RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505490.2

ALYREF-202, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ALYREF, Length 1,088 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-202ENST00000505490 KIF27Q86VH2 1401 aa53.2■■■■■ 6.11
ALYREF-202ENST00000505490 CUL7Q14999 1698 aa53.17■■■■■ 6.1
ALYREF-202ENST00000505490 KIF13AQ9H1H9 1805 aa53.17■■■■■ 6.1
ALYREF-202ENST00000505490 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa53.15■■■■■ 6.1
ALYREF-202ENST00000505490 MAPKBP1O60336 1514 aa52.96■■■■■ 6.07
ALYREF-202ENST00000505490 ADCY10Q96PN6 1610 aa52.95■■■■■ 6.07
ALYREF-202ENST00000505490 ABCC10Q5T3U5 1492 aa52.9■■■■■ 6.06
ALYREF-202ENST00000505490 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa52.85■■■■■ 6.05
ALYREF-202ENST00000505490 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP52.8■■■■■ 6.04
ALYREF-202ENST00000505490 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP52.78■■■■■ 6.04
ALYREF-202ENST00000505490 DIP2BQ9P265 1576 aa52.76■■■■■ 6.04
ALYREF-202ENST00000505490 FAM69CQ0P6D2 419 aa52.72■■■■■ 6.03
ALYREF-202ENST00000505490 PTPRGP23470 1445 aa52.6■■■■■ 6.01
ALYREF-202ENST00000505490 IQGAP2Q13576 1575 aa52.56■■■■■ 6
ALYREF-202ENST00000505490 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa52.54■■■■■ 6
ALYREF-202ENST00000505490 TNIKQ9UKE5 1360 aa52.53■■■■■ 6
ALYREF-202ENST00000505490 ABCC2Q92887 1545 aa52.42■■■■■ 5.98
ALYREF-202ENST00000505490 DISP1Q96F81 1524 aa52.4■■■■■ 5.98
ALYREF-202ENST00000505490 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa52.37■■■■■ 5.97
ALYREF-202ENST00000505490 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa52.36■■■■■ 5.97
ALYREF-202ENST00000505490 UGGT2Q9NYU1 1516 aa52.3■■■■■ 5.96
ALYREF-202ENST00000505490 TSPOAP1O95153 1857 aa52.26■■■■■ 5.96
ALYREF-202ENST00000505490 KDM6BO15054 1643 aa52.26■■■■■ 5.96
ALYREF-202ENST00000505490 UACAQ9BZF9 1416 aa52.23■■■■■ 5.95
ALYREF-202ENST00000505490 PLB1Q6P1J6 1458 aa52.21■■■■■ 5.95
ALYREF-202ENST00000505490 ASXL2Q76L83 1435 aa52.21■■■■■ 5.95
ALYREF-202ENST00000505490 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP52.2■■■■■ 5.95
ALYREF-202ENST00000505490 GLI2P10070 1586 aa52.2■■■■■ 5.95
ALYREF-202ENST00000505490 KDM5BQ9UGL1 1544 aa52.12■■■■■ 5.93
ALYREF-202ENST00000505490 KIAA0556O60303 1618 aa52.11■■■■■ 5.93
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ALYREF-202ENST00000505490 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa51.95■■■■■ 5.91
ALYREF-202ENST00000505490 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP51.94■■■■■ 5.9
ALYREF-202ENST00000505490 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP51.93■■■■■ 5.9
ALYREF-202ENST00000505490 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa51.88■■■■■ 5.9
ALYREF-202ENST00000505490 PRXQ9BXM0 1461 aa51.86■■■■■ 5.89
ALYREF-202ENST00000505490 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa51.86■■■■■ 5.89
ALYREF-202ENST00000505490 GOLGA3Q08378 1498 aa51.78■■■■■ 5.88
ALYREF-202ENST00000505490 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP51.72■■■■■ 5.87
ALYREF-202ENST00000505490 ABCA8O94911 1581 aa51.7■■■■■ 5.87
ALYREF-202ENST00000505490 WDR7Q9Y4E6 1490 aa51.69■■■■■ 5.87
ALYREF-202ENST00000505490 TEX14Q8IWB6 1497 aa51.67■■■■■ 5.86
ALYREF-202ENST00000505490 CFAP43Q8NDM7 1665 aa51.44■■■■■ 5.83
ALYREF-202ENST00000505490 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa51.43■■■■■ 5.82
ALYREF-202ENST00000505490 ADGRL1O94910 1474 aa51.37■■■■■ 5.81
ALYREF-202ENST00000505490 CD109Q6YHK3 1445 aa51.36■■■■■ 5.81
ALYREF-202ENST00000505490 CSRNP3Q8WYN3 585 aa51.29■■■■■ 5.8
ALYREF-202ENST00000505490 SAMD9Q5K651 1589 aa51.28■■■■■ 5.8
ALYREF-202ENST00000505490 KCNH8Q96L42 1107 aa51.25■■■■■ 5.79
ALYREF-202ENST00000505490 ATP10BO94823 1461 aa51.23■■■■■ 5.79
ALYREF-202ENST00000505490 P3H3Q8IVL6 736 aa51.13■■■■■ 5.78
ALYREF-202ENST00000505490 EEA1Q15075 1411 aa51.12■■■■■ 5.77
ALYREF-202ENST00000505490 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP51.11■■■■■ 5.77
ALYREF-202ENST00000505490 ARAP3Q8WWN8 1544 aa51.05■■■■■ 5.76
ALYREF-202ENST00000505490 ABCA9Q8IUA7 1624 aa51.04■■■■■ 5.76
ALYREF-202ENST00000505490 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa51.04■■■■■ 5.76
ALYREF-202ENST00000505490 ARID3CA6NKF2 412 aa50.97■■■■■ 5.75
ALYREF-202ENST00000505490 PHLDB1Q86UU1 1377 aa50.91■■■■■ 5.74
ALYREF-202ENST00000505490 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP50.89■■■■■ 5.74
ALYREF-202ENST00000505490 KIF21BO75037 1637 aa50.79■■■■■ 5.72
ALYREF-202ENST00000505490 FHOD3Q2V2M9 1422 aa50.78■■■■■ 5.72
ALYREF-202ENST00000505490 NEO1Q92859 1461 aa50.78■■■■■ 5.72
ALYREF-202ENST00000505490 HECW2Q9P2P5 1572 aa50.73■■■■■ 5.71
ALYREF-202ENST00000505490 EFCAB5A4FU69 1503 aa50.68■■■■■ 5.7
ALYREF-202ENST00000505490 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP50.62■■■■■ 5.69
ALYREF-202ENST00000505490 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP50.62■■■■■ 5.69
ALYREF-202ENST00000505490 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa50.6■■■■■ 5.69
ALYREF-202ENST00000505490 RAPGEF3O95398 923 aa50.58■■■■■ 5.69
ALYREF-202ENST00000505490 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP50.58■■■■■ 5.69
ALYREF-202ENST00000505490 PLEKHD1A6NEE1 506 aa50.52■■■■■ 5.68
ALYREF-202ENST00000505490 ADAMTSL3P82987 1691 aa50.51■■■■■ 5.68
ALYREF-202ENST00000505490 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP50.45■■■■■ 5.676e-6■■■■□ 21.5
ALYREF-202ENST00000505490 RICTORQ6R327 1708 aa50.39■■■■■ 5.66
ALYREF-202ENST00000505490 CFAP74Q9C0B2 1584 aa50.36■■■■■ 5.65
ALYREF-202ENST00000505490 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP50.36■■■■■ 5.65
ALYREF-202ENST00000505490 AKNAQ7Z591 1439 aa50.36■■■■■ 5.65
ALYREF-202ENST00000505490 TTC37Q6PGP7 1564 aa50.34■■■■■ 5.65
ALYREF-202ENST00000505490 FANCAO15360 1455 aa50.34■■■■■ 5.65
ALYREF-202ENST00000505490 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP50.34■■■■■ 5.65
ALYREF-202ENST00000505490 PTPRMP28827 1452 aa50.34■■■■■ 5.65
ALYREF-202ENST00000505490 BCORL1Q5H9F3 1711 aa50.34■■■■■ 5.65
ALYREF-202ENST00000505490 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa50.31■■■■■ 5.64
ALYREF-202ENST00000505490 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP50.3■■■■■ 5.64
ALYREF-202ENST00000505490 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa50.22■■■■■ 5.63
ALYREF-202ENST00000505490 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa50.2■■■■■ 5.63
ALYREF-202ENST00000505490 FMN1Q68DA7 1419 aa50.19■■■■■ 5.63
ALYREF-202ENST00000505490 MADDQ8WXG6 1647 aa50.18■■■■■ 5.62
ALYREF-202ENST00000505490 CHIC1Q5VXU3 224 aa50.17■■■■■ 5.62
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ALYREF-202ENST00000505490 PLCH2O75038 1416 aa50.14■■■■■ 5.62
ALYREF-202ENST00000505490 HECW1Q76N89 1606 aa50.14■■■■■ 5.62
ALYREF-202ENST00000505490 MAGI2Q86UL8 1455 aa50.09■■■■■ 5.61
ALYREF-202ENST00000505490 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP50.09■■■■■ 5.61
ALYREF-202ENST00000505490 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa50.03■■■■■ 5.6
ALYREF-202ENST00000505490 YEATS2Q9ULM3 1422 aa50.02■■■■■ 5.6
ALYREF-202ENST00000505490 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa50.01■■■■■ 5.6
ALYREF-202ENST00000505490 POGZQ7Z3K3 1410 aa50■■■■■ 5.59
ALYREF-202ENST00000505490 SCAPERQ9BY12 1400 aa49.97■■■■■ 5.59
ALYREF-202ENST00000505490 EHMT2Q96KQ7 1210 aa49.96■■■■■ 5.59
ALYREF-202ENST00000505490 MYO5CQ9NQX4 1742 aa49.96■■■■■ 5.59
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