RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488684.5

POLR2F-211, Transcript of RNA polymerase II subunit F, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene POLR2F, Length 564 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2F-211ENST00000488684 KIF27Q86VH2 1401 aa39.18■■■■□ 3.86
POLR2F-211ENST00000488684 CUL7Q14999 1698 aa39.05■■■■□ 3.84
POLR2F-211ENST00000488684 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa39.03■■■■□ 3.84
POLR2F-211ENST00000488684 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.94■■■■□ 3.82
POLR2F-211ENST00000488684 KIF13AQ9H1H9 1805 aa38.86■■■■□ 3.81
POLR2F-211ENST00000488684 ADCY10Q96PN6 1610 aa38.81■■■■□ 3.8
POLR2F-211ENST00000488684 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP38.8■■■■□ 3.8
POLR2F-211ENST00000488684 MAPKBP1O60336 1514 aa38.72■■■■□ 3.79
POLR2F-211ENST00000488684 ABCC10Q5T3U5 1492 aa38.72■■■■□ 3.79
POLR2F-211ENST00000488684 FAM69CQ0P6D2 419 aa38.71■■■■□ 3.79
POLR2F-211ENST00000488684 PTPRGP23470 1445 aa38.67■■■■□ 3.78
POLR2F-211ENST00000488684 IQGAP2Q13576 1575 aa38.63■■■■□ 3.77
POLR2F-211ENST00000488684 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP38.63■■■■□ 3.77
POLR2F-211ENST00000488684 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa38.61■■■■□ 3.77
POLR2F-211ENST00000488684 DIP2BQ9P265 1576 aa38.6■■■■□ 3.77
POLR2F-211ENST00000488684 TNIKQ9UKE5 1360 aa38.59■■■■□ 3.77
POLR2F-211ENST00000488684 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa38.56■■■■□ 3.76
POLR2F-211ENST00000488684 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP38.55■■■■□ 3.76
POLR2F-211ENST00000488684 DISP1Q96F81 1524 aa38.5■■■■□ 3.75
POLR2F-211ENST00000488684 ABCC2Q92887 1545 aa38.44■■■■□ 3.74
POLR2F-211ENST00000488684 UGGT2Q9NYU1 1516 aa38.42■■■■□ 3.74
POLR2F-211ENST00000488684 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa38.38■■■■□ 3.73
POLR2F-211ENST00000488684 UACAQ9BZF9 1416 aa38.37■■■■□ 3.73
POLR2F-211ENST00000488684 TSPOAP1O95153 1857 aa38.35■■■■□ 3.73
POLR2F-211ENST00000488684 ASXL2Q76L83 1435 aa38.32■■■■□ 3.73
POLR2F-211ENST00000488684 KIAA0556O60303 1618 aa38.29■■■■□ 3.72
POLR2F-211ENST00000488684 PLB1Q6P1J6 1458 aa38.27■■■■□ 3.72
POLR2F-211ENST00000488684 KDM6BO15054 1643 aa38.23■■■■□ 3.71
POLR2F-211ENST00000488684 KDM5BQ9UGL1 1544 aa38.22■■■■□ 3.71
POLR2F-211ENST00000488684 PRXQ9BXM0 1461 aa38.22■■■■□ 3.71
POLR2F-211ENST00000488684 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa38.21■■■■□ 3.71
POLR2F-211ENST00000488684 GLI2P10070 1586 aa38.19■■■■□ 3.7
POLR2F-211ENST00000488684 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP38.12■■■■□ 3.69
POLR2F-211ENST00000488684 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP38.11■■■■□ 3.69
POLR2F-211ENST00000488684 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP38.08■■■■□ 3.69
POLR2F-211ENST00000488684 GOLGA3Q08378 1498 aa38.07■■■■□ 3.68
POLR2F-211ENST00000488684 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa37.98■■■■□ 3.67
POLR2F-211ENST00000488684 ABCA8O94911 1581 aa37.97■■■■□ 3.67
POLR2F-211ENST00000488684 CSRNP3Q8WYN3 585 aa37.95■■■■□ 3.67
POLR2F-211ENST00000488684 WDR7Q9Y4E6 1490 aa37.93■■■■□ 3.66
POLR2F-211ENST00000488684 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa37.93■■■■□ 3.66
POLR2F-211ENST00000488684 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP37.9■■■■□ 3.66
POLR2F-211ENST00000488684 P3H3Q8IVL6 736 aa37.85■■■■□ 3.65
POLR2F-211ENST00000488684 TEX14Q8IWB6 1497 aa37.83■■■■□ 3.65
POLR2F-211ENST00000488684 KCNH8Q96L42 1107 aa37.8■■■■□ 3.64
POLR2F-211ENST00000488684 CD109Q6YHK3 1445 aa37.71■■■■□ 3.63
POLR2F-211ENST00000488684 ARID3CA6NKF2 412 aa37.71■■■■□ 3.63
POLR2F-211ENST00000488684 EEA1Q15075 1411 aa37.7■■■■□ 3.63
POLR2F-211ENST00000488684 SAMD9Q5K651 1589 aa37.7■■■■□ 3.63
POLR2F-211ENST00000488684 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP37.69■■■■□ 3.62
POLR2F-211ENST00000488684 ATP10BO94823 1461 aa37.69■■■■□ 3.62
POLR2F-211ENST00000488684 CFAP43Q8NDM7 1665 aa37.68■■■■□ 3.62
POLR2F-211ENST00000488684 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa37.67■■■■□ 3.62
POLR2F-211ENST00000488684 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP37.57■■■■□ 3.6
POLR2F-211ENST00000488684 ADGRL1O94910 1474 aa37.57■■■■□ 3.6
POLR2F-211ENST00000488684 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa37.54■■■■□ 3.6
POLR2F-211ENST00000488684 FHOD3Q2V2M9 1422 aa37.48■■■■□ 3.59
POLR2F-211ENST00000488684 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP37.45■■■■□ 3.59
POLR2F-211ENST00000488684 KIF21BO75037 1637 aa37.43■■■■□ 3.58
POLR2F-211ENST00000488684 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP37.43■■■■□ 3.58
POLR2F-211ENST00000488684 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP37.43■■■■□ 3.58
POLR2F-211ENST00000488684 ABCA9Q8IUA7 1624 aa37.43■■■■□ 3.58
POLR2F-211ENST00000488684 ARAP3Q8WWN8 1544 aa37.39■■■■□ 3.58
POLR2F-211ENST00000488684 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.33■■■■□ 3.57
POLR2F-211ENST00000488684 EFCAB5A4FU69 1503 aa37.3■■■■□ 3.56
POLR2F-211ENST00000488684 PHLDB1Q86UU1 1377 aa37.29■■■■□ 3.56
POLR2F-211ENST00000488684 EHMT2Q96KQ7 1210 aa37.27■■■■□ 3.56
POLR2F-211ENST00000488684 PLEKHD1A6NEE1 506 aa37.24■■■■□ 3.55
POLR2F-211ENST00000488684 NEO1Q92859 1461 aa37.22■■■■□ 3.55
POLR2F-211ENST00000488684 RAPGEF3O95398 923 aa37.22■■■■□ 3.55
POLR2F-211ENST00000488684 UBTFP17480 764 aaKnown RBP37.2■■■■□ 3.55
POLR2F-211ENST00000488684 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP37.09■■■■□ 3.532e-10■■■■■ 58.5
POLR2F-211ENST00000488684 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa37.08■■■■□ 3.53
POLR2F-211ENST00000488684 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP37.08■■■■□ 3.53
POLR2F-211ENST00000488684 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa37.05■■■■□ 3.52
POLR2F-211ENST00000488684 HECW2Q9P2P5 1572 aa37.04■■■■□ 3.52
POLR2F-211ENST00000488684 TTC37Q6PGP7 1564 aa37.02■■■■□ 3.52
POLR2F-211ENST00000488684 AKNAQ7Z591 1439 aa37.02■■■■□ 3.52
POLR2F-211ENST00000488684 FANCAO15360 1455 aa37■■■■□ 3.51
POLR2F-211ENST00000488684 FMN1Q68DA7 1419 aa36.99■■■■□ 3.51
POLR2F-211ENST00000488684 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP36.98■■■■□ 3.51
POLR2F-211ENST00000488684 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP36.97■■■■□ 3.51
POLR2F-211ENST00000488684 RICTORQ6R327 1708 aa36.93■■■■□ 3.5
POLR2F-211ENST00000488684 ADAMTSL3P82987 1691 aa36.93■■■■□ 3.5
POLR2F-211ENST00000488684 CFAP74Q9C0B2 1584 aa36.91■■■■□ 3.5
POLR2F-211ENST00000488684 HECW1Q76N89 1606 aa36.91■■■■□ 3.5
POLR2F-211ENST00000488684 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP36.86■■■■□ 3.49
POLR2F-211ENST00000488684 PLCH2O75038 1416 aa36.86■■■■□ 3.49
POLR2F-211ENST00000488684 PTPRMP28827 1452 aa36.84■■■■□ 3.49
POLR2F-211ENST00000488684 BCORL1Q5H9F3 1711 aa36.84■■■■□ 3.49
POLR2F-211ENST00000488684 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa36.84■■■■□ 3.49
POLR2F-211ENST00000488684 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP36.81■■■■□ 3.48
POLR2F-211ENST00000488684 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa36.79■■■■□ 3.48
POLR2F-211ENST00000488684 SCAPERQ9BY12 1400 aa36.76■■■■□ 3.48
POLR2F-211ENST00000488684 MADDQ8WXG6 1647 aa36.76■■■■□ 3.48
POLR2F-211ENST00000488684 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa36.76■■■■□ 3.47
POLR2F-211ENST00000488684 YEATS2Q9ULM3 1422 aa36.76■■■■□ 3.47
POLR2F-211ENST00000488684 KIF14Q15058 1648 aa36.75■■■■□ 3.47
POLR2F-211ENST00000488684 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP36.73■■■■□ 3.47
POLR2F-211ENST00000488684 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa36.72■■■■□ 3.47
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