RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491240.5

RBM3-211, Transcript of RNA binding motif protein 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RBM3, Length 951 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM3-211ENST00000491240 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.32■■■□□ 2.12
RBM3-211ENST00000491240 CUL7Q14999 1698 aa28.23■■■□□ 2.11
RBM3-211ENST00000491240 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.19■■■□□ 2.1
RBM3-211ENST00000491240 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa28.18■■■□□ 2.1
RBM3-211ENST00000491240 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.09
RBM3-211ENST00000491240 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP28.05■■■□□ 2.08
RBM3-211ENST00000491240 ADCY10Q96PN6 1610 aa28.02■■■□□ 2.08
RBM3-211ENST00000491240 KIF13AQ9H1H9 1805 aa28.01■■■□□ 2.07
RBM3-211ENST00000491240 FAM69CQ0P6D2 419 aa27.97■■■□□ 2.07
RBM3-211ENST00000491240 PTPRGP23470 1445 aa27.95■■■□□ 2.07
RBM3-211ENST00000491240 IQGAP2Q13576 1575 aa27.94■■■□□ 2.06
RBM3-211ENST00000491240 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa27.91■■■□□ 2.06
RBM3-211ENST00000491240 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa27.91■■■□□ 2.06
RBM3-211ENST00000491240 ABCC10Q5T3U5 1492 aa27.89■■■□□ 2.06
RBM3-211ENST00000491240 TNIKQ9UKE5 1360 aa27.88■■■□□ 2.05
RBM3-211ENST00000491240 MAPKBP1O60336 1514 aa27.88■■■□□ 2.05
RBM3-211ENST00000491240 DIP2BQ9P265 1576 aa27.84■■■□□ 2.05
RBM3-211ENST00000491240 DISP1Q96F81 1524 aa27.82■■■□□ 2.04
RBM3-211ENST00000491240 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
RBM3-211ENST00000491240 TSPOAP1O95153 1857 aa27.75■■■□□ 2.03
RBM3-211ENST00000491240 ABCC2Q92887 1545 aa27.74■■■□□ 2.03
RBM3-211ENST00000491240 UGGT2Q9NYU1 1516 aa27.74■■■□□ 2.03
RBM3-211ENST00000491240 UACAQ9BZF9 1416 aa27.72■■■□□ 2.03
RBM3-211ENST00000491240 KIAA0556O60303 1618 aa27.7■■■□□ 2.02
RBM3-211ENST00000491240 ASXL2Q76L83 1435 aa27.68■■■□□ 2.02
RBM3-211ENST00000491240 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.66■■■□□ 2.02
RBM3-211ENST00000491240 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa27.66■■■□□ 2.02
RBM3-211ENST00000491240 PRXQ9BXM0 1461 aa27.64■■■□□ 2.01
RBM3-211ENST00000491240 PLB1Q6P1J6 1458 aa27.59■■■□□ 2.01
RBM3-211ENST00000491240 KDM6BO15054 1643 aa27.59■■■□□ 2.01
RBM3-211ENST00000491240 KDM5BQ9UGL1 1544 aa27.56■■■□□ 2
RBM3-211ENST00000491240 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP27.55■■■□□ 2
RBM3-211ENST00000491240 P3H3Q8IVL6 736 aa27.53■■■□□ 2
RBM3-211ENST00000491240 GOLGA3Q08378 1498 aa27.52■■■□□ 2
RBM3-211ENST00000491240 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.52■■■□□ 2
RBM3-211ENST00000491240 GLI2P10070 1586 aa27.49■■□□□ 1.99
RBM3-211ENST00000491240 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.49■■□□□ 1.99
RBM3-211ENST00000491240 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
RBM3-211ENST00000491240 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
RBM3-211ENST00000491240 ARID3CA6NKF2 412 aa27.47■■□□□ 1.99
RBM3-211ENST00000491240 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP27.44■■□□□ 1.98
RBM3-211ENST00000491240 ABCA8O94911 1581 aa27.42■■□□□ 1.98
RBM3-211ENST00000491240 KCNH8Q96L42 1107 aa27.41■■□□□ 1.98
RBM3-211ENST00000491240 WDR7Q9Y4E6 1490 aa27.39■■□□□ 1.98
RBM3-211ENST00000491240 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa27.38■■□□□ 1.97
RBM3-211ENST00000491240 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
RBM3-211ENST00000491240 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa27.32■■□□□ 1.96
RBM3-211ENST00000491240 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.31■■□□□ 1.96
RBM3-211ENST00000491240 EEA1Q15075 1411 aa27.3■■□□□ 1.96
RBM3-211ENST00000491240 TEX14Q8IWB6 1497 aa27.29■■□□□ 1.96
RBM3-211ENST00000491240 SAMD9Q5K651 1589 aa27.26■■□□□ 1.95
RBM3-211ENST00000491240 CD109Q6YHK3 1445 aa27.25■■□□□ 1.95
RBM3-211ENST00000491240 ATP10BO94823 1461 aa27.24■■□□□ 1.95
RBM3-211ENST00000491240 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
RBM3-211ENST00000491240 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
RBM3-211ENST00000491240 FHOD3Q2V2M9 1422 aa27.2■■□□□ 1.94
RBM3-211ENST00000491240 CFAP43Q8NDM7 1665 aa27.17■■□□□ 1.94
RBM3-211ENST00000491240 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa27.17■■□□□ 1.94
RBM3-211ENST00000491240 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.16■■□□□ 1.94
RBM3-211ENST00000491240 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa27.15■■□□□ 1.94
RBM3-211ENST00000491240 KIF21BO75037 1637 aa27.12■■□□□ 1.93
RBM3-211ENST00000491240 ADGRL1O94910 1474 aa27.1■■□□□ 1.93
RBM3-211ENST00000491240 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
RBM3-211ENST00000491240 UBTFP17480 764 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
RBM3-211ENST00000491240 ABCA9Q8IUA7 1624 aa27.01■■□□□ 1.91
RBM3-211ENST00000491240 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.98■■□□□ 1.91
RBM3-211ENST00000491240 PLEKHD1A6NEE1 506 aa26.95■■□□□ 1.9
RBM3-211ENST00000491240 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
RBM3-211ENST00000491240 RAPGEF3O95398 923 aa26.94■■□□□ 1.9
RBM3-211ENST00000491240 ARAP3Q8WWN8 1544 aa26.92■■□□□ 1.9
RBM3-211ENST00000491240 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
RBM3-211ENST00000491240 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.86■■□□□ 1.89
RBM3-211ENST00000491240 NEO1Q92859 1461 aa26.84■■□□□ 1.89
RBM3-211ENST00000491240 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.84■■□□□ 1.89
RBM3-211ENST00000491240 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP26.81■■□□□ 1.88
RBM3-211ENST00000491240 TTC37Q6PGP7 1564 aa26.8■■□□□ 1.88
RBM3-211ENST00000491240 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa26.77■■□□□ 1.88
RBM3-211ENST00000491240 FMN1Q68DA7 1419 aa26.77■■□□□ 1.88
RBM3-211ENST00000491240 FANCAO15360 1455 aa26.75■■□□□ 1.87
RBM3-211ENST00000491240 AKNAQ7Z591 1439 aa26.75■■□□□ 1.87
RBM3-211ENST00000491240 HECW1Q76N89 1606 aa26.74■■□□□ 1.87
RBM3-211ENST00000491240 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
RBM3-211ENST00000491240 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
RBM3-211ENST00000491240 HECW2Q9P2P5 1572 aa26.69■■□□□ 1.86
RBM3-211ENST00000491240 RICTORQ6R327 1708 aa26.65■■□□□ 1.86
RBM3-211ENST00000491240 CFAP74Q9C0B2 1584 aa26.65■■□□□ 1.86
RBM3-211ENST00000491240 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
RBM3-211ENST00000491240 KIF14Q15058 1648 aa26.63■■□□□ 1.85
RBM3-211ENST00000491240 PLCH2O75038 1416 aa26.63■■□□□ 1.85
RBM3-211ENST00000491240 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.62■■□□□ 1.85
RBM3-211ENST00000491240 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa26.6■■□□□ 1.85
RBM3-211ENST00000491240 SCAPERQ9BY12 1400 aa26.6■■□□□ 1.85
RBM3-211ENST00000491240 ADAMTSL3P82987 1691 aa26.6■■□□□ 1.85
RBM3-211ENST00000491240 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
RBM3-211ENST00000491240 YEATS2Q9ULM3 1422 aa26.58■■□□□ 1.85
RBM3-211ENST00000491240 PTPRMP28827 1452 aa26.57■■□□□ 1.84
RBM3-211ENST00000491240 BCORL1Q5H9F3 1711 aa26.57■■□□□ 1.84
RBM3-211ENST00000491240 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
RBM3-211ENST00000491240 MYO5CQ9NQX4 1742 aa26.56■■□□□ 1.84
RBM3-211ENST00000491240 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms