RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476803.1

FAAP20-212, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 701 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-212ENST00000476803 ERCC6L2Q5T890 1561 aa31.03■■■□□ 2.56
FAAP20-212ENST00000476803 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa30.99■■■□□ 2.55
FAAP20-212ENST00000476803 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP30.98■■■□□ 2.55
FAAP20-212ENST00000476803 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa30.89■■■□□ 2.54
FAAP20-212ENST00000476803 TRHP20396 242 aaPredicted RBP30.77■■■□□ 2.52
FAAP20-212ENST00000476803 IQGAP2Q13576 1575 aa30.75■■■□□ 2.51
FAAP20-212ENST00000476803 PRXQ9BXM0 1461 aa30.73■■■□□ 2.51
FAAP20-212ENST00000476803 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa30.69■■■□□ 2.5
FAAP20-212ENST00000476803 EEA1Q15075 1411 aa30.67■■■□□ 2.5
FAAP20-212ENST00000476803 CSRNP3Q8WYN3 585 aa30.67■■■□□ 2.5
FAAP20-212ENST00000476803 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.62■■■□□ 2.49
FAAP20-212ENST00000476803 PTPRGP23470 1445 aa30.6■■■□□ 2.49
FAAP20-212ENST00000476803 UGGT2Q9NYU1 1516 aa30.6■■■□□ 2.49
FAAP20-212ENST00000476803 TNIKQ9UKE5 1360 aa30.6■■■□□ 2.49
FAAP20-212ENST00000476803 DISP1Q96F81 1524 aa30.57■■■□□ 2.48
FAAP20-212ENST00000476803 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP30.53■■■□□ 2.48
FAAP20-212ENST00000476803 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP30.52■■■□□ 2.48
FAAP20-212ENST00000476803 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa30.52■■■□□ 2.48
FAAP20-212ENST00000476803 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP30.51■■■□□ 2.47
FAAP20-212ENST00000476803 ADCY10Q96PN6 1610 aa30.5■■■□□ 2.47
FAAP20-212ENST00000476803 KIAA0556O60303 1618 aa30.46■■■□□ 2.47
FAAP20-212ENST00000476803 GOLGA3Q08378 1498 aa30.44■■■□□ 2.46
FAAP20-212ENST00000476803 UACAQ9BZF9 1416 aa30.39■■■□□ 2.45
FAAP20-212ENST00000476803 MAPKBP1O60336 1514 aa30.38■■■□□ 2.45
FAAP20-212ENST00000476803 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa30.36■■■□□ 2.45
FAAP20-212ENST00000476803 ABCC2Q92887 1545 aa30.34■■■□□ 2.45
FAAP20-212ENST00000476803 KIF21BO75037 1637 aa30.31■■■□□ 2.44
FAAP20-212ENST00000476803 ABCC10Q5T3U5 1492 aa30.29■■■□□ 2.44
FAAP20-212ENST00000476803 FAM69CQ0P6D2 419 aa30.25■■■□□ 2.43
FAAP20-212ENST00000476803 PLB1Q6P1J6 1458 aa30.21■■■□□ 2.43
FAAP20-212ENST00000476803 P3H3Q8IVL6 736 aa30.2■■■□□ 2.43
FAAP20-212ENST00000476803 KDM5BQ9UGL1 1544 aa30.2■■■□□ 2.42
FAAP20-212ENST00000476803 DIP2BQ9P265 1576 aa30.2■■■□□ 2.42
FAAP20-212ENST00000476803 KIF13AQ9H1H9 1805 aa30.19■■■□□ 2.42
FAAP20-212ENST00000476803 ASXL2Q76L83 1435 aa30.18■■■□□ 2.42
FAAP20-212ENST00000476803 SAMD9Q5K651 1589 aa30.17■■■□□ 2.42
FAAP20-212ENST00000476803 ABCA8O94911 1581 aa30.15■■■□□ 2.42
FAAP20-212ENST00000476803 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP30.14■■■□□ 2.42
FAAP20-212ENST00000476803 UBTFP17480 764 aaKnown RBP30.12■■■□□ 2.41
FAAP20-212ENST00000476803 EHMT2Q96KQ7 1210 aa30.12■■■□□ 2.41
FAAP20-212ENST00000476803 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP30.1■■■□□ 2.41
FAAP20-212ENST00000476803 EFCAB5A4FU69 1503 aa30.03■■■□□ 2.4
FAAP20-212ENST00000476803 FHOD3Q2V2M9 1422 aa30.02■■■□□ 2.4
FAAP20-212ENST00000476803 GLI2P10070 1586 aa30■■■□□ 2.39
FAAP20-212ENST00000476803 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
FAAP20-212ENST00000476803 WDR7Q9Y4E6 1490 aa29.99■■■□□ 2.39
FAAP20-212ENST00000476803 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa29.93■■■□□ 2.38
FAAP20-212ENST00000476803 ARID3CA6NKF2 412 aa29.92■■■□□ 2.38
FAAP20-212ENST00000476803 ATP10BO94823 1461 aa29.92■■■□□ 2.38
FAAP20-212ENST00000476803 TSPOAP1O95153 1857 aa29.86■■■□□ 2.37
FAAP20-212ENST00000476803 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP29.85■■■□□ 2.37
FAAP20-212ENST00000476803 KCNH8Q96L42 1107 aa29.84■■■□□ 2.37
FAAP20-212ENST00000476803 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa29.84■■■□□ 2.37
FAAP20-212ENST00000476803 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP29.82■■■□□ 2.36
FAAP20-212ENST00000476803 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP29.82■■■□□ 2.36
FAAP20-212ENST00000476803 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa29.82■■■□□ 2.36
FAAP20-212ENST00000476803 FMN1Q68DA7 1419 aa29.79■■■□□ 2.36
FAAP20-212ENST00000476803 KDM6BO15054 1643 aa29.78■■■□□ 2.36
FAAP20-212ENST00000476803 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
FAAP20-212ENST00000476803 TEX14Q8IWB6 1497 aa29.77■■■□□ 2.36
FAAP20-212ENST00000476803 CD109Q6YHK3 1445 aa29.74■■■□□ 2.35
FAAP20-212ENST00000476803 CFAP43Q8NDM7 1665 aa29.7■■■□□ 2.35
FAAP20-212ENST00000476803 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa29.69■■■□□ 2.34
FAAP20-212ENST00000476803 PLEKHD1A6NEE1 506 aa29.68■■■□□ 2.34
FAAP20-212ENST00000476803 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP29.65■■■□□ 2.34
FAAP20-212ENST00000476803 HECW1Q76N89 1606 aa29.63■■■□□ 2.33
FAAP20-212ENST00000476803 CLIP1P30622 1438 aa29.61■■■□□ 2.33
FAAP20-212ENST00000476803 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP29.61■■■□□ 2.33
FAAP20-212ENST00000476803 ABCA9Q8IUA7 1624 aa29.6■■■□□ 2.33
FAAP20-212ENST00000476803 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP29.59■■■□□ 2.33
FAAP20-212ENST00000476803 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
FAAP20-212ENST00000476803 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa29.51■■■□□ 2.31
FAAP20-212ENST00000476803 PHLDB1Q86UU1 1377 aa29.48■■■□□ 2.31
FAAP20-212ENST00000476803 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP29.46■■■□□ 2.31
FAAP20-212ENST00000476803 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP29.45■■■□□ 2.37e-8■■□□□ 13.4
FAAP20-212ENST00000476803 NEO1Q92859 1461 aa29.44■■■□□ 2.3
FAAP20-212ENST00000476803 FYCO1Q9BQS8 1478 aa29.42■■■□□ 2.3
FAAP20-212ENST00000476803 ARAP3Q8WWN8 1544 aa29.42■■■□□ 2.3
FAAP20-212ENST00000476803 CEP162Q5TB80 1403 aa29.42■■■□□ 2.3
FAAP20-212ENST00000476803 CCDC18Q5T9S5 1454 aa29.42■■■□□ 2.3
FAAP20-212ENST00000476803 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP29.39■■■□□ 2.3
FAAP20-212ENST00000476803 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP29.39■■■□□ 2.3
FAAP20-212ENST00000476803 TTC37Q6PGP7 1564 aa29.39■■■□□ 2.29
FAAP20-212ENST00000476803 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa29.36■■■□□ 2.29
FAAP20-212ENST00000476803 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa29.34■■■□□ 2.29
FAAP20-212ENST00000476803 FANCAO15360 1455 aa29.34■■■□□ 2.29
FAAP20-212ENST00000476803 KIF14Q15058 1648 aa29.31■■■□□ 2.28
FAAP20-212ENST00000476803 PLCH2O75038 1416 aa29.31■■■□□ 2.28
FAAP20-212ENST00000476803 CFAP74Q9C0B2 1584 aa29.3■■■□□ 2.28
FAAP20-212ENST00000476803 AKNAQ7Z591 1439 aa29.29■■■□□ 2.28
FAAP20-212ENST00000476803 RAPGEF3O95398 923 aa29.28■■■□□ 2.28
FAAP20-212ENST00000476803 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP29.23■■■□□ 2.27
FAAP20-212ENST00000476803 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa29.23■■■□□ 2.27
FAAP20-212ENST00000476803 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa29.22■■■□□ 2.27
FAAP20-212ENST00000476803 MYO5CQ9NQX4 1742 aa29.2■■■□□ 2.26
FAAP20-212ENST00000476803 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa29.18■■■□□ 2.26
FAAP20-212ENST00000476803 ADGRL1O94910 1474 aa29.17■■■□□ 2.26
FAAP20-212ENST00000476803 ARHGAP5Q13017 1502 aa29.15■■■□□ 2.26
FAAP20-212ENST00000476803 SCAPERQ9BY12 1400 aa29.14■■■□□ 2.26
FAAP20-212ENST00000476803 MTUS2Q5JR59 1369 aa29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms