RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa19.48■□□□□ 0.71
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NISCH-212ENST00000488380 P3H3Q8IVL6 736 aa19.47■□□□□ 0.71
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NISCH-212ENST00000488380 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa19.33■□□□□ 0.68
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NISCH-212ENST00000488380 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa19.28■□□□□ 0.68
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NISCH-212ENST00000488380 PDS5BQ9NTI5 1447 aa19.07■□□□□ 0.64
NISCH-212ENST00000488380 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa19.06■□□□□ 0.64
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NISCH-212ENST00000488380 FMN1Q68DA7 1419 aa19.05■□□□□ 0.64
NISCH-212ENST00000488380 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP19.03■□□□□ 0.64
NISCH-212ENST00000488380 TRIM52Q96A61 297 aa19.03■□□□□ 0.64
NISCH-212ENST00000488380 SAMD9Q5K651 1589 aa19.02■□□□□ 0.64
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NISCH-212ENST00000488380 CHIC2Q9UKJ5 165 aa18.84■□□□□ 0.61
NISCH-212ENST00000488380 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa18.83■□□□□ 0.6
NISCH-212ENST00000488380 NAIPQ13075 1403 aa18.83■□□□□ 0.6
NISCH-212ENST00000488380 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP18.83■□□□□ 0.6
NISCH-212ENST00000488380 ADAMTS12P58397 1594 aa18.82■□□□□ 0.6
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NISCH-212ENST00000488380 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP18.82■□□□□ 0.6
NISCH-212ENST00000488380 UGGT2Q9NYU1 1516 aa18.82■□□□□ 0.6
NISCH-212ENST00000488380 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa18.81■□□□□ 0.6
NISCH-212ENST00000488380 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP18.81■□□□□ 0.6
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NISCH-212ENST00000488380 ARHGEF11O15085 1522 aa18.78■□□□□ 0.6
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NISCH-212ENST00000488380 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa18.76■□□□□ 0.59
NISCH-212ENST00000488380 HECW1Q76N89 1606 aa18.75■□□□□ 0.59
NISCH-212ENST00000488380 FANCIQ9NVI1 1328 aa18.75■□□□□ 0.59
NISCH-212ENST00000488380 KDM6BO15054 1643 aa18.73■□□□□ 0.59
NISCH-212ENST00000488380 DEKP35659 375 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
NISCH-212ENST00000488380 WDR62O43379 1518 aa18.71■□□□□ 0.59
NISCH-212ENST00000488380 CCER2I3L3R5 266 aa18.69■□□□□ 0.58
NISCH-212ENST00000488380 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP18.69■□□□□ 0.58
NISCH-212ENST00000488380 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP18.68■□□□□ 0.58
NISCH-212ENST00000488380 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
NISCH-212ENST00000488380 KDM5BQ9UGL1 1544 aa18.66■□□□□ 0.58
NISCH-212ENST00000488380 IFT140Q96RY7 1462 aa18.66■□□□□ 0.58
NISCH-212ENST00000488380 FOXD1Q16676 465 aa18.66■□□□□ 0.58
NISCH-212ENST00000488380 DISP1Q96F81 1524 aa18.65■□□□□ 0.58
NISCH-212ENST00000488380 NBR1Q14596 966 aa18.65■□□□□ 0.58
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