RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482519.1

VAMP4-204, Transcript of vesicle associated membrane protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene VAMP4, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4-204ENST00000482519 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.12■■■□□ 2.09
VAMP4-204ENST00000482519 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
VAMP4-204ENST00000482519 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa28.03■■■□□ 2.08
VAMP4-204ENST00000482519 TRHP20396 242 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
VAMP4-204ENST00000482519 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa27.95■■■□□ 2.07
VAMP4-204ENST00000482519 IQGAP2Q13576 1575 aa27.86■■■□□ 2.05
VAMP4-204ENST00000482519 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP27.83■■■□□ 2.05
VAMP4-204ENST00000482519 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa27.77■■■□□ 2.04
VAMP4-204ENST00000482519 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.76■■■□□ 2.03
VAMP4-204ENST00000482519 PRXQ9BXM0 1461 aa27.76■■■□□ 2.03
VAMP4-204ENST00000482519 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.74■■■□□ 2.03
VAMP4-204ENST00000482519 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.72■■■□□ 2.03
VAMP4-204ENST00000482519 PTPRGP23470 1445 aa27.72■■■□□ 2.03
VAMP4-204ENST00000482519 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP27.71■■■□□ 2.03
VAMP4-204ENST00000482519 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.71■■■□□ 2.03
VAMP4-204ENST00000482519 TNIKQ9UKE5 1360 aa27.69■■■□□ 2.02
VAMP4-204ENST00000482519 DISP1Q96F81 1524 aa27.67■■■□□ 2.02
VAMP4-204ENST00000482519 UGGT2Q9NYU1 1516 aa27.67■■■□□ 2.02
VAMP4-204ENST00000482519 EEA1Q15075 1411 aa27.67■■■□□ 2.02
VAMP4-204ENST00000482519 ADCY10Q96PN6 1610 aa27.66■■■□□ 2.02
VAMP4-204ENST00000482519 KIAA0556O60303 1618 aa27.59■■■□□ 2.01
VAMP4-204ENST00000482519 GOLGA3Q08378 1498 aa27.52■■■□□ 2
VAMP4-204ENST00000482519 UACAQ9BZF9 1416 aa27.5■■□□□ 1.99
VAMP4-204ENST00000482519 MAPKBP1O60336 1514 aa27.49■■□□□ 1.99
VAMP4-204ENST00000482519 KIF13AQ9H1H9 1805 aa27.47■■□□□ 1.99
VAMP4-204ENST00000482519 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
VAMP4-204ENST00000482519 FAM69CQ0P6D2 419 aa27.47■■□□□ 1.99
VAMP4-204ENST00000482519 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.47■■□□□ 1.99
VAMP4-204ENST00000482519 ABCC2Q92887 1545 aa27.46■■□□□ 1.99
VAMP4-204ENST00000482519 P3H3Q8IVL6 736 aa27.46■■□□□ 1.99
VAMP4-204ENST00000482519 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa27.44■■□□□ 1.98
VAMP4-204ENST00000482519 ABCC10Q5T3U5 1492 aa27.42■■□□□ 1.98
VAMP4-204ENST00000482519 KIF21BO75037 1637 aa27.41■■□□□ 1.98
VAMP4-204ENST00000482519 PLB1Q6P1J6 1458 aa27.38■■□□□ 1.97
VAMP4-204ENST00000482519 DIP2BQ9P265 1576 aa27.37■■□□□ 1.97
VAMP4-204ENST00000482519 ASXL2Q76L83 1435 aa27.35■■□□□ 1.97
VAMP4-204ENST00000482519 UBTFP17480 764 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
VAMP4-204ENST00000482519 KDM5BQ9UGL1 1544 aa27.32■■□□□ 1.96
VAMP4-204ENST00000482519 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
VAMP4-204ENST00000482519 SAMD9Q5K651 1589 aa27.31■■□□□ 1.96
VAMP4-204ENST00000482519 ABCA8O94911 1581 aa27.28■■□□□ 1.96
VAMP4-204ENST00000482519 TSPOAP1O95153 1857 aa27.25■■□□□ 1.95
VAMP4-204ENST00000482519 ARID3CA6NKF2 412 aa27.25■■□□□ 1.95
VAMP4-204ENST00000482519 FHOD3Q2V2M9 1422 aa27.21■■□□□ 1.95
VAMP4-204ENST00000482519 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
VAMP4-204ENST00000482519 WDR7Q9Y4E6 1490 aa27.15■■□□□ 1.94
VAMP4-204ENST00000482519 GLI2P10070 1586 aa27.14■■□□□ 1.94
VAMP4-204ENST00000482519 KCNH8Q96L42 1107 aa27.14■■□□□ 1.94
VAMP4-204ENST00000482519 EFCAB5A4FU69 1503 aa27.14■■□□□ 1.94
VAMP4-204ENST00000482519 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa27.12■■□□□ 1.93
VAMP4-204ENST00000482519 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
VAMP4-204ENST00000482519 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
VAMP4-204ENST00000482519 ATP10BO94823 1461 aa27.09■■□□□ 1.93
VAMP4-204ENST00000482519 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa27.04■■□□□ 1.92
VAMP4-204ENST00000482519 KDM6BO15054 1643 aa27.03■■□□□ 1.92
VAMP4-204ENST00000482519 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
VAMP4-204ENST00000482519 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
VAMP4-204ENST00000482519 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa27■■□□□ 1.91
VAMP4-204ENST00000482519 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
VAMP4-204ENST00000482519 TEX14Q8IWB6 1497 aa26.95■■□□□ 1.91
VAMP4-204ENST00000482519 CD109Q6YHK3 1445 aa26.95■■□□□ 1.9
VAMP4-204ENST00000482519 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.93■■□□□ 1.9
VAMP4-204ENST00000482519 FMN1Q68DA7 1419 aa26.92■■□□□ 1.9
VAMP4-204ENST00000482519 PLEKHD1A6NEE1 506 aa26.9■■□□□ 1.9
VAMP4-204ENST00000482519 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
VAMP4-204ENST00000482519 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa26.85■■□□□ 1.89
VAMP4-204ENST00000482519 HECW1Q76N89 1606 aa26.83■■□□□ 1.88
VAMP4-204ENST00000482519 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
VAMP4-204ENST00000482519 ABCA9Q8IUA7 1624 aa26.81■■□□□ 1.88
VAMP4-204ENST00000482519 CLIP1P30622 1438 aa26.8■■□□□ 1.88
VAMP4-204ENST00000482519 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
VAMP4-204ENST00000482519 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
VAMP4-204ENST00000482519 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
VAMP4-204ENST00000482519 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.68■■□□□ 1.86
VAMP4-204ENST00000482519 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.68■■□□□ 1.86
VAMP4-204ENST00000482519 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP26.68■■□□□ 1.86
VAMP4-204ENST00000482519 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.66■■□□□ 1.86
VAMP4-204ENST00000482519 TTC37Q6PGP7 1564 aa26.65■■□□□ 1.86
VAMP4-204ENST00000482519 ARAP3Q8WWN8 1544 aa26.63■■□□□ 1.85
VAMP4-204ENST00000482519 NEO1Q92859 1461 aa26.62■■□□□ 1.85
VAMP4-204ENST00000482519 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.62■■□□□ 1.85
VAMP4-204ENST00000482519 CEP162Q5TB80 1403 aa26.61■■□□□ 1.85
VAMP4-204ENST00000482519 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.6■■□□□ 1.85
VAMP4-204ENST00000482519 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.6■■□□□ 1.85
VAMP4-204ENST00000482519 RAPGEF3O95398 923 aa26.59■■□□□ 1.85
VAMP4-204ENST00000482519 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
VAMP4-204ENST00000482519 FANCAO15360 1455 aa26.57■■□□□ 1.84
VAMP4-204ENST00000482519 KIF14Q15058 1648 aa26.57■■□□□ 1.84
VAMP4-204ENST00000482519 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa26.54■■□□□ 1.84
VAMP4-204ENST00000482519 AKNAQ7Z591 1439 aa26.54■■□□□ 1.84
VAMP4-204ENST00000482519 CFAP74Q9C0B2 1584 aa26.53■■□□□ 1.84
VAMP4-204ENST00000482519 PLCH2O75038 1416 aa26.52■■□□□ 1.84
VAMP4-204ENST00000482519 MYO5CQ9NQX4 1742 aa26.51■■□□□ 1.83
VAMP4-204ENST00000482519 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
VAMP4-204ENST00000482519 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.46■■□□□ 1.83
VAMP4-204ENST00000482519 ADGRL1O94910 1474 aa26.46■■□□□ 1.83
VAMP4-204ENST00000482519 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa26.45■■□□□ 1.82
VAMP4-204ENST00000482519 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.43■■□□□ 1.82
VAMP4-204ENST00000482519 SCAPERQ9BY12 1400 aa26.4■■□□□ 1.82
VAMP4-204ENST00000482519 RICTORQ6R327 1708 aa26.4■■□□□ 1.82
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