RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478545.1

HIVEP1-204, Transcript of human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene HIVEP1, Length 576 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP1-204ENST00000478545 JPH4Q96JJ6 628 aa26.67■■□□□ 1.86
HIVEP1-204ENST00000478545 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa26.65■■□□□ 1.86
HIVEP1-204ENST00000478545 KIF21BO75037 1637 aa26.58■■□□□ 1.85
HIVEP1-204ENST00000478545 ARHGEF11O15085 1522 aa26.57■■□□□ 1.84
HIVEP1-204ENST00000478545 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.56■■□□□ 1.84
HIVEP1-204ENST00000478545 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.56■■□□□ 1.84
HIVEP1-204ENST00000478545 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.56■■□□□ 1.84
HIVEP1-204ENST00000478545 UBTFP17480 764 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
HIVEP1-204ENST00000478545 SHROOM2Q13796 1616 aa26.54■■□□□ 1.84
HIVEP1-204ENST00000478545 IQGAP2Q13576 1575 aa26.52■■□□□ 1.84
HIVEP1-204ENST00000478545 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
HIVEP1-204ENST00000478545 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.51■■□□□ 1.83
HIVEP1-204ENST00000478545 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.49■■□□□ 1.83
HIVEP1-204ENST00000478545 GOLGA3Q08378 1498 aa26.49■■□□□ 1.83
HIVEP1-204ENST00000478545 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.46■■□□□ 1.83
HIVEP1-204ENST00000478545 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
HIVEP1-204ENST00000478545 ARAP1Q96P48 1450 aa26.39■■□□□ 1.82
HIVEP1-204ENST00000478545 UGGT2Q9NYU1 1516 aa26.39■■□□□ 1.81
HIVEP1-204ENST00000478545 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa26.38■■□□□ 1.81
HIVEP1-204ENST00000478545 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.37■■□□□ 1.81
HIVEP1-204ENST00000478545 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
HIVEP1-204ENST00000478545 DISP1Q96F81 1524 aa26.34■■□□□ 1.81
HIVEP1-204ENST00000478545 P3H3Q8IVL6 736 aa26.33■■□□□ 1.81
HIVEP1-204ENST00000478545 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.29■■□□□ 1.8
HIVEP1-204ENST00000478545 PTPRGP23470 1445 aa26.27■■□□□ 1.8
HIVEP1-204ENST00000478545 KIAA0556O60303 1618 aa26.25■■□□□ 1.79
HIVEP1-204ENST00000478545 SAMD9Q5K651 1589 aa26.17■■□□□ 1.78
HIVEP1-204ENST00000478545 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.12■■□□□ 1.77
HIVEP1-204ENST00000478545 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.11■■□□□ 1.77
HIVEP1-204ENST00000478545 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.09■■□□□ 1.77
HIVEP1-204ENST00000478545 UACAQ9BZF9 1416 aa26.07■■□□□ 1.76
HIVEP1-204ENST00000478545 CLIP1P30622 1438 aa26.05■■□□□ 1.76
HIVEP1-204ENST00000478545 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP26.04■■□□□ 1.76
HIVEP1-204ENST00000478545 PLB1Q6P1J6 1458 aa26.03■■□□□ 1.76
HIVEP1-204ENST00000478545 ADCY10Q96PN6 1610 aa26.03■■□□□ 1.76
HIVEP1-204ENST00000478545 CEP162Q5TB80 1403 aa26■■□□□ 1.75
HIVEP1-204ENST00000478545 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa25.98■■□□□ 1.75
HIVEP1-204ENST00000478545 ABCA8O94911 1581 aa25.97■■□□□ 1.75
HIVEP1-204ENST00000478545 ABCC2Q92887 1545 aa25.96■■□□□ 1.75
HIVEP1-204ENST00000478545 ARID3CA6NKF2 412 aa25.93■■□□□ 1.74
HIVEP1-204ENST00000478545 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
HIVEP1-204ENST00000478545 FMN1Q68DA7 1419 aa25.91■■□□□ 1.74
HIVEP1-204ENST00000478545 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.9■■□□□ 1.74
HIVEP1-204ENST00000478545 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.86■■□□□ 1.73
HIVEP1-204ENST00000478545 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
HIVEP1-204ENST00000478545 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
HIVEP1-204ENST00000478545 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
HIVEP1-204ENST00000478545 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
HIVEP1-204ENST00000478545 ATP10BO94823 1461 aa25.82■■□□□ 1.72
HIVEP1-204ENST00000478545 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
HIVEP1-204ENST00000478545 ASXL2Q76L83 1435 aa25.77■■□□□ 1.72
HIVEP1-204ENST00000478545 MAPKBP1O60336 1514 aa25.76■■□□□ 1.71
HIVEP1-204ENST00000478545 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.75■■□□□ 1.71
HIVEP1-204ENST00000478545 HECW1Q76N89 1606 aa25.72■■□□□ 1.71
HIVEP1-204ENST00000478545 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
HIVEP1-204ENST00000478545 KCNH8Q96L42 1107 aa25.71■■□□□ 1.71
HIVEP1-204ENST00000478545 FAM69CQ0P6D2 419 aa25.7■■□□□ 1.7
HIVEP1-204ENST00000478545 PLEKHD1A6NEE1 506 aa25.69■■□□□ 1.7
HIVEP1-204ENST00000478545 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
HIVEP1-204ENST00000478545 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
HIVEP1-204ENST00000478545 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.67■■□□□ 1.7
HIVEP1-204ENST00000478545 ABCC10Q5T3U5 1492 aa25.66■■□□□ 1.7
HIVEP1-204ENST00000478545 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.65■■□□□ 1.7
HIVEP1-204ENST00000478545 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.65■■□□□ 1.7
HIVEP1-204ENST00000478545 WDR7Q9Y4E6 1490 aa25.65■■□□□ 1.7
HIVEP1-204ENST00000478545 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
HIVEP1-204ENST00000478545 KIF13AQ9H1H9 1805 aa25.6■■□□□ 1.69
HIVEP1-204ENST00000478545 DIP2BQ9P265 1576 aa25.59■■□□□ 1.69
HIVEP1-204ENST00000478545 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.58■■□□□ 1.69
HIVEP1-204ENST00000478545 GLI2P10070 1586 aa25.52■■□□□ 1.68
HIVEP1-204ENST00000478545 TSPOAP1O95153 1857 aa25.5■■□□□ 1.67
HIVEP1-204ENST00000478545 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
HIVEP1-204ENST00000478545 APLP2Q06481 763 aa25.48■■□□□ 1.67
HIVEP1-204ENST00000478545 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.44■■□□□ 1.66
HIVEP1-204ENST00000478545 CD109Q6YHK3 1445 aa25.44■■□□□ 1.66
HIVEP1-204ENST00000478545 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.44■■□□□ 1.66
HIVEP1-204ENST00000478545 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa25.41■■□□□ 1.66
HIVEP1-204ENST00000478545 TIAM1Q13009 1591 aa25.39■■□□□ 1.66
HIVEP1-204ENST00000478545 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.39■■□□□ 1.66
HIVEP1-204ENST00000478545 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP25.39■■□□□ 1.662e-6■■■□□ 14.9
HIVEP1-204ENST00000478545 ABCA9Q8IUA7 1624 aa25.39■■□□□ 1.66
HIVEP1-204ENST00000478545 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
HIVEP1-204ENST00000478545 KIF14Q15058 1648 aa25.37■■□□□ 1.65
HIVEP1-204ENST00000478545 MAP3K1Q13233 1512 aa25.37■■□□□ 1.65
HIVEP1-204ENST00000478545 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
HIVEP1-204ENST00000478545 TTC37Q6PGP7 1564 aa25.33■■□□□ 1.65
HIVEP1-204ENST00000478545 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.32■■□□□ 1.64
HIVEP1-204ENST00000478545 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.3■■□□□ 1.64
HIVEP1-204ENST00000478545 TEX14Q8IWB6 1497 aa25.28■■□□□ 1.64
HIVEP1-204ENST00000478545 PLCH2O75038 1416 aa25.27■■□□□ 1.64
HIVEP1-204ENST00000478545 MYO5CQ9NQX4 1742 aa25.23■■□□□ 1.63
HIVEP1-204ENST00000478545 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.23■■□□□ 1.63
HIVEP1-204ENST00000478545 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa25.23■■□□□ 1.63
HIVEP1-204ENST00000478545 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
HIVEP1-204ENST00000478545 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
HIVEP1-204ENST00000478545 NCOA2Q15596 1464 aa25.2■■□□□ 1.62
HIVEP1-204ENST00000478545 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
HIVEP1-204ENST00000478545 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25.19■■□□□ 1.62
HIVEP1-204ENST00000478545 FANCAO15360 1455 aa25.19■■□□□ 1.62
HIVEP1-204ENST00000478545 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms