RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 KIF27Q86VH2 1401 aa22.08■■□□□ 1.13
PRAME-212ENST00000485532 CUL7Q14999 1698 aa22.04■■□□□ 1.12
PRAME-212ENST00000485532 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22■■□□□ 1.11
PRAME-212ENST00000485532 KIF13AQ9H1H9 1805 aa21.99■■□□□ 1.11
PRAME-212ENST00000485532 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.96■■□□□ 1.11
PRAME-212ENST00000485532 ADCY10Q96PN6 1610 aa21.94■■□□□ 1.1
PRAME-212ENST00000485532 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
PRAME-212ENST00000485532 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP21.85■■□□□ 1.09
PRAME-212ENST00000485532 MAPKBP1O60336 1514 aa21.84■■□□□ 1.09
PRAME-212ENST00000485532 ABCC10Q5T3U5 1492 aa21.83■■□□□ 1.09
PRAME-212ENST00000485532 FAM69CQ0P6D2 419 aa21.83■■□□□ 1.09
PRAME-212ENST00000485532 IQGAP2Q13576 1575 aa21.82■■□□□ 1.08
PRAME-212ENST00000485532 DIP2BQ9P265 1576 aa21.81■■□□□ 1.08
PRAME-212ENST00000485532 PTPRGP23470 1445 aa21.8■■□□□ 1.08
PRAME-212ENST00000485532 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
PRAME-212ENST00000485532 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa21.76■■□□□ 1.07
PRAME-212ENST00000485532 TNIKQ9UKE5 1360 aa21.75■■□□□ 1.07
PRAME-212ENST00000485532 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa21.75■■□□□ 1.07
PRAME-212ENST00000485532 DISP1Q96F81 1524 aa21.74■■□□□ 1.07
PRAME-212ENST00000485532 TSPOAP1O95153 1857 aa21.73■■□□□ 1.07
PRAME-212ENST00000485532 ABCC2Q92887 1545 aa21.68■■□□□ 1.06
PRAME-212ENST00000485532 UGGT2Q9NYU1 1516 aa21.66■■□□□ 1.06
PRAME-212ENST00000485532 UACAQ9BZF9 1416 aa21.63■■□□□ 1.05
PRAME-212ENST00000485532 KIAA0556O60303 1618 aa21.63■■□□□ 1.05
PRAME-212ENST00000485532 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa21.63■■□□□ 1.05
PRAME-212ENST00000485532 ASXL2Q76L83 1435 aa21.63■■□□□ 1.05
PRAME-212ENST00000485532 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa21.62■■□□□ 1.05
PRAME-212ENST00000485532 KDM6BO15054 1643 aa21.61■■□□□ 1.05
PRAME-212ENST00000485532 PLB1Q6P1J6 1458 aa21.57■■□□□ 1.04
PRAME-212ENST00000485532 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
PRAME-212ENST00000485532 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
PRAME-212ENST00000485532 KDM5BQ9UGL1 1544 aa21.55■■□□□ 1.04
PRAME-212ENST00000485532 PRXQ9BXM0 1461 aa21.54■■□□□ 1.04
PRAME-212ENST00000485532 GLI2P10070 1586 aa21.53■■□□□ 1.04
PRAME-212ENST00000485532 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
PRAME-212ENST00000485532 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa21.46■■□□□ 1.03
PRAME-212ENST00000485532 GOLGA3Q08378 1498 aa21.45■■□□□ 1.03
PRAME-212ENST00000485532 ABCA8O94911 1581 aa21.43■■□□□ 1.02
PRAME-212ENST00000485532 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa21.41■■□□□ 1.02
PRAME-212ENST00000485532 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
PRAME-212ENST00000485532 WDR7Q9Y4E6 1490 aa21.4■■□□□ 1.02
PRAME-212ENST00000485532 P3H3Q8IVL6 736 aa21.4■■□□□ 1.02
PRAME-212ENST00000485532 CSRNP3Q8WYN3 585 aa21.37■■□□□ 1.01
PRAME-212ENST00000485532 ARID3CA6NKF2 412 aa21.34■■□□□ 1.01
PRAME-212ENST00000485532 KCNH8Q96L42 1107 aa21.34■■□□□ 1.01
PRAME-212ENST00000485532 TEX14Q8IWB6 1497 aa21.32■■□□□ 1
PRAME-212ENST00000485532 SAMD9Q5K651 1589 aa21.29■■□□□ 1
PRAME-212ENST00000485532 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
PRAME-212ENST00000485532 CD109Q6YHK3 1445 aa21.28■■□□□ 1
PRAME-212ENST00000485532 CFAP43Q8NDM7 1665 aa21.28■■□□□ 1
PRAME-212ENST00000485532 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
PRAME-212ENST00000485532 ATP10BO94823 1461 aa21.26■□□□□ 0.99
PRAME-212ENST00000485532 ADGRL1O94910 1474 aa21.23■□□□□ 0.99
PRAME-212ENST00000485532 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa21.23■□□□□ 0.99
PRAME-212ENST00000485532 EEA1Q15075 1411 aa21.22■□□□□ 0.99
PRAME-212ENST00000485532 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa21.21■□□□□ 0.99
PRAME-212ENST00000485532 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.18■□□□□ 0.98
PRAME-212ENST00000485532 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
PRAME-212ENST00000485532 EHMT2Q96KQ7 1210 aa21.13■□□□□ 0.97
PRAME-212ENST00000485532 ABCA9Q8IUA7 1624 aa21.13■□□□□ 0.97
PRAME-212ENST00000485532 KIF21BO75037 1637 aa21.12■□□□□ 0.97
PRAME-212ENST00000485532 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
PRAME-212ENST00000485532 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
PRAME-212ENST00000485532 ARAP3Q8WWN8 1544 aa21.07■□□□□ 0.96
PRAME-212ENST00000485532 CHIC1Q5VXU3 224 aa21.04■□□□□ 0.96
PRAME-212ENST00000485532 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.04■□□□□ 0.96
PRAME-212ENST00000485532 RAPGEF3O95398 923 aa21.01■□□□□ 0.95
PRAME-212ENST00000485532 UBTFP17480 764 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
PRAME-212ENST00000485532 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
PRAME-212ENST00000485532 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa20.97■□□□□ 0.95
PRAME-212ENST00000485532 NEO1Q92859 1461 aa20.97■□□□□ 0.95
PRAME-212ENST00000485532 PLEKHD1A6NEE1 506 aa20.97■□□□□ 0.95
PRAME-212ENST00000485532 PHLDB1Q86UU1 1377 aa20.96■□□□□ 0.95
PRAME-212ENST00000485532 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP20.94■□□□□ 0.948e-20■■□□□ 11.4
PRAME-212ENST00000485532 HECW2Q9P2P5 1572 aa20.94■□□□□ 0.94
PRAME-212ENST00000485532 TTC37Q6PGP7 1564 aa20.93■□□□□ 0.94
PRAME-212ENST00000485532 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa20.91■□□□□ 0.94
PRAME-212ENST00000485532 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
PRAME-212ENST00000485532 RICTORQ6R327 1708 aa20.88■□□□□ 0.93
PRAME-212ENST00000485532 FANCAO15360 1455 aa20.88■□□□□ 0.93
PRAME-212ENST00000485532 AKNAQ7Z591 1439 aa20.87■□□□□ 0.93
PRAME-212ENST00000485532 ADAMTSL3P82987 1691 aa20.86■□□□□ 0.93
PRAME-212ENST00000485532 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
PRAME-212ENST00000485532 HECW1Q76N89 1606 aa20.84■□□□□ 0.93
PRAME-212ENST00000485532 FMN1Q68DA7 1419 aa20.84■□□□□ 0.93
PRAME-212ENST00000485532 CFAP74Q9C0B2 1584 aa20.84■□□□□ 0.93
PRAME-212ENST00000485532 BCORL1Q5H9F3 1711 aa20.82■□□□□ 0.92
PRAME-212ENST00000485532 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa20.82■□□□□ 0.92
PRAME-212ENST00000485532 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa20.81■□□□□ 0.92
PRAME-212ENST00000485532 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
PRAME-212ENST00000485532 PTPRMP28827 1452 aa20.8■□□□□ 0.92
PRAME-212ENST00000485532 KIF14Q15058 1648 aa20.78■□□□□ 0.92
PRAME-212ENST00000485532 MADDQ8WXG6 1647 aa20.78■□□□□ 0.92
PRAME-212ENST00000485532 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa20.78■□□□□ 0.92
PRAME-212ENST00000485532 PLCH2O75038 1416 aa20.78■□□□□ 0.92
PRAME-212ENST00000485532 YEATS2Q9ULM3 1422 aa20.77■□□□□ 0.91
PRAME-212ENST00000485532 MYO5CQ9NQX4 1742 aa20.75■□□□□ 0.91
PRAME-212ENST00000485532 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa20.75■□□□□ 0.91
PRAME-212ENST00000485532 SCAPERQ9BY12 1400 aa20.74■□□□□ 0.91
PRAME-212ENST00000485532 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms