RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479480.5

CTPS1-208, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTPS1, Length 777 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-208ENST00000479480 NUP160Q12769 1436 aa15.17■□□□□ 0.02
CTPS1-208ENST00000479480 CEP170Q5SW79 1584 aa15.15■□□□□ 0.02
CTPS1-208ENST00000479480 FHAD1B1AJZ9 1412 aa15.14■□□□□ 0.01
CTPS1-208ENST00000479480 JPH4Q96JJ6 628 aa15.13■□□□□ 0.01
CTPS1-208ENST00000479480 ADAMTS12P58397 1594 aa15.11■□□□□ 0.01
CTPS1-208ENST00000479480 TOP2BQ02880 1626 aa15.09■□□□□ 0.01
CTPS1-208ENST00000479480 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
CTPS1-208ENST00000479480 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
CTPS1-208ENST00000479480 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa15.05■□□□□ -0
CTPS1-208ENST00000479480 SHROOM2Q13796 1616 aa15.04■□□□□ -0
CTPS1-208ENST00000479480 ERICH3Q5RHP9 1530 aa15.04■□□□□ -0
CTPS1-208ENST00000479480 NPM3O75607 178 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
CTPS1-208ENST00000479480 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
CTPS1-208ENST00000479480 FAM69CQ0P6D2 419 aa15.01□□□□□ -0.01
CTPS1-208ENST00000479480 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
CTPS1-208ENST00000479480 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa14.99□□□□□ -0.01
CTPS1-208ENST00000479480 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP14.97□□□□□ -0.01
CTPS1-208ENST00000479480 IGF1RP08069 1367 aa14.97□□□□□ -0.01
CTPS1-208ENST00000479480 ABCC10Q5T3U5 1492 aa14.92□□□□□ -0.02
CTPS1-208ENST00000479480 KIF13AQ9H1H9 1805 aa14.9□□□□□ -0.02
CTPS1-208ENST00000479480 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
CTPS1-208ENST00000479480 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa14.88□□□□□ -0.03
CTPS1-208ENST00000479480 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa14.88□□□□□ -0.03
CTPS1-208ENST00000479480 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa14.86□□□□□ -0.03
CTPS1-208ENST00000479480 KIF27Q86VH2 1401 aa14.85□□□□□ -0.03
CTPS1-208ENST00000479480 ADCY10Q96PN6 1610 aa14.84□□□□□ -0.03
CTPS1-208ENST00000479480 PTPRGP23470 1445 aa14.83□□□□□ -0.03
CTPS1-208ENST00000479480 MAPKBP1O60336 1514 aa14.83□□□□□ -0.04
CTPS1-208ENST00000479480 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa14.83□□□□□ -0.04
CTPS1-208ENST00000479480 DIP2BQ9P265 1576 aa14.81□□□□□ -0.04
CTPS1-208ENST00000479480 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
CTPS1-208ENST00000479480 TNIKQ9UKE5 1360 aa14.76□□□□□ -0.05
CTPS1-208ENST00000479480 EHMT2Q96KQ7 1210 aa14.74□□□□□ -0.05
CTPS1-208ENST00000479480 CUL7Q14999 1698 aa14.72□□□□□ -0.05
CTPS1-208ENST00000479480 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa14.72□□□□□ -0.05
CTPS1-208ENST00000479480 KDM6BO15054 1643 aa14.71□□□□□ -0.05
CTPS1-208ENST00000479480 ASXL2Q76L83 1435 aa14.71□□□□□ -0.05
CTPS1-208ENST00000479480 ABCC2Q92887 1545 aa14.71□□□□□ -0.06
CTPS1-208ENST00000479480 TSPOAP1O95153 1857 aa14.69□□□□□ -0.06
CTPS1-208ENST00000479480 DMRT2Q9Y5R5 561 aa14.69□□□□□ -0.06
CTPS1-208ENST00000479480 UACAQ9BZF9 1416 aa14.68□□□□□ -0.06
CTPS1-208ENST00000479480 DISP1Q96F81 1524 aa14.67□□□□□ -0.06
CTPS1-208ENST00000479480 PLB1Q6P1J6 1458 aa14.67□□□□□ -0.06
CTPS1-208ENST00000479480 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa14.66□□□□□ -0.06
CTPS1-208ENST00000479480 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
CTPS1-208ENST00000479480 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CTPS1-208ENST00000479480 IQGAP2Q13576 1575 aa14.64□□□□□ -0.07
CTPS1-208ENST00000479480 GLI2P10070 1586 aa14.62□□□□□ -0.07
CTPS1-208ENST00000479480 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa14.62□□□□□ -0.07
CTPS1-208ENST00000479480 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CTPS1-208ENST00000479480 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CTPS1-208ENST00000479480 KDM5BQ9UGL1 1544 aa14.6□□□□□ -0.07
CTPS1-208ENST00000479480 UGGT2Q9NYU1 1516 aa14.59□□□□□ -0.07
CTPS1-208ENST00000479480 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
CTPS1-208ENST00000479480 KCNH8Q96L42 1107 aa14.57□□□□□ -0.08
CTPS1-208ENST00000479480 ADGRL1O94910 1474 aa14.56□□□□□ -0.08
CTPS1-208ENST00000479480 CSRNP3Q8WYN3 585 aa14.55□□□□□ -0.08
CTPS1-208ENST00000479480 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
CTPS1-208ENST00000479480 KIAA0556O60303 1618 aa14.52□□□□□ -0.09
CTPS1-208ENST00000479480 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CTPS1-208ENST00000479480 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa14.5□□□□□ -0.09
CTPS1-208ENST00000479480 TEX14Q8IWB6 1497 aa14.5□□□□□ -0.09
CTPS1-208ENST00000479480 WDR7Q9Y4E6 1490 aa14.5□□□□□ -0.09
CTPS1-208ENST00000479480 ARID3CA6NKF2 412 aa14.49□□□□□ -0.09
CTPS1-208ENST00000479480 P3H3Q8IVL6 736 aa14.49□□□□□ -0.09
CTPS1-208ENST00000479480 CD109Q6YHK3 1445 aa14.49□□□□□ -0.09
CTPS1-208ENST00000479480 PRXQ9BXM0 1461 aa14.44□□□□□ -0.1
CTPS1-208ENST00000479480 ABCA8O94911 1581 aa14.43□□□□□ -0.1
CTPS1-208ENST00000479480 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa14.43□□□□□ -0.1
CTPS1-208ENST00000479480 GOLGA3Q08378 1498 aa14.43□□□□□ -0.1
CTPS1-208ENST00000479480 ZBTB22O15209 634 aa14.42□□□□□ -0.1
CTPS1-208ENST00000479480 ATP10BO94823 1461 aa14.39□□□□□ -0.11
CTPS1-208ENST00000479480 HECW2Q9P2P5 1572 aa14.38□□□□□ -0.11
CTPS1-208ENST00000479480 RAPGEF3O95398 923 aa14.36□□□□□ -0.11
CTPS1-208ENST00000479480 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa14.35□□□□□ -0.11
CTPS1-208ENST00000479480 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP14.34□□□□□ -0.11
CTPS1-208ENST00000479480 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP14.34□□□□□ -0.11
CTPS1-208ENST00000479480 CFAP43Q8NDM7 1665 aa14.33□□□□□ -0.11
CTPS1-208ENST00000479480 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP14.33□□□□□ -0.12
CTPS1-208ENST00000479480 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP14.33□□□□□ -0.12
CTPS1-208ENST00000479480 ARAP3Q8WWN8 1544 aa14.32□□□□□ -0.12
CTPS1-208ENST00000479480 PHLDB1Q86UU1 1377 aa14.28□□□□□ -0.12
CTPS1-208ENST00000479480 KIF21BO75037 1637 aa14.27□□□□□ -0.12
CTPS1-208ENST00000479480 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP14.25□□□□□ -0.13
CTPS1-208ENST00000479480 PLEKHD1A6NEE1 506 aa14.24□□□□□ -0.13
CTPS1-208ENST00000479480 PTPRMP28827 1452 aa14.24□□□□□ -0.13
CTPS1-208ENST00000479480 ABCA9Q8IUA7 1624 aa14.23□□□□□ -0.13
CTPS1-208ENST00000479480 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
CTPS1-208ENST00000479480 FHOD3Q2V2M9 1422 aa14.23□□□□□ -0.13
CTPS1-208ENST00000479480 NEO1Q92859 1461 aa14.22□□□□□ -0.13
CTPS1-208ENST00000479480 SAMD9Q5K651 1589 aa14.22□□□□□ -0.13
CTPS1-208ENST00000479480 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa14.2□□□□□ -0.14
CTPS1-208ENST00000479480 FBXO41Q8TF61 875 aa14.2□□□□□ -0.14
CTPS1-208ENST00000479480 ADAMTSL3P82987 1691 aa14.19□□□□□ -0.14
CTPS1-208ENST00000479480 FOXD4L1Q9NU39 408 aa14.18□□□□□ -0.14
CTPS1-208ENST00000479480 AKNAQ7Z591 1439 aa14.17□□□□□ -0.14
CTPS1-208ENST00000479480 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa14.17□□□□□ -0.14
CTPS1-208ENST00000479480 SLC4A2P04920 1241 aa14.16□□□□□ -0.14
CTPS1-208ENST00000479480 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP14.16□□□□□ -0.14
CTPS1-208ENST00000479480 HSPA2P54652 639 aa14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 150.7 ms