RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487079.1

POLR2D-204, Transcript of RNA polymerase II subunit D, humanhuman

TSL 2

Gene POLR2D, Length 1,037 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2D-204ENST00000487079 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.9■■■■■ 4.46
POLR2D-204ENST00000487079 CUL7Q14999 1698 aa42.86■■■■■ 4.45
POLR2D-204ENST00000487079 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa42.75■■■■■ 4.43
POLR2D-204ENST00000487079 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.74■■■■■ 4.43
POLR2D-204ENST00000487079 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP42.43■■■■■ 4.38
POLR2D-204ENST00000487079 ADCY10Q96PN6 1610 aa42.39■■■■■ 4.38
POLR2D-204ENST00000487079 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.36■■■■■ 4.37
POLR2D-204ENST00000487079 IQGAP2Q13576 1575 aa42.36■■■■■ 4.37
POLR2D-204ENST00000487079 PTPRGP23470 1445 aa42.33■■■■■ 4.37
POLR2D-204ENST00000487079 KIF13AQ9H1H9 1805 aa42.33■■■■■ 4.37
POLR2D-204ENST00000487079 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa42.32■■■■■ 4.37
POLR2D-204ENST00000487079 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP42.32■■■■■ 4.37
POLR2D-204ENST00000487079 MAPKBP1O60336 1514 aa42.26■■■■■ 4.36
POLR2D-204ENST00000487079 TNIKQ9UKE5 1360 aa42.26■■■■■ 4.35
POLR2D-204ENST00000487079 FAM69CQ0P6D2 419 aa42.23■■■■■ 4.35
POLR2D-204ENST00000487079 ABCC10Q5T3U5 1492 aa42.22■■■■■ 4.35
POLR2D-204ENST00000487079 DISP1Q96F81 1524 aa42.15■■■■■ 4.34
POLR2D-204ENST00000487079 DIP2BQ9P265 1576 aa42.1■■■■■ 4.33
POLR2D-204ENST00000487079 UGGT2Q9NYU1 1516 aa42.1■■■■■ 4.33
POLR2D-204ENST00000487079 ABCC2Q92887 1545 aa42.03■■■■■ 4.32
POLR2D-204ENST00000487079 UACAQ9BZF9 1416 aa42■■■■■ 4.31
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POLR2D-204ENST00000487079 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa41.98■■■■■ 4.31
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POLR2D-204ENST00000487079 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa41.96■■■■■ 4.31
POLR2D-204ENST00000487079 ASXL2Q76L83 1435 aa41.87■■■■■ 4.29
POLR2D-204ENST00000487079 TSPOAP1O95153 1857 aa41.84■■■■■ 4.29
POLR2D-204ENST00000487079 PLB1Q6P1J6 1458 aa41.84■■■■■ 4.29
POLR2D-204ENST00000487079 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP41.82■■■■■ 4.29
POLR2D-204ENST00000487079 GOLGA3Q08378 1498 aa41.8■■■■■ 4.28
POLR2D-204ENST00000487079 KDM5BQ9UGL1 1544 aa41.79■■■■■ 4.28
POLR2D-204ENST00000487079 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.78■■■■■ 4.28
POLR2D-204ENST00000487079 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP41.7■■■■■ 4.27
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POLR2D-204ENST00000487079 KDM6BO15054 1643 aa41.68■■■■■ 4.26
POLR2D-204ENST00000487079 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP41.61■■■■■ 4.25
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POLR2D-204ENST00000487079 ABCA8O94911 1581 aa41.57■■■■■ 4.25
POLR2D-204ENST00000487079 P3H3Q8IVL6 736 aa41.56■■■■■ 4.24
POLR2D-204ENST00000487079 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP41.55■■■■■ 4.24
POLR2D-204ENST00000487079 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.52■■■■■ 4.24
POLR2D-204ENST00000487079 WDR7Q9Y4E6 1490 aa41.5■■■■■ 4.23
POLR2D-204ENST00000487079 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa41.47■■■■■ 4.23
POLR2D-204ENST00000487079 SAMD9Q5K651 1589 aa41.38■■■■■ 4.22
POLR2D-204ENST00000487079 KCNH8Q96L42 1107 aa41.38■■■■■ 4.21
POLR2D-204ENST00000487079 ARID3CA6NKF2 412 aa41.36■■■■■ 4.21
POLR2D-204ENST00000487079 TEX14Q8IWB6 1497 aa41.35■■■■■ 4.21
POLR2D-204ENST00000487079 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP41.35■■■■■ 4.21
POLR2D-204ENST00000487079 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP41.28■■■■■ 4.2
POLR2D-204ENST00000487079 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.27■■■■■ 4.2
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POLR2D-204ENST00000487079 CD109Q6YHK3 1445 aa41.25■■■■■ 4.19
POLR2D-204ENST00000487079 KIF21BO75037 1637 aa41.24■■■■■ 4.19
POLR2D-204ENST00000487079 CFAP43Q8NDM7 1665 aa41.2■■■■■ 4.19
POLR2D-204ENST00000487079 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa41.18■■■■■ 4.18
POLR2D-204ENST00000487079 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa41.18■■■■■ 4.18
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POLR2D-204ENST00000487079 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa41.16■■■■■ 4.18
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POLR2D-204ENST00000487079 ADGRL1O94910 1474 aa40.9■■■■■ 4.14
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POLR2D-204ENST00000487079 ARAP3Q8WWN8 1544 aa40.83■■■■■ 4.13
POLR2D-204ENST00000487079 PHLDB1Q86UU1 1377 aa40.78■■■■■ 4.12
POLR2D-204ENST00000487079 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa40.74■■■■■ 4.11
POLR2D-204ENST00000487079 NEO1Q92859 1461 aa40.72■■■■■ 4.11
POLR2D-204ENST00000487079 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP40.7■■■■■ 4.11
POLR2D-204ENST00000487079 FMN1Q68DA7 1419 aa40.69■■■■■ 4.1
POLR2D-204ENST00000487079 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP40.69■■■■■ 4.1
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POLR2D-204ENST00000487079 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa40.28■■■■■ 4.04
POLR2D-204ENST00000487079 CLIP1P30622 1438 aa40.27■■■■■ 4.04
POLR2D-204ENST00000487079 MYO5CQ9NQX4 1742 aa40.27■■■■■ 4.04
POLR2D-204ENST00000487079 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP40.27■■■■■ 4.04
POLR2D-204ENST00000487079 SCAPERQ9BY12 1400 aa40.26■■■■■ 4.04
POLR2D-204ENST00000487079 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa40.26■■■■■ 4.04
POLR2D-204ENST00000487079 ADAMTSL3P82987 1691 aa40.24■■■■■ 4.03
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POLR2D-204ENST00000487079 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa40.22■■■■■ 4.03
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