RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498535.1

MKRN1-216, Transcript of makorin ring finger protein 1, human

TSL 2

Gene MKRN1, Length 607 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MKRN1-216	ENST00000498535	IGF1R	P08069	1367 aa		44.27	■■■■■ 4.68
MKRN1-216	ENST00000498535	CUL7	Q14999	1698 aa		44.17	■■■■■ 4.66
MKRN1-216	ENST00000498535	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		44.14	■■■■■ 4.66
MKRN1-216	ENST00000498535	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	44.09	■■■■■ 4.65
MKRN1-216	ENST00000498535	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		44	■■■■■ 4.63
MKRN1-216	ENST00000498535	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	43.99	■■■■■ 4.63
MKRN1-216	ENST00000498535	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		43.99	■■■■■ 4.63
MKRN1-216	ENST00000498535	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		43.89	■■■■■ 4.62
MKRN1-216	ENST00000498535	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		43.89	■■■■■ 4.62
MKRN1-216	ENST00000498535	MAPKBP1	O60336	1514 aa		43.86	■■■■■ 4.61
MKRN1-216	ENST00000498535	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		43.86	■■■■■ 4.61
MKRN1-216	ENST00000498535	PTPRG	P23470	1445 aa		43.78	■■■■■ 4.6
MKRN1-216	ENST00000498535	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		43.76	■■■■■ 4.6
MKRN1-216	ENST00000498535	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	43.74	■■■■■ 4.59
MKRN1-216	ENST00000498535	IQGAP2	Q13576	1575 aa		43.7	■■■■■ 4.59
MKRN1-216	ENST00000498535	DIP2B	Q9P265	1576 aa		43.7	■■■■■ 4.59
MKRN1-216	ENST00000498535	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		43.69	■■■■■ 4.59
MKRN1-216	ENST00000498535	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		43.58	■■■■■ 4.57
MKRN1-216	ENST00000498535	ABCC2	Q92887	1545 aa		43.52	■■■■■ 4.56
MKRN1-216	ENST00000498535	DISP1	Q96F81	1524 aa		43.47	■■■■■ 4.55
MKRN1-216	ENST00000498535	TSPOAP1	O95153	1857 aa		43.43	■■■■■ 4.54
MKRN1-216	ENST00000498535	UACA	Q9BZF9	1416 aa		43.42	■■■■■ 4.54
MKRN1-216	ENST00000498535	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		43.42	■■■■■ 4.54
MKRN1-216	ENST00000498535	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		43.4	■■■■■ 4.54
MKRN1-216	ENST00000498535	KDM6B	O15054	1643 aa		43.38	■■■■■ 4.54
MKRN1-216	ENST00000498535	ASXL2	Q76L83	1435 aa		43.38	■■■■■ 4.53
MKRN1-216	ENST00000498535	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		43.38	■■■■■ 4.53
MKRN1-216	ENST00000498535	KIAA0556	O60303	1618 aa		43.27	■■■■■ 4.52
MKRN1-216	ENST00000498535	GLI2	P10070	1586 aa		43.23	■■■■■ 4.51
MKRN1-216	ENST00000498535	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		43.22	■■■■■ 4.51
MKRN1-216	ENST00000498535	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		43.18	■■■■■ 4.5
MKRN1-216	ENST00000498535	GOLGA3	Q08378	1498 aa		43.13	■■■■■ 4.49
MKRN1-216	ENST00000498535	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	43.11	■■■■■ 4.49
MKRN1-216	ENST00000498535	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	43.1	■■■■■ 4.49
MKRN1-216	ENST00000498535	PRX	Q9BXM0	1461 aa		43.08	■■■■■ 4.49
MKRN1-216	ENST00000498535	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	43.07	■■■■■ 4.49
MKRN1-216	ENST00000498535	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		42.97	■■■■■ 4.47
MKRN1-216	ENST00000498535	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		42.96	■■■■■ 4.47
MKRN1-216	ENST00000498535	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		42.94	■■■■■ 4.47
MKRN1-216	ENST00000498535	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		42.94	■■■■■ 4.47
MKRN1-216	ENST00000498535	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	42.9	■■■■■ 4.46
MKRN1-216	ENST00000498535	ABCA8	O94911	1581 aa		42.88	■■■■■ 4.45
MKRN1-216	ENST00000498535	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		42.82	■■■■■ 4.45
MKRN1-216	ENST00000498535	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	42.81	■■■■■ 4.44
MKRN1-216	ENST00000498535	KCNH8	Q96L42	1107 aa		42.8	■■■■■ 4.44
MKRN1-216	ENST00000498535	P3H3	Q8IVL6	736 aa		42.75	■■■■■ 4.43
MKRN1-216	ENST00000498535	CD109	Q6YHK3	1445 aa		42.72	■■■■■ 4.43
MKRN1-216	ENST00000498535	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		42.67	■■■■■ 4.42
MKRN1-216	ENST00000498535	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		42.65	■■■■■ 4.42
MKRN1-216	ENST00000498535	ARID3C	A6NKF2	412 aa		42.63	■■■■■ 4.41
MKRN1-216	ENST00000498535	ADGRL1	O94910	1474 aa		42.62	■■■■■ 4.41
MKRN1-216	ENST00000498535	EEA1	Q15075	1411 aa		42.61	■■■■■ 4.41
MKRN1-216	ENST00000498535	ATP10B	O94823	1461 aa		42.56	■■■■■ 4.4
MKRN1-216	ENST00000498535	SAMD9	Q5K651	1589 aa		42.55	■■■■■ 4.4
MKRN1-216	ENST00000498535	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	42.46	■■■■■ 4.39
MKRN1-216	ENST00000498535	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		42.43	■■■■■ 4.38
MKRN1-216	ENST00000498535	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	42.43	■■■■■ 4.38
MKRN1-216	ENST00000498535	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	42.43	■■■■■ 4.38
MKRN1-216	ENST00000498535	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		42.33	■■■■■ 4.37
MKRN1-216	ENST00000498535	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		42.32	■■■■■ 4.37
MKRN1-216	ENST00000498535	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		42.31	■■■■■ 4.36
MKRN1-216	ENST00000498535	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		42.29	■■■■■ 4.36
MKRN1-216	ENST00000498535	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	42.27	■■■■■ 4.36
MKRN1-216	ENST00000498535	KIF21B	O75037	1637 aa		42.22	■■■■■ 4.35
MKRN1-216	ENST00000498535	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		42.17	■■■■■ 4.34
MKRN1-216	ENST00000498535	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		42.16	■■■■■ 4.34
MKRN1-216	ENST00000498535	NEO1	Q92859	1461 aa		42.16	■■■■■ 4.34
MKRN1-216	ENST00000498535	RAPGEF3	O95398	923 aa		42.11	■■■■■ 4.33
MKRN1-216	ENST00000498535	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	42.04	■■■■■ 4.32
MKRN1-216	ENST00000498535	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		42.03	■■■■■ 4.32
MKRN1-216	ENST00000498535	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		42.02	■■■■■ 4.32
MKRN1-216	ENST00000498535	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		41.94	■■■■■ 4.3
MKRN1-216	ENST00000498535	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		41.9	■■■■■ 4.3
MKRN1-216	ENST00000498535	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	41.9	■■■■■ 4.3	4e-6	■■■■□ 19.8
MKRN1-216	ENST00000498535	AKNA	Q7Z591	1439 aa		41.88	■■■■■ 4.3
MKRN1-216	ENST00000498535	FANCA	O15360	1455 aa		41.88	■■■■■ 4.29
MKRN1-216	ENST00000498535	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	41.88	■■■■■ 4.29
MKRN1-216	ENST00000498535	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	41.87	■■■■■ 4.29
MKRN1-216	ENST00000498535	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		41.86	■■■■■ 4.29
MKRN1-216	ENST00000498535	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	41.86	■■■■■ 4.29
MKRN1-216	ENST00000498535	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	41.85	■■■■■ 4.29
MKRN1-216	ENST00000498535	FMN1	Q68DA7	1419 aa		41.84	■■■■■ 4.29
MKRN1-216	ENST00000498535	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		41.82	■■■■■ 4.29
MKRN1-216	ENST00000498535	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		41.8	■■■■■ 4.28
MKRN1-216	ENST00000498535	RICTOR	Q6R327	1708 aa		41.76	■■■■■ 4.28
MKRN1-216	ENST00000498535	PTPRM	P28827	1452 aa		41.76	■■■■■ 4.28
MKRN1-216	ENST00000498535	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		41.76	■■■■■ 4.28
MKRN1-216	ENST00000498535	HECW1	Q76N89	1606 aa		41.74	■■■■■ 4.27
MKRN1-216	ENST00000498535	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	41.74	■■■■■ 4.27
MKRN1-216	ENST00000498535	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	41.73	■■■■■ 4.27
MKRN1-216	ENST00000498535	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		41.73	■■■■■ 4.27
MKRN1-216	ENST00000498535	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		41.72	■■■■■ 4.27
MKRN1-216	ENST00000498535	PLCH2	O75038	1416 aa		41.68	■■■■■ 4.26
MKRN1-216	ENST00000498535	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		41.63	■■■■■ 4.25
MKRN1-216	ENST00000498535	MADD	Q8WXG6	1647 aa		41.62	■■■■■ 4.25
MKRN1-216	ENST00000498535	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		41.6	■■■■■ 4.25
MKRN1-216	ENST00000498535	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		41.59	■■■■■ 4.25
MKRN1-216	ENST00000498535	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		41.59	■■■■■ 4.25
MKRN1-216	ENST00000498535	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		41.58	■■■■■ 4.25
MKRN1-216	ENST00000498535	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		41.57	■■■■■ 4.25

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