RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484048.1

UBE2E1-209, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2E1, Length 786 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1-209ENST00000484048 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
UBE2E1-209ENST00000484048 SHROOM2Q13796 1616 aa26.65■■□□□ 1.86
UBE2E1-209ENST00000484048 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.63■■□□□ 1.85
UBE2E1-209ENST00000484048 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.59■■□□□ 1.85
UBE2E1-209ENST00000484048 CUL7Q14999 1698 aa26.59■■□□□ 1.85
UBE2E1-209ENST00000484048 ADAMTS12P58397 1594 aa26.58■■□□□ 1.85
UBE2E1-209ENST00000484048 ABCC10Q5T3U5 1492 aa26.58■■□□□ 1.85
UBE2E1-209ENST00000484048 FAM69CQ0P6D2 419 aa26.58■■□□□ 1.85
UBE2E1-209ENST00000484048 IGF1RP08069 1367 aa26.58■■□□□ 1.84
UBE2E1-209ENST00000484048 KIF21BO75037 1637 aa26.54■■□□□ 1.84
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UBE2E1-209ENST00000484048 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
UBE2E1-209ENST00000484048 DIP2BQ9P265 1576 aa26.48■■□□□ 1.83
UBE2E1-209ENST00000484048 MAPKBP1O60336 1514 aa26.48■■□□□ 1.83
UBE2E1-209ENST00000484048 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.48■■□□□ 1.83
UBE2E1-209ENST00000484048 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP26.44■■□□□ 1.82
UBE2E1-209ENST00000484048 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.44■■□□□ 1.82
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UBE2E1-209ENST00000484048 ADCY10Q96PN6 1610 aa26.31■■□□□ 1.8
UBE2E1-209ENST00000484048 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.29■■□□□ 1.8
UBE2E1-209ENST00000484048 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.26■■□□□ 1.79
UBE2E1-209ENST00000484048 ADGRL1O94910 1474 aa26.24■■□□□ 1.79
UBE2E1-209ENST00000484048 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.24■■□□□ 1.79
UBE2E1-209ENST00000484048 TSPOAP1O95153 1857 aa26.22■■□□□ 1.79
UBE2E1-209ENST00000484048 HECW2Q9P2P5 1572 aa26.2■■□□□ 1.78
UBE2E1-209ENST00000484048 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.16■■□□□ 1.78
UBE2E1-209ENST00000484048 UBTFP17480 764 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
UBE2E1-209ENST00000484048 IQGAP2Q13576 1575 aa26.04■■□□□ 1.76
UBE2E1-209ENST00000484048 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa26.02■■□□□ 1.76
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UBE2E1-209ENST00000484048 CEP162Q5TB80 1403 aa25.97■■□□□ 1.75
UBE2E1-209ENST00000484048 FBXO41Q8TF61 875 aa25.96■■□□□ 1.75
UBE2E1-209ENST00000484048 ASXL2Q76L83 1435 aa25.96■■□□□ 1.75
UBE2E1-209ENST00000484048 ABCC2Q92887 1545 aa25.95■■□□□ 1.74
UBE2E1-209ENST00000484048 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.95■■□□□ 1.74
UBE2E1-209ENST00000484048 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
UBE2E1-209ENST00000484048 PTPRGP23470 1445 aa25.94■■□□□ 1.74
UBE2E1-209ENST00000484048 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.91■■□□□ 1.74
UBE2E1-209ENST00000484048 SAMD9Q5K651 1589 aa25.89■■□□□ 1.73
UBE2E1-209ENST00000484048 CLIP1P30622 1438 aa25.88■■□□□ 1.73
UBE2E1-209ENST00000484048 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.87■■□□□ 1.73
UBE2E1-209ENST00000484048 TEX14Q8IWB6 1497 aa25.84■■□□□ 1.73
UBE2E1-209ENST00000484048 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa25.84■■□□□ 1.73
UBE2E1-209ENST00000484048 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
UBE2E1-209ENST00000484048 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
UBE2E1-209ENST00000484048 KIAA0556O60303 1618 aa25.8■■□□□ 1.72
UBE2E1-209ENST00000484048 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa25.8■■□□□ 1.72
UBE2E1-209ENST00000484048 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa25.79■■□□□ 1.72
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UBE2E1-209ENST00000484048 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa25.78■■□□□ 1.72
UBE2E1-209ENST00000484048 DISP1Q96F81 1524 aa25.78■■□□□ 1.72
UBE2E1-209ENST00000484048 UACAQ9BZF9 1416 aa25.71■■□□□ 1.71
UBE2E1-209ENST00000484048 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.68■■□□□ 1.7
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UBE2E1-209ENST00000484048 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.61■■□□□ 1.69
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UBE2E1-209ENST00000484048 LMTK3Q96Q04 1460 aa25.57■■□□□ 1.68
UBE2E1-209ENST00000484048 WDR7Q9Y4E6 1490 aa25.55■■□□□ 1.68
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UBE2E1-209ENST00000484048 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.52■■□□□ 1.68
UBE2E1-209ENST00000484048 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.48■■□□□ 1.67
UBE2E1-209ENST00000484048 CD109Q6YHK3 1445 aa25.48■■□□□ 1.67
UBE2E1-209ENST00000484048 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.48■■□□□ 1.67
UBE2E1-209ENST00000484048 PTPRMP28827 1452 aa25.47■■□□□ 1.67
UBE2E1-209ENST00000484048 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.47■■□□□ 1.67
UBE2E1-209ENST00000484048 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.46■■□□□ 1.67
UBE2E1-209ENST00000484048 ABCA8O94911 1581 aa25.45■■□□□ 1.66
UBE2E1-209ENST00000484048 HECW1Q76N89 1606 aa25.45■■□□□ 1.66
UBE2E1-209ENST00000484048 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.43■■□□□ 1.66
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UBE2E1-209ENST00000484048 KCNH8Q96L42 1107 aa25.34■■□□□ 1.65
UBE2E1-209ENST00000484048 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
UBE2E1-209ENST00000484048 MAP3K1Q13233 1512 aa25.32■■□□□ 1.64
UBE2E1-209ENST00000484048 TIAM1Q13009 1591 aa25.31■■□□□ 1.64
UBE2E1-209ENST00000484048 SOCS7O14512 581 aa25.3■■□□□ 1.64
UBE2E1-209ENST00000484048 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.29■■□□□ 1.64
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UBE2E1-209ENST00000484048 ILDR2Q71H61 639 aa25.25■■□□□ 1.63
UBE2E1-209ENST00000484048 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
UBE2E1-209ENST00000484048 DISP3Q9P2K9 1392 aa25.24■■□□□ 1.63
UBE2E1-209ENST00000484048 APLP2Q06481 763 aa25.23■■□□□ 1.63
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UBE2E1-209ENST00000484048 BCORL1Q5H9F3 1711 aa25.21■■□□□ 1.63
UBE2E1-209ENST00000484048 CERKQ8TCT0 537 aa25.21■■□□□ 1.63
UBE2E1-209ENST00000484048 ATP10BO94823 1461 aa25.2■■□□□ 1.62
UBE2E1-209ENST00000484048 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.18■■□□□ 1.62
UBE2E1-209ENST00000484048 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
UBE2E1-209ENST00000484048 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.15■■□□□ 1.62
UBE2E1-209ENST00000484048 HSPA2P54652 639 aa25.15■■□□□ 1.62
UBE2E1-209ENST00000484048 RAPGEF3O95398 923 aa25.14■■□□□ 1.62
UBE2E1-209ENST00000484048 ARID3CA6NKF2 412 aa25.13■■□□□ 1.61
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UBE2E1-209ENST00000484048 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
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