RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481211.1

NISCH-208, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 557 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-208ENST00000481211 TNIKQ9UKE5 1360 aa21.15■□□□□ 0.98
NISCH-208ENST00000481211 UBTFP17480 764 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
NISCH-208ENST00000481211 OSCARQ8IYS5 282 aa21.13■□□□□ 0.97
NISCH-208ENST00000481211 IQGAP2Q13576 1575 aa21.1■□□□□ 0.97
NISCH-208ENST00000481211 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.1■□□□□ 0.97
NISCH-208ENST00000481211 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa21.06■□□□□ 0.96
NISCH-208ENST00000481211 UGGT2Q9NYU1 1516 aa21.04■□□□□ 0.96
NISCH-208ENST00000481211 EHMT2Q96KQ7 1210 aa21.03■□□□□ 0.96
NISCH-208ENST00000481211 SHROOM2Q13796 1616 aa21.02■□□□□ 0.96
NISCH-208ENST00000481211 EFCAB5A4FU69 1503 aa20.99■□□□□ 0.95
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NISCH-208ENST00000481211 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa20.95■□□□□ 0.94
NISCH-208ENST00000481211 CEP162Q5TB80 1403 aa20.94■□□□□ 0.94
NISCH-208ENST00000481211 SAMD9Q5K651 1589 aa20.93■□□□□ 0.94
NISCH-208ENST00000481211 CLIP1P30622 1438 aa20.92■□□□□ 0.94
NISCH-208ENST00000481211 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.94
NISCH-208ENST00000481211 KIAA0556O60303 1618 aa20.89■□□□□ 0.93
NISCH-208ENST00000481211 DISP1Q96F81 1524 aa20.88■□□□□ 0.93
NISCH-208ENST00000481211 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa20.87■□□□□ 0.93
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NISCH-208ENST00000481211 ERCC6L2Q5T890 1561 aa20.76■□□□□ 0.91
NISCH-208ENST00000481211 PTPRGP23470 1445 aa20.73■□□□□ 0.91
NISCH-208ENST00000481211 P3H3Q8IVL6 736 aa20.71■□□□□ 0.91
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NISCH-208ENST00000481211 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa20.71■□□□□ 0.91
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NISCH-208ENST00000481211 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa20.62■□□□□ 0.89
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NISCH-208ENST00000481211 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa20.62■□□□□ 0.89
NISCH-208ENST00000481211 HECW1Q76N89 1606 aa20.6■□□□□ 0.89
NISCH-208ENST00000481211 ABCC2Q92887 1545 aa20.59■□□□□ 0.89
NISCH-208ENST00000481211 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
NISCH-208ENST00000481211 PLB1Q6P1J6 1458 aa20.58■□□□□ 0.89
NISCH-208ENST00000481211 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
NISCH-208ENST00000481211 CCDC18Q5T9S5 1454 aa20.55■□□□□ 0.88
NISCH-208ENST00000481211 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
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NISCH-208ENST00000481211 ADCY10Q96PN6 1610 aa20.5■□□□□ 0.87
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NISCH-208ENST00000481211 KDM5BQ9UGL1 1544 aa20.49■□□□□ 0.87
NISCH-208ENST00000481211 CYB5RLQ6IPT4 315 aa20.49■□□□□ 0.87
NISCH-208ENST00000481211 APLP2Q06481 763 aa20.46■□□□□ 0.87
NISCH-208ENST00000481211 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
NISCH-208ENST00000481211 CFAP43Q8NDM7 1665 aa20.44■□□□□ 0.86
NISCH-208ENST00000481211 ATP10BO94823 1461 aa20.43■□□□□ 0.86
NISCH-208ENST00000481211 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP20.43■□□□□ 0.86
NISCH-208ENST00000481211 TIAM1Q13009 1591 aa20.42■□□□□ 0.86
NISCH-208ENST00000481211 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
NISCH-208ENST00000481211 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa20.41■□□□□ 0.86
NISCH-208ENST00000481211 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
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NISCH-208ENST00000481211 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
NISCH-208ENST00000481211 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
NISCH-208ENST00000481211 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa20.34■□□□□ 0.85
NISCH-208ENST00000481211 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa20.33■□□□□ 0.85
NISCH-208ENST00000481211 PLEKHD1A6NEE1 506 aa20.33■□□□□ 0.85
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NISCH-208ENST00000481211 MTUS2Q5JR59 1369 aa20.32■□□□□ 0.84
NISCH-208ENST00000481211 WDR7Q9Y4E6 1490 aa20.3■□□□□ 0.84
NISCH-208ENST00000481211 ARID3CA6NKF2 412 aa20.3■□□□□ 0.84
NISCH-208ENST00000481211 ASXL2Q76L83 1435 aa20.28■□□□□ 0.84
NISCH-208ENST00000481211 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa20.26■□□□□ 0.83
NISCH-208ENST00000481211 KIF14Q15058 1648 aa20.24■□□□□ 0.83
NISCH-208ENST00000481211 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
NISCH-208ENST00000481211 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
NISCH-208ENST00000481211 NCOA2Q15596 1464 aa20.18■□□□□ 0.82
NISCH-208ENST00000481211 GLI2P10070 1586 aa20.17■□□□□ 0.82
NISCH-208ENST00000481211 ABCC10Q5T3U5 1492 aa20.16■□□□□ 0.82
NISCH-208ENST00000481211 ABCA9Q8IUA7 1624 aa20.15■□□□□ 0.82
NISCH-208ENST00000481211 DIP2BQ9P265 1576 aa20.13■□□□□ 0.81
NISCH-208ENST00000481211 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP20.13■□□□□ 0.81
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NISCH-208ENST00000481211 ITSN2Q9NZM3 1697 aa20.11■□□□□ 0.81
NISCH-208ENST00000481211 ARAP3Q8WWN8 1544 aa20.11■□□□□ 0.81
NISCH-208ENST00000481211 CCNB3Q8WWL7 1395 aa20.1■□□□□ 0.81
NISCH-208ENST00000481211 TTC37Q6PGP7 1564 aa20.09■□□□□ 0.81
NISCH-208ENST00000481211 MYOM3Q5VTT5 1437 aa20.08■□□□□ 0.8
NISCH-208ENST00000481211 MYO5CQ9NQX4 1742 aa20.07■□□□□ 0.8
NISCH-208ENST00000481211 MIA2Q96PC5 1412 aa20.07■□□□□ 0.8
NISCH-208ENST00000481211 PREX2Q70Z35 1606 aa20.06■□□□□ 0.8
NISCH-208ENST00000481211 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa20.06■□□□□ 0.8
NISCH-208ENST00000481211 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
NISCH-208ENST00000481211 PLCH2O75038 1416 aa20.05■□□□□ 0.8
NISCH-208ENST00000481211 PHLDB1Q86UU1 1377 aa20.05■□□□□ 0.8
NISCH-208ENST00000481211 FAM69CQ0P6D2 419 aa20.04■□□□□ 0.8
NISCH-208ENST00000481211 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
NISCH-208ENST00000481211 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa20.04■□□□□ 0.8
NISCH-208ENST00000481211 CD109Q6YHK3 1445 aa20.03■□□□□ 0.8
NISCH-208ENST00000481211 KIF13AQ9H1H9 1805 aa20.02■□□□□ 0.8
NISCH-208ENST00000481211 CFAP74Q9C0B2 1584 aa20.01■□□□□ 0.79
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