RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488279.6

PTPN4-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 4, humanhuman

TSL 5

Gene PTPN4, Length 662 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN4-211ENST00000488279 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.99■■■■□ 3.83
PTPN4-211ENST00000488279 CUL7Q14999 1698 aa38.97■■■■□ 3.83
PTPN4-211ENST00000488279 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.95■■■■□ 3.83
PTPN4-211ENST00000488279 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa38.94■■■■□ 3.82
PTPN4-211ENST00000488279 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP38.74■■■■□ 3.79
PTPN4-211ENST00000488279 PTPRGP23470 1445 aa38.58■■■■□ 3.77
PTPN4-211ENST00000488279 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa38.58■■■■□ 3.77
PTPN4-211ENST00000488279 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa38.58■■■■□ 3.77
PTPN4-211ENST00000488279 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP38.54■■■■□ 3.76
PTPN4-211ENST00000488279 IQGAP2Q13576 1575 aa38.53■■■■□ 3.76
PTPN4-211ENST00000488279 ADCY10Q96PN6 1610 aa38.52■■■■□ 3.76
PTPN4-211ENST00000488279 FAM69CQ0P6D2 419 aa38.51■■■■□ 3.76
PTPN4-211ENST00000488279 TNIKQ9UKE5 1360 aa38.51■■■■□ 3.76
PTPN4-211ENST00000488279 MAPKBP1O60336 1514 aa38.47■■■■□ 3.75
PTPN4-211ENST00000488279 ABCC10Q5T3U5 1492 aa38.45■■■■□ 3.75
PTPN4-211ENST00000488279 KIF13AQ9H1H9 1805 aa38.41■■■■□ 3.74
PTPN4-211ENST00000488279 DISP1Q96F81 1524 aa38.36■■■■□ 3.73
PTPN4-211ENST00000488279 UGGT2Q9NYU1 1516 aa38.33■■■■□ 3.73
PTPN4-211ENST00000488279 ABCC2Q92887 1545 aa38.28■■■■□ 3.72
PTPN4-211ENST00000488279 DIP2BQ9P265 1576 aa38.27■■■■□ 3.72
PTPN4-211ENST00000488279 UACAQ9BZF9 1416 aa38.26■■■■□ 3.72
PTPN4-211ENST00000488279 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa38.23■■■■□ 3.71
PTPN4-211ENST00000488279 PRXQ9BXM0 1461 aa38.23■■■■□ 3.71
PTPN4-211ENST00000488279 KIAA0556O60303 1618 aa38.16■■■■□ 3.7
PTPN4-211ENST00000488279 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP38.15■■■■□ 3.7
PTPN4-211ENST00000488279 ASXL2Q76L83 1435 aa38.13■■■■□ 3.7
PTPN4-211ENST00000488279 PLB1Q6P1J6 1458 aa38.13■■■■□ 3.69
PTPN4-211ENST00000488279 CSRNP3Q8WYN3 585 aa38.11■■■■□ 3.69
PTPN4-211ENST00000488279 GOLGA3Q08378 1498 aa38.09■■■■□ 3.69
PTPN4-211ENST00000488279 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa38.08■■■■□ 3.69
PTPN4-211ENST00000488279 KDM5BQ9UGL1 1544 aa38.05■■■■□ 3.68
PTPN4-211ENST00000488279 TSPOAP1O95153 1857 aa37.96■■■■□ 3.67
PTPN4-211ENST00000488279 GLI2P10070 1586 aa37.94■■■■□ 3.66
PTPN4-211ENST00000488279 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP37.93■■■■□ 3.66
PTPN4-211ENST00000488279 EEA1Q15075 1411 aa37.92■■■■□ 3.66
PTPN4-211ENST00000488279 KDM6BO15054 1643 aa37.9■■■■□ 3.66
PTPN4-211ENST00000488279 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP37.9■■■■□ 3.66
PTPN4-211ENST00000488279 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP37.88■■■■□ 3.65
PTPN4-211ENST00000488279 P3H3Q8IVL6 736 aa37.86■■■■□ 3.65
PTPN4-211ENST00000488279 ABCA8O94911 1581 aa37.81■■■■□ 3.64
PTPN4-211ENST00000488279 WDR7Q9Y4E6 1490 aa37.78■■■■□ 3.64
PTPN4-211ENST00000488279 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP37.72■■■■□ 3.63
PTPN4-211ENST00000488279 KCNH8Q96L42 1107 aa37.72■■■■□ 3.63
PTPN4-211ENST00000488279 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa37.7■■■■□ 3.63
PTPN4-211ENST00000488279 TEX14Q8IWB6 1497 aa37.68■■■■□ 3.62
PTPN4-211ENST00000488279 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP37.66■■■■□ 3.62
PTPN4-211ENST00000488279 ARID3CA6NKF2 412 aa37.64■■■■□ 3.62
PTPN4-211ENST00000488279 SAMD9Q5K651 1589 aa37.62■■■■□ 3.61
PTPN4-211ENST00000488279 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.6■■■■□ 3.61
PTPN4-211ENST00000488279 CD109Q6YHK3 1445 aa37.59■■■■□ 3.61
PTPN4-211ENST00000488279 ATP10BO94823 1461 aa37.58■■■■□ 3.61
PTPN4-211ENST00000488279 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP37.58■■■■□ 3.61
PTPN4-211ENST00000488279 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa37.53■■■■□ 3.6
PTPN4-211ENST00000488279 KIF21BO75037 1637 aa37.5■■■■□ 3.59
PTPN4-211ENST00000488279 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP37.49■■■■□ 3.59
PTPN4-211ENST00000488279 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP37.49■■■■□ 3.59
PTPN4-211ENST00000488279 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa37.49■■■■□ 3.59
PTPN4-211ENST00000488279 FHOD3Q2V2M9 1422 aa37.46■■■■□ 3.59
PTPN4-211ENST00000488279 CFAP43Q8NDM7 1665 aa37.45■■■■□ 3.59
PTPN4-211ENST00000488279 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa37.44■■■■□ 3.58
PTPN4-211ENST00000488279 UBTFP17480 764 aaKnown RBP37.42■■■■□ 3.58
PTPN4-211ENST00000488279 EHMT2Q96KQ7 1210 aa37.4■■■■□ 3.58
PTPN4-211ENST00000488279 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP37.36■■■■□ 3.57
PTPN4-211ENST00000488279 EFCAB5A4FU69 1503 aa37.34■■■■□ 3.57
PTPN4-211ENST00000488279 PLEKHD1A6NEE1 506 aa37.28■■■■□ 3.56
PTPN4-211ENST00000488279 ABCA9Q8IUA7 1624 aa37.24■■■■□ 3.55
PTPN4-211ENST00000488279 PHLDB1Q86UU1 1377 aa37.23■■■■□ 3.55
PTPN4-211ENST00000488279 ADGRL1O94910 1474 aa37.21■■■■□ 3.55
PTPN4-211ENST00000488279 ARAP3Q8WWN8 1544 aa37.2■■■■□ 3.55
PTPN4-211ENST00000488279 NEO1Q92859 1461 aa37.1■■■■□ 3.53
PTPN4-211ENST00000488279 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP37.1■■■■□ 3.53
PTPN4-211ENST00000488279 FMN1Q68DA7 1419 aa37.1■■■■□ 3.53
PTPN4-211ENST00000488279 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa37.07■■■■□ 3.53
PTPN4-211ENST00000488279 RAPGEF3O95398 923 aa37.07■■■■□ 3.52
PTPN4-211ENST00000488279 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP36.99■■■■□ 3.51
PTPN4-211ENST00000488279 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP36.96■■■■□ 3.51
PTPN4-211ENST00000488279 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP36.95■■■■□ 3.51
PTPN4-211ENST00000488279 AKNAQ7Z591 1439 aa36.91■■■■□ 3.5
PTPN4-211ENST00000488279 FANCAO15360 1455 aa36.9■■■■□ 3.5
PTPN4-211ENST00000488279 HECW1Q76N89 1606 aa36.9■■■■□ 3.5
PTPN4-211ENST00000488279 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP36.87■■■■□ 3.49
PTPN4-211ENST00000488279 TTC37Q6PGP7 1564 aa36.85■■■■□ 3.49
PTPN4-211ENST00000488279 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa36.8■■■■□ 3.48
PTPN4-211ENST00000488279 CFAP74Q9C0B2 1584 aa36.8■■■■□ 3.48
PTPN4-211ENST00000488279 PLCH2O75038 1416 aa36.8■■■■□ 3.48
PTPN4-211ENST00000488279 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP36.76■■■■□ 3.47
PTPN4-211ENST00000488279 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa36.74■■■■□ 3.47
PTPN4-211ENST00000488279 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP36.73■■■■□ 3.47
PTPN4-211ENST00000488279 CLIP1P30622 1438 aa36.7■■■■□ 3.47
PTPN4-211ENST00000488279 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa36.69■■■■□ 3.46
PTPN4-211ENST00000488279 RICTORQ6R327 1708 aa36.68■■■■□ 3.46
PTPN4-211ENST00000488279 SCAPERQ9BY12 1400 aa36.68■■■■□ 3.46
PTPN4-211ENST00000488279 KIF14Q15058 1648 aa36.63■■■■□ 3.45
PTPN4-211ENST00000488279 CCDC18Q5T9S5 1454 aa36.62■■■■□ 3.45
PTPN4-211ENST00000488279 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa36.61■■■■□ 3.45
PTPN4-211ENST00000488279 MAGI2Q86UL8 1455 aa36.6■■■■□ 3.45
PTPN4-211ENST00000488279 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa36.59■■■■□ 3.45
PTPN4-211ENST00000488279 POGZQ7Z3K3 1410 aa36.59■■■■□ 3.45
PTPN4-211ENST00000488279 ADAMTSL3P82987 1691 aa36.58■■■■□ 3.45
PTPN4-211ENST00000488279 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP36.57■■■■□ 3.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.5 ms