RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492536.5

RUSC1-215, Transcript of RUN and SH3 domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene RUSC1, Length 1,069 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUSC1-215ENST00000492536 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.68■■■■■ 6.98
RUSC1-215ENST00000492536 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.55■■■■■ 6
RUSC1-215ENST00000492536 ABCC9O60706 1549 aa52.14■■■■■ 5.94
RUSC1-215ENST00000492536 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.86■■■■■ 5.57
RUSC1-215ENST00000492536 NACADO15069 1562 aa49.62■■■■■ 5.53
RUSC1-215ENST00000492536 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.3■■■■■ 5.48
RUSC1-215ENST00000492536 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.1■■■■■ 5.45
RUSC1-215ENST00000492536 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.73■■■■■ 5.39
RUSC1-215ENST00000492536 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.61■■■■■ 5.37
RUSC1-215ENST00000492536 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.57■■■■■ 5.37
RUSC1-215ENST00000492536 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.56■■■■■ 5.36
RUSC1-215ENST00000492536 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.55■■■■■ 5.36
RUSC1-215ENST00000492536 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.32■■■■■ 5.33
RUSC1-215ENST00000492536 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.88■■■■■ 5.26
RUSC1-215ENST00000492536 SCRIBQ14160 1630 aa47.81■■■■■ 5.24
RUSC1-215ENST00000492536 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.15■■■■■ 5.14
RUSC1-215ENST00000492536 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.13■■■■■ 5.14
RUSC1-215ENST00000492536 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.97■■■■■ 5.11
RUSC1-215ENST00000492536 NCAPD3P42695 1498 aa45.8■■■■■ 4.92
RUSC1-215ENST00000492536 SMARCA4P51532 1647 aa45.69■■■■■ 4.9
RUSC1-215ENST00000492536 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.68■■■■■ 4.9
RUSC1-215ENST00000492536 SMARCA2P51531 1590 aa45.6■■■■■ 4.89
RUSC1-215ENST00000492536 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.57■■■■■ 4.89
RUSC1-215ENST00000492536 HMGXB3Q12766 1538 aa45.5■■■■■ 4.87
RUSC1-215ENST00000492536 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.31■■■■■ 4.84
RUSC1-215ENST00000492536 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.25■■■■■ 4.83
RUSC1-215ENST00000492536 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.17■■■■■ 4.82
RUSC1-215ENST00000492536 ERCC6Q03468 1493 aa45.04■■■■■ 4.8
RUSC1-215ENST00000492536 CUX2O14529 1486 aa44.9■■■■■ 4.78
RUSC1-215ENST00000492536 NESP48681 1621 aa44.86■■■■■ 4.77
RUSC1-215ENST00000492536 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.71■■■■■ 4.75
RUSC1-215ENST00000492536 WIZO95785 1651 aa44.62■■■■■ 4.73
RUSC1-215ENST00000492536 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.45■■■■■ 4.71
RUSC1-215ENST00000492536 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.44■■■■■ 4.7
RUSC1-215ENST00000492536 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.41■■■■■ 4.7
RUSC1-215ENST00000492536 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.39■■■■■ 4.7
RUSC1-215ENST00000492536 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.39■■■■■ 4.7
RUSC1-215ENST00000492536 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.29■■■■■ 4.68
RUSC1-215ENST00000492536 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.17■■■■■ 4.66
RUSC1-215ENST00000492536 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.02■■■■■ 4.64
RUSC1-215ENST00000492536 CFTRP13569 1480 aa43.97■■■■■ 4.63
RUSC1-215ENST00000492536 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.92■■■■■ 4.62
RUSC1-215ENST00000492536 WDR62O43379 1518 aa43.9■■■■■ 4.62
RUSC1-215ENST00000492536 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.89■■■■■ 4.62
RUSC1-215ENST00000492536 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.63■■■■■ 4.57
RUSC1-215ENST00000492536 PRDM2Q13029 1718 aa43.53■■■■■ 4.56
RUSC1-215ENST00000492536 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.47■■■■■ 4.55
RUSC1-215ENST00000492536 ABCC8Q09428 1581 aa43.1■■■■■ 4.49
RUSC1-215ENST00000492536 TOPBP1Q92547 1522 aa43.08■■■■■ 4.49
RUSC1-215ENST00000492536 IFT140Q96RY7 1462 aa43.04■■■■■ 4.48
RUSC1-215ENST00000492536 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.97■■■■■ 4.47
RUSC1-215ENST00000492536 OSCARQ8IYS5 282 aa42.87■■■■■ 4.45
RUSC1-215ENST00000492536 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.86■■■■■ 4.45
RUSC1-215ENST00000492536 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.67■■■■■ 4.42
RUSC1-215ENST00000492536 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.67■■■■■ 4.42
RUSC1-215ENST00000492536 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.66■■■■■ 4.42
RUSC1-215ENST00000492536 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.6■■■■■ 4.41
RUSC1-215ENST00000492536 TRIM41Q8WV44 630 aa42.56■■■■■ 4.4
RUSC1-215ENST00000492536 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.51■■■■■ 4.48e-10■■■■■ 51.9
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RUSC1-215ENST00000492536 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.45■■■■■ 4.39
RUSC1-215ENST00000492536 CUX1P39880 1505 aa42.44■■■■■ 4.38
RUSC1-215ENST00000492536 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.43■■■■■ 4.38
RUSC1-215ENST00000492536 WDR97A6NE52 1622 aa42.36■■■■■ 4.37
RUSC1-215ENST00000492536 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.31■■■■■ 4.36
RUSC1-215ENST00000492536 CHD1O14646 1710 aa42.24■■■■■ 4.35
RUSC1-215ENST00000492536 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.22■■■■■ 4.35
RUSC1-215ENST00000492536 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.22■■■■■ 4.35
RUSC1-215ENST00000492536 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.22■■■■■ 4.35
RUSC1-215ENST00000492536 ARHGEF11O15085 1522 aa42.16■■■■■ 4.34
RUSC1-215ENST00000492536 FBLN2P98095 1184 aa42.16■■■■■ 4.34
RUSC1-215ENST00000492536 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.12■■■■■ 4.33
RUSC1-215ENST00000492536 GRIN2BQ13224 1484 aa42.1■■■■■ 4.33
RUSC1-215ENST00000492536 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.09■■■■■ 4.33
RUSC1-215ENST00000492536 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.01■■■■■ 4.32
RUSC1-215ENST00000492536 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.98■■■■■ 4.31
RUSC1-215ENST00000492536 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.96■■■■■ 4.31
RUSC1-215ENST00000492536 SYNJ2O15056 1496 aa41.92■■■■■ 4.3
RUSC1-215ENST00000492536 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.92■■■■■ 4.3
RUSC1-215ENST00000492536 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.9■■■■■ 4.3
RUSC1-215ENST00000492536 PBRM1Q86U86 1689 aa41.9■■■■■ 4.3
RUSC1-215ENST00000492536 TOP2BQ02880 1626 aa41.87■■■■■ 4.29
RUSC1-215ENST00000492536 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.87■■■■■ 4.29
RUSC1-215ENST00000492536 SYNJ1O43426 1573 aa41.87■■■■■ 4.29
RUSC1-215ENST00000492536 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.83■■■■■ 4.29
RUSC1-215ENST00000492536 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.79■■■■■ 4.28
RUSC1-215ENST00000492536 ARAP1Q96P48 1450 aa41.75■■■■■ 4.27
RUSC1-215ENST00000492536 ADAMTS12P58397 1594 aa41.55■■■■■ 4.24
RUSC1-215ENST00000492536 GRIN2AQ12879 1464 aa41.54■■■■■ 4.24
RUSC1-215ENST00000492536 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.51■■■■■ 4.24
RUSC1-215ENST00000492536 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.49■■■■■ 4.23
RUSC1-215ENST00000492536 NUP160Q12769 1436 aa41.41■■■■■ 4.22
RUSC1-215ENST00000492536 CEP170Q5SW79 1584 aa41.34■■■■■ 4.21
RUSC1-215ENST00000492536 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.22■■■■■ 4.19
RUSC1-215ENST00000492536 SHROOM2Q13796 1616 aa41.16■■■■■ 4.18
RUSC1-215ENST00000492536 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.12■■■■■ 4.17
RUSC1-215ENST00000492536 KIF27Q86VH2 1401 aa41.1■■■■■ 4.17
RUSC1-215ENST00000492536 IGF1RP08069 1367 aa41■■■■■ 4.15
RUSC1-215ENST00000492536 JPH4Q96JJ6 628 aa40.96■■■■■ 4.15
RUSC1-215ENST00000492536 CUL7Q14999 1698 aa40.96■■■■■ 4.15
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