8-208ENST00000510195 KIF14Q15058 1648 aa43.37■■■■■ 4.53
SNF8-208ENST00000510195 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa43.36■■■■■ 4.53
SNF8-208ENST00000510195 CCDC18Q5T9S5 1454 aa43.35■■■■■ 4.53
SNF8-208ENST00000510195 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa43.35■■■■■ 4.53
SNF8-208ENST00000510195 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa43.35■■■■■ 4.53
SNF8-208ENST00000510195 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa43.34■■■■■ 4.53
SNF8-208ENST00000510195 MYO5CQ9NQX4 1742 aa43.34■■■■■ 4.53
SNF8-208ENST00000510195 MAGI2Q86UL8 1455 aa43.32■■■■■ 4.53
SNF8-208ENST00000510195 ADAMTSL3P82987 1691 aa43.31■■■■■ 4.52
SNF8-208ENST00000510195 SCAPERQ9BY12 1400 aa43.31■■■■■ 4.52
SNF8-208ENST00000510195 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP43.29■■■■■ 4.52
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