RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479480.5

CTPS1-208, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTPS1, Length 777 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-208ENST00000479480 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
CTPS1-208ENST00000479480 CHIC1Q5VXU3 224 aa21.5■■□□□ 1.03
CTPS1-208ENST00000479480 NISCHQ9Y2I1 1504 aa21.31■■□□□ 1
CTPS1-208ENST00000479480 ABCC9O60706 1549 aa19.41■□□□□ 0.7
CTPS1-208ENST00000479480 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP19.03■□□□□ 0.64
CTPS1-208ENST00000479480 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa19.03■□□□□ 0.64
CTPS1-208ENST00000479480 DNAJC5BQ9UF47 199 aa18.53■□□□□ 0.56
CTPS1-208ENST00000479480 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa18.27■□□□□ 0.52
CTPS1-208ENST00000479480 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
CTPS1-208ENST00000479480 DCAF8L2P0C7V8 631 aa18.24■□□□□ 0.51
CTPS1-208ENST00000479480 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP18.17■□□□□ 0.5
CTPS1-208ENST00000479480 NACADO15069 1562 aa18.12■□□□□ 0.49
CTPS1-208ENST00000479480 BICRAQ9NZM4 1560 aa17.82■□□□□ 0.44
CTPS1-208ENST00000479480 MYO15BQ96JP2 1530 aa17.8■□□□□ 0.44
CTPS1-208ENST00000479480 UNC13AQ9UPW8 1703 aa17.8■□□□□ 0.44
CTPS1-208ENST00000479480 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP17.59■□□□□ 0.41
CTPS1-208ENST00000479480 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa17.52■□□□□ 0.4
CTPS1-208ENST00000479480 PLPPR3Q6T4P5 718 aa17.51■□□□□ 0.39
CTPS1-208ENST00000479480 CECR2Q9BXF3 1484 aa17.47■□□□□ 0.39
CTPS1-208ENST00000479480 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa17.45■□□□□ 0.38
CTPS1-208ENST00000479480 SCRIBQ14160 1630 aa17.44■□□□□ 0.38
CTPS1-208ENST00000479480 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa17.43■□□□□ 0.38
CTPS1-208ENST00000479480 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
CTPS1-208ENST00000479480 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa17.05■□□□□ 0.32
CTPS1-208ENST00000479480 FOXD1Q16676 465 aa17■□□□□ 0.31
CTPS1-208ENST00000479480 NCAPD3P42695 1498 aa16.82■□□□□ 0.28
CTPS1-208ENST00000479480 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa16.75■□□□□ 0.27
CTPS1-208ENST00000479480 CUX2O14529 1486 aa16.7■□□□□ 0.26
CTPS1-208ENST00000479480 ERCC6Q03468 1493 aa16.7■□□□□ 0.26
CTPS1-208ENST00000479480 PPP6R1Q9UPN7 881 aa16.67■□□□□ 0.26
CTPS1-208ENST00000479480 NESP48681 1621 aa16.64■□□□□ 0.25
CTPS1-208ENST00000479480 SMARCA4P51532 1647 aa16.6■□□□□ 0.25
CTPS1-208ENST00000479480 ADRA2BP18089 450 aa16.6■□□□□ 0.25
CTPS1-208ENST00000479480 SMARCA2P51531 1590 aa16.59■□□□□ 0.25
CTPS1-208ENST00000479480 HMGXB3Q12766 1538 aa16.56■□□□□ 0.24
CTPS1-208ENST00000479480 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
CTPS1-208ENST00000479480 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
CTPS1-208ENST00000479480 MROH2BQ7Z745 1585 aa16.46■□□□□ 0.23
CTPS1-208ENST00000479480 PEG3Q9GZU2 1588 aa16.43■□□□□ 0.22
CTPS1-208ENST00000479480 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
CTPS1-208ENST00000479480 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa16.36■□□□□ 0.21
CTPS1-208ENST00000479480 PDS5BQ9NTI5 1447 aa16.35■□□□□ 0.21
CTPS1-208ENST00000479480 CADPSQ9ULU8 1353 aa16.33■□□□□ 0.2
CTPS1-208ENST00000479480 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa16.27■□□□□ 0.19
CTPS1-208ENST00000479480 TRIM41Q8WV44 630 aa16.24■□□□□ 0.19
CTPS1-208ENST00000479480 MRC2Q9UBG0 1479 aa16.2■□□□□ 0.18
CTPS1-208ENST00000479480 WIZO95785 1651 aa16.2■□□□□ 0.18
CTPS1-208ENST00000479480 WDR62O43379 1518 aa16.13■□□□□ 0.17
CTPS1-208ENST00000479480 FANCD2Q9BXW9 1451 aa16.1■□□□□ 0.17
CTPS1-208ENST00000479480 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
CTPS1-208ENST00000479480 CEP164Q9UPV0 1460 aa16.09■□□□□ 0.17
CTPS1-208ENST00000479480 CFTRP13569 1480 aa16.06■□□□□ 0.16
CTPS1-208ENST00000479480 OSCARQ8IYS5 282 aa16.05■□□□□ 0.16
CTPS1-208ENST00000479480 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
CTPS1-208ENST00000479480 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
CTPS1-208ENST00000479480 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
CTPS1-208ENST00000479480 CCDC88BA6NC98 1476 aa15.88■□□□□ 0.13
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
CTPS1-208ENST00000479480 IFT140Q96RY7 1462 aa15.79■□□□□ 0.12
CTPS1-208ENST00000479480 TOPBP1Q92547 1522 aa15.77■□□□□ 0.11
CTPS1-208ENST00000479480 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa15.73■□□□□ 0.11
CTPS1-208ENST00000479480 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa15.73■□□□□ 0.11
CTPS1-208ENST00000479480 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa15.73■□□□□ 0.11
CTPS1-208ENST00000479480 CYB5RLQ6IPT4 315 aa15.73■□□□□ 0.11
CTPS1-208ENST00000479480 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP15.71■□□□□ 0.11
CTPS1-208ENST00000479480 ARHGEF11O15085 1522 aa15.68■□□□□ 0.1
CTPS1-208ENST00000479480 FBLN2P98095 1184 aa15.68■□□□□ 0.1
CTPS1-208ENST00000479480 ABCC8Q09428 1581 aa15.67■□□□□ 0.1
CTPS1-208ENST00000479480 PRDM2Q13029 1718 aa15.65■□□□□ 0.1
CTPS1-208ENST00000479480 DNMBPQ6XZF7 1577 aa15.63■□□□□ 0.09
CTPS1-208ENST00000479480 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa15.62■□□□□ 0.09
CTPS1-208ENST00000479480 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
CTPS1-208ENST00000479480 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
CTPS1-208ENST00000479480 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
CTPS1-208ENST00000479480 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
CTPS1-208ENST00000479480 TRHP20396 242 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
CTPS1-208ENST00000479480 KCNA4P22459 653 aa15.58■□□□□ 0.08
CTPS1-208ENST00000479480 SOGA1O94964 1423 aa15.58■□□□□ 0.08
CTPS1-208ENST00000479480 ARAP1Q96P48 1450 aa15.55■□□□□ 0.08
CTPS1-208ENST00000479480 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa15.52■□□□□ 0.08
CTPS1-208ENST00000479480 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
CTPS1-208ENST00000479480 CHD1O14646 1710 aa15.51■□□□□ 0.07
CTPS1-208ENST00000479480 FGD5Q6ZNL6 1462 aa15.48■□□□□ 0.07
CTPS1-208ENST00000479480 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa15.47■□□□□ 0.07
CTPS1-208ENST00000479480 CUX1P39880 1505 aa15.44■□□□□ 0.06
CTPS1-208ENST00000479480 MSH5O43196 834 aa15.43■□□□□ 0.06
CTPS1-208ENST00000479480 CLASP1Q7Z460 1538 aa15.4■□□□□ 0.06
CTPS1-208ENST00000479480 GRIN2BQ13224 1484 aa15.4■□□□□ 0.06
CTPS1-208ENST00000479480 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
CTPS1-208ENST00000479480 SYNJ2O15056 1496 aa15.36■□□□□ 0.05
CTPS1-208ENST00000479480 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
CTPS1-208ENST00000479480 GAPVD1Q14C86 1478 aa15.34■□□□□ 0.05
CTPS1-208ENST00000479480 SYNJ1O43426 1573 aa15.33■□□□□ 0.05
CTPS1-208ENST00000479480 WDR97A6NE52 1622 aa15.32■□□□□ 0.04
CTPS1-208ENST00000479480 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa15.27■□□□□ 0.04
CTPS1-208ENST00000479480 ERCC6L2Q5T890 1561 aa15.23■□□□□ 0.03
CTPS1-208ENST00000479480 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP15.21■□□□□ 0.03
CTPS1-208ENST00000479480 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa15.21■□□□□ 0.02
CTPS1-208ENST00000479480 PBRM1Q86U86 1689 aa15.2■□□□□ 0.02
CTPS1-208ENST00000479480 GRIN2AQ12879 1464 aa15.2■□□□□ 0.02
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