RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481655.2

CTCFL-210, Transcript of CCCTC-binding factor like, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTCFL, Length 1,512 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTCFL-210ENST00000481655 CHD1O14646 1710 aa24.07■■□□□ 1.44
CTCFL-210ENST00000481655 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.02■■□□□ 1.44
CTCFL-210ENST00000481655 CEP170Q5SW79 1584 aa24.01■■□□□ 1.43
CTCFL-210ENST00000481655 OSCARQ8IYS5 282 aa24■■□□□ 1.43
CTCFL-210ENST00000481655 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.97■■□□□ 1.43
CTCFL-210ENST00000481655 IQGAP2Q13576 1575 aa23.96■■□□□ 1.43
CTCFL-210ENST00000481655 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
CTCFL-210ENST00000481655 CEP162Q5TB80 1403 aa23.9■■□□□ 1.42
CTCFL-210ENST00000481655 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.88■■□□□ 1.41
CTCFL-210ENST00000481655 JPH4Q96JJ6 628 aa23.88■■□□□ 1.41
CTCFL-210ENST00000481655 CLIP1P30622 1438 aa23.87■■□□□ 1.41
CTCFL-210ENST00000481655 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.84■■□□□ 1.41
CTCFL-210ENST00000481655 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.82■■□□□ 1.4
CTCFL-210ENST00000481655 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa23.8■■□□□ 1.4
CTCFL-210ENST00000481655 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
CTCFL-210ENST00000481655 SHROOM2Q13796 1616 aa23.75■■□□□ 1.39
CTCFL-210ENST00000481655 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.75■■□□□ 1.39
CTCFL-210ENST00000481655 SAMD9Q5K651 1589 aa23.74■■□□□ 1.39
CTCFL-210ENST00000481655 DISP1Q96F81 1524 aa23.72■■□□□ 1.39
CTCFL-210ENST00000481655 P3H3Q8IVL6 736 aa23.71■■□□□ 1.39
CTCFL-210ENST00000481655 KIAA0556O60303 1618 aa23.7■■□□□ 1.38
CTCFL-210ENST00000481655 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.67■■□□□ 1.38
CTCFL-210ENST00000481655 ARAP1Q96P48 1450 aa23.65■■□□□ 1.38
CTCFL-210ENST00000481655 FMN1Q68DA7 1419 aa23.62■■□□□ 1.37
CTCFL-210ENST00000481655 PTPRGP23470 1445 aa23.59■■□□□ 1.37
CTCFL-210ENST00000481655 VPS8Q8N3P4 1428 aa23.58■■□□□ 1.37
CTCFL-210ENST00000481655 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.57■■□□□ 1.36
CTCFL-210ENST00000481655 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
CTCFL-210ENST00000481655 ARHGEF11O15085 1522 aa23.54■■□□□ 1.36
CTCFL-210ENST00000481655 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.47■■□□□ 1.35
CTCFL-210ENST00000481655 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.45■■□□□ 1.34
CTCFL-210ENST00000481655 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
CTCFL-210ENST00000481655 APLP2Q06481 763 aa23.43■■□□□ 1.34
CTCFL-210ENST00000481655 UACAQ9BZF9 1416 aa23.43■■□□□ 1.34
CTCFL-210ENST00000481655 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.43■■□□□ 1.34
CTCFL-210ENST00000481655 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.43■■□□□ 1.34
CTCFL-210ENST00000481655 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.43■■□□□ 1.34
CTCFL-210ENST00000481655 PLB1Q6P1J6 1458 aa23.42■■□□□ 1.34
CTCFL-210ENST00000481655 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
CTCFL-210ENST00000481655 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa23.39■■□□□ 1.34
CTCFL-210ENST00000481655 ABCA8O94911 1581 aa23.39■■□□□ 1.34
CTCFL-210ENST00000481655 HECW1Q76N89 1606 aa23.39■■□□□ 1.33
CTCFL-210ENST00000481655 ABCC2Q92887 1545 aa23.35■■□□□ 1.33
CTCFL-210ENST00000481655 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa23.35■■□□□ 1.33
CTCFL-210ENST00000481655 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.34■■□□□ 1.33
CTCFL-210ENST00000481655 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.34■■□□□ 1.33
CTCFL-210ENST00000481655 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
CTCFL-210ENST00000481655 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
CTCFL-210ENST00000481655 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
CTCFL-210ENST00000481655 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
CTCFL-210ENST00000481655 MAP3K1Q13233 1512 aa23.28■■□□□ 1.32
CTCFL-210ENST00000481655 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
CTCFL-210ENST00000481655 ARID3CA6NKF2 412 aa23.27■■□□□ 1.32
CTCFL-210ENST00000481655 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP23.27■■□□□ 1.32
CTCFL-210ENST00000481655 ADCY10Q96PN6 1610 aa23.24■■□□□ 1.31
CTCFL-210ENST00000481655 ATP10BO94823 1461 aa23.23■■□□□ 1.31
CTCFL-210ENST00000481655 TIAM1Q13009 1591 aa23.22■■□□□ 1.31
CTCFL-210ENST00000481655 KDM5BQ9UGL1 1544 aa23.22■■□□□ 1.31
CTCFL-210ENST00000481655 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
CTCFL-210ENST00000481655 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.18■■□□□ 1.3
CTCFL-210ENST00000481655 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.18■■□□□ 1.3
CTCFL-210ENST00000481655 PLEKHD1A6NEE1 506 aa23.18■■□□□ 1.3
CTCFL-210ENST00000481655 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa23.15■■□□□ 1.3
CTCFL-210ENST00000481655 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
CTCFL-210ENST00000481655 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.14■■□□□ 1.29
CTCFL-210ENST00000481655 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
CTCFL-210ENST00000481655 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa23.11■■□□□ 1.29
CTCFL-210ENST00000481655 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
CTCFL-210ENST00000481655 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
CTCFL-210ENST00000481655 ASXL2Q76L83 1435 aa23.05■■□□□ 1.28
CTCFL-210ENST00000481655 WDR7Q9Y4E6 1490 aa23.05■■□□□ 1.28
CTCFL-210ENST00000481655 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa23.04■■□□□ 1.28
CTCFL-210ENST00000481655 MAPKBP1O60336 1514 aa23.03■■□□□ 1.28
CTCFL-210ENST00000481655 KCNH8Q96L42 1107 aa22.99■■□□□ 1.27
CTCFL-210ENST00000481655 KIF14Q15058 1648 aa22.99■■□□□ 1.27
CTCFL-210ENST00000481655 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
CTCFL-210ENST00000481655 NCOA2Q15596 1464 aa22.97■■□□□ 1.27
CTCFL-210ENST00000481655 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.92■■□□□ 1.26
CTCFL-210ENST00000481655 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.88■■□□□ 1.25
CTCFL-210ENST00000481655 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.87■■□□□ 1.25
CTCFL-210ENST00000481655 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.86■■□□□ 1.253e-12■■■■■ 30.2
CTCFL-210ENST00000481655 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.86■■□□□ 1.25
CTCFL-210ENST00000481655 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
CTCFL-210ENST00000481655 FAM69CQ0P6D2 419 aa22.82■■□□□ 1.24
CTCFL-210ENST00000481655 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
CTCFL-210ENST00000481655 ABCA9Q8IUA7 1624 aa22.82■■□□□ 1.24
CTCFL-210ENST00000481655 GLI2P10070 1586 aa22.81■■□□□ 1.24
CTCFL-210ENST00000481655 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.81■■□□□ 1.24
CTCFL-210ENST00000481655 MIA2Q96PC5 1412 aa22.81■■□□□ 1.24
CTCFL-210ENST00000481655 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.79■■□□□ 1.24
CTCFL-210ENST00000481655 DIP2BQ9P265 1576 aa22.79■■□□□ 1.24
CTCFL-210ENST00000481655 CD109Q6YHK3 1445 aa22.79■■□□□ 1.24
CTCFL-210ENST00000481655 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.79■■□□□ 1.24
CTCFL-210ENST00000481655 PLCH2O75038 1416 aa22.78■■□□□ 1.24
CTCFL-210ENST00000481655 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
CTCFL-210ENST00000481655 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22.75■■□□□ 1.23
CTCFL-210ENST00000481655 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
CTCFL-210ENST00000481655 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.75■■□□□ 1.23
CTCFL-210ENST00000481655 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.75■■□□□ 1.23
CTCFL-210ENST00000481655 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22.74■■□□□ 1.23
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