RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491236.1

RBM3-210, Transcript of RNA binding motif protein 3, humanhuman

TSL 2

Gene RBM3, Length 729 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM3-210ENST00000491236 SHROOM2Q13796 1616 aa32.02■■■□□ 2.72
RBM3-210ENST00000491236 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa31.96■■■□□ 2.71
RBM3-210ENST00000491236 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP31.92■■■□□ 2.7
RBM3-210ENST00000491236 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa31.9■■■□□ 2.7
RBM3-210ENST00000491236 CUL7Q14999 1698 aa31.9■■■□□ 2.7
RBM3-210ENST00000491236 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP31.8■■■□□ 2.68
RBM3-210ENST00000491236 PTPRGP23470 1445 aa31.73■■■□□ 2.67
RBM3-210ENST00000491236 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa31.73■■■□□ 2.67
RBM3-210ENST00000491236 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa31.69■■■□□ 2.66
RBM3-210ENST00000491236 FAM69CQ0P6D2 419 aa31.68■■■□□ 2.66
RBM3-210ENST00000491236 TNIKQ9UKE5 1360 aa31.65■■■□□ 2.66
RBM3-210ENST00000491236 IQGAP2Q13576 1575 aa31.58■■■□□ 2.65
RBM3-210ENST00000491236 ABCC10Q5T3U5 1492 aa31.52■■■□□ 2.64
RBM3-210ENST00000491236 ADCY10Q96PN6 1610 aa31.52■■■□□ 2.64
RBM3-210ENST00000491236 MAPKBP1O60336 1514 aa31.5■■■□□ 2.63
RBM3-210ENST00000491236 DISP1Q96F81 1524 aa31.44■■■□□ 2.62
RBM3-210ENST00000491236 UACAQ9BZF9 1416 aa31.43■■■□□ 2.62
RBM3-210ENST00000491236 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP31.42■■■□□ 2.62
RBM3-210ENST00000491236 UGGT2Q9NYU1 1516 aa31.41■■■□□ 2.62
RBM3-210ENST00000491236 ABCC2Q92887 1545 aa31.39■■■□□ 2.62
RBM3-210ENST00000491236 CSRNP3Q8WYN3 585 aa31.39■■■□□ 2.62
RBM3-210ENST00000491236 PRXQ9BXM0 1461 aa31.38■■■□□ 2.61
RBM3-210ENST00000491236 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa31.35■■■□□ 2.61
RBM3-210ENST00000491236 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP31.33■■■□□ 2.61
RBM3-210ENST00000491236 DIP2BQ9P265 1576 aa31.32■■■□□ 2.6
RBM3-210ENST00000491236 KIF13AQ9H1H9 1805 aa31.31■■■□□ 2.6
RBM3-210ENST00000491236 ASXL2Q76L83 1435 aa31.31■■■□□ 2.6
RBM3-210ENST00000491236 PLB1Q6P1J6 1458 aa31.3■■■□□ 2.6
RBM3-210ENST00000491236 GOLGA3Q08378 1498 aa31.29■■■□□ 2.6
RBM3-210ENST00000491236 KIAA0556O60303 1618 aa31.27■■■□□ 2.6
RBM3-210ENST00000491236 P3H3Q8IVL6 736 aa31.2■■■□□ 2.59
RBM3-210ENST00000491236 KDM5BQ9UGL1 1544 aa31.19■■■□□ 2.58
RBM3-210ENST00000491236 EEA1Q15075 1411 aa31.18■■■□□ 2.58
RBM3-210ENST00000491236 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa31.11■■■□□ 2.57
RBM3-210ENST00000491236 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP31.1■■■□□ 2.57
RBM3-210ENST00000491236 KCNH8Q96L42 1107 aa31.08■■■□□ 2.57
RBM3-210ENST00000491236 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP31.08■■■□□ 2.57
RBM3-210ENST00000491236 GLI2P10070 1586 aa31.06■■■□□ 2.56
RBM3-210ENST00000491236 ARID3CA6NKF2 412 aa31.04■■■□□ 2.56
RBM3-210ENST00000491236 KDM6BO15054 1643 aa31.04■■■□□ 2.56
RBM3-210ENST00000491236 TSPOAP1O95153 1857 aa31.01■■■□□ 2.55
RBM3-210ENST00000491236 WDR7Q9Y4E6 1490 aa31.01■■■□□ 2.55
RBM3-210ENST00000491236 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP31■■■□□ 2.55
RBM3-210ENST00000491236 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.99■■■□□ 2.55
RBM3-210ENST00000491236 ABCA8O94911 1581 aa30.97■■■□□ 2.55
RBM3-210ENST00000491236 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP30.94■■■□□ 2.54
RBM3-210ENST00000491236 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP30.94■■■□□ 2.54
RBM3-210ENST00000491236 TEX14Q8IWB6 1497 aa30.93■■■□□ 2.54
RBM3-210ENST00000491236 EHMT2Q96KQ7 1210 aa30.91■■■□□ 2.54
RBM3-210ENST00000491236 CD109Q6YHK3 1445 aa30.89■■■□□ 2.53
RBM3-210ENST00000491236 UBTFP17480 764 aaKnown RBP30.88■■■□□ 2.53
RBM3-210ENST00000491236 ATP10BO94823 1461 aa30.84■■■□□ 2.53
RBM3-210ENST00000491236 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa30.81■■■□□ 2.52
RBM3-210ENST00000491236 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa30.8■■■□□ 2.52
RBM3-210ENST00000491236 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP30.8■■■□□ 2.52
RBM3-210ENST00000491236 FHOD3Q2V2M9 1422 aa30.8■■■□□ 2.52
RBM3-210ENST00000491236 SAMD9Q5K651 1589 aa30.79■■■□□ 2.52
RBM3-210ENST00000491236 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP30.78■■■□□ 2.52
RBM3-210ENST00000491236 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa30.74■■■□□ 2.51
RBM3-210ENST00000491236 KIF21BO75037 1637 aa30.73■■■□□ 2.51
RBM3-210ENST00000491236 PLEKHD1A6NEE1 506 aa30.71■■■□□ 2.51
RBM3-210ENST00000491236 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa30.67■■■□□ 2.5
RBM3-210ENST00000491236 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP30.65■■■□□ 2.5
RBM3-210ENST00000491236 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP30.64■■■□□ 2.5
RBM3-210ENST00000491236 EFCAB5A4FU69 1503 aa30.63■■■□□ 2.49
RBM3-210ENST00000491236 CFAP43Q8NDM7 1665 aa30.62■■■□□ 2.49
RBM3-210ENST00000491236 PHLDB1Q86UU1 1377 aa30.58■■■□□ 2.49
RBM3-210ENST00000491236 ADGRL1O94910 1474 aa30.52■■■□□ 2.48
RBM3-210ENST00000491236 FMN1Q68DA7 1419 aa30.49■■■□□ 2.47
RBM3-210ENST00000491236 RAPGEF3O95398 923 aa30.49■■■□□ 2.47
RBM3-210ENST00000491236 ARAP3Q8WWN8 1544 aa30.48■■■□□ 2.47
RBM3-210ENST00000491236 ABCA9Q8IUA7 1624 aa30.47■■■□□ 2.47
RBM3-210ENST00000491236 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP30.46■■■□□ 2.47
RBM3-210ENST00000491236 NEO1Q92859 1461 aa30.44■■■□□ 2.46
RBM3-210ENST00000491236 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa30.44■■■□□ 2.46
RBM3-210ENST00000491236 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP30.36■■■□□ 2.45
RBM3-210ENST00000491236 AKNAQ7Z591 1439 aa30.32■■■□□ 2.44
RBM3-210ENST00000491236 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP30.3■■■□□ 2.44
RBM3-210ENST00000491236 FANCAO15360 1455 aa30.3■■■□□ 2.44
RBM3-210ENST00000491236 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP30.29■■■□□ 2.44
RBM3-210ENST00000491236 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP30.29■■■□□ 2.44
RBM3-210ENST00000491236 HECW1Q76N89 1606 aa30.26■■■□□ 2.44
RBM3-210ENST00000491236 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa30.24■■■□□ 2.43
RBM3-210ENST00000491236 PLCH2O75038 1416 aa30.22■■■□□ 2.43
RBM3-210ENST00000491236 CLIP1P30622 1438 aa30.2■■■□□ 2.42
RBM3-210ENST00000491236 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP30.18■■■□□ 2.42
RBM3-210ENST00000491236 TTC37Q6PGP7 1564 aa30.18■■■□□ 2.42
RBM3-210ENST00000491236 SCAPERQ9BY12 1400 aa30.16■■■□□ 2.42
RBM3-210ENST00000491236 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa30.14■■■□□ 2.42
RBM3-210ENST00000491236 CFAP74Q9C0B2 1584 aa30.12■■■□□ 2.41
RBM3-210ENST00000491236 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa30.09■■■□□ 2.41
RBM3-210ENST00000491236 MYT1LQ9UL68 1186 aa30.07■■■□□ 2.4
RBM3-210ENST00000491236 CCDC18Q5T9S5 1454 aa30.06■■■□□ 2.4
RBM3-210ENST00000491236 KIF14Q15058 1648 aa30.04■■■□□ 2.4
RBM3-210ENST00000491236 MAGI2Q86UL8 1455 aa30.03■■■□□ 2.4
RBM3-210ENST00000491236 POGZQ7Z3K3 1410 aa30.03■■■□□ 2.4
RBM3-210ENST00000491236 YEATS2Q9ULM3 1422 aa30.01■■■□□ 2.39
RBM3-210ENST00000491236 ARHGAP5Q13017 1502 aa30.01■■■□□ 2.39
RBM3-210ENST00000491236 MLECQ14165 292 aa30■■■□□ 2.39
RBM3-210ENST00000491236 AFAP1Q8N556 730 aa30■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 92.3 ms