RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492536.5

RUSC1-215, Transcript of RUN and SH3 domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene RUSC1, Length 1,069 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUSC1-215ENST00000492536 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.96■■■■■ 4.15
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RUSC1-215ENST00000492536 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP40.46■■■■■ 4.07
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RUSC1-215ENST00000492536 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40.43■■■■■ 4.06
RUSC1-215ENST00000492536 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa40.42■■■■■ 4.06
RUSC1-215ENST00000492536 ADCY10Q96PN6 1610 aa40.42■■■■■ 4.06
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RUSC1-215ENST00000492536 DIP2BQ9P265 1576 aa40.18■■■■■ 4.02
RUSC1-215ENST00000492536 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP40.16■■■■■ 4.02
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RUSC1-215ENST00000492536 TEX14Q8IWB6 1497 aa39.52■■■■□ 3.92
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RUSC1-215ENST00000492536 CD109Q6YHK3 1445 aa39.34■■■■□ 3.89
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RUSC1-215ENST00000492536 ATP10BO94823 1461 aa39.34■■■■□ 3.89
RUSC1-215ENST00000492536 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP39.32■■■■□ 3.89
RUSC1-215ENST00000492536 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa39.32■■■■□ 3.89
RUSC1-215ENST00000492536 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa39.3■■■■□ 3.88
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RUSC1-215ENST00000492536 ARAP3Q8WWN8 1544 aa39■■■■□ 3.83
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RUSC1-215ENST00000492536 NEO1Q92859 1461 aa38.92■■■■□ 3.82
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RUSC1-215ENST00000492536 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa38.86■■■■□ 3.81
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RUSC1-215ENST00000492536 TTC37Q6PGP7 1564 aa38.67■■■■□ 3.78
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RUSC1-215ENST00000492536 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa38.41■■■■□ 3.74
RUSC1-215ENST00000492536 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP38.41■■■■□ 3.74
RUSC1-215ENST00000492536 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa38.4■■■■□ 3.74
RUSC1-215ENST00000492536 ADAMTSL3P82987 1691 aa38.39■■■■□ 3.74
RUSC1-215ENST00000492536 MAGI2Q86UL8 1455 aa38.39■■■■□ 3.74
RUSC1-215ENST00000492536 SCAPERQ9BY12 1400 aa38.38■■■■□ 3.73
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