RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 KIF27Q86VH2 1401 aa22.08■■□□□ 1.13
PRAME-212ENST00000485532 CUL7Q14999 1698 aa22.04■■□□□ 1.12
PRAME-212ENST00000485532 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22■■□□□ 1.11
PRAME-212ENST00000485532 KIF13AQ9H1H9 1805 aa21.99■■□□□ 1.11
PRAME-212ENST00000485532 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.96■■□□□ 1.11
PRAME-212ENST00000485532 ADCY10Q96PN6 1610 aa21.94■■□□□ 1.1
PRAME-212ENST00000485532 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
PRAME-212ENST00000485532 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP21.85■■□□□ 1.09
PRAME-212ENST00000485532 MAPKBP1O60336 1514 aa21.84■■□□□ 1.09
PRAME-212ENST00000485532 ABCC10Q5T3U5 1492 aa21.83■■□□□ 1.09
PRAME-212ENST00000485532 FAM69CQ0P6D2 419 aa21.83■■□□□ 1.09
PRAME-212ENST00000485532 IQGAP2Q13576 1575 aa21.82■■□□□ 1.08
PRAME-212ENST00000485532 DIP2BQ9P265 1576 aa21.81■■□□□ 1.08
PRAME-212ENST00000485532 PTPRGP23470 1445 aa21.8■■□□□ 1.08
PRAME-212ENST00000485532 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
PRAME-212ENST00000485532 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa21.76■■□□□ 1.07
PRAME-212ENST00000485532 TNIKQ9UKE5 1360 aa21.75■■□□□ 1.07
PRAME-212ENST00000485532 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa21.75■■□□□ 1.07
PRAME-212ENST00000485532 DISP1Q96F81 1524 aa21.74■■□□□ 1.07
PRAME-212ENST00000485532 TSPOAP1O95153 1857 aa21.73■■□□□ 1.07
PRAME-212ENST00000485532 ABCC2Q92887 1545 aa21.68■■□□□ 1.06
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PRAME-212ENST00000485532 UACAQ9BZF9 1416 aa21.63■■□□□ 1.05
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PRAME-212ENST00000485532 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa21.63■■□□□ 1.05
PRAME-212ENST00000485532 ASXL2Q76L83 1435 aa21.63■■□□□ 1.05
PRAME-212ENST00000485532 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa21.62■■□□□ 1.05
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PRAME-212ENST00000485532 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
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PRAME-212ENST00000485532 PRXQ9BXM0 1461 aa21.54■■□□□ 1.04
PRAME-212ENST00000485532 GLI2P10070 1586 aa21.53■■□□□ 1.04
PRAME-212ENST00000485532 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
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PRAME-212ENST00000485532 ABCA8O94911 1581 aa21.43■■□□□ 1.02
PRAME-212ENST00000485532 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa21.41■■□□□ 1.02
PRAME-212ENST00000485532 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
PRAME-212ENST00000485532 WDR7Q9Y4E6 1490 aa21.4■■□□□ 1.02
PRAME-212ENST00000485532 P3H3Q8IVL6 736 aa21.4■■□□□ 1.02
PRAME-212ENST00000485532 CSRNP3Q8WYN3 585 aa21.37■■□□□ 1.01
PRAME-212ENST00000485532 ARID3CA6NKF2 412 aa21.34■■□□□ 1.01
PRAME-212ENST00000485532 KCNH8Q96L42 1107 aa21.34■■□□□ 1.01
PRAME-212ENST00000485532 TEX14Q8IWB6 1497 aa21.32■■□□□ 1
PRAME-212ENST00000485532 SAMD9Q5K651 1589 aa21.29■■□□□ 1
PRAME-212ENST00000485532 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
PRAME-212ENST00000485532 CD109Q6YHK3 1445 aa21.28■■□□□ 1
PRAME-212ENST00000485532 CFAP43Q8NDM7 1665 aa21.28■■□□□ 1
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PRAME-212ENST00000485532 CHIC1Q5VXU3 224 aa21.04■□□□□ 0.96
PRAME-212ENST00000485532 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.04■□□□□ 0.96
PRAME-212ENST00000485532 RAPGEF3O95398 923 aa21.01■□□□□ 0.95
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PRAME-212ENST00000485532 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa20.97■□□□□ 0.95
PRAME-212ENST00000485532 NEO1Q92859 1461 aa20.97■□□□□ 0.95
PRAME-212ENST00000485532 PLEKHD1A6NEE1 506 aa20.97■□□□□ 0.95
PRAME-212ENST00000485532 PHLDB1Q86UU1 1377 aa20.96■□□□□ 0.95
PRAME-212ENST00000485532 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP20.94■□□□□ 0.948e-20■■□□□ 11.4
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PRAME-212ENST00000485532 TTC37Q6PGP7 1564 aa20.93■□□□□ 0.94
PRAME-212ENST00000485532 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa20.91■□□□□ 0.94
PRAME-212ENST00000485532 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
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PRAME-212ENST00000485532 YEATS2Q9ULM3 1422 aa20.77■□□□□ 0.91
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PRAME-212ENST00000485532 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa20.73■□□□□ 0.91
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