RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490240.5

MDK-210, Transcript of midkine, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene MDK, Length 603 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Exosome, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDK-210ENST00000490240 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.06■■■□□ 2.88
MDK-210ENST00000490240 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP32.98■■■□□ 2.87
MDK-210ENST00000490240 ABCC10Q5T3U5 1492 aa32.98■■■□□ 2.87
MDK-210ENST00000490240 FAM69CQ0P6D2 419 aa32.96■■■□□ 2.87
MDK-210ENST00000490240 MAPKBP1O60336 1514 aa32.96■■■□□ 2.87
MDK-210ENST00000490240 ADCY10Q96PN6 1610 aa32.89■■■□□ 2.86
MDK-210ENST00000490240 DIP2BQ9P265 1576 aa32.87■■■□□ 2.85
MDK-210ENST00000490240 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa32.85■■■□□ 2.85
MDK-210ENST00000490240 IGF1RP08069 1367 aa32.78■■■□□ 2.84
MDK-210ENST00000490240 CUL7Q14999 1698 aa32.78■■■□□ 2.84
MDK-210ENST00000490240 KIF27Q86VH2 1401 aa32.77■■■□□ 2.84
MDK-210ENST00000490240 KDM6BO15054 1643 aa32.72■■■□□ 2.83
MDK-210ENST00000490240 TSPOAP1O95153 1857 aa32.65■■■□□ 2.82
MDK-210ENST00000490240 PTPRGP23470 1445 aa32.63■■■□□ 2.81
MDK-210ENST00000490240 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa32.57■■■□□ 2.8
MDK-210ENST00000490240 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa32.56■■■□□ 2.8
MDK-210ENST00000490240 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa32.56■■■□□ 2.8
MDK-210ENST00000490240 TNIKQ9UKE5 1360 aa32.54■■■□□ 2.8
MDK-210ENST00000490240 ABCC2Q92887 1545 aa32.53■■■□□ 2.8
MDK-210ENST00000490240 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP32.52■■■□□ 2.8
MDK-210ENST00000490240 IQGAP2Q13576 1575 aa32.47■■■□□ 2.79
MDK-210ENST00000490240 PLB1Q6P1J6 1458 aa32.47■■■□□ 2.79
MDK-210ENST00000490240 ASXL2Q76L83 1435 aa32.46■■■□□ 2.79
MDK-210ENST00000490240 GLI2P10070 1586 aa32.43■■■□□ 2.78
MDK-210ENST00000490240 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa32.42■■■□□ 2.78
MDK-210ENST00000490240 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP32.38■■■□□ 2.77
MDK-210ENST00000490240 UACAQ9BZF9 1416 aa32.37■■■□□ 2.77
MDK-210ENST00000490240 DISP1Q96F81 1524 aa32.34■■■□□ 2.77
MDK-210ENST00000490240 KDM5BQ9UGL1 1544 aa32.27■■■□□ 2.76
MDK-210ENST00000490240 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP32.26■■■□□ 2.75
MDK-210ENST00000490240 UGGT2Q9NYU1 1516 aa32.25■■■□□ 2.75
MDK-210ENST00000490240 ADGRL1O94910 1474 aa32.23■■■□□ 2.75
MDK-210ENST00000490240 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa32.23■■■□□ 2.75
MDK-210ENST00000490240 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa32.22■■■□□ 2.75
MDK-210ENST00000490240 TEX14Q8IWB6 1497 aa32.2■■■□□ 2.75
MDK-210ENST00000490240 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP32.19■■■□□ 2.74
MDK-210ENST00000490240 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP32.19■■■□□ 2.74
MDK-210ENST00000490240 KIAA0556O60303 1618 aa32.18■■■□□ 2.74
MDK-210ENST00000490240 WDR7Q9Y4E6 1490 aa32.08■■■□□ 2.73
MDK-210ENST00000490240 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP32.04■■■□□ 2.72
MDK-210ENST00000490240 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa31.98■■■□□ 2.71
MDK-210ENST00000490240 GOLGA3Q08378 1498 aa31.97■■■□□ 2.71
MDK-210ENST00000490240 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa31.93■■■□□ 2.7
MDK-210ENST00000490240 CFAP43Q8NDM7 1665 aa31.92■■■□□ 2.7
MDK-210ENST00000490240 CD109Q6YHK3 1445 aa31.92■■■□□ 2.7
MDK-210ENST00000490240 HECW2Q9P2P5 1572 aa31.92■■■□□ 2.7
MDK-210ENST00000490240 ABCA8O94911 1581 aa31.91■■■□□ 2.7
MDK-210ENST00000490240 KCNH8Q96L42 1107 aa31.86■■■□□ 2.69
MDK-210ENST00000490240 PRXQ9BXM0 1461 aa31.77■■■□□ 2.68
MDK-210ENST00000490240 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP31.71■■■□□ 2.67
MDK-210ENST00000490240 KIF21BO75037 1637 aa31.7■■■□□ 2.66
MDK-210ENST00000490240 ARAP3Q8WWN8 1544 aa31.7■■■□□ 2.66
MDK-210ENST00000490240 ATP10BO94823 1461 aa31.63■■■□□ 2.65
MDK-210ENST00000490240 ARID3CA6NKF2 412 aa31.62■■■□□ 2.65
MDK-210ENST00000490240 PHLDB1Q86UU1 1377 aa31.6■■■□□ 2.65
MDK-210ENST00000490240 ABCA9Q8IUA7 1624 aa31.59■■■□□ 2.65
MDK-210ENST00000490240 P3H3Q8IVL6 736 aa31.58■■■□□ 2.65
MDK-210ENST00000490240 SAMD9Q5K651 1589 aa31.51■■■□□ 2.63
MDK-210ENST00000490240 NEO1Q92859 1461 aa31.49■■■□□ 2.63
MDK-210ENST00000490240 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa31.48■■■□□ 2.63
MDK-210ENST00000490240 ADAMTSL3P82987 1691 aa31.48■■■□□ 2.63
MDK-210ENST00000490240 PTPRMP28827 1452 aa31.46■■■□□ 2.63
MDK-210ENST00000490240 RAPGEF3O95398 923 aa31.46■■■□□ 2.63
MDK-210ENST00000490240 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP31.41■■■□□ 2.62
MDK-210ENST00000490240 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP31.41■■■□□ 2.62
MDK-210ENST00000490240 CSRNP3Q8WYN3 585 aa31.4■■■□□ 2.62
MDK-210ENST00000490240 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa31.38■■■□□ 2.61
MDK-210ENST00000490240 BCORL1Q5H9F3 1711 aa31.36■■■□□ 2.61
MDK-210ENST00000490240 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP31.36■■■□□ 2.61
MDK-210ENST00000490240 FBXO41Q8TF61 875 aa31.36■■■□□ 2.61
MDK-210ENST00000490240 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP31.34■■■□□ 2.61
MDK-210ENST00000490240 MADDQ8WXG6 1647 aa31.31■■■□□ 2.6
MDK-210ENST00000490240 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa31.28■■■□□ 2.6
MDK-210ENST00000490240 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP31.27■■■□□ 2.6
MDK-210ENST00000490240 FHOD3Q2V2M9 1422 aa31.26■■■□□ 2.6
MDK-210ENST00000490240 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP31.26■■■□□ 2.59
MDK-210ENST00000490240 PLEKHD1A6NEE1 506 aa31.25■■■□□ 2.59
MDK-210ENST00000490240 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP31.23■■■□□ 2.59
MDK-210ENST00000490240 RICTORQ6R327 1708 aa31.22■■■□□ 2.59
MDK-210ENST00000490240 EEA1Q15075 1411 aa31.22■■■□□ 2.59
MDK-210ENST00000490240 AKNAQ7Z591 1439 aa31.22■■■□□ 2.59
MDK-210ENST00000490240 CFAP74Q9C0B2 1584 aa31.22■■■□□ 2.59
MDK-210ENST00000490240 LMTK3Q96Q04 1460 aa31.21■■■□□ 2.59
MDK-210ENST00000490240 FANCAO15360 1455 aa31.2■■■□□ 2.58
MDK-210ENST00000490240 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP31.18■■■□□ 2.58
MDK-210ENST00000490240 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP31.16■■■□□ 2.582e-9■□□□□ 11
MDK-210ENST00000490240 POGZQ7Z3K3 1410 aa31.13■■■□□ 2.57
MDK-210ENST00000490240 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa31.13■■■□□ 2.57
MDK-210ENST00000490240 EFCAB5A4FU69 1503 aa31.12■■■□□ 2.57
MDK-210ENST00000490240 TTC37Q6PGP7 1564 aa31.12■■■□□ 2.57
MDK-210ENST00000490240 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa31.09■■■□□ 2.57
MDK-210ENST00000490240 MAGI2Q86UL8 1455 aa31.07■■■□□ 2.56
MDK-210ENST00000490240 YEATS2Q9ULM3 1422 aa31.05■■■□□ 2.56
MDK-210ENST00000490240 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa31.01■■■□□ 2.56
MDK-210ENST00000490240 HSPA2P54652 639 aa31.01■■■□□ 2.55
MDK-210ENST00000490240 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP31■■■□□ 2.55
MDK-210ENST00000490240 PLPPR3Q6T4P5 718 aa31■■■□□ 2.55
MDK-210ENST00000490240 HECW1Q76N89 1606 aa30.99■■■□□ 2.55
MDK-210ENST00000490240 PLCH2O75038 1416 aa30.97■■■□□ 2.55
MDK-210ENST00000490240 SCAPERQ9BY12 1400 aa30.97■■■□□ 2.55
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