RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490386.1

CLEC3B-203, Transcript of C-type lectin domain family 3 member B, humanhuman

TSL 3

Gene CLEC3B, Length 708 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC3B-203ENST00000490386 CUL7Q14999 1698 aa49.78■■■■■ 5.56
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CLEC3B-203ENST00000490386 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa49.7■■■■■ 5.55
CLEC3B-203ENST00000490386 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP49.38■■■■■ 5.5
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CLEC3B-203ENST00000490386 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa49.26■■■■■ 5.48
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CLEC3B-203ENST00000490386 KDM6BO15054 1643 aa48.22■■■■■ 5.31
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CLEC3B-203ENST00000490386 TEX14Q8IWB6 1497 aa48.05■■■■■ 5.28
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CLEC3B-203ENST00000490386 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP47.81■■■■■ 5.24
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CLEC3B-203ENST00000490386 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa47.68■■■■■ 5.22
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CLEC3B-203ENST00000490386 EHMT2Q96KQ7 1210 aa47.63■■■■■ 5.22
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CLEC3B-203ENST00000490386 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa47.36■■■■■ 5.17
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CLEC3B-203ENST00000490386 ADGRL1O94910 1474 aa47.32■■■■■ 5.17
CLEC3B-203ENST00000490386 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP47.29■■■■■ 5.16
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CLEC3B-203ENST00000490386 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP47.17■■■■■ 5.14
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CLEC3B-203ENST00000490386 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP47.14■■■■■ 5.14
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CLEC3B-203ENST00000490386 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP47.02■■■■■ 5.12
CLEC3B-203ENST00000490386 PLCH2O75038 1416 aa46.98■■■■■ 5.11
CLEC3B-203ENST00000490386 CFAP74Q9C0B2 1584 aa46.98■■■■■ 5.11
CLEC3B-203ENST00000490386 TTC37Q6PGP7 1564 aa46.97■■■■■ 5.11
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CLEC3B-203ENST00000490386 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa46.91■■■■■ 5.1
CLEC3B-203ENST00000490386 CLIP1P30622 1438 aa46.89■■■■■ 5.1
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CLEC3B-203ENST00000490386 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa46.88■■■■■ 5.1
CLEC3B-203ENST00000490386 CCDC18Q5T9S5 1454 aa46.81■■■■■ 5.08
CLEC3B-203ENST00000490386 SCAPERQ9BY12 1400 aa46.78■■■■■ 5.08
CLEC3B-203ENST00000490386 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP46.78■■■■■ 5.08
CLEC3B-203ENST00000490386 KIF14Q15058 1648 aa46.76■■■■■ 5.08
CLEC3B-203ENST00000490386 RICTORQ6R327 1708 aa46.75■■■■■ 5.07
CLEC3B-203ENST00000490386 MAGI2Q86UL8 1455 aa46.73■■■■■ 5.07
CLEC3B-203ENST00000490386 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP46.7■■■■■ 5.07
CLEC3B-203ENST00000490386 FYCO1Q9BQS8 1478 aa46.7■■■■■ 5.07
CLEC3B-203ENST00000490386 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa46.69■■■■■ 5.06
CLEC3B-203ENST00000490386 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa46.67■■■■■ 5.06
CLEC3B-203ENST00000490386 MYO5CQ9NQX4 1742 aa46.66■■■■■ 5.06
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