RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480232.5

GNAS-237, Transcript of GNAS complex locus, humanhuman

TSL 5

Gene GNAS, Length 893 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNAS-237ENST00000480232 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP42.66■■■■■ 4.42
GNAS-237ENST00000480232 JPH4Q96JJ6 628 aa42.64■■■■■ 4.42
GNAS-237ENST00000480232 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa42.61■■■■■ 4.41
GNAS-237ENST00000480232 TRHP20396 242 aaPredicted RBP42.56■■■■■ 4.4
GNAS-237ENST00000480232 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.41■■■■■ 4.38
GNAS-237ENST00000480232 IQGAP2Q13576 1575 aa42.37■■■■■ 4.37
GNAS-237ENST00000480232 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa42.22■■■■■ 4.35
GNAS-237ENST00000480232 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa42.16■■■■■ 4.34
GNAS-237ENST00000480232 ADCY10Q96PN6 1610 aa42.13■■■■■ 4.33
GNAS-237ENST00000480232 TNIKQ9UKE5 1360 aa42.08■■■■■ 4.33
GNAS-237ENST00000480232 PTPRGP23470 1445 aa42.08■■■■■ 4.33
GNAS-237ENST00000480232 PRXQ9BXM0 1461 aa42.08■■■■■ 4.33
GNAS-237ENST00000480232 UGGT2Q9NYU1 1516 aa42.08■■■■■ 4.33
GNAS-237ENST00000480232 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP42.07■■■■■ 4.33
GNAS-237ENST00000480232 DISP1Q96F81 1524 aa42.01■■■■■ 4.32
GNAS-237ENST00000480232 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP41.97■■■■■ 4.31
GNAS-237ENST00000480232 MAPKBP1O60336 1514 aa41.97■■■■■ 4.31
GNAS-237ENST00000480232 EEA1Q15075 1411 aa41.96■■■■■ 4.31
GNAS-237ENST00000480232 KIAA0556O60303 1618 aa41.96■■■■■ 4.31
GNAS-237ENST00000480232 KIF13AQ9H1H9 1805 aa41.96■■■■■ 4.31
GNAS-237ENST00000480232 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.89■■■■■ 4.3
GNAS-237ENST00000480232 GOLGA3Q08378 1498 aa41.85■■■■■ 4.29
GNAS-237ENST00000480232 ABCC2Q92887 1545 aa41.81■■■■■ 4.28
GNAS-237ENST00000480232 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa41.8■■■■■ 4.28
GNAS-237ENST00000480232 ABCC10Q5T3U5 1492 aa41.8■■■■■ 4.28
GNAS-237ENST00000480232 UACAQ9BZF9 1416 aa41.79■■■■■ 4.28
GNAS-237ENST00000480232 DIP2BQ9P265 1576 aa41.77■■■■■ 4.28
GNAS-237ENST00000480232 FAM69CQ0P6D2 419 aa41.7■■■■■ 4.27
GNAS-237ENST00000480232 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.64■■■■■ 4.26
GNAS-237ENST00000480232 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.64■■■■■ 4.26
GNAS-237ENST00000480232 PLB1Q6P1J6 1458 aa41.6■■■■■ 4.25
GNAS-237ENST00000480232 KIF21BO75037 1637 aa41.59■■■■■ 4.25
GNAS-237ENST00000480232 KDM5BQ9UGL1 1544 aa41.59■■■■■ 4.25
GNAS-237ENST00000480232 ASXL2Q76L83 1435 aa41.57■■■■■ 4.25
GNAS-237ENST00000480232 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP41.57■■■■■ 4.25
GNAS-237ENST00000480232 TSPOAP1O95153 1857 aa41.51■■■■■ 4.24
GNAS-237ENST00000480232 ABCA8O94911 1581 aa41.5■■■■■ 4.23
GNAS-237ENST00000480232 SAMD9Q5K651 1589 aa41.5■■■■■ 4.23
GNAS-237ENST00000480232 GLI2P10070 1586 aa41.43■■■■■ 4.22
GNAS-237ENST00000480232 P3H3Q8IVL6 736 aa41.38■■■■■ 4.21
GNAS-237ENST00000480232 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP41.33■■■■■ 4.21
GNAS-237ENST00000480232 WDR7Q9Y4E6 1490 aa41.31■■■■■ 4.2
GNAS-237ENST00000480232 KDM6BO15054 1643 aa41.28■■■■■ 4.2
GNAS-237ENST00000480232 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP41.27■■■■■ 4.2
GNAS-237ENST00000480232 EFCAB5A4FU69 1503 aa41.26■■■■■ 4.2
GNAS-237ENST00000480232 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa41.25■■■■■ 4.19
GNAS-237ENST00000480232 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa41.24■■■■■ 4.19
GNAS-237ENST00000480232 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP41.23■■■■■ 4.19
GNAS-237ENST00000480232 FHOD3Q2V2M9 1422 aa41.18■■■■■ 4.18
GNAS-237ENST00000480232 UBTFP17480 764 aaKnown RBP41.17■■■■■ 4.18
GNAS-237ENST00000480232 EHMT2Q96KQ7 1210 aa41.13■■■■■ 4.17
GNAS-237ENST00000480232 TEX14Q8IWB6 1497 aa41.11■■■■■ 4.17
GNAS-237ENST00000480232 CFAP43Q8NDM7 1665 aa41.1■■■■■ 4.17
GNAS-237ENST00000480232 ATP10BO94823 1461 aa41.09■■■■■ 4.17
GNAS-237ENST00000480232 ARID3CA6NKF2 412 aa41.08■■■■■ 4.17
GNAS-237ENST00000480232 KCNH8Q96L42 1107 aa41.02■■■■■ 4.16
GNAS-237ENST00000480232 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP41■■■■■ 4.15
GNAS-237ENST00000480232 CD109Q6YHK3 1445 aa40.96■■■■■ 4.15
GNAS-237ENST00000480232 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP40.94■■■■■ 4.14
GNAS-237ENST00000480232 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP40.94■■■■■ 4.14
GNAS-237ENST00000480232 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa40.92■■■■■ 4.14
GNAS-237ENST00000480232 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa40.87■■■■■ 4.13
GNAS-237ENST00000480232 ABCA9Q8IUA7 1624 aa40.85■■■■■ 4.13
GNAS-237ENST00000480232 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP40.85■■■■■ 4.13
GNAS-237ENST00000480232 FMN1Q68DA7 1419 aa40.84■■■■■ 4.13
GNAS-237ENST00000480232 HECW1Q76N89 1606 aa40.78■■■■■ 4.12
GNAS-237ENST00000480232 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP40.77■■■■■ 4.12
GNAS-237ENST00000480232 PLEKHD1A6NEE1 506 aa40.72■■■■■ 4.11
GNAS-237ENST00000480232 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP40.68■■■■■ 4.1
GNAS-237ENST00000480232 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP40.63■■■■■ 4.09
GNAS-237ENST00000480232 PHLDB1Q86UU1 1377 aa40.59■■■■■ 4.09
GNAS-237ENST00000480232 ARAP3Q8WWN8 1544 aa40.57■■■■■ 4.09
GNAS-237ENST00000480232 NEO1Q92859 1461 aa40.56■■■■■ 4.08
GNAS-237ENST00000480232 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP40.52■■■■■ 4.083e-7■■■□□ 16.6
GNAS-237ENST00000480232 TTC37Q6PGP7 1564 aa40.5■■■■■ 4.07
GNAS-237ENST00000480232 CFAP74Q9C0B2 1584 aa40.5■■■■■ 4.07
GNAS-237ENST00000480232 CLIP1P30622 1438 aa40.49■■■■■ 4.07
GNAS-237ENST00000480232 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP40.48■■■■■ 4.07
GNAS-237ENST00000480232 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP40.48■■■■■ 4.07
GNAS-237ENST00000480232 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa40.47■■■■■ 4.07
GNAS-237ENST00000480232 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa40.43■■■■■ 4.06
GNAS-237ENST00000480232 CCDC18Q5T9S5 1454 aa40.4■■■■■ 4.06
GNAS-237ENST00000480232 KIF14Q15058 1648 aa40.39■■■■■ 4.06
GNAS-237ENST00000480232 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa40.38■■■■■ 4.05
GNAS-237ENST00000480232 FANCAO15360 1455 aa40.38■■■■■ 4.05
GNAS-237ENST00000480232 ADGRL1O94910 1474 aa40.36■■■■■ 4.05
GNAS-237ENST00000480232 FYCO1Q9BQS8 1478 aa40.36■■■■■ 4.05
GNAS-237ENST00000480232 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP40.35■■■■■ 4.05
GNAS-237ENST00000480232 MYO5CQ9NQX4 1742 aa40.35■■■■■ 4.05
GNAS-237ENST00000480232 AKNAQ7Z591 1439 aa40.31■■■■■ 4.04
GNAS-237ENST00000480232 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa40.29■■■■■ 4.04
GNAS-237ENST00000480232 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP40.26■■■■■ 4.04
GNAS-237ENST00000480232 RAPGEF3O95398 923 aa40.26■■■■■ 4.04
GNAS-237ENST00000480232 PLCH2O75038 1416 aa40.25■■■■■ 4.03
GNAS-237ENST00000480232 RICTORQ6R327 1708 aa40.25■■■■■ 4.03
GNAS-237ENST00000480232 CEP162Q5TB80 1403 aa40.18■■■■■ 4.02
GNAS-237ENST00000480232 ARHGAP5Q13017 1502 aa40.11■■■■■ 4.01
GNAS-237ENST00000480232 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa40.11■■■■■ 4.01
GNAS-237ENST00000480232 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa40.11■■■■■ 4.01
GNAS-237ENST00000480232 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa40.1■■■■■ 4.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.3 ms