RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510195.1

SNF8-208, Transcript of SNF8, ESCRT-II complex subunit, humanhuman

TSL 2

Gene SNF8, Length 445 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNF8-208ENST00000510195 NISCHQ9Y2I1 1504 aa66.22■■■■■ 8.19
SNF8-208ENST00000510195 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa59.27■■■■■ 7.08
SNF8-208ENST00000510195 ABCC9O60706 1549 aa58.78■■■■■ 7
SNF8-208ENST00000510195 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa56.24■■■■■ 6.59
SNF8-208ENST00000510195 NACADO15069 1562 aa55.99■■■■■ 6.55
SNF8-208ENST00000510195 DCAF8L2P0C7V8 631 aa55.64■■■■■ 6.5
SNF8-208ENST00000510195 MYO15BQ96JP2 1530 aa55.43■■■■■ 6.46
SNF8-208ENST00000510195 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP54.95■■■■■ 6.39
SNF8-208ENST00000510195 UNC13AQ9UPW8 1703 aa54.85■■■■■ 6.37
SNF8-208ENST00000510195 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa54.82■■■■■ 6.37
SNF8-208ENST00000510195 DNAJC5BQ9UF47 199 aa54.81■■■■■ 6.36
SNF8-208ENST00000510195 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP54.79■■■■■ 6.36
SNF8-208ENST00000510195 BICRAQ9NZM4 1560 aa54.51■■■■■ 6.32
SNF8-208ENST00000510195 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa54.02■■■■■ 6.24
SNF8-208ENST00000510195 SCRIBQ14160 1630 aa53.9■■■■■ 6.22
SNF8-208ENST00000510195 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP53.17■■■■■ 6.1
SNF8-208ENST00000510195 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa53.17■■■■■ 6.1
SNF8-208ENST00000510195 CECR2Q9BXF3 1484 aa52.98■■■■■ 6.07
SNF8-208ENST00000510195 NCAPD3P42695 1498 aa51.69■■■■■ 5.87
SNF8-208ENST00000510195 SMARCA4P51532 1647 aa51.53■■■■■ 5.84
SNF8-208ENST00000510195 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa51.53■■■■■ 5.84
SNF8-208ENST00000510195 SMARCA2P51531 1590 aa51.45■■■■■ 5.83
SNF8-208ENST00000510195 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP51.4■■■■■ 5.82
SNF8-208ENST00000510195 HMGXB3Q12766 1538 aa51.32■■■■■ 5.81
SNF8-208ENST00000510195 PEG3Q9GZU2 1588 aa51.12■■■■■ 5.77
SNF8-208ENST00000510195 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP51.03■■■■■ 5.76
SNF8-208ENST00000510195 MROH2BQ7Z745 1585 aa50.96■■■■■ 5.75
SNF8-208ENST00000510195 ERCC6Q03468 1493 aa50.78■■■■■ 5.72
SNF8-208ENST00000510195 CUX2O14529 1486 aa50.65■■■■■ 5.7
SNF8-208ENST00000510195 NESP48681 1621 aa50.58■■■■■ 5.69
SNF8-208ENST00000510195 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa50.44■■■■■ 5.67
SNF8-208ENST00000510195 WIZO95785 1651 aa50.34■■■■■ 5.65
SNF8-208ENST00000510195 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa50.17■■■■■ 5.62
SNF8-208ENST00000510195 PDS5BQ9NTI5 1447 aa50.17■■■■■ 5.62
SNF8-208ENST00000510195 CADPSQ9ULU8 1353 aa50.12■■■■■ 5.61
SNF8-208ENST00000510195 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP50.1■■■■■ 5.61
SNF8-208ENST00000510195 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP50.04■■■■■ 5.6
SNF8-208ENST00000510195 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa49.96■■■■■ 5.59
SNF8-208ENST00000510195 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP49.8■■■■■ 5.56
SNF8-208ENST00000510195 MRC2Q9UBG0 1479 aa49.64■■■■■ 5.54
SNF8-208ENST00000510195 CFTRP13569 1480 aa49.63■■■■■ 5.53
SNF8-208ENST00000510195 CEP164Q9UPV0 1460 aa49.52■■■■■ 5.52
SNF8-208ENST00000510195 WDR62O43379 1518 aa49.51■■■■■ 5.52
SNF8-208ENST00000510195 FANCD2Q9BXW9 1451 aa49.5■■■■■ 5.51
SNF8-208ENST00000510195 CCDC88BA6NC98 1476 aa49.23■■■■■ 5.47
SNF8-208ENST00000510195 PRDM2Q13029 1718 aa49.1■■■■■ 5.45
SNF8-208ENST00000510195 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP49.03■■■■■ 5.44
SNF8-208ENST00000510195 ABCC8Q09428 1581 aa48.64■■■■■ 5.38
SNF8-208ENST00000510195 TOPBP1Q92547 1522 aa48.59■■■■■ 5.37
SNF8-208ENST00000510195 IFT140Q96RY7 1462 aa48.55■■■■■ 5.36
SNF8-208ENST00000510195 DNMBPQ6XZF7 1577 aa48.47■■■■■ 5.35
SNF8-208ENST00000510195 OSCARQ8IYS5 282 aa48.41■■■■■ 5.34
SNF8-208ENST00000510195 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP48.32■■■■■ 5.33
SNF8-208ENST00000510195 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP48.13■■■■■ 5.3
SNF8-208ENST00000510195 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP48.12■■■■■ 5.29
SNF8-208ENST00000510195 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP48.09■■■■■ 5.29
SNF8-208ENST00000510195 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP48.08■■■■■ 5.29
SNF8-208ENST00000510195 TRIM41Q8WV44 630 aa47.99■■■■■ 5.27
SNF8-208ENST00000510195 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP47.97■■■■■ 5.275e-6■■■□□ 16.9
SNF8-208ENST00000510195 SOGA1O94964 1423 aa47.94■■■■■ 5.26
SNF8-208ENST00000510195 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa47.88■■■■■ 5.26
SNF8-208ENST00000510195 CUX1P39880 1505 aa47.86■■■■■ 5.25
SNF8-208ENST00000510195 FGD5Q6ZNL6 1462 aa47.85■■■■■ 5.25
SNF8-208ENST00000510195 WDR97A6NE52 1622 aa47.79■■■■■ 5.24
SNF8-208ENST00000510195 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP47.74■■■■■ 5.23
SNF8-208ENST00000510195 CHD1O14646 1710 aa47.64■■■■■ 5.22
SNF8-208ENST00000510195 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa47.61■■■■■ 5.21
SNF8-208ENST00000510195 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa47.61■■■■■ 5.21
SNF8-208ENST00000510195 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa47.61■■■■■ 5.21
SNF8-208ENST00000510195 FBLN2P98095 1184 aa47.58■■■■■ 5.21
SNF8-208ENST00000510195 ARHGEF11O15085 1522 aa47.54■■■■■ 5.2
SNF8-208ENST00000510195 GRIN2BQ13224 1484 aa47.49■■■■■ 5.19
SNF8-208ENST00000510195 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa47.49■■■■■ 5.19
SNF8-208ENST00000510195 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP47.47■■■■■ 5.19
SNF8-208ENST00000510195 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa47.4■■■■■ 5.18
SNF8-208ENST00000510195 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP47.37■■■■■ 5.17
SNF8-208ENST00000510195 GAPVD1Q14C86 1478 aa47.36■■■■■ 5.17
SNF8-208ENST00000510195 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP47.3■■■■■ 5.16
SNF8-208ENST00000510195 SYNJ2O15056 1496 aa47.29■■■■■ 5.16
SNF8-208ENST00000510195 TOP2BQ02880 1626 aa47.25■■■■■ 5.15
SNF8-208ENST00000510195 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa47.24■■■■■ 5.15
SNF8-208ENST00000510195 PBRM1Q86U86 1689 aa47.24■■■■■ 5.15
SNF8-208ENST00000510195 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa47.23■■■■■ 5.15
SNF8-208ENST00000510195 SYNJ1O43426 1573 aa47.21■■■■■ 5.15
SNF8-208ENST00000510195 CLASP1Q7Z460 1538 aa47.17■■■■■ 5.14
SNF8-208ENST00000510195 CYB5RLQ6IPT4 315 aa47.17■■■■■ 5.14
SNF8-208ENST00000510195 ARAP1Q96P48 1450 aa47.08■■■■■ 5.13
SNF8-208ENST00000510195 GRIN2AQ12879 1464 aa46.85■■■■■ 5.09
SNF8-208ENST00000510195 ADAMTS12P58397 1594 aa46.84■■■■■ 5.09
SNF8-208ENST00000510195 ERICH3Q5RHP9 1530 aa46.83■■■■■ 5.09
SNF8-208ENST00000510195 FHAD1B1AJZ9 1412 aa46.8■■■■■ 5.08
SNF8-208ENST00000510195 NUP160Q12769 1436 aa46.71■■■■■ 5.07
SNF8-208ENST00000510195 CEP170Q5SW79 1584 aa46.61■■■■■ 5.05
SNF8-208ENST00000510195 TRHP20396 242 aaPredicted RBP46.51■■■■■ 5.04
SNF8-208ENST00000510195 SHROOM2Q13796 1616 aa46.43■■■■■ 5.02
SNF8-208ENST00000510195 KIF27Q86VH2 1401 aa46.37■■■■■ 5.01
SNF8-208ENST00000510195 ERCC6L2Q5T890 1561 aa46.37■■■■■ 5.01
SNF8-208ENST00000510195 IGF1RP08069 1367 aa46.31■■■■■ 5
SNF8-208ENST00000510195 JPH4Q96JJ6 628 aa46.26■■■■■ 5
SNF8-208ENST00000510195 CUL7Q14999 1698 aa46.2■■■■■ 4.99
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