RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478545.1

HIVEP1-204, Transcript of human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene HIVEP1, Length 576 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP1-204ENST00000478545 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.6■■■■□ 3.77
HIVEP1-204ENST00000478545 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa34.08■■■■□ 3.05
HIVEP1-204ENST00000478545 ABCC9O60706 1549 aa33.2■■■□□ 2.91
HIVEP1-204ENST00000478545 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.35■■■□□ 2.77
HIVEP1-204ENST00000478545 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.17■■■□□ 2.74
HIVEP1-204ENST00000478545 NACADO15069 1562 aa32.02■■■□□ 2.72
HIVEP1-204ENST00000478545 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.99■■■□□ 2.71
HIVEP1-204ENST00000478545 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.88■■■□□ 2.69
HIVEP1-204ENST00000478545 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.88■■■□□ 2.69
HIVEP1-204ENST00000478545 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.3■■■□□ 2.6
HIVEP1-204ENST00000478545 SCRIBQ14160 1630 aa31.23■■■□□ 2.59
HIVEP1-204ENST00000478545 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.17■■■□□ 2.58
HIVEP1-204ENST00000478545 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.02■■■□□ 2.56
HIVEP1-204ENST00000478545 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.83■■■□□ 2.53
HIVEP1-204ENST00000478545 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.28■■■□□ 2.44
HIVEP1-204ENST00000478545 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.17■■■□□ 2.42
HIVEP1-204ENST00000478545 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.09■■■□□ 2.41
HIVEP1-204ENST00000478545 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30■■■□□ 2.39
HIVEP1-204ENST00000478545 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.87■■■□□ 2.37
HIVEP1-204ENST00000478545 SMARCA4P51532 1647 aa29.86■■■□□ 2.37
HIVEP1-204ENST00000478545 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.78■■■□□ 2.36
HIVEP1-204ENST00000478545 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.66■■■□□ 2.34
HIVEP1-204ENST00000478545 SMARCA2P51531 1590 aa29.6■■■□□ 2.33
HIVEP1-204ENST00000478545 NCAPD3P42695 1498 aa29.57■■■□□ 2.32
HIVEP1-204ENST00000478545 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.56■■■□□ 2.32
HIVEP1-204ENST00000478545 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.52■■■□□ 2.32
HIVEP1-204ENST00000478545 WIZO95785 1651 aa29.49■■■□□ 2.31
HIVEP1-204ENST00000478545 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
HIVEP1-204ENST00000478545 HMGXB3Q12766 1538 aa29.39■■■□□ 2.3
HIVEP1-204ENST00000478545 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
HIVEP1-204ENST00000478545 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
HIVEP1-204ENST00000478545 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.86■■■□□ 2.21
HIVEP1-204ENST00000478545 NESP48681 1621 aa28.83■■■□□ 2.21
HIVEP1-204ENST00000478545 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.77■■■□□ 2.2
HIVEP1-204ENST00000478545 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.71■■■□□ 2.19
HIVEP1-204ENST00000478545 CFTRP13569 1480 aa28.62■■■□□ 2.17
HIVEP1-204ENST00000478545 ERCC6Q03468 1493 aa28.57■■■□□ 2.16
HIVEP1-204ENST00000478545 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.56■■■□□ 2.16
HIVEP1-204ENST00000478545 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.45■■■□□ 2.14
HIVEP1-204ENST00000478545 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.42■■■□□ 2.14
HIVEP1-204ENST00000478545 PRDM2Q13029 1718 aa28.4■■■□□ 2.14
HIVEP1-204ENST00000478545 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.34■■■□□ 2.13
HIVEP1-204ENST00000478545 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.22■■■□□ 2.11
HIVEP1-204ENST00000478545 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
HIVEP1-204ENST00000478545 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
HIVEP1-204ENST00000478545 CUX2O14529 1486 aa28.09■■■□□ 2.09
HIVEP1-204ENST00000478545 WDR62O43379 1518 aa28.08■■■□□ 2.09
HIVEP1-204ENST00000478545 ABCC8Q09428 1581 aa28■■■□□ 2.07
HIVEP1-204ENST00000478545 TOPBP1Q92547 1522 aa28■■■□□ 2.07
HIVEP1-204ENST00000478545 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.95■■■□□ 2.07
HIVEP1-204ENST00000478545 CUX1P39880 1505 aa27.91■■■□□ 2.06
HIVEP1-204ENST00000478545 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.85■■■□□ 2.05
HIVEP1-204ENST00000478545 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.76■■■□□ 2.04
HIVEP1-204ENST00000478545 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.76■■■□□ 2.03
HIVEP1-204ENST00000478545 SYNJ1O43426 1573 aa27.74■■■□□ 2.03
HIVEP1-204ENST00000478545 SOGA1O94964 1423 aa27.74■■■□□ 2.03
HIVEP1-204ENST00000478545 IFT140Q96RY7 1462 aa27.73■■■□□ 2.03
HIVEP1-204ENST00000478545 TOP2BQ02880 1626 aa27.72■■■□□ 2.03
HIVEP1-204ENST00000478545 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.71■■■□□ 2.03
HIVEP1-204ENST00000478545 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.7■■■□□ 2.02
HIVEP1-204ENST00000478545 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.63■■■□□ 2.01
HIVEP1-204ENST00000478545 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.62■■■□□ 2.01
HIVEP1-204ENST00000478545 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
HIVEP1-204ENST00000478545 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.54■■■□□ 2
HIVEP1-204ENST00000478545 TRIM41Q8WV44 630 aa27.53■■■□□ 2
HIVEP1-204ENST00000478545 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.49■■□□□ 1.99
HIVEP1-204ENST00000478545 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.45■■□□□ 1.99
HIVEP1-204ENST00000478545 WDR97A6NE52 1622 aa27.45■■□□□ 1.98
HIVEP1-204ENST00000478545 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP27.44■■□□□ 1.98
HIVEP1-204ENST00000478545 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.41■■□□□ 1.98
HIVEP1-204ENST00000478545 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.38■■□□□ 1.97
HIVEP1-204ENST00000478545 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.31■■□□□ 1.96
HIVEP1-204ENST00000478545 GRIN2BQ13224 1484 aa27.31■■□□□ 1.96
HIVEP1-204ENST00000478545 PBRM1Q86U86 1689 aa27.26■■□□□ 1.95
HIVEP1-204ENST00000478545 KIF27Q86VH2 1401 aa27.25■■□□□ 1.95
HIVEP1-204ENST00000478545 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.24■■□□□ 1.95
HIVEP1-204ENST00000478545 FBLN2P98095 1184 aa27.23■■□□□ 1.95
HIVEP1-204ENST00000478545 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.17■■□□□ 1.94
HIVEP1-204ENST00000478545 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
HIVEP1-204ENST00000478545 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
HIVEP1-204ENST00000478545 IGF1RP08069 1367 aa27.15■■□□□ 1.94
HIVEP1-204ENST00000478545 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.15■■□□□ 1.94
HIVEP1-204ENST00000478545 OSCARQ8IYS5 282 aa27.13■■□□□ 1.93
HIVEP1-204ENST00000478545 CHD1O14646 1710 aa27.09■■□□□ 1.93
HIVEP1-204ENST00000478545 SYNJ2O15056 1496 aa27.07■■□□□ 1.92
HIVEP1-204ENST00000478545 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.07■■□□□ 1.92
HIVEP1-204ENST00000478545 ADAMTS12P58397 1594 aa27.03■■□□□ 1.92
HIVEP1-204ENST00000478545 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
HIVEP1-204ENST00000478545 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27■■□□□ 1.91
HIVEP1-204ENST00000478545 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa26.99■■□□□ 1.91
HIVEP1-204ENST00000478545 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.96■■□□□ 1.91
HIVEP1-204ENST00000478545 CUL7Q14999 1698 aa26.95■■□□□ 1.9
HIVEP1-204ENST00000478545 GRIN2AQ12879 1464 aa26.94■■□□□ 1.9
HIVEP1-204ENST00000478545 EEA1Q15075 1411 aa26.91■■□□□ 1.9
HIVEP1-204ENST00000478545 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.83■■□□□ 1.89
HIVEP1-204ENST00000478545 NUP160Q12769 1436 aa26.81■■□□□ 1.88
HIVEP1-204ENST00000478545 CEP170Q5SW79 1584 aa26.8■■□□□ 1.88
HIVEP1-204ENST00000478545 PRXQ9BXM0 1461 aa26.79■■□□□ 1.88
HIVEP1-204ENST00000478545 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.75■■□□□ 1.87
HIVEP1-204ENST00000478545 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.69■■□□□ 1.86
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