RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496977.5

STX4-212, Transcript of syntaxin 4, humanhuman

TSL 5

Gene STX4, Length 983 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4-212ENST00000496977 JPH4Q96JJ6 628 aa41.6■■■■■ 4.25
STX4-212ENST00000496977 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa41.55■■■■■ 4.24
STX4-212ENST00000496977 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP41.52■■■■■ 4.24
STX4-212ENST00000496977 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.46■■■■■ 4.23
STX4-212ENST00000496977 PRXQ9BXM0 1461 aa41.28■■■■■ 4.2
STX4-212ENST00000496977 IQGAP2Q13576 1575 aa41.26■■■■■ 4.2
STX4-212ENST00000496977 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.25■■■■■ 4.19
STX4-212ENST00000496977 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.19■■■■■ 4.18
STX4-212ENST00000496977 EEA1Q15075 1411 aa41.14■■■■■ 4.18
STX4-212ENST00000496977 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.09■■■■■ 4.17
STX4-212ENST00000496977 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa41.08■■■■■ 4.17
STX4-212ENST00000496977 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa41.06■■■■■ 4.16
STX4-212ENST00000496977 UGGT2Q9NYU1 1516 aa41.05■■■■■ 4.16
STX4-212ENST00000496977 DISP1Q96F81 1524 aa41.03■■■■■ 4.16
STX4-212ENST00000496977 PTPRGP23470 1445 aa41■■■■■ 4.15
STX4-212ENST00000496977 TNIKQ9UKE5 1360 aa40.99■■■■■ 4.15
STX4-212ENST00000496977 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP40.99■■■■■ 4.15
STX4-212ENST00000496977 ADCY10Q96PN6 1610 aa40.93■■■■■ 4.14
STX4-212ENST00000496977 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP40.9■■■■■ 4.14
STX4-212ENST00000496977 KIAA0556O60303 1618 aa40.89■■■■■ 4.14
STX4-212ENST00000496977 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP40.8■■■■■ 4.12
STX4-212ENST00000496977 GOLGA3Q08378 1498 aa40.77■■■■■ 4.12
STX4-212ENST00000496977 KIF21BO75037 1637 aa40.75■■■■■ 4.11
STX4-212ENST00000496977 UACAQ9BZF9 1416 aa40.71■■■■■ 4.11
STX4-212ENST00000496977 MAPKBP1O60336 1514 aa40.7■■■■■ 4.11
STX4-212ENST00000496977 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa40.69■■■■■ 4.1
STX4-212ENST00000496977 ABCC2Q92887 1545 aa40.65■■■■■ 4.1
STX4-212ENST00000496977 KIF13AQ9H1H9 1805 aa40.61■■■■■ 4.09
STX4-212ENST00000496977 ABCC10Q5T3U5 1492 aa40.56■■■■■ 4.08
STX4-212ENST00000496977 SAMD9Q5K651 1589 aa40.54■■■■■ 4.08
STX4-212ENST00000496977 P3H3Q8IVL6 736 aa40.53■■■■■ 4.08
STX4-212ENST00000496977 PLB1Q6P1J6 1458 aa40.52■■■■■ 4.08
STX4-212ENST00000496977 KDM5BQ9UGL1 1544 aa40.5■■■■■ 4.07
STX4-212ENST00000496977 FAM69CQ0P6D2 419 aa40.48■■■■■ 4.07
STX4-212ENST00000496977 DIP2BQ9P265 1576 aa40.48■■■■■ 4.07
STX4-212ENST00000496977 EHMT2Q96KQ7 1210 aa40.47■■■■■ 4.07
STX4-212ENST00000496977 ABCA8O94911 1581 aa40.47■■■■■ 4.07
STX4-212ENST00000496977 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP40.44■■■■■ 4.06
STX4-212ENST00000496977 ASXL2Q76L83 1435 aa40.43■■■■■ 4.06
STX4-212ENST00000496977 UBTFP17480 764 aaKnown RBP40.42■■■■■ 4.06
STX4-212ENST00000496977 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP40.41■■■■■ 4.06
STX4-212ENST00000496977 FHOD3Q2V2M9 1422 aa40.3■■■■■ 4.04
STX4-212ENST00000496977 EFCAB5A4FU69 1503 aa40.29■■■■■ 4.04
STX4-212ENST00000496977 GLI2P10070 1586 aa40.22■■■■■ 4.03
STX4-212ENST00000496977 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP40.19■■■■■ 4.02
STX4-212ENST00000496977 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa40.19■■■■■ 4.02
STX4-212ENST00000496977 TSPOAP1O95153 1857 aa40.17■■■■■ 4.02
STX4-212ENST00000496977 WDR7Q9Y4E6 1490 aa40.17■■■■■ 4.02
STX4-212ENST00000496977 ATP10BO94823 1461 aa40.15■■■■■ 4.02
STX4-212ENST00000496977 ARID3CA6NKF2 412 aa40.13■■■■■ 4.01
STX4-212ENST00000496977 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa40.1■■■■■ 4.01
STX4-212ENST00000496977 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP40.07■■■■■ 4
STX4-212ENST00000496977 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP40.02■■■■■ 4
STX4-212ENST00000496977 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa40.02■■■■■ 4
STX4-212ENST00000496977 KCNH8Q96L42 1107 aa40■■■■□ 3.99
STX4-212ENST00000496977 FMN1Q68DA7 1419 aa39.92■■■■□ 3.98
STX4-212ENST00000496977 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP39.92■■■■□ 3.98
STX4-212ENST00000496977 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP39.92■■■■□ 3.98
STX4-212ENST00000496977 KDM6BO15054 1643 aa39.87■■■■□ 3.97
STX4-212ENST00000496977 CFAP43Q8NDM7 1665 aa39.86■■■■□ 3.97
STX4-212ENST00000496977 CD109Q6YHK3 1445 aa39.83■■■■□ 3.97
STX4-212ENST00000496977 TEX14Q8IWB6 1497 aa39.81■■■■□ 3.96
STX4-212ENST00000496977 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa39.77■■■■□ 3.96
STX4-212ENST00000496977 PLEKHD1A6NEE1 506 aa39.77■■■■□ 3.96
STX4-212ENST00000496977 CLIP1P30622 1438 aa39.76■■■■□ 3.96
STX4-212ENST00000496977 HECW1Q76N89 1606 aa39.76■■■■□ 3.95
STX4-212ENST00000496977 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP39.75■■■■□ 3.95
STX4-212ENST00000496977 ABCA9Q8IUA7 1624 aa39.73■■■■□ 3.95
STX4-212ENST00000496977 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP39.73■■■■□ 3.95
STX4-212ENST00000496977 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP39.69■■■■□ 3.94
STX4-212ENST00000496977 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa39.61■■■■□ 3.93
STX4-212ENST00000496977 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa39.6■■■■□ 3.93
STX4-212ENST00000496977 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP39.59■■■■□ 3.93
STX4-212ENST00000496977 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa39.57■■■■□ 3.93
STX4-212ENST00000496977 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP39.53■■■■□ 3.92
STX4-212ENST00000496977 CEP162Q5TB80 1403 aa39.52■■■■□ 3.92
STX4-212ENST00000496977 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP39.52■■■■□ 3.92
STX4-212ENST00000496977 FYCO1Q9BQS8 1478 aa39.48■■■■□ 3.91
STX4-212ENST00000496977 TTC37Q6PGP7 1564 aa39.46■■■■□ 3.91
STX4-212ENST00000496977 PHLDB1Q86UU1 1377 aa39.45■■■■□ 3.91
STX4-212ENST00000496977 CCDC18Q5T9S5 1454 aa39.44■■■■□ 3.9
STX4-212ENST00000496977 ARAP3Q8WWN8 1544 aa39.44■■■■□ 3.9
STX4-212ENST00000496977 NEO1Q92859 1461 aa39.43■■■■□ 3.9
STX4-212ENST00000496977 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP39.42■■■■□ 3.9
STX4-212ENST00000496977 KIF14Q15058 1648 aa39.36■■■■□ 3.89
STX4-212ENST00000496977 FANCAO15360 1455 aa39.3■■■■□ 3.88
STX4-212ENST00000496977 PLCH2O75038 1416 aa39.3■■■■□ 3.88
STX4-212ENST00000496977 AKNAQ7Z591 1439 aa39.27■■■■□ 3.88
STX4-212ENST00000496977 CFAP74Q9C0B2 1584 aa39.25■■■■□ 3.87
STX4-212ENST00000496977 RAPGEF3O95398 923 aa39.24■■■■□ 3.87
STX4-212ENST00000496977 MYO5CQ9NQX4 1742 aa39.23■■■■□ 3.87
STX4-212ENST00000496977 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa39.17■■■■□ 3.86
STX4-212ENST00000496977 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP39.16■■■■□ 3.86
STX4-212ENST00000496977 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP39.15■■■■□ 3.86
STX4-212ENST00000496977 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa39.14■■■■□ 3.86
STX4-212ENST00000496977 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa39.14■■■■□ 3.86
STX4-212ENST00000496977 RICTORQ6R327 1708 aa39.11■■■■□ 3.85
STX4-212ENST00000496977 ADGRL1O94910 1474 aa39.09■■■■□ 3.85
STX4-212ENST00000496977 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa39.08■■■■□ 3.85
STX4-212ENST00000496977 ARHGAP5Q13017 1502 aa39.07■■■■□ 3.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms