RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487476.5

NF1-211, Transcript of neurofibromin 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NF1, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF1-211ENST00000487476 NUP160Q12769 1436 aa27.29■■□□□ 1.96
NF1-211ENST00000487476 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
NF1-211ENST00000487476 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa27.2■■□□□ 1.94
NF1-211ENST00000487476 OSCARQ8IYS5 282 aa27.19■■□□□ 1.94
NF1-211ENST00000487476 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.17■■□□□ 1.94
NF1-211ENST00000487476 IQGAP2Q13576 1575 aa27.14■■□□□ 1.93
NF1-211ENST00000487476 CEP162Q5TB80 1403 aa27.13■■□□□ 1.93
NF1-211ENST00000487476 JPH4Q96JJ6 628 aa27.1■■□□□ 1.93
NF1-211ENST00000487476 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.09■■□□□ 1.93
NF1-211ENST00000487476 CLIP1P30622 1438 aa27.06■■□□□ 1.92
NF1-211ENST00000487476 P3H3Q8IVL6 736 aa27.05■■□□□ 1.92
NF1-211ENST00000487476 UGGT2Q9NYU1 1516 aa27.01■■□□□ 1.91
NF1-211ENST00000487476 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa27■■□□□ 1.91
NF1-211ENST00000487476 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
NF1-211ENST00000487476 DISP1Q96F81 1524 aa26.96■■□□□ 1.91
NF1-211ENST00000487476 SHROOM2Q13796 1616 aa26.94■■□□□ 1.9
NF1-211ENST00000487476 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.92■■□□□ 1.9
NF1-211ENST00000487476 SAMD9Q5K651 1589 aa26.92■■□□□ 1.9
NF1-211ENST00000487476 ARAP1Q96P48 1450 aa26.91■■□□□ 1.9
NF1-211ENST00000487476 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.91■■□□□ 1.9
NF1-211ENST00000487476 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.89■■□□□ 1.9
NF1-211ENST00000487476 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
NF1-211ENST00000487476 KIAA0556O60303 1618 aa26.87■■□□□ 1.89
NF1-211ENST00000487476 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa26.87■■□□□ 1.89
NF1-211ENST00000487476 PTPRGP23470 1445 aa26.72■■□□□ 1.87
NF1-211ENST00000487476 ARHGEF11O15085 1522 aa26.71■■□□□ 1.87
NF1-211ENST00000487476 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.71■■□□□ 1.87
NF1-211ENST00000487476 FMN1Q68DA7 1419 aa26.68■■□□□ 1.86
NF1-211ENST00000487476 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
NF1-211ENST00000487476 PLB1Q6P1J6 1458 aa26.64■■□□□ 1.86
NF1-211ENST00000487476 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.62■■□□□ 1.85
NF1-211ENST00000487476 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.62■■□□□ 1.85
NF1-211ENST00000487476 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.62■■□□□ 1.85
NF1-211ENST00000487476 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
NF1-211ENST00000487476 ARID3CA6NKF2 412 aa26.58■■□□□ 1.85
NF1-211ENST00000487476 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.58■■□□□ 1.85
NF1-211ENST00000487476 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.55■■□□□ 1.84
NF1-211ENST00000487476 UACAQ9BZF9 1416 aa26.54■■□□□ 1.84
NF1-211ENST00000487476 ABCA8O94911 1581 aa26.54■■□□□ 1.84
NF1-211ENST00000487476 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa26.53■■□□□ 1.84
NF1-211ENST00000487476 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.52■■□□□ 1.84
NF1-211ENST00000487476 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa26.52■■□□□ 1.84
NF1-211ENST00000487476 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
NF1-211ENST00000487476 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
NF1-211ENST00000487476 ABCC2Q92887 1545 aa26.45■■□□□ 1.82
NF1-211ENST00000487476 HECW1Q76N89 1606 aa26.45■■□□□ 1.82
NF1-211ENST00000487476 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
NF1-211ENST00000487476 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
NF1-211ENST00000487476 APLP2Q06481 763 aa26.42■■□□□ 1.82
NF1-211ENST00000487476 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.42■■□□□ 1.82
NF1-211ENST00000487476 ADCY10Q96PN6 1610 aa26.42■■□□□ 1.82
NF1-211ENST00000487476 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa26.42■■□□□ 1.82
NF1-211ENST00000487476 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
NF1-211ENST00000487476 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
NF1-211ENST00000487476 ATP10BO94823 1461 aa26.4■■□□□ 1.82
NF1-211ENST00000487476 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
NF1-211ENST00000487476 TIAM1Q13009 1591 aa26.34■■□□□ 1.81
NF1-211ENST00000487476 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.34■■□□□ 1.81
NF1-211ENST00000487476 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.32■■□□□ 1.8
NF1-211ENST00000487476 MAP3K1Q13233 1512 aa26.3■■□□□ 1.8
NF1-211ENST00000487476 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.28■■□□□ 1.8
NF1-211ENST00000487476 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
NF1-211ENST00000487476 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa26.27■■□□□ 1.8
NF1-211ENST00000487476 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.26■■□□□ 1.79
NF1-211ENST00000487476 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP26.26■■□□□ 1.79
NF1-211ENST00000487476 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.23■■□□□ 1.79
NF1-211ENST00000487476 PLEKHD1A6NEE1 506 aa26.23■■□□□ 1.79
NF1-211ENST00000487476 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
NF1-211ENST00000487476 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
NF1-211ENST00000487476 ASXL2Q76L83 1435 aa26.16■■□□□ 1.78
NF1-211ENST00000487476 KCNH8Q96L42 1107 aa26.16■■□□□ 1.78
NF1-211ENST00000487476 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.13■■□□□ 1.77
NF1-211ENST00000487476 WDR7Q9Y4E6 1490 aa26.1■■□□□ 1.77
NF1-211ENST00000487476 KIF14Q15058 1648 aa26.07■■□□□ 1.76
NF1-211ENST00000487476 NCOA2Q15596 1464 aa26.06■■□□□ 1.76
NF1-211ENST00000487476 MAPKBP1O60336 1514 aa26.04■■□□□ 1.76
NF1-211ENST00000487476 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.04■■□□□ 1.76
NF1-211ENST00000487476 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
NF1-211ENST00000487476 ABCC10Q5T3U5 1492 aa25.98■■□□□ 1.75
NF1-211ENST00000487476 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP25.97■■□□□ 1.75
NF1-211ENST00000487476 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.95■■□□□ 1.74
NF1-211ENST00000487476 TTC37Q6PGP7 1564 aa25.94■■□□□ 1.74
NF1-211ENST00000487476 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
NF1-211ENST00000487476 FAM69CQ0P6D2 419 aa25.9■■□□□ 1.74
NF1-211ENST00000487476 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.9■■□□□ 1.74
NF1-211ENST00000487476 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
NF1-211ENST00000487476 ABCA9Q8IUA7 1624 aa25.85■■□□□ 1.73
NF1-211ENST00000487476 DIP2BQ9P265 1576 aa25.85■■□□□ 1.73
NF1-211ENST00000487476 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.84■■□□□ 1.73
NF1-211ENST00000487476 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
NF1-211ENST00000487476 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25.82■■□□□ 1.72
NF1-211ENST00000487476 PLCH2O75038 1416 aa25.82■■□□□ 1.72
NF1-211ENST00000487476 CD109Q6YHK3 1445 aa25.82■■□□□ 1.72
NF1-211ENST00000487476 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
NF1-211ENST00000487476 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
NF1-211ENST00000487476 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
NF1-211ENST00000487476 GLI2P10070 1586 aa25.8■■□□□ 1.72
NF1-211ENST00000487476 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
NF1-211ENST00000487476 MIA2Q96PC5 1412 aa25.77■■□□□ 1.72
NF1-211ENST00000487476 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms